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Hermetia illucens, the black soldier fly, is a dipteran of the family Stratiomyidae. This detritivorous insect is increasingly used in mass production to reduce bio-waste and produce food for aquaculture and poultry farms. It originates from the north of Latin America and has spread over much of the planet. For the last ten years, many companies have been breeding and processing larvae from a circular economy perspective. This CIFRE thesis aims to improve genetic and genomic knowledge on the black soldier fly for performance improvement and selection. We focused, in a first step, on obtaining and analyzing a reference genome for the species using hybrid sequencing. We also worked on the genetic diversity and invasive history of BSF. We did this through global sampling using the CO1 gene and assembling about 60 complete mitochondrial genomes. We have shown the complexity of the black soldier fly's invasion scenarios combining an ancient process of natural dispersal on the American continent and the importance of human introductions, notably due to industrial breeding. Finally, we also looked at the structural variations of the genomes induced by transposable elements in natural populations of Hermetia illucens to determine the most active elements in the genomes and their evolutionary dynamics. This work revealed the species' surprising and unexpected genetic and genomic diversity. It opens new perspectives towards selection and improvement experiments on the black soldier fly for the entomoculture industry., Hermetia illucens, la mouche soldat noire, est un diptère de la famille des Stratiomyidae. Cet insecte détritivore est de plus en plus utilisé en élevage de masse pour réduire les biodéchets et produire de la nourriture à destination des élevages aquacoles et avicoles. Elle est originaire du nord de l'Amérique Latine et s'est répandue sur une grande partie de la planète. Depuis une dizaine d'années, un nombre croissant d'entreprises élèvent et transforment des larves dans une optique d'économie circulaire. Cette thèse CIFRE a pour but d'améliorer les connaissances génétiques et génomiques sur la mouche soldat noire pour l'amélioration des performances et de la sélection. Nous nous sommes concentrés, dans un premier temps, sur l'obtention et l'analyse d'un génome de référence, pour l'espèce en utilisant du séquençage hybride. Nous avons également travaillé sur la diversité génétique et l'histoire invasive de la BSF. Nous l'avons fait au moyen d'un échantillonnage mondial en utilisant à la fois le gène CO1 et l'assemblage d'une soixantaine de génomes mitochondriaux complets. Nous avons montré la complexité des scénarios d'invasion de la mouche soldat noire combinant à la fois un processus ancien de dispersion naturelle sur le continent Américain ainsi que, l'importance des introductions humaines, notamment en raison des élevages industriels. Enfin nous nous sommes également intéressés aux variations structurales des génomes, induites par les éléments transposables dans les populations naturelles d'Hermetia illucens, afin de déterminer les éléments les plus actifs dans les génomes ainsi que leurs dynamiques évolutives. Ce travail a révélé une étonnante et inattendue diversité génétique et génomique au sein de l'espèce. Il ouvre de nouvelles perspectives vers des expérimentations de sélection et d'amélioration sur la mouche soldat noire pour l'industrie entomocole.

RésuméAu sein des plantations agro-industrielles de la canne à sucre en Afrique de l'Ouest, les experts chargés du développement productiviste occultent souvent le discours critique que tiennent les paysans locaux vis-à-vis du nouveau mode d'exploitation de la terre et de son impact sur l'écosystème. Dans les logiques paysannes anciennes, tout un ensemble de pratiques religieuses était destiné à fixer des limites à une utilisation excessive des ressources naturelles. En affirmant que «le monde est gâté», les cultivateurs traduisent la crise d'un modèle agricole traditionnel et la dissolution des liens sociaux qu'il sous-tendait. Cette expression est le signe de la profonde métamorphose que connaît la société sénoufo qui, si elle a souvent été perçue comme particulièrement fermée, apparaît ici comme un monde en transition.þ AbstractExperts in industrial, productivity-oriented sugar-cane plantations in west Africa often overlook the criticism that local peasants make of new methods for working the land and their impact on the ecosystem. In line with traditional farming strategies, religious practices were intended to set limits on overusing natural resources. When declaring, “The world is spoiled”, farmers are referring to the crisis of traditional farming and disintegration of the social bonds underlying this model. Though often seen as very closed, Senufo society is undergoing a transformation.þ

This work aims to better understand the role played by the Rural Development Programme (RDP) to support the agro-food industry in Piedmont. The agro-food sector is the portion of the production chain dealing with food processing and characterised by the highest added value. Differently from other production sectors, it includes various types of businesses: large farming enterprises, cooperatives of producers, as well as processing industries. The effect of rural development policies is assessed by comparing the economic-financial performance of businesses receiving public support to that of businesses which are not supported through public funds. In order to do so, the sample under investigation comprises enterprises which received financing earmarked for the agro-food industry during the periods 2000-2006 and 2007-2013. Our purpose is to understand the role played by the RDP and how financing affects agro-food businesses, as well as to describe the features of beneficiary enterprises.

Beaucoup d’agriculteurs, comme les opérateurs des filières aval qui transforment leur production, dépendent aujourd’hui des ressources en eau souterraine. Or, dans de nombreuses régions du monde, en climat aride comme tempéré, les nappes souterraines sont surexploitées et les ressources disponibles déclinent. Les agriculteurs sont alors confrontés à une pression croissante pour préserver cette ressource. Cette situation les amène d’une part, à économiser l’eau en mettant l’accent sur des productions moins consommatrices, d’autre part, à mieux valoriser les quantités utilisées. Plusieurs stratégies sont envisageables comme modifier les choix d’assolement ou adapter les modes de conduite des cultures. Ces stratégies peuvent avoir des conséquences importantes sur l’organisation des filières aval. Cette communication propose les bases d’une démarche visant à analyser les conséquences de fortes restrictions d’eau sur l’organisation de filières locales. Elle a été mise en oeuvre en France, sur le cas de la nappe de Beauce, en partenariat avec la profession agricole, les opérateurs des unités de transformation et les représentants de l’Etat. Elle permet d’analyser les adaptations et les stratégies de chacun face à des baisses de volumes d’eau disponibles. Elle met en évidence les interactions entre les opérateurs d’une même filière et les interactions entre différentes filières. Many farmers, and the large set of downstream operators who depend on their farm products, have become dependent on groundwater resources. Although overexploitation of groundwater resources is far from being a universal phenomenon, it can be observed not only in arid areas but also in the areas with a temperate climate. In regions where groundwater resources are declining, farmers have to reduce water consumption by growing crops with lower water requirement, or apply optimal irrigation strategies. The strategies they choose can have major consequences for downstream operators and local agro- industries. This paper presents an approach to analyze the impacts on and consequences of high water restrictions for the subsectors. This approach was implemented in the region of Beauce, in France, in collaboration with farmers, downstream operators and state representatives. Adaptations and strategies to face reduced water availability were analyzed in economic and technical terms for both farmers and downstream operators. Participatory workshops brought together different downstream operators who could become competitors for the same resource and highlighted interactions between operators in the same subsector as well as interactions between different sectors.

Long-time isolated from the rest of Brazil as a region dominated by the extractivsm of natural forest resources, the Jarí river region encounters a radical change of its economic development from 1967 on with the arrival of the American multimillionaire D.K. Ludwig and hos “Jari project”: the transformation of the region into an economic pole on the basis of the agro-industrial production of cellulose on the basis of extensive monoculture plantations. However, the region was already populated by small local communities scattered in the forest and living of the extractivism of natural resources. The evolution of the Jarí river region and “its” economic project, which is unique in the history of the so-called “Pharaonic projects” in the Amazon region, is in the center of this article. After a geo-historical synthesis of the Jarí project's evolution, the paper discusses the company's current strategies for the management of their territory, as well as the possibilities and limits of the company's foundation to effectively contribute to a more sustainable development in the region, able to respond to both the historic and actual contradictions of the economic development of the Jarí river region on the basis of agro-business., Longtemps isolée du reste du Brésil, cette région connaît son développement économique à partir de 1967 avec l'arrivé du multimillionnaire Américain Ludwig, dont le projet ambitieux (connu comme "projeto Jarí") consiste à former un laboratoire de développement économique pour l'Amazonie à base de l'agroindustrie, alors que la zone était déjà peuplée de petites communautés locales dispersées dans la forêt et vivant de l'extractivisme des ressources naturelles. Cette contribution vise à montrer comment une firme, dont la présence provoque un important bouleversement régional, apporte des réponses aux contradictions du développement économique en Amazonie. On analysera notamment le rôle de l'entreprise dans le développement régional, afin de comprendre ses stratégies territoriales en vu d'alliances favorables avec les pouvoirs publiques et les populations locales. Alors qu'un dialogue constructif entre ces acteurs a effectivement été ouvert notamment par l'intermédiation d'une Fondation sociale créée par l'entreprise, la question sur la répartition des tâches entre l'état et l'entreprise demeure une source de désaccord, encore aggravée par des conflits fonciers historiques autour de la propriété sur des aires protégées à proximité du territoire réclamé par l'entreprise.

Today, impact evaluation of development projects is dominated by quantitative methods, both experimental and quasi experimental. Yet, they are difficult to apply to agricultural development projects, and do not allow for quantification of the impact over the useful life of the project realisations. This thesis proposes a new method, the systemic impact evaluation. It enables us to understand both the process through which impact materializes and to rigorously quantify the impact of agricultural development projects on the producers' income. The analysis is notably based on the comprehension of the agrarian dynamics and the farmers' strategies, and permits the quantification of ex-post impact but also to devise a model of ex- ante evolution for the following years. The systemic impact evaluation is applied to two major types of development projects in the forest region of Guinea: inland valley development projects and the oil-palm and rubber tree plantation project. These two case studies notably prove the importance of going beyond a mean impact on households: the existence of highly differentiated impacts by farming system is one of the main conclusions of this thesis.; L'évaluation d'impact des projets de développement est aujourd'hui dominée par les méthodes quantitatives : expérimentales ou quasi-expérimentales. Elles sont toutefois difficilement applicables aux projets de développement agricoles, et elles ne permettent pas de quantifier l'impact sur toute la durée de vie des réalisations. Cette thèse propose une nouvelle méthode, l'évaluation systémique d'impact. Elle permet à la fois de comprendre les processus par lesquels l'impact se matérialise et de quantifier rigoureusement l'impact des projets de développement agricole sur le revenu des producteurs. L'analyse repose notamment sur la compréhension des dynamiques agraires et des stratégies des agriculteurs, et permet de quantifier l'impact ex-post mais également d'en modéliser ex-ante l'évolution pour les années suivantes. L'évaluation systémique d'impact est appliquée à deux grands types de projets en Guinée forestière : les projets d'aménagements de bas-fonds et un projet agro-industriel de plantations de palmiers à huile et d'hévéas. Ces deux études de cas démontrent notamment l'importance de ne pas se contenter de rechercher un impact moyen sur les ménages : l'existence d'impacts fortement différenciés par système de production est l'une des principales conclusions de cette thèse.

Au sein des plantations agro-industrielles de la canne à sucre en Afrique de l’Ouest, les experts chargés du développement productiviste occultent souvent le discours critique que tiennent les paysans locaux vis-à-vis du nouveau mode d’exploitation de la terre et de son impact sur l’écosystème. Dans les logiques paysannes anciennes, tout un ensemble de pratiques religieuses était destiné à fixer des limites à une utilisation excessive des ressources naturelles. En affirmant que « le monde est gâté », les cultivateurs traduisent la crise d’un modèle agricole traditionnel et la dissolution des liens sociaux qu’il sous-tendait. Cette expression est le signe de la profonde métamorphose que connaît la société sénoufo qui, si elle a souvent été perçue comme particulièrement fermée, apparaît ici comme un monde en transition. Senufo Farmers’ Sugar-Cane Plantations in Ivory Coast and Burkina Faso. – Experts in industrial, productivity-oriented sugar-cane plantations in west Africa often overlook the criticism that local peasants make of new methods for working the land and their impact on the ecosystem. In line with traditional farming strategies, religious practices were intended to set limits on overusing natural resources. When declaring, “The world is spoiled”, farmers are referring to the crisis of traditional farming and disintegration of the social bonds underlying this model. Though often seen as very closed, Senufo society is undergoing a transformation.

The authorities of the Socialist Republic of the Union of Burma waited until the Fifth Four-Year Plan starting in 1986 to implement the promotion of crops by implanting new agro-based industries. Among these was the creation of a pilot milk plant in the area of Mandalay. Livestock in Burma, dominated by draught cattle (565 millions heads) is unbalanced and under-employed. Mad consumption is 5.46 kg per person and per year but this meat derives mainly from fowls. Burmese do not eat beef due to their religious beliefs. Some projects of livestock development were initiated in 1982 but mostly concerned fowls. In 1987, the total area of pasture for the whole union was 5.024 hectares. Milkproduction reached only 646 tons in 1987, which is 17 grams per inhabitant. Cattle surplus are systematically smuggled in Thailand. The Taung Myin Milk is under construction in the dry zone in the south of Mandalay. The site zoos chosen because of a favorable situation between rich agricultural zones, with a traditional muslim expertise in the field of cattle breeding and the making of condensed milk. The milk production of local breeds being too low, experts are encouraging the development of cross-breeds. To increase the yield, new plants are introduced to enrich the pasture. Moreover a new factory to produce animal feeds with agricultural by-products has been included in the project. Collecting milk, traditionnally by bicycles, will be improved by adding a fleet of tank trucks to connect the collection centers with the milk plant. Whatever advantages may be offered to the farmers by this innovation, it is still uncertain whether the mil plant will be able to enter into production and commercialise its products in an area where inhabitants are known to have a strong attachment to their traditional buddhistic values., Il a fallu attendre le Ve Plan Quadriennal (avril 1986) pour que les autorités de la République socialiste de l'Union de Birmanie commencent à envisager de valoriser leurs matières premières agricoles par la mise en place de nouvelles industries agro-alimentaires. Parmi ces dernières, l'implantation d'une laiterie pilote fut décidée dans le bassin de Mandalay. L'élevage birman est dominé par le bétail de trait (6 500 000 têtes), ce qui forme un cheptel déséquilibré et sous-employé. La consommation de viande s'élève à 5,46 kg par personne et par an, mais l'essentiel de cette viande provient des volailles. Les birmans ne mangent pas de boeuf pour des raisons religieuses. Quelques projets de développement du cheptel ont vu timidement le jour en 1982, mais là encore ils intéressent surtout les volailles. En 1987, la superficie totale des pâturages s'élevait à 5 024 ha pour l'ensemble de l'Union. La production de lait n'a atteint que 646 1 en 1987, soit 17 grammes par habitant. Les surplus de bétail sont exportés en contrebande vers la Thaïlande. L'usine de Taung Myin est en cours de construction dans la zone sèche au sud de Mandalay. Le choix du site correspond à une situation favorable au contact de riches zones agricoles bénéficiant d'une main-d'oeuvre musulmane traditionnellement spécialisée dans l'élevage laitier et la fabrication artisanale de lait condensé. La production laitière des espèces locales étant trop faible, les experts encouragent l'élevage de bovins métissés. Pour augmenter la production, ils ont prévu d'améliorer l'alimentation du bétail stabulaire en introduisant de nouvelles plantes fourragères et en créant une usine de production de tourteaux utilisant les sous-produits des cultures. Le ramassage du lait s'effectue traditionnellement à vélo et sera complété par une flotte de camions-citernes desservant des centres de pré-conditionnement. Malgré les avantages offerts par cette innovation, il n'est pas certain que la laiterie puisse aisément fonctionner et commercialiser ses produits dans un milieu fortement attaché aux traditions bouddhiques., Lubeigt Guy. Elevage, traditions et innovations dans le bassin de Mandalay (Birmanie). In: Innovations et développement rural dans les pays tropicaux. Bordeaux : Presses Universitaires de Bordeaux, 1993. pp. 141-163. (Espaces tropicaux, 8)

Cet article analyse les divers modes d’insertion des jeunes ruraux dans les périmètres irrigués du delta du fleuve Sénégal dans un contexte de réalisation de nouveaux aménagements hydroagricoles et d’acquisition massive de terres par des entreprises de type agribusiness. Dans les années 1960, c’est l’État qui aménageait les périmètres hydroagricoles et qui distribuait des parcelles aux actifs. Les jeunes actifs de la région pouvaient alors acquérir une petite parcelle de 0,2 ha gratuitement sur un périmètre irrigué. À partir des années 1980, le Sénégal prend un tournant libéral, ce qui réduira le développement des aménagements hydroagricoles publics et augmentera les périmètres privés. Dans cette logique, les jeunes actifs qui, le plus souvent, n’ont pas les ressources nécessaires pour acquérir des terres, éprouvent de sérieuses difficultés à s’installer en agriculture irriguée. À partir de 2006, des programmes bâtis selon le paradigme du partenariat public-privé ont réalisé 5 000 ha de nouveaux aménagements hydroagricoles dans cette zone et, dans ce cadre, laissent une petite place aux jeunes agriculteurs. Parallèlement, l’agro-industrie a aussi gagné du terrain et permet l’embauche de nombreux jeunes, mais de façon temporaire et précaire.En s’appuyant sur des enquêtes auprès des exploitants et des salariés agricoles du delta du fleuve Sénégal, nous montrons que les jeunes peinent de plus en plus à accéder à la terre ou à trouver des emplois décents dans le salariat agricole. En outre, l’étude montre que, plus que le salariat agricole, l’autonomisation des jeunes à travers l’accès au foncier irrigué demeure le meilleur moyen de lutter contre la pauvreté., This article analyzes different approaches to establishing rural youth in irrigation areas in the Senegal River delta in the context of new hydro-agricultural developments and massive land acquisitions by agrobusiness. Government-led irrigation projects introduced in the 1960s distributed free 0.2-hectare plots of land to young workers from the surrounding region. However, in the 1980s, Senegal took a liberal turn that led to a shift from public-sector to private-sector initiatives. As a result, young workers, who often lack the means necessary to acquire land, have found it much more challenging to pursue farming in irrigation areas. Since 2006, few young farmers have acquired any of the 5,000 hectares of new irrigated farmland developed through programs based on the public-private partnership model. At the same time, agro-industry growth has provided young people with many temporary and precarious employment opportunities.Based on surveys of farmers and agricultural workers in the Senegal River delta, we show how young people find it increasingly difficult to acquire land or secure adequate employment in the agricultural sector. In addition, we demonstrate that access to irrigated land, as opposed to salaried agricultural work, represents the most effective strategy for poverty reduction.