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2. Genetic diversity of tropical-adapted onion germplasm assessed by RAPD markers Diversidade genética em germoplasma tropical de cebola estimada via marcadores RAPD
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Maria do Desterro M dos Santos, Carlos Francisco Ragassi, Maria Esther de N Fonseca, Anne Gizelle R Buzar, Valter R Oliveira, Paulo César T de Melo, and Leonardo S Boiteux
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Allium cepa ,molecular markers ,marcadores moleculares ,melhoramento genético ,plant breeding ,lcsh:SB1-1110 ,lcsh:Plant culture - Abstract
Onion is a crop of significant socioeconomic importance to Brazil. Onion germplasm with adaptation to tropical and sub-tropical conditions has played an important role in the development of this crop in the country. In this context, we studied the genetic diversity in a germplasm collection potentially useful for the development of cultivars for tropical and subtropical regions. The genetic variability of 21 accessions/cultivars that have been used as germplasm and/or were developed by onion breeding programs in Brazil was evaluated via RAPD markers. The following accessions were included in the study :'Red Creole', 'Roxa IPA-3', 'Valenciana 14', 'Beta Cristal', 'Diamante', 'Composto IPA-6', 'Aurora', 'Bojuda Rio Grande', 'Alfa Tropical', 'Pêra IPA-4', 'Primavera', 'Belém IPA-9', 'Crioula Alto Vale', 'Conquista', 'Pira-Ouro', 'Vale-Ouro IPA-11', 'Franciscana IPA-10', 'Serrana', 'CNPH 6400', 'Petroline', and 'Baia Periforme'. From the 520 primers used in the initial screening only 38 displayed stable polymorphisms. They produced 624 amplicons, of which 522 (83.7%) were monomorphic and 102 (16.3%) were polymorphic. An average similarity coefficient of 0.72 was calculated among accessions based upon this subgroup of polymorphic amplicons. This allowed the discrimination of this germplasm collection into six groups with only one of them comprising more than one accession. The main group was formed by 16 accessions ('Diamante', 'Composto IPA-6', 'Aurora', 'Bojuda Rio Grande', 'Conquista', 'Pira-Ouro', 'Serrana', 'Vale-Ouro IPA-11', 'Baia Periforme', 'Primavera', 'Franciscana IPA-10', 'Belém IPA-9', 'Crioula Alto Vale', 'Petroline', 'Pêra IPA-4' and 'Alfa Tropical'), for which the genetic origin (with few exceptions) can be traced back to the variety 'Baia Periforme'. The populations 'Red Creole', 'Roxa IPA-3', 'Beta Cristal', 'CNPH 6400', and 'Valenciana 14' comprised a set of five isolated groups, showing genetic divergence among them and in relation to main 'Baia Periforme' group. This germplasm displayed a relatively low genetic diversity, with the predominance of materials originated from the base population 'Baia Periforme'. There are, however, some accessions, which can add genetic diversity to this germplasm and they can be exploited by onion breeding programs aiming to develop cultivars for tropical regions of the world.A cebola é uma cultura de expressiva importância socioeconômica para o Brasil. Marcantes contribuições para o desenvolvimento da cultura têm sido feitas utilizando-se germoplasma de cebola adaptado às regiões tropicais e subtropicais. Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade genética existente em uma coleção de germoplasma potencialmente útil ao desenvolvimento de cultivares para essas regiões. Para isso, a variabilidade genética de um grupo de 21 acessos foi analisada via marcadores RAPD. Esses acessos ('Red Creole', 'Roxa IPA-3', 'Valenciana 14', 'Beta Cristal', 'Diamante', 'Composto IPA-6', 'Aurora', 'Bojuda Rio Grande', 'Alfa Tropical', 'Pêra IPA-4', 'Primavera', 'Belém IPA-9', 'Crioula Alto Vale', 'Conquista', 'Pira-Ouro', 'Vale-Ouro IPA-11', 'Franciscana IPA-10', 'Serrana', 'CNPH 6400', 'Petroline' e 'Baia Periforme') têm sido empregados como germoplasma e/ou foram desenvolvidos pelos programas de melhoramento genético de cebola conduzidos no Brasil. Dos 520 iniciadores ('primers') utilizados na triagem inicial, somente 38 confirmaram polimorfismos entre os 21 acessos. Esses 38 'primers' produziram 624 amplicons, dos quais 522 (83,7%) foram monomórficos e 102 (16,3%) polimórficos. Com base nos padrões revelados, seis grupos foram formados de acordo com a similaridade média global entre os acessos (= 0,72). Somente um desses seis grupos englobou mais de um acesso. O grupo principal (formado por 16 acessos) incluiu, predominantemente, as cultivares que apresentam no seu pedigree a contribuição de 'Baia Periforme' ('Diamante', 'Composto IPA-6', 'Aurora', 'Bojuda Rio Grande', 'Conquista', 'Pira-Ouro', 'Serrana', 'Vale-Ouro IPA-11', 'Baia Periforme', 'Primavera', 'Franciscana IPA-10', 'Belém IPA-9', 'Crioula Alto Vale', 'Petroline', 'Pêra IPA-4' e 'Alfa Tropical'). As cultivares 'Red Creole', 'Roxa IPA-3', 'Beta Cristal', 'CNPH 6400' e 'Valenciana 14' formaram agrupamentos isolados e distintos do grupo 'Baia Periforme', revelando, dessa forma, divergência genética entre essas cinco populações e o grupo principal. Verificou-se que os materiais estudados possuem base genética relativamente estreita, apresentando, em sua grande maioria origem na população 'Baia Periforme'. Existem, no entanto, alguns materiais divergentes, cuja diversidade pode ser explorada em programas de melhoramento.
- Published
- 2012
3. Identificação dos citoplasmas 'S', 'T' e 'N' via PCR em populações de cebola no Vale do São Francisco Identification of 'S', 'T' and 'N' cytoplasm via PCR in onion populations in the Sao Francisco river Valley, Brazil
- Author
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Carlos Antonio F Santos, Daniela L Leite, Nivaldo D Costa, Valter R Oliveira, Ierla Carla N dos Santos, and Marciene A Rodrigues
- Subjects
hybrids ,Allium cepa ,macho-esterilidade ,PCR ,híbrido ,lcsh:SB1-1110 ,lcsh:Plant culture ,male-sterility - Abstract
A identificação do tipo de citoplasma em cebola foi facilitada com a publicação de primers de DNA específicos para os tipos "S", "T" e "N". O objetivo do presente trabalho foi identificar, por meio de marcadores moleculares, o tipo de citoplasma presente na cultivar de cebola BRS São Francisco e numa população experimental em desenvolvimento na Embrapa Semi-Árido, de forma a orientar o desenvolvimento de híbridos de cebola adaptados à região. Na amostra de 19 plantas da 'BRS Alfa São Francisco' observou-se a amplificação de fragmentos de 180 pb, ausência do fragmento de 414 pb com os primers 5'cob e a amplificação do fragmento de 473 pb dos primers OrfA501, indicando que o citoplasma presente nesta população é o citoplasma T. Foi também identificada a presença de citoplasma N na população BRS Alfa São Francisco. Na amostra de 44 plantas da população experimental cascuda-bronzeada observou-se a amplificação de produtos consistentes com os fragmentos de 180 e 414 pb dos primers 5'cob, bem como a amplificação de fragmento de 473 pb dos primers OrfA501, indicando que o citoplasma presente na população é o citoplasma S. Não foi identificada a presença de citoplasma N na população cascuda-bronzeada. Estes resultados indicam a possibilidade do desenvolvimento de híbrido tropical, tendo como base a cultivar BRS Alfa São Francisco, enquanto que, na população cascuda-bronzeada será necessário a introgressão do citoplasma "N" para o desenvolvimento de linhagens mantenedoras.The identification of the onion cytoplasm was obtained by the development of DNA specific primers to "S", "T" and "N" types. The goal of this work was the identification of the cytoplasm type in two different onion populations in the São Francisco river Valley, in order to facilitate the development of onion hybrids from Northeast Brazil. In the sample of 19 plants of the BRS Alfa São Francisco cultivar was observed the amplification of fragments of 180 bp and absence of the fragment of 414 bp of the 5'cob primers and the presence of fragment of 473 bp of the orfA501 primers, indicating that the cytoplasm of the population is the "T". Plants with cytoplasm N were also identified in the BRS Alfa São Francisco population. The amplification of consistent fragments with the 180 and 414 bp of 5'cob primers was observed in the sample of 44 plants of a Valenciana type population and, the presence of a fragment of 473 bp of orfA501 primers, indicating that the cytoplasm of the population is the "S". No plant with cytoplasm N was identified in the Valenciana population. The development of a tropical onion hybrid is possible, based on the BRS Alfa São Francisco cultivar, while in the Valenciana type, the introgression of N cytoplasm will be necessary.
- Published
- 2008
4. Productivity and quality of melon cultivated in a protected environment under different soil managements
- Author
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Lima, Carlos Eduardo P, primary, Fontenelle, Mariana R, additional, Ligoski, Gabriela R, additional, Madeira, Nuno R, additional, Oliveira, Valter R, additional, Pinheiro, Jadir B, additional, Gondim, Rubens S, additional, and Lima, Mirtes F, additional
- Published
- 2017
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5. Estimativa da diversidade genética de germoplasma de cebola via descritores morfológicos, agronômicos e bioquímicos Estimating genetic diversity of onion germplasm via morphological, agronomic, and biochemical descriptors
- Author
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Anne Giselle R Buzar, Valter R Oliveira, and Leonardo S Boiteux
- Subjects
germoplasma ,Allium cepa L ,distância genética ,genetic distance ,cebola subtropical ,tropical onion ,análise de agrupamento ,lcsh:SB1-1110 ,grouping analysis ,germplasm ,lcsh:Plant culture ,cebola tropical ,sub-tropical onion - Abstract
A divergência genética de 64 acessos de cebola (Allium cepa L.) tropicais e subtropicais do banco de germoplasma da Embrapa Hortaliças foi avaliada utilizando 23 descritores morfológicos, bioquímicos e agronômicos. A distância generalizada de Mahalanobis (D²) foi usada como medida de dissimilaridade e os métodos de otimização de Tocher e hierárquico do Vizinho mais Próximo foram empregados para o agrupamento dos acessos. O germoplasma de cebola avaliado apresentou base genética relativamente ampla. As cultivares EX 3000 e Régia foram os acessos geneticamente mais similares. A maior distância genética estimada foi entre os acessos VAL 14 e Beta Cristal. O método de otimização de Tocher proporcionou a formação de treze grupos, enquanto o procedimento hierárquico do vizinho mais próximo possibilitou a formação de doze grupos (corte com 43% de dissimilaridade) A maioria dos acessos dos tipos Grano e Granex, agronomicamente considerados de dias curtos e com ciclo de maturação precoce, se concentraram em mesmo grupo de similaridade genética. À exceção do acesso Tampico White, os demais acessos de bulbos brancos do tipo indústria (Beta Cristal; Dehydrator # 8; Dehydrator # 6; Primero e White Creole) exibiram estreito relacionamento. Os acessos TX 24, Baia Periforme Super Precoce, EX 3001, Excel, Red Creole, H 688, Franciscana IPA 10 e Roxa IPA 3 exibiram alta dissimilaridade genética. Os caracteres teor de açúcares totais, comprimento de bulbo, número de dias para a colheita, porcentagem de bulbos com diâmetro entre 70 e 90 mm e massa média de bulbos foram responsáveis por 58% de toda a variabilidade genética observada entre os acessos. O estudo da divergência entre acessos é importante subsídio na escolha de parentais divergentes e complementares a fim de desenvolver populações segregantes com ampla base genética em programas de melhoramento genético de cebolas tropicais.The genetic diversity of 64 tropical and subtropical onion accessions (Allium cepa L.) belonging to the Embrapa Hortaliças collection was estimated using 23 morphological, agronomic, and biochemical descriptors. Methods of multivariate statistical analysis (Mahalanobis' D² distances, Tocher's cluster analysis and nearest-neighbor method) were employed in order to obtain the average genetic distances among accessions and to perform the clustering. The onion germplasm displayed a relatively large genetic base. Cultivars EX 3000 and Régia were the two most similar accessions. The highest mean genetic distance was observed between cultivars VAL 14 and Beta Cristal. The Tocher's optimization method revealed the formation of 13 groups, whereas the nearest-neighbor method revealed the formation of 12 groups (cutting point of 43% of dissimilarity. The majority of the accessions belonging to Grano and Granex cultivars (agronomically classified as short-day and early-maturing types) clustered together in the same group. The white bulb accessions for processing (Beta Cristal; Dehydrator # 8; Dehydrator # 6; Primero and White Creole), with the exception of Tampico White, displayed a small genetic divergence. The accessions TX 24, Baia Periforme Super Precoce, EX 3001, Excel, Red Creole, H 688, Franciscana IPA 10 and Roxa IPA 3 displayed a large genetic divergence. The descriptors total sugar content, bulb length, number of days from planting to harvesting (i.e. plant cycle), percentage of bulbs with transversal diameter between 70 and 90 mm, and average bulb weight were responsible for 58% of the genetic variability present among accessions. Studies of divergence among accessions are important to choose divergent parentals but complementary genetic materials would allow the development of useful segregating populations with wide genetic basis for tropical onion breeding programs.
- Published
- 2007
6. Desafios e oportunidades para o agronegócio da cebola no Brasil The challenges and the oportunities for the onion agribusiness
- Author
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Nirlene J. Vilela, Nozomu Makishima, Valter R. Oliveira, Nivaldo D. Costa, João Carlos M. Madail, Waldemar P. Camargo Filho, Guido Boeing, and Paulo César T. de Melo
- Subjects
Alium cepa ,produção ,Allium cepa ,competitiveness ,importation ,lcsh:Plant culture ,importação ,agronegócio ,agribusiness ,lcsh:SB1-1110 ,production ,competitividade ,mercado ,commercialization - Abstract
Este trabalho teve por objetivo descrever alguns aspectos socioeconômicos relacionados à cebola no Brasil e detectar os principais desafios e oportunidades que o produto apresenta para o agronegócio. A cultura, de caráter tipicamente "familiar" (88%), gera cerca de 250 mil empregos somente no setor de produção. O consumo é estável em 85 mil t por mês. A consolidação do Mercosul e a conseqüente importação de cebola da Argentina somada à produção nacional tem causado excesso de oferta em alguns meses, gerando perdas e conseqüentes prejuízos para os produtores. O setor produtivo brasileiro necessita elevar o nível tecnológico para alcançar maior eficiência técnica e econômica. No entanto, é necessário que as regiões produtoras do Brasil e da Argentina tenham estabilidade de produção e que a quantidade ofertada seja suficiente para atender às necessidades de abastecimento em determinados períodos do ano, sem causar desequilíbio no mercado.The main objective of this work was to describe some socieconomic aspects of the onion production in Brazil and to detect the principal challenges and opportunities for the onion agribusiness. The onion cultivation in Brazil is a family activity (88%), generating about 250 thousand jobs directly involved in the production. The onion consumption in Brazil is nearly 85 thousand t per month. With the consolidation of the MERCOSUL, the onion import from Argentina and the national production has caused excess of supply in some months, generating losses and consequent damages for the producers. The Brazilian productive sector needs to improve the technological level of the onion production to reach greater technical and economic efficiency. However, it is necessary that Brazilian and Argentinian producers look for a better production forecast to avoid excess of supply during some periods of the year.
- Published
- 2005
7. Avaliação da diversidade genética em pimentão através de análise multivariada Assessment of genetic diversity in sweet pepper using multivariate analysis
- Author
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Valter R. Oliveira, Vicente Wagner D. Casali, Cosme Damião Cruz, Paulo Roberto G. Pereira, and Alessandro de L. e Braccini
- Subjects
produção ,Capsicum annuum L ,agronomic characteristics ,características agronômicas ,melhoramento ,lcsh:Plant culture ,yield ,índice de precocidade ,breeding ,análise de agrupamento ,index of cropping concentration ,lcsh:SB1-1110 ,método de Tocher ,index of earliness ,índice de concentração da produção ,cluster analysis ,Tocher's method - Abstract
A diversidade entre 133 genótipos de pimentão (Capsicum annuum L.), em relação a doze características agronômicas, foi avaliada através de técnicas de análise multivariada (distância D² de Mahalanobis, agrupamento pelo método de Tocher e dispersão em eixos cartesianos). O ensaio foi conduzido no período de 6 de outubro de 1993 a 19 de março de 1994, em condições de campo, no município de Viçosa (MG), em solo Podzólico vermelho-amarelo câmbico. O delineamento experimental utilizado foi blocos completos casualizados, com três repetições, sendo cada parcela composta por seis plantas (2,16 m²). Com a metodologia utilizada foi observada a colocação dos genótipos em quinze grupos. Os genótipos P-141-195-F10, P-142-270-F10, P-141-90-F13, cv. Apolo AG 511 e P-142-222-F13 destacaram-se pela diversidade e elevada produtividade (935 g/planta) e qualidade de frutos (frutos brilhantes, com formato cônico, de coloração verde-escura uniforme e com reduzida presença de deformações), o que os qualifica como promissores para serem utilizados em programas de melhoramento. As características com menor contribuição para a diversidade genética foram produção total de frutos por planta, número de dias para o início do florescimento, índice de concentração da colheita, diâmetro do caule e diâmetro do pedúnculo. As características de maior contribuição foram altura da primeira bifurcação, altura da planta, relação comprimento/largura do fruto e índice de precocidade.Diversity among 133 sweet pepper (Capsicum annuum L.) genotypes in relation to twelve agronomic characteristics was assessed through multivariate analysis techniques (Mahalanobis' D² distances, Tocher's cluster analysis, and dispersion graph analysis). The trial was carried out from October 6, 1993 to March 19, 1994, under field conditions, in Viçosa (MG), on a red yellow podzolic soil. The experimental design was a complete randomized block, with three replications, and each experimental plot was made up of six plants (2.16 m²). Through the analysis it was possible to cluster the sweet pepper genotypes in fifteen distinct groups. Genotypes P-141-195-F10, P-142-270-F10, P-141-90-F13, cv. Apolo AG 511 and P-142-222-F13 were the most divergent and showed the highest yields (935 g/plant) and fruit quality (bright, conical-shaped, uniformly dark green coloured fruits, with a reduced occurrence of deformations), which qualifies them as promising for genetic breeding programs. The characteristics that contributed less to genetic diversity were total yield per plant, number of days to begin flowering, index of cropping concentration, and stem and stalk diameter. Those with major contributions were firstly bifurcation and plant height, length/width ratio of fruits and index of earlyness.
- Published
- 1999
8. Reação de genótipos de cebola à mancha púrpura
- Author
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Pereira, Ricardo B, primary, Oliveira, Valter R, additional, Carvalho, Agnaldo DF, additional, and Pinheiro, Jadir B, additional
- Published
- 2016
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9. Genotipagem de polimorfismos associados com sistemas de macho-esterilidade em acessos de cebola adaptados ao Brasil
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Ragassi, Carlos Francisco, primary, Santos, Maria do Desterro M dos, additional, Fonseca, Maria Esther de N, additional, Oliveira, Valter R, additional, Buzar, Anne Giselle R, additional, Costa, Cyro P da, additional, and Boiteux, Leonardo S, additional
- Published
- 2012
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10. Genetic diversity of tropical-adapted onion germplasm assessed by RAPD markers
- Author
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Santos, Maria do Desterro M dos, primary, Ragassi, Carlos Francisco, additional, Fonseca, Maria Esther de N, additional, Buzar, Anne Gizelle R, additional, Oliveira, Valter R, additional, Melo, Paulo César T de, additional, and Boiteux, Leonardo S, additional
- Published
- 2012
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11. Ouro Verde MG 2: nova cultivar de mungo-verde para Minas Gerais Ouro Verde MG 2: new mungbean cultivar for Minas Gerais State, Brazil
- Author
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Rogério F. Vieira, Valter R. Oliveira, Clibas Vieira, and Cleide Maria F. Pinto
- Subjects
acamamento ,seed weight ,rendimento ,lcsh:SB1-1110 ,lcsh:Plant culture ,Vigna radiata ,peso de sementes ,yield ,lodging - Abstract
Dentre várias linhagens introduzidas do "Asian Vegetable Research and Development Center" (AVRDC), sobressaiu a linhagem VC 3984-B-2-B-4-1-B, que recebeu o nome de Ouro Verde MG 2. Suas sementes são verde-brilhantes e o peso de 1000 unidades varia de 43 a 51 g. O início da floração ocorre em torno de 33 dias após a emergência e a primeira vagem madura surge entre 23 e 33 dias. Por se tratar de espécie de maturação desuniforme, podem ser necessárias duas a quatro colheitas. As plantas podem atingir 95 cm de altura. As vagens são marrom-escuras e concentram-se na parte superior da planta. É suscetível a duas doenças que geralmente aparecem no final do ciclo de vida do mungo-verde: míldio-pulverulento (Erysiphe polygoni) e mancha-foliar-de-cercospora (Cercospora canescens). A 'Ouro Verde MG 2' é resistente ao acamamento, e o seu rendimento, em três ensaios instalados em dezembro, janeiro e fevereiro, variou de 1,5 a 2,0 t/ha. Esses rendimentos foram, em média, 12% superior ao da cultivar Ouro Verde.Among many accessions introduced from Asian Vegetable Research and Development Center (AVRDC), the VC 3984-B-2-B-4-1-B stood out and was named 'Ouro Verde MG 2'. The seeds are bright green and 1000-seed weight ranges from 43 to 51 g. Flowering starts approximately 33 days after emergence and the first pod ripens between 23 and 33 days later. As mungbean is a non-uniform maturation species, two to four harvests could be necessary. The plant can reach 95 cm high. The pods are dark brown and concentrated in the upper canopy. This cv. is susceptible to two diseases which generally appear late in the crop: powdery mildew (Erysiphe polygoni) and cercospora leaf spot (Cercospora canescens). 'Ouro Verde MG 2' is resistant to lodging. The yield measured in three experiments carried out in December, January, and February, ranged from 1.5 to 2.0 t/ha. In average, these yields were 12% superior than the achieved by the cultivar 'Ouro Verde'.
- Published
- 2002
12. Identificação dos citoplasmas "S", "T" e "N" via PCR em populações de cebola no Vale do São Francisco
- Author
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Santos, Carlos Antonio F, primary, Leite, Daniela L, additional, Costa, Nivaldo D, additional, Oliveira, Valter R, additional, Santos, Ierla Carla N dos, additional, and Rodrigues, Marciene A, additional
- Published
- 2008
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13. Estimativa da diversidade genética de germoplasma de cebola via descritores morfológicos, agronômicos e bioquímicos
- Author
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Buzar, Anne Giselle R, primary, Oliveira, Valter R, additional, and Boiteux, Leonardo S, additional
- Published
- 2007
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14. Cultivo do feijão-mungo-verde no verão em Viçosa e em Prudente de Morais
- Author
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Vieira, Rogério F., primary, Oliveira, Valter R., additional, and Vieira, Clibas, additional
- Published
- 2003
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15. Ouro Verde MG 2: nova cultivar de mungo-verde para Minas Gerais
- Author
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Vieira, Rogério F., primary, Oliveira, Valter R., additional, Vieira, Clibas, additional, and Pinto, Cleide Maria F., additional
- Published
- 2002
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16. Avaliação da diversidade genética em pimentão através de análise multivariada
- Author
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Oliveira, Valter R., primary, Casali, Vicente Wagner D., additional, Cruz, Cosme Damião, additional, Pereira, Paulo Roberto G., additional, and Braccini, Alessandro de L. e, additional
- Published
- 1999
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17. Correlações canônicas entre componentes primários e secundários da produção de frutos em pimentão.
- Author
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Carvalho;, Claudio G. P. de, primary, Oliveira;, Valter R., additional, Casali;, Vicente W. D., additional, and Cruz., Cosme D., additional
- Published
- 1998
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