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Background: Closed breeding populations are useful to conduct basic and applied research. The Wye Angus herd is one of them. It was founded using only a few animals. The pedigree of the descendants of the original herd can be completely described by historical records resulting from strong selection. Wye Angus genetics has influenced that of Aberdeen Angus, Red Angus, and Brangus cattle worldwide. Objective: To evaluate parameters and genetic trends associated with the reproduction traits of the Wye Angus herd between the years 1937 and 2012. Methods: We used pedigree information of 11,692 individuals. The reproductive traits assessed were age at first calving (AFC), calving interval (CI), and scrotal circumference (SC). The covariance components were estimated by Bayesian inference. The genetic trends were obtained by linear regression of the genetic values over birth years of the animals. Results: The heritability estimates for AFC, and CI were negligible, although a small genetic gain was associated with CI. Because the AFC and CI values of the herd are small, past reproductive management has produced favourable results for the heifers. Conclusion: The Wye Angus herd has enough genetic variability for genetic gain through selection on SC. Resumen Antecedentes: Las poblaciones reproductivas cerradas son útiles para realizar investigacion básica y aplicada. El hato Wye Angus es uno de ellos. Fue fundado utilizando sólo unos pocos animales. El pedigrí de los descendientes del hato original puede describirse completamente mediante registros históricos resultantes de una fuerte selección. La genética del Wye Angus ha influido en la del Aberdeen Angus, Red Angus y Brangus en todo el mundo. Objetivo: Evaluar los parámetros y las tendencias genéticas de características reproductivas del rebaño Wye Angus en el periodo entre 1937 y 2012. Métodos: Utilizamos información de pedigrí de 11.692 individuos. Las características evaluadas fueron circunferencia escrotal (SC), edad al primer parto (AFC) y el intervalo entre partos (CI). Los componentes de (co)variancia fueron obtenidos mediante metodología Bayesiana. Las tendencias genéticas fueron obtenidas por regresión lineal ponderada de los valores genéticos sobre el año de nacimiento del animal. Resultados: Las estimaciones de heredabilidad para AFC y CI fueron insignificantes, aunque se asoció un pequeño beneficio genético con CI. Sin embargo, la AFC y el CI del rebaño son bajos, indicando que el manejo reproductivo ha traído resultados favorables para las novillas. Conclusion: El rebaño Wye Angus posee suficiente variabilidad genética para la ganancia genética por medio de la selección para SC. Resumo Antecedentes: O rebanho Wye Angus foi fundado a partir de poucos animais e destaca-se por ser um rebanho fechado, com informações completas de pedigree e forte seleção, oferecendo vantagens únicas em termos de realização de pesquisas em melhoramento genético animal. Além disso, a genética de Wye Angus tem influenciado os de Aberdeen Angus, Red Angus e Brangus em todo o mundo. Objetivo: Avaliar os parâmetros genéticos e tendências de características reprodutivas do rebanho Wye Angus no período entre 1937 e 2012. Métodos: Foram usadas informações do pedigree de 11.692 individuos. As características avaliadas foram: perímetro escrotal (SC), idade ao primeiro parto (AFC), e do intervalo entre partos (CI). Componentes de (co) variância foram obtidos por meio da metodologia Bayesiana. As tendências genéticas foram obtidas por regressão linear ponderada dos valores genéticos sobre o ano de nascimento do animal. Resultados: Hereditariedade para AFC e CI foram insignificantes, embora um pequeno ganho genético tenha sido associado a CI. No entanto, os valores para AFC e CI do rebanho são baixos, indicando que o manejo reprodutivo trouxe resultados favoráveis para as novilhas. Conclusão: O rebanho Wye Angus tem variabilidade genética suficiente para ganho genético através de seleção para SC.

Made available in DSpace on 2018-12-11T17:22:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2018-01-01 Mortality from collision with vehicles is the most visible impact of road traffic on wildlife. Mortality due to roads (hereafter road-kill) can affect the dynamic of populations of many species and can, therefore, increase the risk of local decline or extinction. This is especially true in Brazil, where plans for road network upgrading and expansion overlaps biodiversity hotspot areas, which are of high importance for global conservation. Researchers, conservationists and road planners face the challenge to define a national strategy for road mitigation and wildlife conservation. The main goal of this dataset is a compilation of geo-referenced road-kill data from published and unpublished road surveys. This is the first Data Paper in the BRAZIL series (see ATLANTIC, NEOTROPICAL, and BRAZIL collections of Data Papers published in Ecology), which aims make public road-kill data for species in the Brazilian Regions. The dataset encompasses road-kill records from 45 personal communications and 26 studies published in peer-reviewed journals, theses and reports. The road-kill dataset comprises 21,512 records, 83% of which are identified to the species level (n = 450 species). The dataset includes records of 31 amphibian species, 90 reptile species, 229 bird species, and 99 mammal species. One species is classified as Endangered, eight as Vulnerable and twelve as Near Threatened. The species with the highest number of records are: Didelphis albiventris (n = 1,549), Volatinia jacarina (n = 1,238), Cerdocyon thous (n = 1,135), Helicops infrataeniatus (n = 802), and Rhinella icterica (n = 692). Most of the records came from southern Brazil. However, observations of the road-kill incidence for non-Least Concern species are more spread across the country. This dataset can be used to identify which taxa seems to be vulnerable to traffic, analyze temporal and spatial patterns of road-kill at local, regional and national scales and also used to understand the effects of road-kill on population persistence. It may also contribute to studies that aims to understand the influence of landscape and environmental influences on road-kills, improve our knowledge on road-related strategies on biodiversity conservation and be used as complementary information on large-scale and macroecological studies. No copyright or proprietary restrictions are associated with the use of this data set other than citation of this Data Paper. Setor de Ecologia Aplicada Universidade Federal de Lavras PPG Análise e Modelagem de Sistemas Ambientais Departamento de Cartografia Instituto de Geociências Universidade Federal de Minas Gerais NERF-UFRGS Núcleo de Ecologia de Rodovias e Ferrovias Departamento de Biologia Universidade Federal do Rio Grande do Sul Programa de Pós Graduação em Ecologia Instituto de Biociências Universidade Federal do Rio Grande do Sul Centro Brasileiro de Estudos em Ecologia de Estradas (CBEE) Universidade Federal de Lavras Núcleo em Ecologia e Desenvolvimento Sócio-Ambiental de Macaé Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) Autopista Fluminense S. A., Av. São Gonçalo, 100, Unidade 101, Bairro Boa Vista Universidade Federal de Uberlandia (UFU) Programa de Pós Graduação em Políticas Públicas Núcleo de Ciências Ambientais Universidade de Mogi das Cruzes Spatial Ecology and Conservation Lab (LEEC) Departamento de Ecologia Universidade Estadual Paulista - UNESP Programa de Pós-graduação em Ecologia e Biodiversidade Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista - UNESP Ciências Biológicas Núcleo de Ciências Ambientais Universidade de Mogi das Cruzes Caipora Cooperativa, Rua Desembargador Vitor Lima, 260/908 Setor de Mastozoologia Museu de Ciências Naturais Fundação Zoobotânica do Rio Grande do Sul Programa de Pós Graduação em Ecologia Animal Universidade Federal do Rio Grande do Sul Departamento de Zoologia Instituto de Biociências Universidade Federal do Rio Grande do Sul UFRGS Universidade Federal de São Carlos Pós Graduação em Conservação em Fauna Universidade Federal de São Carlos Programa de Pós Graduação em Genética Biodiversidade e Conservação Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Jequié Departamento de Biologia Universidade Federal Rural de Pernambuco Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Pioneiros Departamento de Biologia Centro de Ciências Exatas Naturais e da Saúde Universidade Federal do Espírito Santo Departamento de Ciências Biológicas Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Laboratório de Ecologia e Conservação Universidade Federal da Fronteira Sul, Campus Erechim Universidade Federal do Rio Grande do Sul CETESB - Companhia Ambiental do Estado de São Paulo Universidade Federal do Pampa Universidade Veiga de Almeida Instituto Tecnológico de Transportes e Infraestrutura Universidade Federal do Paraná Laboratório de Ecologia de Manguezal Instituto de Estudos Costeiros Universidade Federal do Pará Programa de Pós-Graduação em Biologia Universidade do Vale do Rio dos Sinos Arcadis Laboratório de Ecologia e Biogeografia de Mamíferos Universidade Estadual de Goiás Laboratório de Zoologia Universidade Federal do Amazonas, Coroado I IPÊ Pantanal, Rua Licuala, 622, Damha 1 Departamento de Patologia Veterinária Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista Faculdade de Biociências Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade – ICMBio Ministério do Meio Ambiente Centro Universitario de Rivera Universidad de la República, Ituzaingó 667 Departamento de Genética e Evolução Universidade Federal de São Carlos Laboratório de Biodiversidade Molecular e Conservação Departamento de Genética e Evolução Universidade Federal de São Carlos Centro Universitário de Anápolis Universidade Federal da Paraíba Departamento de Engenharia e Meio Ambiente Rua Botuverá, 257 Dom Joaquim Departamento de Ecologia -Universidade Federal do Rio Grande do Norte Instituto Conservação Brazil (ICB), Rua dos Angicos, 185, Recanto dos Angicos R Embrapa Pantanal, Rua 21 de Setembro, n 1.880, Bairro Nossa Senhora de Fátima, Caixa Postal: 109 Departamento de Biologia Geral Agrárias e Humanas Instituto de Ciências da Saúde Centro Universitário do Planalto de Araxá UNIARAXÁ Hori Consultoria Ambiental, Rua Paulo Gorski, 2058, Mussunguê Centro Brasileiro para Conservação dos Felinos Neotropicais, Av. Emílio Antonon, 1000 – Chácara Aeroporto Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Recursos Naturais Universidade Federal de São Carlos Programa de Pós Graduação em Ecologia Instituto de Ciências Biológicas Universidade de Brasília, Campus Darcy Ribeiro Centro de Ciências Biologicas e de Saude Universidade Federal de São Carlos Instituto de Ciências Biologicas Universidade de Brasília Núcleo de Licenciamento Ambiental, Superintendência do Ibama em São Paulo/SP, Alameda Tietê, 637, 10° andar Curso de Medicina Veterinária Centro Universitário de Lavras (Unilavras) Departamento de Engenharia Florestal Universidade de Brasília Pontifícia Universidade Católica do Paraná Universidade Estadual de Goiás Complexo Cultural e Científico de Peirópolis Departamento de Biologia Universidade Federal de Lavras Spatial Ecology and Conservation Lab (LEEC) Departamento de Ecologia Universidade Estadual Paulista - UNESP Programa de Pós-graduação em Ecologia e Biodiversidade Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista - UNESP Departamento de Patologia Veterinária Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Universidade Estadual Paulista

Habitat fragmentation can promote patches of small and isolated populations, gene flow disruption between those populations, and reduction of local and total genetic variation. As a consequence, these small populations may go extinct in the long-term. The ocelot (Leopardus pardalis), originally distributed from Texas to southern Brazil and northern Argentina, has been impacted by habitat fragmentation throughout much of its range. To test whether habitat fragmentation has already induced genetic differentiation in an area where this process has been documented for a larger felid (jaguars), we analyzed molecular variation in ocelots inhabiting two Atlantic Forest fragments, Morro do Diabo (MD) and Iguaçu Region (IR). Analyses using nine microsatellites revealed mean observed and expected heterozygosity of 0.68 and 0.70, respectively. The MD sampled population showed evidence of a genetic bottleneck under two mutational models (TPM = 0.03711 and SMM = 0.04883). Estimates of genetic structure (FST = 0.027, best fit of k = 1 with STRUCTURE) revealed no meaningful differentiation between these populations. Thus, our results indicate that the ocelot populations sampled in these fragments are still not significantly different genetically, a pattern that strongly contrasts with that previously observed in jaguars for the same comparisons. This observation is likely due to a combination of two factors: (i) larger effective population size of ocelots (relative to jaguars) in each fragment, implying a slower effect of drift-induced differentiation, and (ii) potentially some remaining permeability of the anthropogenic matrix for ocelots, as opposed to the observed lack of permeability for jaguars. The persistence of ocelot gene flow between these areas must be prioritized in long-term conservation planning on behalf of these felids.

The capybara is the largest rodent in the world and is widely distributed throughout Central and South America. It is an animal of economic interest due to the pleasant flavor of its meat and higher protein content in comparison to beef and pork meat. The hide, hair and fat also have economic advantages. Thus, as an animal with such high economic potential, it is the target of hunters, even though hunting capybara is prohibited by law in Brazil. Due to their similarities, capybara meat is easily confused with pork meat. This occurs upon the apprehension of the meat from hunters, as well as in some restaurants that serve capybara meat that was slaughtered clandestinely. In both cases, when the meat is confiscated, those responsible for the crimes claim it is pork meat, hindering the enforcement of the law. A practical course was ministered to undergraduate biology students enrolled in the elective course Introduction to Genetic Engineering at Federal University of Sao Carlos (UFSCar), Sao Paulo State, Brazil. The objective of the course was to establish and apply a Polymerase Chain Reaction (PCR) assay to identify capybara meat and discriminate it in relation to other types of meat, including pork. Primers were designed based on 12S rRNA, transthyretin and growth hormone receptor genes. The primers generated capybara specific fragments of approximately 220, 290 and 330 bp for transthyretin, 12S rRNA and growth hormone receptor, respectively. The duplexes developed in the present work can be used effectively to discriminate capybara meat from other animals, contributing to combating predatory capybara hunting. The results were extensively discussed and the students have contributed to written a paper to be submitted to a publication. Supported by Fapesp