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La sacralización de la quinta vértebra lumbar corresponde a una patología escasamente reportada en la literatura bioarqueológica de las poblaciones del Norte Grande de Chile. En este artículo, se presentan dos casos observados en grupos prehispánicos de la costa desértica de la región de Antofagasta, distanciados tanto espacial como cronológicamente; uno de ellos corresponde al caso más temprano de esta anomalía ósea para el norte de Chile. El diagnóstico de esta condición fue realizada a través de criterios discriminantes morfológicos que permitieron la clasificación de forma y orientación de los rasgos patológicos observados. Considerando la asociación a factores genéticos que posee la manifestación de esta patología, junto con la descripción histórica de las formas de elaboración de alianzas matrimoniales que tenían los habitantes del área de estudio al momento de contacto hispano-indígena, en este trabajo exploramos la posibilidad de que su aparición pueda ser el resultado de prácticas sociales endogámicas. Estas habrían estado limitadas a la zona costera y fueron mantenidas tradicionalmente, por lo menos hasta momentos históricos.