5 results on '"Agreda, Jesús"'
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2. Two simultaneous left ventricular aneurysms not following a coronary distribution: Thinking outside the box includes considering chagas cardiomyopathy
- Author
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Achury, Maria Daniela Valderrama, Torres, Daniela, Forero, Julian F., Chálela, Carlos Guerrero, Agreda, Jesus, Medina, Hector, and Chetrit, Michael
- Published
- 2025
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3. Homoquiralidad biológica y el análisis de redes estequiométricas: el modelo de Frank y sus variantes
- Author
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Montoya, Andrés, Mejía, Carolina, and Agreda, Jesús
- Subjects
mecanismos de reacción ,autocatálise ,autocatálisis ,análise de redes estequiométricas ,feedback ,Homochirality ,homoquiralidad ,stoichiometric network analysis ,retroalimentación ,mecanismos de reação ,retroalimentação ,chemical reaction mechanisms ,autocatalysis ,análisis de redes estequiométricas ,homoquiralidade - Abstract
Biological homochirality is modelled using chemical reaction mechanisms that include autocatalytic and inhibition reactions as well as input and output flows. From the mathematical point of view, the differential equations associated with those mechanisms have to exhibit bistability. The search for those bifurcations can be carried out using stoichiometric network analysis. This algorithm simplifies the mathematical analysis and can be implemented in a computer programme, which can help us to analyse chemical networks. However, regardless of the reduction to linear polynomials, which is made possible by this algorithm, in some cases, the complexity and length of the polynomials involved make the analysis unfeasible. This problem has been partially solved by extending the stoichiometric matrix with rows that code the duality relations between the different reactions occurring in the network given as input. All these facts allow us to analyse 28 different network models, highlighting the basic requirements needed by a chemical mechanism to have spontaneous mirror symmetry breaking. Resumen El origen de la homoquiralidad biológica se ha modelado usando mecanismos de reacción con pasos autocatalíticos, de inhibición y flujos de entrada y salida. Desde el punto de vista de las matemáticas, las ecuaciones diferenciales asociadas a tales mecanismos deben exhibir biestabilidad. La búsqueda de tales bifurcaciones se puede hacer usando el análisis de redes estequiométricas. Tal algoritmo facilita el trabajo matemático y se puede implementar en un programa de computadora, con lo que se simplifica el análisis y ayuda a entender y mejorar los mecanismos de reacción. No obstante, y a pesar de la reducción en la complejidad que es alcanzada usando el análisis de redes estequiométricas, la dificultad y la longitud de los polinomios involucrados hacen que, en los casos más difíciles y de mayor envergadura, la solución de estos no sea posible. En este trabajo se ha superado parcialmente el problema, adicionando a la matriz estequiométrica un conjunto de filas que codifican la relación de dualidad entre las diferentes reacciones presentes en la red química dada como entrada al programa. Así, hemos logrado analizar 28 modelos diferentes de homoquiralidad biológica, extrayendo de ellos el conjunto de requisitos necesarios para tener un modelo cinética y termodinámicamente consistente. Resumo A origem da homoquiralidade biológica foi modelada usando mecanismos de reação com etapas autocatalíticas, de inibição e fluxos de entrada e saída. Do ponto de vista da matemática, as equações diferenciais associadas a tais mecanismos devem ser instáveis. A instabilidade pode ser estudada usando o algoritmo de análise de redes estequiométricas. Tal algoritmo facilita o trabalho matemático e pode ser implementado num programa de computador, o que simplifica a análise e ajuda a entender e melhorar os mecanismos de reação. No entanto, e apesar da redução na complexidade que é alcançada usando a análise de redes estequiométricas, a complexidade e comprimento dos polinômios envolvidos fazem que, nos casos mais complexos e de maior envergadura, a solução dos mesmos não seja possível. Neste trabalho, o problema foi superado, parcialmente, adicionando à matriz estequiométrica um conjunto de linhas que codificam a relação de dualidade entre as diferentes reações presentes na rede química dada como entrada ao programa. Desta forma foi possível analisar 28 modelos diferentes de homoquiralidade biológica, extraindo deles o conjunto de requisitos necessários para ter um modelo cinético e termodinamicamente consistente.
- Published
- 2022
4. Linear stability analysis of chemical mechanism, Listanalchem: A tool for the search of spontaneous mirror symmetry breaking
- Author
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Cruz, Elkin, Montoya, Andrés, and Ágreda, Jesús
- Published
- 2023
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5. DEVELOPMENT OF FLOW INJECTION ANALYSIS METHODS BY CLASSICAL PROCEDURES: Determination of Pb in water
- Author
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Pérez, Walter, Castillo, Elianna, and Agreda, Jesús
- Subjects
cethyltrimethylammonium bromide (CTAB) ,lcsh:Chemistry ,Pb(II)-ditizona ,Flow-injection analysis (FIA) ,bromuro de cetiltrimetil amônio (CTAB) ,Pb(II)-Dithizone complex ,lcsh:QD1-999 ,implementação de método de fluxo ,implementación de métodos en flujo ,análisis por inyección en flujo (FIA) ,flow injection methods implementation ,Análise por injeção em fluxo (FIA) ,bromuro de cetiltrimetil amonio (CTAB) - Abstract
El análisis químico día a día se acerca más a la automatización, buscando satisfacer las necesidades actuales de resultados rápidos y confiables. Los sistemas de análisis en flujo (FIA - Flow Injection Analysis) son una de las formas de aproximarse a la automatización. En este artículo se presentan los pasos necesarios para implementar una metodología FIA, para la determinación de Pb(II) en agua, partiendo de la revisión de los procedimientos clásicos y describiendo detalladamente los pasos necesarios para implementar la técnica de análisis en flujo. El trabajo produjo un método de análisis de Pb en agua que usa ditizona disuelta en isopropanol (agente cromogénico), en presencia de bromuro de cetiltrimetil amonio (CTAB), para solubilizar en agua el complejo, cuyas características más sobresalientes fueron: volumen de inyección de muestra de 81,7 µL, velocidad de flujo de 8,0 mL/min, tiempo de toma de espectros 1,4 s e intervalo lineal de 1,0 a 40 mg L-1. Chemical analysis has evolved towards automation to satisfy the current requirements: fast analysis and certainty in the results. Flow injection analysis (FIA) is a way to reach automation. This work presents the necessary steps to obtain an optimized FIA methodology for the determination of Pb(II) in water by classic methods. The result was a FIA method to determinate Pb with dithizone (chromogenic agent) dissolved in iso-propyl alcohol, using cethyltrimethylammonium bromide (CTAB) to solubilize the complex. The main characteristics of the method were: injection sample volume 81.7 µL, flow 8.0 mL/min, spectra acquisition time 1.4 s and linear range 1 to 40 mg L-1. Cada dia, a análise química é mais cerca da automatização com o fim de satisfazer as necessidades atuais de resultados rápidos e confiáveis. Os sistemas de análise em fluxo (FIA - Flow Inyection Analysis) são uma das formas de aproximação à automatização. Este artigo apresenta os passos necessários para implementar uma metodologia FIA para a determinação de Pb(II) em água, partindo da revisão dos procedimentos clássicos e descrevendo detalhadamente os passos necessários para implementar a técnica de análise em fluxo. Os resultado são um método de análise de Pb em água que usa ditizona dissolvida em isopropanol (agente cromogénico) na presença de bromuro de cetiltrimetil amônio (CTAB), usado para solubilizar o complexo em água. As características principais do método foram: volume de injeção de amostra de 81,7 µL, velocidade de fluxo de 8,0 mL min-1, tempo de aquisição de espectros de 1,4 s e intervalo linear de 0.9 a 40 mg L-1.
- Published
- 2011
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