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RESUME La determination de la sequence genomique de plusieurs souches de Plasmodium falciparumet de plusieurs especes murines ou simiennes de Plasmodium a fourni une masse considerable de donnees sur ces parasites et sur les relations evolutives au sein de ce genre. L’annotation des genomes a identifie des cibles therapeutiques potentielles a divers stades. Pourtant, la connaissance des voies metaboliques, de la biologie et de la physiologie cellulaire reste encore tres fragmentaire. En effet, environ 50 % des genes demeure sans fonction attribuee. De plus, une fraction importante des sequences de P. falciparum n’a pas d’equivalent chez les especesmurines ou simiennes—et vice versa. Le developpement demethodes de criblage a haut debit au niveau du genome complet a ouvert de nouveaux horizons. L’analyse post-genomique du transcriptome et du proteome a divers stades de developpement au long du cycle biologique a dechiffre les premieres bases du programme d’expression, donnees qui se sont enrichies avec les premieres cartes d’interactome. Les defis qui sont devant nous sont ceux de la genomique fonctionnelle. Ils se heurtent aux difficultes logistiques des etudes de genetique formelle, a la lourdeur de la transfection pour P. falciparum, a la specificite d’espece de certaines cibles et processus physiologiques et a la necessite de developper les modeles experimentaux appropries pour evaluer de nouvelles cibles d’intervention.La biologie des populations dispose maintenant d’outils puissants pour etudier le polymorphisme et les flux geniques au sein des populations naturelles ainsi que l’impact de nouvelles interventions medicamenteuses, anti-vectorielles ou vaccinales sur les populations parasitaires.