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Conservation management systems are usually suggested as alternative to restore the soil methane (CH4) oxidation capacity of degraded soils; however, little information is available on tropical and subtropical soils. Our objective was to evaluate the long-term (19 years) effect of no-tillage (NT) versus conventional tillage (CT) management systems on CH4 fluxes in a formerly degraded Acrisol in Southern Brazil. Annual CH4 fluxes of two cropping systems [O/M-black oat (Avena strigosa)/maize and V/M-vetch (Vigna sativa)/maize] were measured in NT and CT soils. Static chambers were used for air sampling, while chromatography was used for CH4 analysis. Analysis of the historical dataset at this experimental site indicated improvements in soil quality under the NT system, especially in legume-based cropping system (V/M) that exhibited the highest annual biomass input. CH4 fluxes ranged from −42 ± 2 to 38 ± 16 μg C m-2 h-1, and annual CH4 emissions ranged from −825 ± 117 (CT V/M) to 453 ± 185 g C ha-1 (NT O/M). Thus, the annual CH4 oxidation capacity of the soil was not related to the soil quality produced by the soil management systems. On the basis of our results and published literature, we postulate that conservation management systems improve the methane oxidation and soil quality in distinct soil layers, which result in a slow effect of these management systems on the methane oxidation capacity. Sistemas conservacionistas de manejo de solo são considerados usualmente uma alternativa para restaurar a capacidade de solos agrícolas degradados em oxidar metano (CH4), mas escassa informação é disponível para solos tropicais e subtropicais. O objetivo do presente estudo foi avaliar o efeito de longo prazo (19 anos) do plantio direto (PD) nos fluxos de CH4 em um Argissolo Vermelho (Classificação Brasileira) degradado da região Sul do Brasil, em comparação ao preparo convencional (PC). Fluxos anuais de CH4 do solo foram avaliados nos sistemas PD e PC sob dois sistemas de cultura (aveia/ milho- A/M e ervilhaca/milho-E/M). Amostragem do ar foi conduzida utilizando o método da câmara estática fechada e as análises de CH4 foram realizadas por cromatografia gasosa. Dados históricos do experimento evidenciaram melhoria expressiva da qualidade do solo em PD, especialmente quando associado ao sistema de cultura com leguminosas de cobertura de solo (E/M) que apresentou a mais elevada adição anual de biomassa ao solo. Os fluxos de CH4 variaram de −42±2 a 38±16 μg C m-2 h-1 e as emissões anuais de CH4 variaram de −825±117 (PC E/M) a 453±185 g C ha-1 (PD A/M). Portanto, a capacidade de oxidação de CH4 não teve relação com a qualidade do solo nos distintos sistemas de manejo. Baseado nos resultados do presente estudo e da literatura, nos hipotetizamos que as zonas de oxidação de CH4 e de melhoria da qualidade do solo ocorrem em posições distintas no perfil do solo sob sistemas conservacionistas de manejo, determinando que a recuperação da capacidade do solo em oxidar CH4 seja bastante lenta.