Search

De voorlopige resultaten zijn beschreven van de ontwikkeling van een indicator voor de functionele diversiteit van microbiele populaties met behulp van microtiterplaten van Biolog. Voor dit doel werden zowel aquatische als terrestrische milieu monsters getoetst. Het rapport beschrijft de experimentele procedure en de uitwerking van de meetgegevens. In het rapport worden twee biodiversiteitsindicatoren onderscheiden, berekend uit de log-logistische relatie tussen de gemeten activiteit en het aantal kolonie vormende eenheden (CFU). Een indicator is de helling in het buigpunt, de andere indicator is de logaritme van de CFU die nodig is om 50% van de maximale activiteit te bereiken. De functionaliteit van de indicatoren wordt bediscussieerd.

In dit artikel wordt de rol van de microbiële gemeenschap in de darm van vissen beschreven en wordt een overzicht gegeven van de belangrijkste huidige kennis en inzichten. Ook wordt een korte beschrijving gegeven van het ministerie van EL&I (voormalig LNV) gefinancierde project "Visgezondheid in RAS" en wordt aangestipt wat we verwachten te leren van dit project.

The field of Rhodococcus cell engineering is rapidly advancing because of the availability of improved genetic tools and increased insights in their broad catabolic and biochemical diversity. Rhodococci harbor large linear plasmids that may contribute to their catabolic diversity. In addition, multiple pathways and gene homologs are often present, thus further increasing Rhodococcus catabolic versatility and efficiency. The recent development of effective genetic tools for Rhodococcus, such as unmarked gene deletion, transposon-based mutagenesis, and gene expression systems, now allows the construction of biocatalysts with desirable properties for industrial purposes. This is exemplified here by a description of cell engineering of biocatalysts for improved desulphurization and steroid biotransformation.

Bitterzoet wordt beschouwd als een belangrijke factor in de overleving van de bruinrotbacterie, veroorzaker van bruinrot in aardappel, in oppervlaktewater in Nederland. Onderzoek heeft geleid tot verbeterde inzichten in de ecologie en beheersmogelijkheden van bitterzoet langs watergangen

Termite-derived methane contributes 3 to 4% to the total methane budget globally. Termites are not known to harbor methane-oxidizing microorganisms (methanotrophs). However, a considerable fraction of the methane produced can be consumed by methanotrophs that inhabit the mound material, yet the methanotroph ecology in these environments is virtually unknown. The potential for methane oxidation was determined using slurry incubations under conditions with high (12%) and in situ (∼0.004%) methane concentrations through a vertical profile of a termite ( Macrotermes falciger ) mound and a reference soil. Interestingly, the mound material showed higher methanotrophic activity. The methanotroph community structure was determined by means of a pmoA -based diagnostic microarray. Although the methanotrophs in the mound were derived from populations in the reference soil, it appears that termite activity selected for a distinct community. Applying an indicator species analysis revealed that putative atmospheric methane oxidizers (high-indicator-value probes specific for the JR3 cluster) were indicative of the active nest area, whereas methanotrophs belonging to both type I and type II were indicative of the reference soil. We conclude that termites modify their environment, resulting in higher methane oxidation and selecting and/or enriching for a distinct methanotroph population.

In dit artikel wordt de rol van de microbiële gemeenschap in de darm van vissen beschreven en wordt een overzicht gegeven van de belangrijkste huidige kennis en inzichten. Ook wordt een korte beschrijving gegeven van het ministerie van EL&I (voormalig LNV) gefinancierde project "Visgezondheid in RAS" en wordt aangestipt wat we verwachten te leren van dit project.

Met de afnemende beschikbaarheid van chemische gewasbeschermingsmiddelen, is de land- en tuinbouw steeds meer aangewezen op de natuurlijke, ziekteonderdrukkende eigenschappen van de bodem. In een ziektewerende grond zal, ondanks de aanwezigheid van een ziekteverwekker, geen of weinig schade optreden in een vatbaar gewas. Het microbiële bodemleven is hierbij een belangerijke factor. Een rijk en divers bodemleven kan goede concurrenten of antagonisten tegen ziekteverwekkers bevatten. De samenstelling van het bodemleven is afhankelijk van de fysische en chemische eigenschappen van de bodem. Toevoeging van organische stof kan de fysische- en chemische variatie in de grond verhogen en daarmee ook de bodembiodiversiteit. Maar, zorgt meer organische stof ook altijd voor een hogere bodemweerbaarheid? Dit is onderzocht in het project TopSoil + (2005-2009)

Met de afnemende beschikbaarheid van chemische gewasbeschermingsmiddelen, is de land- en tuinbouw steeds meer aangewezen op de natuurlijke, ziekteonderdrukkende eigenschappen van de bodem. In een ziektewerende grond zal, ondanks de aanwezigheid van een ziekteverwekker, geen of weinig schade optreden in een vatbaar gewas. Het microbiële bodemleven is hierbij een belangerijke factor. Een rijk en divers bodemleven kan goede concurrenten of antagonisten tegen ziekteverwekkers bevatten. De samenstelling van het bodemleven is afhankelijk van de fysische en chemische eigenschappen van de bodem. Toevoeging van organische stof kan de fysische- en chemische variatie in de grond verhogen en daarmee ook de bodembiodiversiteit. Maar, zorgt meer organische stof ook altijd voor een hogere bodemweerbaarheid? Dit is onderzocht in het project TopSoil + (2005-2009)

In dit artikel wordt de rol van de microbiële gemeenschap in de darm van vissen beschreven en wordt een overzicht gegeven van de belangrijkste huidige kennis en inzichten. Ook wordt een korte beschrijving gegeven van het ministerie van EL&I (voormalig LNV) gefinancierde project "Visgezondheid in RAS" en wordt aangestipt wat we verwachten te leren van dit project.

The provisional results have been described of the development of an indicator for the functional diversity of microbial populations by use of Biolog microtiterplates. Aquatic as well as terrestrial environmental samples were tested. The report describes the experimental procedure and the manipulation of the measured data. Two diversity indicators are distinguished, both calculated from the log logistic relation of the measured activity and the number of colony forming units (CFU). One indicator is the slope in the point of inflection and the other is the logarithm of the CFU necessary for 50% of the maximal activity. The functionality of the proposed indicators is discussed.

The provisional results have been described of the development of an indicator for the functional diversity of microbial populations by use of Biolog microtiterplates. Aquatic as well as terrestrial environmental samples were tested. The report describes the experimental procedure and the manipulation of the measured data. Two diversity indicators are distinguished, both calculated from the log logistic relation of the measured activity and the number of colony forming units (CFU). One indicator is the slope in the point of inflection and the other is the logarithm of the CFU necessary for 50% of the maximal activity. The functionality of the proposed indicators is discussed.

Met de afnemende beschikbaarheid van chemische gewasbeschermingsmiddelen, is de land- en tuinbouw steeds meer aangewezen op de natuurlijke, ziekteonderdrukkende eigenschappen van de bodem. In een ziektewerende grond zal, ondanks de aanwezigheid van een ziekteverwekker, geen of weinig schade optreden in een vatbaar gewas. Het microbiële bodemleven is hierbij een belangerijke factor. Een rijk en divers bodemleven kan goede concurrenten of antagonisten tegen ziekteverwekkers bevatten. De samenstelling van het bodemleven is afhankelijk van de fysische en chemische eigenschappen van de bodem. Toevoeging van organische stof kan de fysische- en chemische variatie in de grond verhogen en daarmee ook de bodembiodiversiteit. Maar, zorgt meer organische stof ook altijd voor een hogere bodemweerbaarheid? Dit is onderzocht in het project TopSoil + (2005-2009)

Bitterzoet wordt beschouwd als een belangrijke factor in de overleving van de bruinrotbacterie, veroorzaker van bruinrot in aardappel, in oppervlaktewater in Nederland. Onderzoek heeft geleid tot verbeterde inzichten in de ecologie en beheersmogelijkheden van bitterzoet langs watergangen