1. Isolation and characterization of a satellite DNA family in the Saccharum complex
- Author
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Karine Alix, Franc-Christophe Baurens, Florence Paulet, Jean-Christophe Glaszmann, and Angélique D'Hont
- Subjects
Séquence nucléotidique ,ADN ,Hybridation ,General Medicine ,Miscanthus sinensis ,F30 - Génétique et amélioration des plantes ,Saccharum ,PCR ,Électrophorèse ,Erianthus ,Genetics ,Molecular Biology ,Biotechnology - Abstract
La migration électrophorétique, sur gel d'agarose, de fragments résultant d'une restriction par l'endonucléase Taql d'ADN génomique, a permie d'isoler un ADN satellite de 371 pb spécifique du genre #Erianthus#, EaCIRI. Cette séquence présente 77% d'homologie avec un ADN satellite de 365 pb spécifique de #Helictotrichon convolutum#, ainsi que 72% d'homologie avec une séquence répétée en tandem de 353 pb spécifique de #Oryza sativa#. Des amorces PCR définies dans les zones conservées de ces séquences répétées ont permis d'isoler d'autres ADN satellites chez différents représentants du complexe #Saccharum# : SoCIRI chez #Saccharum officinarum#. SrCIR1 chez #Sacharum robustum#, SsCIR1 et SsCIR2 chez #Saccharum spontaneum# ainsi que MsCIR1 chez #Miscanthus sinensis#. EaCIR1 et SoCIR1 ont été localisés dans les régions subtélométriques des chromosomes, par hybridation #in situ# en fluorescence. La réalisation d'hybridations de type Southern, en utilisant deux représentants de cette famille de séquences répétées comme sondes, a illustré l'existence de la spécificité d'espèce de ces satellites, et démontré l'existence d'éléments répétés similaires chez le sorgho et la maïs.
- Published
- 1998
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