1. Crystallization and preliminary X-ray analysis of Weissella viridescens FemX UDP-MurNAc-pentapeptide:l-alanine ligase
- Author
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Wladimir Sougakoff, Sabrina Biarrotte-Sorin, Didier Blanot, Jean Delettré, Michel Arthur, Antoine P. Maillard, Jean-Emmanuel Hugonnet, Claudine Mayer, Karine Blondeau, Pathogenèse bactérienne et réponses cellulaires (PBRC), Biologie du Cancer et de l'Infection (BCI ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de minéralogie, cristallographie de Paris (LMCP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut de Physique du Globe de Paris (IPG Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique et microbiologie [Orsay] (IGM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IPG PARIS-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio] ,chemistry.chemical_element ,Biology ,medicine.disease_cause ,Crystallography, X-Ray ,03 medical and health sciences ,chemistry.chemical_compound ,X-Ray Diffraction ,Structural Biology ,medicine ,Escherichia coli ,Peptide Synthases ,030304 developmental biology ,MESH: Crystallization ,chemistry.chemical_classification ,Alanine ,0303 health sciences ,DNA ligase ,Bacteria ,030306 microbiology ,MESH: Escherichia coli ,Resolution (electron density) ,MESH: X-Ray Diffraction ,MESH: Chromatography, Gel ,General Medicine ,MESH: Crystallography, X-Ray ,MESH: Peptide Synthases ,Matrix-assisted laser desorption/ionization ,Crystallography ,MESH: Bacteria ,Enzyme ,chemistry ,MESH: Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization ,Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization ,Chromatography, Gel ,Peptidoglycan ,Crystallization ,Selenium - Abstract
International audience; Synthesis of the cell-wall peptidoglycan of firmicutes involves a unique family of peptide-bond-forming enzymes that use amino-acyl-tRNAs as substrates and are referred to as Fem proteins as they are factors essential for methicillin resistance in Staphylococcus aureus. The FemX UDP-MurNAc-pentapeptide:l-alanine ligase of Weissella viridescens was overexpressed, purified and crystallized. Native data were collected to 1.7 A resolution. The crystals belong to space group P2(1), with unit-cell parameters a = 42.03, b = 99.92, c = 45.84 A, beta = 116.02 degrees. The asymmetric unit contains one molecule. A selenium-derivative data set has been collected to 2.1 A resolution at the peak wavelength of the selenium absorption edge. Six strong selenium positions were visible in the anomalous Patterson map. Three additional weaker Se atoms have been identified by anomalous Fourier synthesis.
- Published
- 2002
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