12 pages, 6 figures, 4 tables, [EN] In some routine studies of larval condition based on RNA:DNA ratios, heads and/or guts are removed for further age and feeding analysis. Also, during capture larvae are often found with their eyes missing. In this work we analysed tissues effects (muscle, head, eye, gut and the whole larvae) on RNA:DNA ratios from different species (Sardina pilchardus, Engraulis encrasicolus, Atherina presbyter and Paralichthys orbignyanus) in different developmental stages and from different locations. For all species and development phases, it was shown that RNA:DNA ratios in the head were significantly lower than in muscle or gut. The comparison of RNA:DNA ratios of head with or without eyes did not show significant differences. In a comparison of results from muscle from two tail sections, RNA:DNA ratios were higher for the anterior section in Sardina pilchardus and Engraulis encrasicolus larvae. Caution is needed when RNA:DNA ratios are compared with other studies employing different dissection protocols. For the species studied we propose conversion factors to be applied to RNA:DNA ratio data when different body sections are analysed. We discuss the most appropriate tissues for assessing nutritional condition in fish larvae, based on trends in concentrations of nucleic acids and ratios during starvation experiments, [ES] Efecto del tipo de tejido sobre los cocientes ARN:ADN en larvas de peces marinos. – En estudios de condición nutricional larvaria basados en la relación ARN:ADN, las cabezas y/o tubos digestivos suelen diseccionarse para posteriores estudios de edad o alimentación. Además, durante la captura algunas larvas pierden los ojos. En este trabajo analizamos el efecto de diferentes tejidos (músculo, cabeza, ojos y tubo digestivo) sobre la relación ARN:ADN en Sardina pilchardus, Engraulis encrasicolus, Atherina presbyter y Paralichthys orbignyanus, en diferentes estadios de desarrollo y en diversas regiones. En todas las especies la relación ARN:ADN en la cabeza fue significativamente menor que para el músculo o el tubo digestivo. La comparación de la relación ARN:ADN de la cabeza con o sin ojos no mostró diferencias significativas. Al comparar dos secciones de músculo de la cola en Sardina pilchardus y Engraulis encrasicolus se observó mayor ARN:ADN en la parte anterior que en la posterior. Es necesaria precaución cuando se comparan ARN:ADN entre estudios que emplean diferentes protocolos de disección. Proponemos factores de conversión para ser aplicados a las relaciones ARN:ADN cuando se analizan diferentes secciones del cuerpo. Se discute cuales son los tejidos más apropiados para determinar la condición nutricional de larvas de peces, basados en las concentraciones de ácidos nucleicos y sus cocientes obtenidos en experimentos de inanición, This work was partially funded by the Spanish CTM2004-03510-C02-01/MAR Project, the “Centre de Referència de Recerca i Desenvolupament en Aqüicultura (CRA-CIRIT)” of the “Generalitat de Catalunya” and the Portuguese “Fundação para a Ciência e a Tecnologia” that financed the sabbatical grant to Maria Alexandra Chícharo (SFRH/BSAB/745 /2007), financed by Portuguese “Fundação para a Ciência e a Tecnologia” and by the Spanish CTM2004-03510 C02-01/MAR Project. M.V. Díaz acknowledges MAEC-AECI Fellowship support from the Agencia Española de Cooperación Internacional