1. Diversity of ectomycorrhizal symbionts in a disturbed Pinus halepensis plantation in the Mediterranean region
- Author
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Khalid El Karkouri, Daniel Mousain, Francis Martin, Interactions Arbres-Microorganismes (IAM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), UMR INRA / ENSAM : Rhizosphère et Symbiose (UMR R&S), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier (ENSA M)
- Subjects
0106 biological sciences ,Mediterranean climate ,PCR-RFLP-séquençage ,champignon ,rflp ,plantation ,Biology ,ectomycorrhizal diversity ,010603 evolutionary biology ,01 natural sciences ,pcr ,[SDV.SA.SF]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry ,séquençage ,Botany ,diversité des ectomycorhizes ,ADNr (ITS) ,Ribosomal DNA ,pinus halepensis ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,rDNA (ITS)---Pinus halepensis M ,2. Zero hunger ,Ecology ,DIVERSITE DES ECTOMYCORHIZES ,PCR-RFLP-sequencing ,Forestry ,15. Life on land ,PLANTATION ,ECTOMYCORRHIZAL DIVERSITY ,PCR RFLP SEQUENCING ,RDNA (ITS) ,PIN D'ALEP ,adn ribosomique ,%22">Pinus ,mycorhize ,ectomycorhize ,Restriction fragment length polymorphism ,symbiose ,région méditerranéenne ,010606 plant biology & botany - Abstract
Ectomycorrhizal diversity (ED) associated with Pinus halepensis trees was examined 1.5 years after outplanting at a fire-disturbed site of Rieucoulon (Herault, France). ED analysis was examined on non-inoculated and Suillus collinitus-inoculated plants, and on naturally regenerated trees. A total of 461 single ectomycorrhizas was typed using PCR-RFLP analysis and sequencing of the internal transcribed spacer ( ITS) of the nuclear rDNA. Twelve ITS RFLP-taxa were detected. The ectomycorrhizal fungus S. collinitus ( ITS RFLP-taxon 1) was the most abundant (45.8 - 59.7%) species in the three treatments, suggesting that it is a strong ectomycorrhizal competitor in this site. S. mediterraneensis ( ITS RFLP-taxon 2) was restricted to control and naturally regenerated trees and was unequally moderate (11.7 - 31.9%). The remaining below-ground ITS RFLP-taxa were uncommon and rare (0.0 - 9.6%). The current experimental P. halepensis plantation showed a species-poor community dominated by two Suillus species. Ecological strategies of these symbionts are discussed., Diversité ectomycorhizienne dans une plantation à Pinus halepensis. La diversité génétique des ectomycorhizes de plants de P. halepensis a été examinée une année et demie après introduction dans un site incendié de Rieucoulon (Hérault, France). Cette diversité a été caractérisée à l’aide du polymorphisme de fragments de restriction (RFLP) et du séquençage de l’espaceur interne transcrit (ITS) de l’ADN ribosomal nucléaire. Trois traitements ont été examinés : des plants témoins, des plants mycorhizés avec Suillus collinitus et des plants en régénération naturelle. Au total, 461 ectomycorhizes ont été soumises au typage moléculaire. Douze ribotypes d’ITS ont été détectés. S. collinitus (ribotype 1) est l’espèce dominante (45,8–59,7 %) dans les trois traitements suggérant une forte capacité de colonisation dans ce site. La présence de S. mediterraneensis (ribotype 2) est limitée aux plants témoins et aux autres issus de la régénération naturelle et sa fréquence est modérée (11,7–31,9 %). Les autres symbiotes ectomycorhiziens sont rares (0,0–9,6 %) et leur abondance diffère d’un traitement à l’autre. Cette étude révèle une faible diversité des symbiotes ectomycorhiziens dans la plantation à P. halepensis; elle est dominée par deux espèces du genre Suillus. Les stratégies écologiques de ces symbiotes sont discutées.
- Published
- 2004
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