1. Mitochondrial DNA variation in ranked caste groups of Maharashtra (India) and its implication on genetic relationships and origins
- Author
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Chitra M. Thakur, Partha P. Majumder, and Sangita Roy
- Subjects
Aging ,education.field_of_study ,Polymorphism, Genetic ,Physiology ,Epidemiology ,Population ,Public Health, Environmental and Occupational Health ,India ,Sequence Analysis, DNA ,Biology ,DNA, Mitochondrial ,Genetics, Population ,Gene Frequency ,Haplotypes ,Mutation ,Genetics ,Ethnicity ,Ethnology ,Humans ,education ,Humanities ,Phylogeny - Abstract
Arriere-plan: Les polymorphismes de l'ADN mitochondrial ont fait la preuve de leur utilite pour l'etude des origines et des parentes genetiques. Les origines des populations castees de l'Inde sont restees enigmatiques et les apparentements genetiques des castes ne sont pas uniformes d'une region geographique a une autre. But: Cette etude a ete entreprises pour analyser la nature et l'etendue des variations d'ADNmt ainsi que les relations des groupes castes de l'etat indien occidental du Maharashtra et pour examiner ce que les resultats impliquent quant a leurs origines. Sujets et methodes: Une population a ete selectionnee dans chacune des trois castes et des echantillons sanguins ont ete obtenus de sujets non apparentes pleinement informes du but de l'etude. Les populations ordonnees en castes etaient : le rang superieur (Brahmane; n = 31), rang moyen (Maratha; n = 41) et le rang inferieur (Nava Baudh; n = 40). On a etudie les polymorphismes de dix sites de restriction (RSPs) et d'un locus d'insertion/deletion (InDel). Le segment hypervariable 1 (SHV1) a ete sequence a partir d'un sous-ensemble des individus echantillonnes. Resultats: Quatre loci RSPs ont ete trouves monomorphiques dans les trois populations. Le locus InDel est monomorphique dans deux d'entre-elles (Brahmane et Maratha). Un haplotype construit sur la base des RSPs est predominant dans les trois groupes. La diversite haplotypique est de magnitude similaire chez les Maratha et les Nava Baudh (respectivement 68% et 64%), nettement plus elevee que chez les brahmanes (49%). La frequence de l'haplogroupe M est elevee dans les trois groupes, mais contrairement a ce qui etait attendu, elle est plus haute chez les brahmanes. Pres de 10% des brahmanes cependant portent l'haplogroupe C. Une large variation a ete trouvee dans la region du SHV1. Les diversites nucleotidiques et le nombre moyen de non appariements, ont une magnitude semblable dans les trois groupes. Conclusions: La caste superieure Brahmane est genetiquement distincte des castes moyenne et inferieure; cependant, sa frequence plus elevee de l'haplogroupe M, laisse penser qu'elle aurait pu recevoir des apports de population externes.
- Published
- 2003