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Fish is thought to be the most appropriate for indication of toxicity in water. So, purpose of present study was to determine the concentrations of few metals (Na, K, Ca, Mg, Fe, Cd, Pb and Zn) in relation to the body size and condition factor in Scomberoides commersonnianus. A total of 73 samples of marine fish, S. commersonnianus with various sizes that ranged from 93.4-1180 g of body weight and total length 20.5-56.9cm were randomly collected from the Arabian Sea of Karachi Pakistan, for examination of elemental composition. The concentration of Calcium found maximum while Cadmium found minimum in S. commersonnianus. Concentrations of Zn showed highly significant (P0.05) with the fish size. Condition factor showed highly significant correlation (P0.05) with condition factor of S. commersonnianus. Resumo O peixe é considerado o mais adequado para indicação de toxicidade na água. Assim, o objetivo do presente estudo foi determinar as concentrações de alguns metais (Na, K, Ca, Mg, Fe, Cd, Pb e Zn) em relação ao tamanho corporal e fator de condição em Scomberoides commersonnianus. Foi coletado um total de 73 amostras de peixes marinhos, S. commersonnianus, com tamanhos que variaram de 93,4 a 1.180 g de peso corporal e comprimento total de 20,5 a 56,9 cm, aleatoriamente do Mar Arábico de Karachi, Paquistão, para exame de composição elementar. A concentração de Ca foi máxima, enquanto a de Cd foi mínima em S. commersonnianus. As concentrações de Zn mostraram-se altamente significativas negativas (P < 0,001), enquanto Na e Ca apresentaram forte correlação positiva com o tamanho dos peixes. As correlações de Pb, K e Mg foram menos significativas (P < 0,05) com o peso úmido e o comprimento total de S. commersonnianus. Já o Fe e o Cd permaneceram pouco correlacionados (P > 0,05) com o tamanho dos peixes. O fator de condição apresentou correlação altamente significativa (P < 0,001) com todos os metais estudados, exceto Cd e Pb, que foram encontrados correlacionados insignificantemente (P > 0,05) com o fator de condição de S. commersonnianus.

This study was conducted to determine the pathogenic bacteria load of 14 species of marine fish obtained from two suppliers (in Bitlis city, Turkey), which provide fish for fish markets, and to reveal the safety of the marine fish in terms of microbiological quality. The counts of total mesophilic aerobic bacteria (TMAB), Staphylococcus aureus, and Escherichia coli, the presence of Salmonella spp. and Listeria monocytogenes were determined in anchovy, horse mackerel, salmon, red mullet, gilthead seabream, bonito, pilchard, common sole, sand smelt, axillary seabream, seabass, Mediterranean horse mackerel, bluefish, and garpike. It was determined that common sole, axillary seabream, seabass, bluefish and Mediterranean horse mackerel obtained from both suppliers were unacceptable in terms of the counts of TMAB. Twenty-four samples exceeded the critical limit of S. aureus and all the samples were unacceptable according to the critical limit of E. coli. While L. monocytogenes was isolated from 50.0% of the samples, Salmonella spp. was isolated from 39.3% of the samples. These results showed that the pathogenic bacteria load of the analyzed marine fish was quite high and they were unsafe in terms of microbiological quality. Resumo Este estudo foi realizado para determinar a carga de bactérias patogênicas de 14 espécies de peixes marinhos obtidos de dois fornecedores (na cidade de Bitlis, Turquia), que fornecem peixes para mercados de peixes, e para revelar a segurança do peixe marinho em termos de qualidade microbiológica. As contagens de bactérias aeróbias mesófilas totais (TMAB), Staphylococcus aureus e Escherichia coli, a presença de Salmonella spp. e Listeria monocytogenes foram determinados em anchova, carapau, salmão, salmonete, dourada, bonito, sardinha, linguado, cheirado, dourada-axilar, robalo, carapau-do-mediterrâneo, anchova e garpike. Foi determinado que o linguado, o dourada-axilar, o robalo, a anchova e o carapau-do-mediterrâneo obtidos de ambos os fornecedores eram inaceitáveis nas contagens do TMAB. Vinte e quatro amostras excederam o limite crítico de S. aureus, e todas as amostras foram inaceitáveis de acordo com o limite crítico de E. coli. Enquanto L. monocytogenes foi isolada em 50.0% das amostras, Salmonella spp. foi isolado de 39.3% das amostras. Esses resultados mostraram que a carga de bactérias patogênicas dos peixes marinhos analisados era bastante alta e eles eram inseguros em termos de qualidade microbiológica.

In the Abrolhos Bank (Southwest Atlantic), multidimensional indicators were used in sustainability assessments of data‐poor reef fisheries. Potential impacts, risks and stocks vulnerabilities were evaluated based on biological, environmental, social and economic aspects by combining both adapted productivity and susceptibility analysis (PSA) and scale intensity consequence analysis (SICA). Data were obtained from local surveys with stakeholders and experts and from literature. A value chain map revealed final consumers at many locations and middleman presence. Vulnerability to overexploitation ranged from low (Cephalopholis fulva (L.), Lutjanus synagris (L.) and Ocyurus chrysurus (Bloch)) to moderate (Lutjanus jocu (Bloch & Schneider), Epinephelus morio (Val.) and Mycteroperca bonaci Poey). While moderate consequences of the catches were observed to C. fulva, major consequences were identified to the other five stocks. The main threat to coral reef habitats was found to be mining wastes. Poor governance may constrain fisheries sustainability in the region, while the empowerment of fishers in both governance and post‐harvest processes should enhance it.

This work aimed to obtain aspartic proteases of industrial and biotechnological interest from the stomach of the crevalle jack fish (Caranx hippos). In order to do so, a crude extract (CE) of the stomach was obtained and subjected to a partial purification by salting-out, which resulted in the enzyme extract (EE) obtainment. EE proteases were characterized physicochemically and by means of zymogram. In addition, the effect of chemical agents on their activity was also assessed. By means of salting-out it was possible to obtain a purification of 1.6 times with a yield of 49.4%. Two acid proteases present in the EE were observed in zymogram. The optimum temperature and thermal stability for EE acidic proteases were 55 ºC and 45 °C, respectively. The optimum pH and pH stability found for these enzymes were pH 1.5 and 7.0, respectively. Total inhibition of EE acid proteolytic activity was observed in the presence of pepstatin A. dithiothreitol (DTT) and Ca2+ did not promote a significant effect on enzyme activity. In the presence of heavy metals, such as Al3+, Cd2+ and Hg2+, EE acidic proteases showed more than 70% of their enzymatic activity. The results show that it is possible to obtain, from the stomach of C. hippos, aspartic proteases with high proteolytic activity and characteristics that demonstrate potential for industrial and biotechnological applications. Resumo Este trabalho objetivou obter proteases aspárticas de interesse industrial e biotecnológico a partir do estômago do peixe xaréu (Caranx hippos). Para isso, foi obtido um extrato bruto do estômago, o qual foi submetido a uma purificação parcial por salting-out onde se obteve o extrato enzimático (EE). As proteases do EE foram caracterizadas físico-quimicamente e através de zimograma. Além disso, o efeito de agentes químicos sobre sua atividade também foi avaliado. Através de salting-out foi possível obter uma purificação de 1,6 vezes com rendimento de 49,4%. Foram observadas duas proteases ácidas presentes no EE através de zimograma. A temperatura ótima e a estabilidade térmica para as proteases ácidas do EE foram de 55 ºC e 45 °C, respectivamente. O pH ótimo e a estabilidade ao pH encontrados para estas enzimas foram o pH 1,5 e 7,0, respectivamente. Observou-se a inibição total da atividade proteolítica ácida do EE na presença de pepstatina A. O ditiotreitol (DTT) e o Ca2+ não promoveram efeito significativo na atividade enzimática. Na presença de metais pesados, como Al3+, Cd2+ e Hg2+, o EE manteve mais de 70% de atividade enzimática do EE. Os resultados mostram que é possível obter, a partir do estômago de C. hippos, proteases aspárticas com alta atividade proteolítica e características que demonstram potencial para aplicações industriais e biotecnológicas.

Made available in DSpace on 2022-04-29T08:31:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2021-01-01 Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações The fishes of the Haemulidae family are currently allocated to 19 genera with a worldwide distribution in the tropical and subtropical waters of the world’s oceans. Brachygenys and Haemulon are important genera of reef fish in Brazil, as they occur in large shoals, which are both ecologically and commercially valuable. This study identified the Brazilian species of the genera Brachygenys and Haemulon using DNA barcodes. While we found only a single lineage in Brachygenys chrysargyrea, Haemulon melanurum, H. parra, and H. squamipinna, more than one molecular operational taxonomic unit (MOTU) was identified in H. atlanticus, H. aurolineatum, and H. plumieri, indicating the possible existence of discrete populations or cryptic species. Laboratório de Biologia e Genética de Peixes Departamento de Biologia Estrutural e Funcional Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho IBB/UNESP, R. Prof. Dr. Antonio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior Acervo Zoológico da Universidade de Santa Cecília AZUSC Universidade Santa Cecília UNISANTA, Rua Oswaldo Cruz, 266 Museu Paraense Emílio Goeldi – MPEG Avenida Governador Magalhães Barata Laboratório de Biologia e Genética de Peixes Departamento de Biologia Estrutural e Funcional Instituto de Biociências Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho IBB/UNESP, R. Prof. Dr. Antonio Celso Wagner Zanin, 250, Distrito de Rubião Junior FAPESP: 2016/09204–6 CNPq: 300462/2016– 6 CNPq: 300675/2019– 4 Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações: 300675/2019– 4 CNPq: 306054/2006 CNPq: 444338/2018–7 Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações: 444338/2018–7 FAPESP: ICAAF 017/2016

This study reports the importance to evaluate the length-weight relationships (LWR) across the years. We evaluate the LWR for 8 Sciaenidae species of Paranaguá Estuarine Complex, South Brazil, sampled between 2016 and 2018 by bottom trawls similar to the used by artisanal fisheries in this region. There were differences between growth type among the years for 5 species, and all species showed differences in the slope of LWR in at least one year. These results show the importance of fauna and fisheries monitoring programs to better evaluate the population dynamics and fisheries stocks.

Foram examinados os conteúdos estomacais de 38 exemplares de Conodon nobilis (Linnaeus, 1758) e de 14 exemplares de Pomadasys corvinaeformis (Steindachner, 1868) (Actinopterygii: Haemulidae) capturados entre novembro de 2003 e novembro de 2005 na Praia do Malhado (Ilhéus, estado da Bahia, litoral nordeste do Brasil). Foram identificadas 11 categorias alimentares para C. nobilis e 10 para P. corvinaeformis com predomínio de Crustacea Decapoda e escamas de Teleostei para C. nobilis e matéria orgânica digerida e Decapode para P. corvinaeformis.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2020. O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito da suplementação de um blend de ácidos orgânicos comercial (126,5 g kg -1 de formiato de amônio, 115,5 g kg -1 de ácido fórmico, 82,5 g kg -1 de ácidos graxos vegetais, 66,0 g kg -1 de ácido propiônico e 55,0 g kg -1 de ácido acético) na dieta de juvenis de 21 dias após a eclosão (DAE) (peso médio de 21 mg) do peixe-palhaço Amphiprion ocellaris durante 77 dias. Foram testados, em triplicata, cinco tratamentos com diferentes concentrações do blend de ácidos orgânicos: 5 g kg -1 (T5), 10 g kg -1 (T10), 15 g kg -1 (T15), 20 g kg -1 (T20), e dieta sem suplementação (T0). Para o pH das dietas, assim como para as análises enzimáticas e histológicas foram realizadas duas coletas, no 49o dia de experimento (70 DAE) e no 77o dia de experimento (98 DAE). Os parâmetros de desempenho zootécnico (sobrevivência, ganho de peso, taxa de crescimento específico em peso, crescimento diário em comprimento, consumo de ração, taxa de conversão alimentar e fator de condição) foram avaliados após 15, 30, 45, 49, 65 e 77 dias de experimento. O pH da ração diminuiu proporcionalmente com o aumento da suplementação do blend de ácidos orgânicos na dieta (p

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2020. A riqueza de espécies tem sido amplamente abordada visando entender os padrões que estruturam as comunidades biológicas. No entanto esta abordagem oferece uma visão incompleta do funcionamento do ecossistema, já que ela assume que as espécies são equivalentes, e perdas na diversidade são raramente compreendias apenas analisando a riqueza de espécies. Considerando essa incompleta visão e o continuo declínio da biodiversidade devido as interferências humanas, abordagens que levam em consideração o papel funcional das espécies no ecossistema, são chaves para compreender os processos evolutivos e ecológicos que determinam uma comunidade. A Teoria de Biogeografia de Ilhas é comumente abordada em estudos de diversidade taxonômica, porém estudos que abordam essa teoria em relação a diversidade funcional ainda são escassos. Trabalhos que visam entender como a diversidade funcional das espécies respondem às variações ambientais são cruciais para prever os efeitos das mudanças ambientais nos atributos, e por consequência, no funcionamento dos ecossistemas. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi investigar a diversidade funcional de peixes recifais em setenta e duas ilhas oceânicas ao redor do globo que diferem em área atual, área passada, idade e no grau de isolamento. Mais especificamente, este estudo avaliou padrões nos índices funcionais de riqueza (FRic), divergência (FDiv), equitabilidade (FEve), redundância (FOR) e vulnerabilidade (FVul) das assembleias de peixes recifais nessas ilhas. Para este objetivo foi utilizado dados de ocorrência de espécies. Posteriormente cada espécie foi classificada de acordo com seus atributos biológicos para então construir um espaço multidimensional usando uma matriz de dissimilaridade de Gower e Análise de Coordenadas Principais (PCoA). Os índices funcionais (FRic, FDiv FEve, FOR e Fvul) foram estimados para cada ilha oceânica a fim de verificar sua possível relação entre estes e a área submersa atual e passada da ilha, idade e grau de isolamento através de um modelo de regressão Beta. Nossos resultados demonstraram que a área atual, isolamento e idade influenciam nos padrões de diversidade funcional de peixes recifais em ilhas oceânicas tropicais. Foi observado um efeito positivo da área aos índices FRic, FDiv e FOR, uma vez que esses índices são correlacionados a riqueza de espécies. Por outro lado, a área teve um efeito negativo no FVul e FEve. O isolamento do continente teve um efeito positivo sobre o FVul e FEve, enquanto teve um efeito negativo sobre o FOR e FRic, podendo estar relacionado a menor riqueza de espécies em ilhas mais distantes da costa. Da mesma forma, uma maior intensidade de filtros ambientais atuando ao longo do isolamento podem ter influenciado a relação positiva entre FEve e isolamento. O fator idade da ilha apresentou uma relação negativa com a FVul e positiva com FOR, possivelmente devido a ilhas antigas contarem com um maior tempo de colonização, aumentando o número de espécies dentro das entidades funcionais. A distribuição dos índices foi divergente entre os reinos biogeográficos, sendo que FRic, FDiv e FOR foram maiores nos reinos Indo-Pacífico Central, Pacífico Central e Índico Ocidental, enquanto os outros índices foram maiores nos reinos do TEP e Atlântico. Tal padrão sugere a influência do refúgio no arquipélago indo-australiano durante o período do quaternário e da proximidade atual do centro de origem das espécies de peixes recifais. Através desses resultados foi possível observar que a diversidade funcional segue um padrão semelhante a riqueza de espécies em relação à teoria de biogeografia de ilhas. Por fim, a integração da ecologia funcional na biogeografia de ilhas fornece uma melhor compreensão sobre a distribuição dos atributos biológicos em função das características do habitat. Abstract: Species richness has been widely addressed to understand the patterns that structure biological communities. However, this approach provides an incomplete vision into ecosystem functioning, since it assumes that species are equivalent, and biodiversity loss is not completely understood through the species richness analysis. Considering this incomplete perception and the continuous decline in biodiversity due to human interference, approaches taking into account the functional species role are key to understanding the evolutionary and ecological processes that determine a community. Theory of Island Biogeography (TIB) is commonly addressed in studies of taxonomic diversity, but studies of TIB through functional diversity approach are still scarce. Studies that aim to understand how functional diversity responds to environmental changes are crucial to predict the effects of these changes on species traits, and consequently, on the ecosystems functioning. Thus, the goal of this study was to investigate the functional diversity of reef fish on seventy-two tropical oceanic islands that differ in current and past area, age and isolation of mainland. More specifically, this study aimed to evaluate the indices of functional richness (FRic), divergence (FDiv), evenness (FEve), over-redundancy (FOR) and vulnerability (FVul) of reef fish assemblage in these islands. In order to achieve that, species occurrence data was used, and each species was classified according to their biological traits to build a multidimensional space using a Gower dissimilarity matrix, and a Principal Coordinate Analysis (PCoA). Finally, the indices of FRic, FDiv, FEve, FOR and FVul were applied to each sample (i.e. oceanic islands) to verify the relationship between response variables (i.e. functional indices) and explanatory variables (i.e. current area, past area, age, and degree of isolation) through Beta regression model. Our results demonstrate that current area, isolation, and age influence patterns of functional diversity of reef fishes on tropical oceanic islands. A positive effect of area on the FRic, FDiv, and FOR indices was observed since these indices are correlated with species richness. On the other hand, the area had a negative effect on FVul and FEve. Isolation from the continent had a positive effect on FVul and FEve, while had a negative effect on FOR and FRic, which could be related to lower species richness in isolated islands. Likewise, a greater intensity of environmental filters acting along the isolation may influence the positive relationship between FEve and isolation. The island age showed a negative relationship with FVul and a positive relationship with FOR, possibly due to older islands have a longer colonization time, increasing the number of species within the functional entities. The indices distribution was divergent between the biogeographic realms, with FRic, FDiv, and FOR being higher in the Central-indo Pacific, Central Pacific, and Western Indian, while the other indices were higher in the TEP and Atlantic realms. This pattern suggests the influence of refuge in the Indo-Australian archipelago during the Quaternary period and also the closeness of the current reef fish centre of origin. Through these results, it is possible to observe that the functional diversity follows a similar pattern to species richness in relation to the Theory of Island Biogeography. Finally, integration of functional ecology in island biogeography provides a better understanding of biological traits distribution depending on the habitat characteristics.

Rising concentrations of plastics in the oceans are leading to increasing negative interactions with marine biota, including ingestion by endangered and/or economically important seafood species such as fish. In this paper, we visually evaluated plastic debris ingestion by 965 specimens of eight commercially exploited fish species from different marine habitats off the southeast-south coast of Brazil. All species ingested plastics, with pelagic animals having higher amounts, frequency of occurrence, diversity and sizes of ingested items than demersal-pelagic and demersal animals. Highest frequency of occurrence (FO%) of plastic ingestion (25.8%) was observed for the pelagic skipjack tuna Katsuwonus pelamis (Scombridae), and lowest (5%) for the demersal bluewing searobin Prionotus punctatus (Triglidae). Microplastics predominated in all species, and fibers/lines and fragments were the main items found, possibly derived from fishing materials. The most abundant plastic colors were transparent, black and blue, and the most common polymers were polyamide and polyurethane. With the available data, no relationship between the size of the individuals and amount of ingested plastics was observed. Considering the negative impacts of plastic ingestion on marine fish, and potentially on human health due to their consumption, understanding ingestion patterns is critical for better evaluating their origin and possible causes, and consequently for helping define prevention strategies for this problem.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2020. A temperatura deve ser mantida dentro de uma faixa ótima para a espécie durante a incubação e larvicultura, pois altera o tempo dos eventos ontogenéticos. O objetivo deste trabalho foi determinar uma faixa de temperatura para a incubação de ovos, sobrevivência e desenvolvimento inicial das larvas de tainha Mugil liza e sardinha- verdadeira Sardinella brasiliensis. A desova da tainha foi realizada após indução hormonal e os ovos na fase de fechamento do blastóporo (~24 h após a desova a 23 °C) foram incubados em 17, 20, 23, 26 e 29 °C. A desova da sardinha-verdadeira foi natural, os ovos foram incubados, com o fechamento do blastóporo (~12 h após a desova a 27 °C), nas temperaturas 17, 20, 23, 26, 29 e 32 °C. A transferência para os béqueres de 2 L foi realizada com aclimatação por banho termostático. Foi avaliado o desenvolvimento larval (200 ovos L -1 ), as taxas de eclosão e sobrevivência de larvas (100 ovos L -1 ), após 24 h da eclosão, e razão RNA:DNA. Para a tainha, foi encontrado que a temperatura 23,2 °C é a ideal para a taxa de eclosão e 23,9 °C a melhor taxa de sobrevivência e a temperatura 16,5 °C causa 70% de mortalidade. A razão RNA:DNA não sofreu alteração pela temperatura. O tempo para abertura de boca variou com a temperatura, entre 48 e 72 h. Também variou o tempo para a pigmentação do olho (36 a 64 h) e absorção do saco vitelino (42 a 48 h). Para a sardinha, foi encontrado que a melhor temperatura para a eclosão dos ovos é 28 °C e para a sobrevivência é 24,7 °C. A razão RNA:DNA não sofreu alteração pela temperatura. Os tempos para o desenvolvimento larval variaram conforme a temperatura. A abertura da boca variou de 24 a 51 h e a pigmentação do olho de 21 a 45 h. O comprimento inicial e final da larva não foi afetado pela temperatura. O intervalo ideal de temperatura para a incubação dos ovos e desenvolvimento da larva (até a abertura da boca) verificado para as duas espécies está de acordo com observações feitas em áreas de desova na natureza. Abstract: The temperature must be kept within an optimum range for a species during incubation and larviculture, as it changes the time of ontogenetic events. The objective of this work was to determine the range of temperature for egg incubation, survival and initial development of lebranche mullet Mugil liza and Brazilian sardine Sardinella brasiliensis larvae. The mullet spawning was performed after hormonal induction and the eggs in the blastospore closure phase (~ 24 h after spawning at 23 ° C) were incubated at 17, 20, 23, 26 and 29 ° C. The spawning of the true sardine was natural, the eggs were incubated, in the blastospore closure phase (~ 12 h after spawning at 27 ° C), at temperatures 17, 20, 23, 26, 29 and 32 ° C. The transfer was performed with 2 L becker and acclimatization by thermostatic bath. Larval development (200 L -1 eggs) was evaluated, as hatching and larval survival rates (100 L -1 eggs), after 24 h of hatching, and RNA: DNA ratio. For mullet, it was found that the temperature 23.2 ° C is ideal for hatching rate and 23.9 ° C, the best survival rate and temperature 16.5 ° C, causing 70% mortality. RNA:DNA ratio had no change by the temperature. The mouth opening time varies with temperature, between 48 and 72h. The time for eye pigmentation (36 to 64 h) and absorption of the yolk sac (42 to 48 h) was also changed. For sardines, the best temperature was found for the hatching of eggs at 28 ° C and for survival is 24.7 ° C. The RNA: DNA ratio did not suffer with the change in temperature. The times for larval development were changed according to the temperature. The opening of the mouth varies from 24 to 51 h and pigmentation of the eye from 21 to 45 h. The initial and final length of the larva was not affected by temperature. The ideal temperature range for incubation of eggs and larval development (until the mouth opening) recorded for both species is within the range already determined for natural populations.

In most small-scale fisheries, especially in developing countries, the collection of reliable fishing statistics is not regular, hampering traditional stock assessments. In those data-poor fisheries, a precise knowledge of resources co-occurrence at the ecosystem level, as well as the spatial mapping of fishing activities seem key to support management in a complex fishers-environment context. In the largest South Atlantic coralline reef, the Abrolhos Bank, fisheries are extremely diverse in terms of exploitation capacity, fishing gears, target stocks and operating areas, but any regional fisheries management is currently in place. The aim of this study was to assess, organize, and analyze fisheries of three snappers (Lutjanus jocu, L. synagris and Ocyurus chrysurus), and three groupers (Cephalopholis fulva, Epinephelus morio and Mycteroperca bonaci) along the Abrolhos Bank, with an ultimate goal of proposing useful management units. Surveys were conducted in the main fishing ports, including fishers' interviews and fish size measures in landings. Data analysis allowed a precise fishing characterization, a grouping of stocks co-occurrence, and the mapping of fishing spots and grounds. Three stocks and seven fishing areas clusters were obtained and defined statistically, suggesting useful management units. Specific fishers' groups per fleet were identified as the main stakeholders to be consulted in fisheries plans. Spatial units based on the occurrence of snappers and groupers stocks were defined, having the “Parcel das Paredes” the greatest number of fishing spots and the lower fish sizes. Overall, findings contain unprecedented fine scale resolution units that clarifies and simplifies the connections among species, fleets, fishing areas and fishers. They should also strength the call for action to implement fisheries management in a broader ecosystem-scale context.

Acetylcholine deficiency is a neurochemical characteristic of patients with clinical diagnosis of Alzheimer´s disease. Substances that inhibit the enzyme acetylcholinesterase, increasing levels of acetylcholine in the brain, are a promising form of treatment. Studies relate the use of omega-3 fatty acids in the treatment and prevention of Alzheimer's disease. The Northeast Region of Brazil has an enormous biological diversity and a wide variety of fish species. In this work, the oils of eleven species of marine fish found on the coast of Ceará, Brazil, were analyzed in relation to the fatty acid profile and the inhibitory activity of the enzyme acetylcholinesterase. Total lipids were extracted from fish samples by Folch metodology. The lipid extracts of the fish and industrialized fish oil, used for comparison, were esterified and fatty acid profiles were analyzed. The acetylcholinesterase inhibitory activity was measured quantitatively. The oils presented a high percentage of saturated fatty acids, which is a general characteristic of tropical fish. Oleic acid was the highest monounsaturated fatty acid. Oils of Scomberomorus cavalla, Lutjanus synagris and Haemulon plumieri presented expressive percentages of polyunsaturated fatty acids and the most potent anticholinesterase activities. This research showed the oils of S. cavalla, L. synagris and H. plumieri may be promising functional food products of active fatty acids as new therapies to treatment or prevention of Alzheimer's disease. The expressive concentration of unsaturated and polyunsaturated fatty acids together with their relevant anticholinesterase activity are characteristics of the importance of these fish oils. A deficiência da acetilcolina é uma característica neuroquímica de pacientes com diagnóstico clínico da doença de Alzheimer. As substâncias que inibem a enzima acetilcolinesterase, aumentando os níveis de acetilcolina no cérebro, são uma forma promissora de tratamento. Estudos relacionam o uso de ácidos graxos ômega-3 no tratamento e prevenção da doença. Neste trabalho, os óleos de onze espécies de peixes marinhos encontrados no litoral do Ceará, Brasil, foram analisados em relação ao perfil de ácidos graxos e à atividade inibitória da enzima acetilcolinesterase. Os lipídios totais foram extraídos das amostras de peixes pela metodologia de Folch. Os extratos lipídicos dos peixes e o óleo de peixe industrializado, usado para comparação, foram esterificados e os perfis de ácidos graxos analisados. A atividade inibitória da acetilcolinesterase foi medida quantitativamente. Os óleos apresentaram elevados percentuais de ácidos graxos saturados, característica dos peixes de águas tropicais. O ácido oléico representou o ácido graxo monoinsaturado em maior proporção. Os óleos de Scomberomorus cavalla, Lutjanus synagris e Haemulon plumieri apresentaram percentuais expressivos de ácidos graxos poli-insaturados, assim como as mais potentes atividades anticolinesterásicas. Dessa forma, a pesquisa demonstrou a importância dos óleos de S. cavalla, L. synagris e H. plumieri, como alimentos funcionais ricos em ácidos graxos ativos, e que podem ser utilizados em novas terapias para o tratamento ou prevenção da doença de Alzheimer. A deficiência da acetilcolina é uma característica neuroquímica de pacientes com diagnóstico clínico da doença de Alzheimer. As substâncias que inibem a enzima acetilcolinesterase, aumentando os níveis de acetilcolina no cérebro, são uma forma promissora de tratamento. Estudos relacionam o uso de ácidos graxos ômega-3 no tratamento e prevenção da doença. Neste trabalho, os óleos de onze espécies de peixes marinhos encontrados no litoral do Ceará, Brasil, foram analisados em relação ao perfil de ácidos graxos e à atividade inibitória da enzima acetilcolinesterase. Os lipídios totais foram extraídos das amostras de peixes pela metodologia de Folch. Os extratos lipídicos dos peixes e o óleo de peixe industrializado, usado para comparação, foram esterificados e os perfis de ácidos graxos analisados. A atividade inibitória da acetilcolinesterase foi medida quantitativamente. Os óleos apresentaram elevados percentuais de ácidos graxos saturados, característica dos peixes de águas tropicais. O ácido oléico representou o ácido graxo monoinsaturado em maior proporção. Os óleos de Scomberomorus cavalla, Lutjanus synagris e Haemulon plumieri apresentaram percentuais expressivos de ácidos graxos poli-insaturados, assim como as mais potentes atividades anticolinesterásicas. Dessa forma, a pesquisa demonstrou a importância dos óleos de S. cavalla, L. synagris e H. plumieri, como alimentos funcionais ricos em ácidos graxos ativos, e que podem ser utilizados em novas terapias para o tratamento ou prevenção da doença de Alzheimer.

The first record of Apterichtus kendalli in the Southeast Brazilian Bight is reported based on one leptocephalus collected at around the 100 m isobath during an oceanographic cruise in 1979. It is the southernmost record of this species in the Atlantic. The leptocephalus of A. kendalli was identified based on myomeres counts, fin positions, nine moderate gut swellings, and midline prominent patches of pigments.

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2022-02-14T21:25:38Z No. of bitstreams: 1 2019 - Mariana Marques Martins.pdf: 2129395 bytes, checksum: 2d28dd97912b4da629275a3dd0325720 (MD5) Made available in DSpace on 2022-02-14T21:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2019 - Mariana Marques Martins.pdf: 2129395 bytes, checksum: 2d28dd97912b4da629275a3dd0325720 (MD5) Previous issue date: 2019-05-08 CAPES - Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior The analysis of fish diet is of great importance to understand not only the coexistence of these groups of organisms, but also the processes developed in ecosystem in which they inhabit. The objective of this study was to analyze the diet of twoc Sciaenidae species, Ctenosciaena gracilicirrhus and Micropogonias furnieri and to assess the occurrence of ontogenetic and seasonal variations in diet, besides the possible mechanisms used to allow the coexistence of these abundant syntopic species in the outer zone of Sepetiba Bay. The tested hypothesis is that these species closely related in form, have partitioning of food resources to coexist in Sepetiba Bay and that occur changes in feeding habits along the growth. The stomach contents of 198 specimens of M. furnieri (85-280 mm of total length) and 198 of C. gracilicirrhus (49-131 mm in total length) obtained from quarterly daytime bottom trawls performed between the winter of 2012 and the fall of 201 in outer zone of the Bay of Septiba, RJ were examined. Different patterns in diets between species, size classes and seasons were determined by the Non-Metric Multidimensional Scalin. Significant differences were detected in the diet between the two species (Pseudo-F= 37.139, p = 0.001) and between size classes (Pseudo-F = 2.23, p = 0.001), but not between seasons (F = 0.36, p = 0.920), according to PERMANOVA. Micropogonias furnieri fed mainly on Polychaeta and Caprella, while C. gracilicirrhus preferred Caprella. Micropogonias furnieri prefered Crutacea in the smaller size classes, extending to the use of Polychaeta in larger size classes. Ctenosciaena gracilicirrhus showed preference for Caprella in larger size classes. No significant seasonal variations were observed for the two species. Both species presented a narrower trophic niche with increasing in size, thus characterizing a trend towards specialization, also confirmed through the Amundsen diagram, with M. furnieri preferring Polychaeta, and C. gracilicirrhus, Caprella. As expected, a high intraspecific overlap of intraspecific trophic niche was observed between size classes within each species, but not at an interspecific level, with both species using different dietary resources. The hypothesis that the two species closely related in form present partition of the trophic niches as a mechanism to facilitate coexistence was confirmed. A an?lise da dieta de peixes ? de grande import?ncia para entendermos n?o s? a coexist?ncia desses grupos de organismos, mas tamb?m os processos desenvolvidos no ecossistema em que habitam. Este estudo tem como objetivo analisar a dieta de Ctenosciaena gracilicirrhus e Micropogonias furnieri e verificar a ocorr?ncia de varia??es ontogen?ticas e sazonais na alimenta??o, al?m dos poss?veis mecanismos utilizados para possibilitar a coexist?ncia dessas esp?cies sint?picas abundantes na zona exterior do da Ba?a de Sepetiba. A hip?tese testada ? de que estas esp?cies proximamente relacionadas em forma apresentem parti??o dos recursos alimentares para coexistirem na Ba?a de Sepetiba e que ocorram varia??es nos h?bitos alimentares ao longo do crescimento. Foram examinados os conte?dos estomacais de 198 esp?cimes de M. furnieri (85?280 mm de comprimento total) e 198 de C. gracilicirrhus (49?131 mm no total comprimento) obtidos de arrastos de fundo diurnos trimestrais realizados entre o inverno de 2012 e o outono de 2013 na zona externa da Ba?a de Sepetiba, RJ. Diferentes padr?es nas dietas entre as esp?cies, classes de tamanho e esta??es do ano foram determinados pelas an?lises de Ordena??o Multidimensional N?o-M?trica. Diferen?as significativas foram detectadas na dieta entre as duas esp?cies (Pseudo-F = 5,16; p = 0,001) e entre as classes de tamanho (Pseudo-F = 2,23; p = 0,001), mas n?o entre as esta??es (Pseudo-F = 0,36; p = .920), segundo PERMANOVA. Micropogonias furnieri alimentou-se principalmente de Polychaeta e Caprella, enquanto C. gracilicirrhus utilizou preferencialmente Caprella. Micropogonias furnieri apresentou prefer?ncia por Crustacea nas menores classes de tamanho, ampliando para o uso de Polychaeta nas maiores classes de tamanho. Ctenosciaena gracilicirrhus apresentou prefer?ncia por Caprella, que foi mais claramente observada nas maiores classes de tamanho. N?o foram observadas varia??es sazonais significativas para as duas esp?cies. Ambas as esp?cies apresentaram diminui??o do nicho tr?fico com o aumento do tamanho, caracterizando assim tend?ncia a especializa??o, tamb?m confirmada atrav?s do diagrama de Amundsen. Ambas as esp?cies tenderam a se especializar a medida que cresciam, com M. furnieri preferindo Polychaeta, e C. gracilicirrhus, Caprella. Como esperado, uma alta sobreposi??o intraespecifica de nicho foi observada entre as classes de tamanho dentro de cada esp?cie, mas n?o a um n?vel interespec?fico, com as duas esp?cies utilizando diferentes recursos alimentares. A hip?tese de que as duas esp?cies proximamente relacionadas em forma apresentam parti??o do nicho tr?fico como mecanismo para facilitar a coexist?ncia foi confirmada.

Submitted by Fernanda Andreoli Rolim (fernanda.rolim@unesp.br) on 2019-07-19T14:13:46Z No. of bitstreams: 2 TESE_FernandaRolim.pdf: 5347587 bytes, checksum: 670440a0ae35879fe44391c70de7806c (MD5) Rolim et al.2019_Network of small no-take marine reserves reveals greater abundance and body size of fisheries target species.pdf: 2642977 bytes, checksum: e24c43b12c1a78b854078a2f3cdeed45 (MD5) Approved for entry into archive by Adriana Aparecida Puerta Buzzá (dripuerta@rc.unesp.br) on 2019-07-19T17:47:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rolim_fa_dr_rcla.pdf: 5347587 bytes, checksum: 670440a0ae35879fe44391c70de7806c (MD5) Made available in DSpace on 2019-07-19T17:47:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rolim_fa_dr_rcla.pdf: 5347587 bytes, checksum: 670440a0ae35879fe44391c70de7806c (MD5) Previous issue date: 2019-05-03 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O estabelecimento de reservas marinhas de restrição total (No-take reserves - NTRs), ou seja, áreas com proibição total de pesca, tem sido uma alternativa mundial para preservar a biodiversidade e as funções dos ecossistemas. O Brasil tem importantes NTRs com poucos estudos descrevendo sua relevância e eficiência para a vida marinha. Com isso, o objetivo central desta tese foi avaliar os efeitos de NTRs em assembleias de peixes, testando a hipótese de que as diferenças em riqueza, abundância, biomassa e tamanho corporal dos peixes são mais explicadas pelo status de proteção do que por características ambientais. Para tanto, técnicas inovadoras no Brasil, estéreo-vídeos subaquáticos com isca (Baited Remote Underwater stereo-Videos - stereo-BRUVs) e estéreo-vídeos operados por mergulhador (Diver Operated stereo-Videos - stereo-DOVs) foram testados no Atlântico Sudoeste, comparando com os censos visuais tradicionalmente aplicados (estacionário e transecto), e utilizados para analisar os efeitos da Estação Ecológica Tupinambás e do Parque Nacional Marinho dos Abrolhos nas assembleias de peixes. Para isso, as características das assembleias de peixes em termos de riqueza, biomassa, abundância e tamanho corpóreo, foram comparadas com as áreas onde a pesca é permitida, e a complexidade do habitat foi estimada através das imagens. Em relação à comparação dos métodos, o estéreo-DOV apresentou maior eficiência, amostrando mais riqueza e abundância com menor esforço, e o estéreo-BRUV amostrou uma assembleia específica, composta principalmente por espécies de peixes móveis e de grande porte, geralmente alvos da pesca. Em ambas as NTRs avaliadas, as características das espécies-alvo foram explicadas pelo nível de proteção, enquanto as assembleias de espécies não-alvo foram mais relacionadas às características do habitat. Os resultados incluem a implementação de técnicas não-destrutivas de amostragem da ictiofauna no Brasil, uma geração de conhecimento sobre a ecologia dos peixes e a disseminação da importância dessas áreas protegidas, que auxiliarão nas medidas de manejo e estimularão a sua preservação. The establishment of no-take marine reserves (NTRs), i.e. areas with total fishing restrictions, has been an alternative worldwide aiming to preserve both biodiversity and ecosystem functions. Brazil has important NTRs with few studies describing their relevance and efficiency for marine life. With this, the central objective of this thesis was to evaluate the effects of NTRs on fish assemblage, testing the hypothesis that the differences in richness, abundance, biomass and fish body size is more explained by protection status than environmental characteristics. Thus, innovative techniques in Brazil, Baited Remote Underwater stereo-Videos (stereo-BRUVs) and Diver Operated stereo-Videos (stereo-DOVs) were tested in the Southwestern Atlantic, comparing with traditional visual census (stationary point count and belt transects), and used to analyze the effects of the Tupinambás Ecological Station and Abrolhos Marine National Park on fish assemblages. For this, fish assemblage characteristics, such as richness, abundance, biomass and body size, were compared to areas where fishing is allowed, and the habitat complexity was estimated through the footages. Concerning methods comparison, stereo-DOV showed to be more effective, sampling more richness and abundance within less effort, and Stereo-BRUVs showed to sample a very specific assemblage, comprised mostly by mobile and large bodied fish species, usually targeted by fisheries. Within both NTRs evaluated, target species characteristics was explained by protection status, while non-target species assemblage were more related to habitat characteristics. The results include an implementation of non-destructive ichthyofauna sampling techniques in Brazil, a generation of knowledge about fish ecology and the dissemination of the importance of these protected areas, which will assist management measures and encourage the preservation of the region. CNPq: 141799/2016-1.

Made available in DSpace on 2019-10-03T17:31:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2019. Added 1 bitstream(s) on 2019-10-04T16:20:44Z : No. of bitstreams: 1 S1679-62252019000200205.pdf: 42102578 bytes, checksum: 1bb3b7beaf32eac8dcb05eab031c86e0 (MD5) RESUMO A costa Norte do Brasil é um dos pesqueiros de camarão mais importantes do mundo, com uma área total de aproximadamente 223.000 km2. No entanto, dados disponíveis sobre a diversidade de peixes capturados pela frota industrial de arrasto de portas na região são limitados às espécies com valor comercial. Essa lacuna no conhecimento sobre a fauna de peixes marinhos da região é preocupante, tanto para o manejo dos estoques quanto para a conservação da biodiversidade local. O presente estudo é baseado num inventário abrangente dos peixes teleósteos capturados por operações de arrasto de portas da frota industrial que opera na costa Norte do Brasil. Este inventário registrou 201 espécies pertencentes a 64 famílias e 20 ordens, e revelou uma fauna única, caracterizada por 17 espécies endêmicas, e uma mistura de espécies estuarino-dependentes e espécies marinhas, principalmente associadas a recifes de corais. A análise da densidade Kernel indicou que a frota industrial de arrasto de portas opera dentro de um importante ecótono, que abrange uma zona de transição de diferentes comunidades de peixes encontrados na costa Norte do Brasil. ABSTRACT The Brazilian North coast is one of the world’s most important shrimp fishery grounds, with a total area of approximately 223,000 km2. However, the available data on the diversity of fish caught by the region’s industrial trawler fleet are limited to the commercially-valuable species. This lacuna in the data on the region’s marine fish fauna is worrying, both for the management of stocks and the conservation of the local biodiversity. The present study was based on a comprehensive inventory of the teleost fishes captured by the industrial outrigger trawling operations off the North coast of Brazil. This inventory recorded 201 species belonging to 64 families and 20 orders, and revealed a unique fauna, characterized by 17 endemic species, and a mixture of estuarine-dependent and marine species, mainly associated with coral reefs. The Kernel density analysis indicated that the industrial trawling fleet operates within an important ecotone, which encompasses the transition zones of different fish communities found off the Brazilian North coast. Museu Paraense Emílio Goeldi Centro de Pesquisa e Gestão de Recursos Pesqueiros do Litoral Norte Universidade Estadual Paulista Instituto de Biociências Departamento de Morfologia Universidade Santa Cecília Acervo Zoológico Universidade de São Paulo Museu de Zoologia Universidade da Amazônia Instituto Federal do Pará Universidade Federal do Pará Universidade Federal Rural da Amazônia Universidade Federal de Sergipe Departamento de Ecologia Universidade Federal do Pará Instituto de Ciências Biológicas Laboratório de Ecologia e Conservação Universidade Estadual Paulista Instituto de Biociências Departamento de Morfologia

The influence of the moon cycles on the ichthyofauna has been little studied in the surf zone. In this study, the number of species, density and biomass were evaluated as a function of the moon. A total of 49 species distributed in 24 families were captured in two areas of Miramar beach. The mean density was significant high in the weaning and low in the new moon, while density and biomass together showed differences for areas. The most abundant species were Anchoa tricolor and Trachinotus falcatus (new moon), and Anchovia clupeoides showed significant differences in the waning moon. The RDA indicates that turbidity influenced significantly the presence of two species group. The group I were represented by Stellifer brasiliensis, Trachinotus goodei, A. clupeoides, Chilomycterus spinosus and Conodon nobilis that occurred on the waning and new phases in both areas, while the group II were represented by Polydactylus virginicus and Haemulopsis corvinaeformis in the full moon. The surf zones may also be strongly governed by the lunar phases. Therefore, the results found in this study, showed that the biological interactions between the species with turbidity and moon might explain the density and biomass variations for some species in the surf zone. RESUMO A influência das fases lunares sobre a ictiofauna tem sido pouco estudada na zona de arrebentação. Nesse estudo, foram avaliadas, o número de espécies, densidade e a biomassa da ictiofauna em função da lua. Foram capturadas 49 espécies distribuídas em 24 famílias em duas áreas na Praia de Miramar. A densidade foi significativamente elevada nas luas minguante e nova. Além disso, a densidade e biomassa juntas mostraram diferenças entre as áreas. As espécies mais abundantes na lua nova foram Anchoa tricolor e Trachinotus falcatus, e Anchovia clupeoides teve uma maior abundancia na lua minguante. O RDA, indicou que a turbidez influenciou significativamente a presença de dois grupos distintos. O grupo I, representado por Stellifer brasiliensis, Trachinotus goodei, A. clupeoides, Chilomycterus spinosus e Conodon nobilis estiveram presentes nas luas minguante e nova em ambas as áreas, e o grupo II, representado por Polydactylus virginicus e Haemulopsis corvinaeformis na lua cheia. As zonas de arrebentação também podem ser reguladas fortemente pelas fases lunares. Os resultados mostraram que as interações biológicas entre as espécies com a turbidez e as fases lunares podem explicar as variações de densidade e biomassa para algumas espécies na zona de arrebentação.

Lista atualizada dos nomes comuns e científicos de todas as espécies de peixes, taxonomicamente válidas, que foram referenciadas nas águas marinhas de Portugal. Inclui as referências bibliográficas mais importantes dos trabalhos dedicados à ictiofauna portuguesa publicados desde 1765,bem como os códigos de registos em bases de dados (espécimes, tecidos ou de observação humana). Nesta lista incluem-se 1349 espécies em que 1191 ocorrem em águas territoriais e nas três sub-áreas da Zona Económica Exclusiva Portuguesa, 71 exclusivamente na área da Extensão da Plataforma Continental Portuguesa e 87 cuja presença na área de estudo deste trabalho foi considerada duvidosa. São propostos 874 novos nomes vulgares em português e apresentam-se os critérios considerados na atribuição destes nomes. Centro Português de Estudo dos Mamíferos Marinhos - Projecto Delfim e Centro Português de Actividades Subaquáticas. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Tilapia culture presents high potential for income generation and hunger alleviation in developing countries. Suitable culture planning can help achieve such goals sustainably. This work aimed to comparatively evaluate the influence of semi-intensive and intensive cultivation systems of O. niloticus on condition factor, its derivatives and established growth models (Von Bertalanffy - VBGF, sigmoid Logistic - SLogistic, Brody and Gompertz) as well as on two proposed models (Michaelis-Menten hyperbolic growth – MMHG and hyperbolic Logistic - HLogistic). A linear estimation of VBGF parameters was also proposed. Weight-length relationships of tilapia were not significantly altered by the systems. Relative weights from the present study were higher in 9 out of 14 comparisons with tilapia from other natural environments and cultivations. Condition factor (K), Kmean, Krel and relative weight (Wrm) proved to be useful tools when assessing growth. In size-at-age analyzes (total length), VBGF and MMHG were the best models for intensive system whereas Gompertz and VBGF were selected for semi-intensive. Although length-at-age analyzes did not show significant differences between the systems and the growth indexes (o and P) were slightly higher in cages than in ponds, the comparison between VBGF and Gompertz (best models for weight datasets) - connected to the condition factor investigation and to the importance of natural food - suggested that semi-intensive system specimens would reach commercial size earlier based on weight in the present conditions. The adoption of MMHG model when indicated suggests a wide field of research that could allow making inferences expanding the amplitude of growth studies.

Fish should be considered as a functional food, in addition to being a high nutritional value alternative, mainly due to the presence of polyunsaturated fatty acids. Ceará State has a vast coastline with a great variety of fish. Some species are commercially important; however, others are devalued from a commercial and mainly nutritional point of view. Thus, the objective of this work was to study twelve species of marine fish caught on the coast of Ceará, evaluating the nutritional value of the fish and the biotechnological potential of its by-products. The species studied were: Balistes capriscus (grey triggerfish), Cephalopholis fulva (coney), Ginglymostoma cirratum (nurse shark), Haemulon aurolineatum (tomtate grunt), Haemulon parrai (chere-chere grunt), Haemulon plumieri (white grunt), Lutjanus synagris (lane snapper), Malacanthus plumieri (sand tilefish), Myrispristes jacobus (blackbar soldierfish), Scomberomorus brasiliensis (serra Spanish mackerel), Scomberomorus cavalla (king mackerel) and Sparisoma chrysopterum (gray Parrotfish). The determination of the centesimal composition and calorific value of the fish fillets was carried out, followed by determination of the mineral composition of the fillets and heads, through Atomic Absorption Spectrometry.The oils were extracted, transmethylated, characterized by Gas Chromatography coupled to Mass Spectrometer and evaluation of anticholinesterase activity. And the gelatin of B. capriscus skin was extracted, characterized by Infrared Spectroscopy and Nuclear Magnetic Resonance of Hydrogen and evaluated for anticholinesterase, antifungal and antioxidant activities. All the analyzed species showed high Ca, P, Fe and Zn contents, especially in the heads. The oils of H. plumieri, L. synagris and S. cavalla presented expressive percentages of polyunsaturated fatty acids, as well as the most potent anticholinesterase activities, which may contribute to the prevention or treatment of Alzheimer's disease. And the gelatine of B. capriscus obtained from the skin showed a protein percentage of 61%, with anticholinesterasic, antifungical and antioxidant activities. O peixe, além de ser uma alternativa alimentar de alto valor nutritivo, é considerado um alimento funcional, principalmente devido a presença de ácidos graxos poli-insaturados. Há uma grande variedade de peixes na costa marítima cearense. Alguns são comercialmente importantes, porém, outros são desvalorizados do ponto de vista comercial e principalmente nutricional. Dessa forma, objetivou-se com este trabalho realizar o estudo de doze espécies de peixes marinhos capturados na costa cearense, avaliando o valor nutricional dos peixes e o potencial biotecnológico de seus subprodutos. As espécies estudadas foram: Balistes capriscus (cangulo), Cephalopholis fulva (piraúna), Ginglymostoma cirratum (tubarão lixa), Haemulon aurolineatum (sapuruna), Haemulon plumieri (biquara), Haemulon parrai (cambuba), Lutjanus synagris (ariacó), Malacanthus plumieri (pirá), Myripristis jacobus (mariquita), Scomberomorus cavalla (cavala), Scomberomorus brasiliensis (serra) e Sparisoma chrysopterum (bodião). Realizou-se a determinação da composição centesimal e valor calórico dos filés dos peixes, prosseguindo com a determinação da composição mineral dos filés e das cabeças, através da Espectrometria de Absorção Atômica. Os óleos obtidos da carne dos pescados foram transmetilados, caracterizados por Cromatografia Gasosa acoplada a Espectrometria de Massa e avaliados quanto a atividade anticolinesterásica. A gelatina da pele de B. capriscus foi extraída, caracterizada por Espectroscopia de Infravermelho e Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio e avaliada quanto as atividades anticolinesterásica, antifúngica e antioxidante. Todas as espécies analisadas demonstraram importante valor nutricional e conteúdos de Ca, P, Fe e Zn, especialmente nas cabeças. Os óleos de H. plumieri, L. synagris e S. cavalla apresentaram porcentuais expressivos de ácidos graxos poli-insaturados , assim como as mais potentes atividades anticolinesterásicas, podendo contribuir para o tratamento ou prevenção da doença de Alzheimer. A gelatina da pele de B. capriscus, com porcentual de proteínas de 61%, demonstrou atividades anticolinesterásica, antifúngica e antioxidante.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2018. O robalo-flecha (Centropomus undecimalis) tem grande potencial para a aquicultura. Considerando a existência de poucos estudos relacionados à exigência de parâmetros físico químicos da qualidade de água com larvas e juvenis desta espécie e visando a otimização do desempenho zootécnico, o presente estudo determinou sua tolerância à amônia e ao nitrito. Desta forma, foram conduzidos três experimentos para avaliar a toxicidade aguda de amônia não ionizada (NH3) e de nitrito (NO2), e para determinar a concentração letal média (CL50) em 24, 48, 72 e 96 h de exposição a ambos os compostos. No primeiro experimento foi avaliada a tolerância de larvas de robalo-flecha expostas a concentrações crescentes de amônia não ionizada por 96 h. Dez larvas (20,85±1,46 mm) de 47 dias de idade por unidade experimental (1,5 L) foram submetidas por 96 h aos seguintes tratamentos em triplicatas: controle (0,00 mg L-1 NH3) e cinco concentrações crescentes de amônia (0,65±0,04; 1,29±0,09; 2,59±0,18; 3,88±0,27; 5,17±0,34 e 6,47±0,43 mg L-1 NH3). Durante este período, não foram observadas mortalidades. Para o segundo experimento, utilizaram-se cinco juvenis (20,35±6,10 g; 13,90±1,75 cm) por unidade experimental (60 L) expostos a concentrações de amônia não ionizada de 0,00±0,00; 2,26±0,07; 2,68±0,11; 3,20±0,13; 3,68±0,17 e 4,27±0,16 mg L-1. Após 96 h de exposição, amostras de brânquias e sangue foram coletadas para análise histológica e bioquímica, respectivamente. A mortalidade dos peixes aumentou à medida que as concentrações de amônia aumentaram, e a CL50 96 h foi 3,52 mg L-1 NH3. Os resultados demonstraram que as larvas são mais tolerantes que os juvenis, indicando que a toxicidade ambiental da amônia para o robalo-flecha é influenciada pela idade. A exposição subletal à amônia causou danos histológicos em brânquias de juvenis bem como variação nos níveis de glicose, hematócrito e contagem total de eritrócitos (RBC), demonstrando efeitos negativos sobre a homeostase dos peixes. No terceiro experimento avaliou-se a tolerância de juvenis de robalo-flecha à exposição aguda de nitrito em salinidade 30 g L-1. Houve efeito letal nos peixes, aumento da toxicidade do nitrito ao longo do tempo de exposição e a CL50 96 h foi 166,89 mg L-1 NO2. Abstract : The common snook (Centropomus undecimalis) has great potential for aquaculture. Considering the few studies related to water quality requirements and aiming at the reduction of zootechnical losses or even mortalities, the present study evaluated the tolerance of common snook to ammonia and nitrite. Thus, three experiments were conducted to determine the toxic effects and the lethal concentration (LC50) at 24, 48, 72 and 96 h of exposure to both compounds. The first experiment evaluated larvae exposed to acute concentrations of non-ionized ammonia for 96 h in salinity 35g L-1, after 24 h of starvation. Ten larvae (20.85 ± 1.46 mm) of 47 days per experimental unit (1.5 L) were submitted for 96 h to the following triplicate treatments: control without ammonia (0.00 mg L-1 NH3) and five increasing concentrations of non-ionized ammonia (0.65 ± 0.04, 1.29 ± 0.09, 2.59 ± 0.18, 3.88 ± 0.27, 5.17 ± 0,34 and 6.47 ± 0.43 mg L-1 NH3. No mortalities were observed during this period. The second experiment was carried out with five juveniles (20.35 ± 6.10 g, 13.90 ± 1.75 cm) per experimental unit (60 L) exposed to a control without ammonia (0.00 mg L-1 NH3) and five increasing concentrations of non-ionized ammonia (2.26 ± 0.07, 2.68 ± 0.11, 3.20 ± 0.13, 3.68 ± 0.17 and 4.27 ± 0.16 mg L-1). After 96 h, gills and blood were sampled to histological and biochemical analysis, respectively. Fish mortality increased as ammonia concentrations increased, and the LC50 96 h was 3.52 mg L-1 NH3. The larvae were less sensitive than juveniles, indicating that ammonia toxicity is influenced by age in common snook. In addition, sublethal exposition to ammonia causes histological damage in juvenile gills as well as variation in glucose, hematocrit and red boold cells (RBC), demonstrating negative effects on fish homeostasis. In the third experiment, tolerance of common snook juveniles was evaluated after acute exposition to nitrite in salinity 30 g L-1. There was lethal effect on fish, increased nitrite toxicity over time, and LC50 96 h was 166.89 mg L-1 NO2.

No Brasil, a piscicultura marinha de corte tem pouca participação no setor econômico, mas algumas espécies têm mostrado grande potencial, como a carapeba, Eugerres brasilianus. Porém, a larvicultura ainda é um gargalo devido a raridade de protocolos que auxiliem na sobrevivência e desempenho das larvas, fazendo necessário identificar agentes estressores sobre o fenótipo dos peixes na larvicultura. A Assimetria Flutuante (AF) desponta como ferramenta indicadora do desempenho de peixes, e pode ser utilizada para estes estudos. Objetivou-se no presente estudo observar a ocorrência de AF e a sobrevivência das larvas de E. brasilianus submetidas a diferentes temperaturas (20ºC,25º e 30º) e salinidades (25,30 e 35). Usou-se o diâmetro dos olhos para calcular os níveis de AF em três índices individuais: FA1 = |D-E|; FA2 = |D- E|÷[ (D+E) ÷2]; e FA5 = (D-E)2, como proposto por Palmer (1994), onde: D = lado direito; e E = lado esquerdo. Foram analisadas 95 larvas. Foi aplicada PERMANOVA para verificar diferenças entre os tratamentos e a AF. O teste t-student validou a existência de AF nas larvas de carapeba (p=0,53). A sobrevivência das larvas não diferiu significativamente sob diferentes temperaturas (PERMANOVA; F=0,57; p=0,58) e salinidades (PERMANOVA; F=0,42; p=0,68). Houve diferenças significativas na AF nos experimentos com diferentes temperaturas (PERMANOVA; F=20,85; p=0,0001), mas não foram nas diferentes salinidades (PERMANOVA; F=0,25; p=0,77). A ausência de relação significativa da AF com a sobrevivência possivelmente ocorreu, devido às larvas não terem absorvido seu saco vitelínico, o que justifica a baixa mortalidade registrada. A carapeba é uma espécie eurihalina, e como os tratamentos não chegaram a níveis críticos, a salinidade testada não foi considerada estressora para a espécie, e sim as menores temperaturas (20oC). Neste contexto, a AF no diâmetro dos olhos em temperaturas mais baixas pode reduzir a aptidão dos indivíduos afetando a capacidade visual da espécie e seu desempenho zootécnico, sendo um problema econômico em pisciculturas. In Brazil, marine fisheries have little participation in the economic sector. However, some species have a great potential, as a carapeba, Eugerres brasilianus. The larviculture is still a bottleneck due to a rarity of protocols that aid in the survival and performance of larvae, requiring identifying the stressing agents on the fish phenotype in larviculture. Fluctuating Asymmetry (FA) emerges as a performance indicator builder, and can be used for these studies. This study aimed to assess the occurrence of FA in larvae of E. brasilianus at different temperatures and salinities. The diameter of the eyes was used to calculate the AF levels in three individual indexes: FA1 = | D-E | FA2 = | D- E | ÷ [(D + E) ÷ 2]; and FA5 = (D-E) 2, as proposed by PALMER (1994), where: D = right side; and E = left side. A total of 95 larvae were analyzed. The t-student test validated the presence of FA in carapeba larvae (p=0.53). The larvae survival did not differ significantly under different temperatures (PERMANOVA, F=0.57, p = 0.58) and salinities (PERMANOVA; F=0.42, p =0.68). Significant differences were found in FA indexes for experiments with different temperatures (PERMANOVA; F =20.85; p = 0.0001), but were not in the different salinities (PERMANOVA; F=0.25; p=0.77). The absence of a significant relationship between FA and survival possibly occurred because larvae did not absorb their yolk sac, which justifies the low mortality rate. Carapeba is an eurihaline species, and as the treatments did not reach critical levels, the salinity tested was not considered stressful for the species, but the lowest temperatures (20oC). In this context, the AF in the diameter of the eyes at lower temperatures can reduce the aptitude of the individuals affecting the visual capacity of the species and its zootechnical performance, being an economic problem in fish farms.

Mestrado em Biologia Marinha Submitted by Carla Jesus (cjesus@ua.pt) on 2018-02-20T10:49:04Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Ricardo Vieira.pdf: 1796638 bytes, checksum: 5b5bf609ce181f0f090418d5d5cdc561 (MD5) Made available in DSpace on 2018-02-20T10:49:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_Ricardo Vieira.pdf: 1796638 bytes, checksum: 5b5bf609ce181f0f090418d5d5cdc561 (MD5) Previous issue date: 2017-07-28

The aim of this study was to investigate the ichthyofauna structure in the region of the north outfall of the Bertioga Channel (São Paulo, Brazil) and the possible effects of the environmental quality loss. The samples were collected in a monthly basis, from September to December 2005, at two oceanographic stations with an otter-trawl. The fish fauna structure was evaluated by ecological indicators and the environmental quality evaluated by the ABC analysis and the Estuarine Fish Communities Index (EFCI). A total of 1553 individuals from 50 species were sampled. Ariidae and Sciaenidae amounted to 60 % and Cathorops spixii represented 36 % of all specimens collected. The highest richness and ecological diversity were recorded in December, while the highest numerical abundance was found in October. The majority of the species were represented by juveniles. The cluster analysis and canonical correspondence analysis showed a consistent and clear difference between the sampling stations, and the abiotic factors analyzed (temperature, depth and salinity) do not seem to have influence on the community structure. The ABC analysis suggested a moderate disturbed environment and the EFCI allowed classifying the area as "poor", due to the 12 metrics analyzed, concerning the reduction of the species diversity, composition and abundance, and modifications in the nursery function and trophic integrity of the area. Future studies should focus on jointly analyze chemical indicators of water and sediment with the biological indicators, to confirm the ichthyofaunal condition of the north outfall of the Bertioga Channel. Resumo O objetivo deste estudo foi investigar a estrutura da ictiofauna na região da desembocadura norte do Canal de Bertioga (São Paulo, Brasil) e os possíveis efeitos da perda da qualidade ambiental. As amostras foram coletadas mensalmente de setembro a dezembro de 2005, em duas estações oceanográficas, com rede de arrasto. A estrutura da fauna de peixes foi avaliada por indicadores ecológicos e a qualidade ambiental por curvas ABC e um índice de comunidades de peixes estuarinos (EFCI). Um total de 1553 indivíduos em 50 espécies foi amostrado. Ariidae e Sciaenidae totalizaram 60% e Cathorops spixii representou 36% de todos os espécimes coletados. Maior riqueza e diversidade ecológica foram registradas em dezembro, enquanto a maior abundância numérica foi encontrada em outubro. A maioria das espécies foi representada por juvenis. As análises de agrupamento e de correspondência canônica mostraram uma diferença consistente e clara entre as estações de amostragem, e os fatores abióticos analisados (temperatura, profundidade e salinidade) parecem não ter influência sobre a estrutura da comunidade. A curva ABC sugeriu um ambiente moderadamente perturbado e o EFCI permitiu classificar a área como "pobre", a partir das 12 métricas analisadas, que consideraram a redução da diversidade específica, a composição e a abundância, bem como a modificação na função de berçário/infantário e a integridade trófica da área. Futuros estudos devem se concentrar em analisar conjuntamente os indicadores químicos da água, do sedimento e os indicadores biológicos, para confirmar a condição da ictiofauna da desembocadura norte do Canal de Bertioga.

Dissertação de mestrado, Aquacultura e Pescas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2017 Atualmente, têm vindo a ser observados inúmeros problemas ligados à sustentabilidade em aquacultura convencional, devido à acumulação de nutrientes orgânicos, derivados do resto de ração não consumida e produtos de excreção, resultantes dos organismos produzidos nos sistemas de cultivo. Como alternativa, nos últimos anos, vem-se prestando uma maior atenção à Aquacultura Multitrófica Integrada (Integrated Multitrophic Aquaculture – IMTA), que é um sistema de cultivo que permite um aproveitamento de forma sustentável da energia e matéria, através da reciclagem dos nutrientes, possibilitando um manuseamento equilibrado do ambiente, o que se refletirá na qualidade da água e no bem-estar dos peixes cultivados. Com o presente trabalho pretende-se caracterizar a microbiota bacteriana associada ao muco da pele de corvinas (Argyrosomus regius) produzidas em diferentes sistemas IMTA. Para este efeito foram efectuadas amostragens mensais, durante os meses de maio a novembro de 2016. Diariamente em cada tanque foram determinados os parâmetros físico-químicos da água, nomeadamente o pH, a temperatura, oxigénio dissolvido, salinidade e turbidez. Em cada amostragem foram recolhidas 6 corvinas de cada tanque, divididos em três sistemas de cultivo IMTA com dois replicados (IMTA 1: Peixe + Ostras + Macroalgas, IMTA 2: Peixes + Ostras, e IMTA 3: Peixes + Macroalgas) para a recolha dos dados biométricos (comprimento e peso) e bacteriológicos (muco). Os resultados permitiram observar que os parâmetros físico – químicos influenciaram fortemente na variação dos parâmetros microbiológicos, (teor de bactérias marinhas totais, Vibrionaceae e Pseudomonas), rondando o número de bactérias marinhas totais, no muco da pele das corvinas entre 103-105 cfu. g-1. Os géneros identificados no muco da pele das corvinas produzidas nos três sistemas - IMTA foram Vibrio ssp., Pseudomonas spp., Flavobacterium spp. e Aeromonas spp. Concluiu-se assim, que o sistema de cultivo IMTA 2, comparativamente aos outros sistemas, foi o que exibiu os valores mais baixos de colonização bacteriana no muco, fator que pode estar associada a alta capacidade de filtração das ostras presentes.

Records of the fishes from the northern Mid-Atlantic Ridge (MAR) (41⁰N - 60⁰N) sampled during two research cruises conducted in summer 2004 on the R/V G.O. Sars and M/S Loran are presented. The cruises were major sampling efforts carried out for the MAR-ECO project, i.e. the Census of Marine Life field project entitled “Patterns and Processes of the Ecosystems of the Northern Mid-Atlantic”. The investigation included sampling with several midwater nets, bottom trawl and longlines from surface waters to about 4000 m. The list comprises around 300 species of fishes from 82 families. Many records were new to the northern mid- Atlantic area, and the list also comprises three recently described species and some additional specimens to date only identified to genus. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Soares I.A. & Luque J.L. [Parasites as biological tags for the discrimination of marine fish stocks in Brazil: current status and perspectives.] Parasitos como marcadores biológicos para discriminação de estoques de peixes marinhos no Brasil: estado atual e perspectivas. Revista Brasileira de Medicina Veterinária, 38(supl. 3):99-113, 2016. Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, BR 465 Km 7, Seropédica, RJ 23890-000, Brasil. E-mail: luqueufrrj@gmail.com The global state of marine fisheries and its effects endanger the future of fishery resources, which may result in extinction of several species as well as threatening the overall integrity of the ecosystems. As the fish consumption growths, marine fishing and related market activities are stimulated increasing the incidence of threatened or exploited species. Aiming the future sustainability, fishery inventories need to be properly identified as a tool for implementation of more efficient policies on the management and conservation of the natural resources. Thus, by the high heterogeneity observed in the Atlantic coast of Brazil as well as the lack of related studies using this tool, the country represents great potential for the use of this technique, to improve our knowledge of local fishing resources. Therefore, the present study highlights the use of parasites as biological markers on identifying fish populations through robust statistical analysis, which represents an efficient and low cost approach and the lack of similar studies in Brazil showing the need of more research efforts on this subject in Brazil., O estado global da pesca marítima e seus efeitos põem em perigo o futuro dos recursos pesqueiros, o que pode resultar na extinção de várias espécies, bem como ameaçar a integridade global dos ecossistemas. À medida que cresce o consumo de peixe, a pesca marinha e as atividades de mercado relacionadas são estimuladas aumentando a incidência de espécies ameaçadas ou exploradas. Visando a sustentabilidade futura, os inventários de pesca precisam ser devidamente identificados como um instrumento para a implementação de políticas mais eficientes sobre a gestão e preservação dos recursos naturais. Assim, pela alta heterogeneidade observada na costa atlântica do Brasil, bem como pela falta de estudos relacionados com essa ferramenta, o país representa um grande potencial para o uso dessa técnica, visando melhorar o conhecimento dos recursos pesqueiros locais. Assim, o presente estudo destaca o uso de parasitas como marcadores biológicos na identificação de populaçõesde peixes por meio de análise estatística robusta o que representa uma abordagem eficiente e de baixo custo e a ausência de estudos semelhantes no Brasil mostrando a necessidade de mais pesquisas sobre o tema no Brasil.

CNPq No ambiente marinho, a ausência de barreiras óbvias parece indicar ecossistemas marinhos resilientes que facilitam o fluxo gênico entre populações. Contudo, fatores físicos tais como correntes marítimas, temperatura e salinidade contribuem para a definição dos limites biogeográficos e ecológicos através da formação, manutenção e distribuição de uma fauna em especial. O objetivo deste estudo foi utilizar a metodologia de DNA barcode para investigar o efeito da escala geográfica sobre a variação genética e conectividade entre populações de espécies de peixes marinhos ao longo de um gradiente latitudinal no Atlântico Ocidental. Um total de 1549 sequências do gene citocromo oxidase I (COI) pertencentes a 54 espécies foi obtido para quatro províncias biogeográficas do Atlântico Ocidental (Província da Carolina-CR, Caribe-CA, Brasil-BR e Argentina-AR). Na comparação entre espécimes provenientes de diferentes províncias biogeográficas, foram observadas divergências genéticas profundas (>2%) nas espécies Polydactylus virginicus, Achirus lineatus, Harengula clupeola, Elops Saurus, Haemulon plumieri e Pomatomus saltatrix. O DNA Barcode mostrou-se uma ferramenta útil em detectar descontinuidades genéticas ao longo de uma gradiente latitudinal no Atlântico Ocidental. Além disso, a análise de métodos filogenéticos comparativos mostrou que a variação nas distâncias genéticas entre populações de diferentes províncias biogeográficas pode ser influenciada por características biológicas das espécies, como a capacidade de formar cardumes. Contudo, outras características biológicas, como período de reprodução podem ter influência sobre a divergência genética das espécies. Nossos resultados destacam a eficiência deste marcador em uma primeira avaliação sobre o status taxonômico das espécies, assim como na detecção de unidades evolutivas significativas, que poderá nortear futuras revisões taxonômicas, estudos filogeográficos e consequentemente programas de conservação. In the marine environment, the absence of obvious barriers seems to indicate resilient marine ecosystems that facilitate gene flow between large marine populations. However, physical factors such as ocean currents, temperature and salinity contribute to the definition of biogeographical and ecological limits through training, maintenance and distribution of a special fauna. The aim of this study was to use the barcode DNA methodology to investigate the effect of geographic scale on genetic variation and connectivity among populations of marine fish species along a latitudinal gradient in the western Atlantic. 1.549 sequences of the gene cytochrome oxidase I (COI) belonging to 54 species of marine fish they were obtained for four biogeographical provinces of the western Atlantic (Carolina Province -PC, Caribbean-CA, Brazil-BR and Argentina-AR). When comparing specimens from different biogeographic provinces, deep genetic differences were observed (>2%) the species Polydactylus virginicus, Achirus lineatus, Harengula clupeola, Elops Saurus, Haemulon plumieri and Pomatomus saltatrix. The DNA Barcode proved to be a useful tool in detecting genetic discontinuities along a latitudinal gradient in the western Atlantic. Moreover, the comparative phylogenetic analysis methods showed that genetic variation in populations of different distances between biogeographic provinces can be influenced by biological characteristics of the species, such as the ability to form schools. However, other biological characteristics, such as breeding period can influence the genetic diversity of the species. Our results highlight the effectiveness of this marker in a first assessment of the taxonomic status of the species, as well as in the detection of significant evolutionary units, which may guide future taxonomic revisions, phylogeographic studies and consequently conservation programs.

Estudamos a dieta dos juvenis de Trachinotus carolinus (Linnaeus, 1766) em praias da Baía de Sepetiba (Rio de Janeiro, Brasil) entre janeiro de 2000 e abril de 2001. Procuramos avaliar a plasticidade trófica de peixes desta espécie ao longo de um gradiente espacial com diferentes níveis de exposição às ondas, sazonalidade, além de avaliar mudanças ontogenéticas na dieta. Os itens alimentares foram analisados através do índice de importância relativa (IIR), determinado pelos valores das frequências de ocorrência, de número e de peso. Os itens de maior importância foram do subfilo Crustacea, ordens Mysidacea, e o representante da ordem Decapoda Emerita brasiliensis (Schmitt, 1935), além de Cefalochordata, representado por Branchiostoma platae (Fitzinger, 1862). Na zona de maior exposição às ondas (praia de Barra de Guaratiba) e com substrato predominantemente arenoso, a dieta foi constituída principalmente por Emerita brasiliensis e Cirripedia, este último presente nos costões rochosos que limitam a praia; na zona de exposição intermediária (praia de Muriqui), houve um predomínio de Mysidacea e Branchiostoma platae; na zona mais protegida (praia de Itacuruçá), os itens de maior abundância foram Polychaeta, Mysidacea e Branchiostoma platae. Sazonalmente não ocorreu variação no uso de Mysidacea, enquanto Branchiostoma platae foi mais consumido durante o inverno, Polychaeta na primavera e Cirripedia e Emerita brasiliensis, no verão. Mysidacea foi o alimento predominante em todas as classes de tamanho, enquanto Polychaeta foi utilizado predominantemente por peixes menores que 20 mm de comprimento padrão e Emerita brasiliensis e Cirripedia foram consumidos principalmente por indivíduos maiores que 40 mm, somente na praia de maior exposição. O sucesso no uso de praias desprotegidas e zonas de arrebentação por esta espécie de peixe pode ser em parte devido à estratégia trófica oportunista, que utiliza uma ampla variedade de recursos disponíveis no ambiente.We studied the diet of juvenile Trachinotus carolinus (Linnaeus, 1766) in sandy beaches of Sepetiba Bay (Rio de Janeiro, Brazil), between January 2000 and April 2001. We tried to evaluate the trophic plasticity of fish this species along a spatial gradient of wave exposure, seasonality, besides to evaluate ontogenetic changes in the diet. The Index of Relative Importance (IRI) was used to measure the food items, determined by their frequency of occurrence, numbers and weights. The subphylum Crustacea, mainly the order Mysidacea, Decapoda Emerita brasiliensis (Schmitt, 1935) and Cephalochordata, represented by Branchiostoma platae (Fitzinger, 1862) were dominant in the diet. In the most exposed zone (Barra de Guaratiba beach) with predominant sandy substrate, the diet was comprised mainly by Emerita brasiliensis and Cirripedia, this later item common in rocky shores at the beach edge; in the intermediate exposed beach (Muriqui beach), Mysidacea and Branchiostoma platae; in the most protected beach (Itacuruçá beach), Polychaeta, Mysidacea and Branchiostoma platae was predominant. No seasonal change was recorded for the use of Mysidacea, while Branchiostoma platae was the more consumed during the winter, Polychaeta in spring, Cirripedia and Emerita brasiliensis, in summer. Mysidacea was the predominate food in all size classes, while Polychaeta was used predominantly by fish smaller than 20 mm standard length (SL) and Emerita brasiliensis and Cirripedia, were consumed mainly by larger individuals than 40 mm in the most exposed beach only. The success in use of surf zones and sand beaches by this fishes species, it can be partly, due the opportunist trophic strategy that uses a wide variety of available resources on environmental.

Fifty four specimens of marine fish belonging to seven species collected from the coast of the State of Rio de Janeiro, Brazil were examined for helminths, and results relating to Monogenea and Digenea are presented. The monogeneans Metamicrocotyla macracantha, Microcotyle pomatomi and Gotocotyla acanthura are reported in new hosts. The digeneans Parahemiurus merus, Lecithochirium microstomum, Gonocercella pacifica, Aponurus laguncula, Gonocerca trematomi and Lampritrema miescheri are reported in new hosts, and the latter two species are also reported for the first time in Brazil.Cinquenta e quatro espécimens de peixes marinhos pertencentes a sete espécies coletados do litoral do estado do Rio de Janeiro, Brasil foram examinados para helmintos, os resultados referentes a Monogenea e Digenea são apresentados. Os monogenéticos Metamicrocotyla macracantha, Microcotyle pomatomi e Gotocotyla acanthura são apresentados em novos hospedeiros. Os digenéticos Parahemiurus merus, Lecithochirium microstomum, Gonocercella pacifica, Aponurus laguncula, Gonocerca trematomi e Lampritrema miescheri são registrados em novos hospedeiros, as duas últimas espécies são também registradas pela primeira vez no Brasil.

Made available in DSpace on 2019-09-12T16:25:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008 O objetivo do trabalho foi analisar a taxocenose de bagres marinhos do complexo baía-estuário de São Vicente, SP. As coletas foram mensais, no período de setembro de 2000 a agosto de 2002, em quatro regiões do estuário. Foram capturados 3.985 exemplares, pertencentes a cinco gêneros e seis espécies, totalizando 47.807 g. A espécie Cathorops spixii apresentou a maior abundância numérica com 1.569 indivíduos amostrados. No transecto I (próximo da região costeira) foi registrada a maior riqueza e no transecto IV (estuário acima) a maior abundância com 2.602 exemplares e peso de 26.236 g. Em março de 2002 registrou-se a maior abundância com 687 indivíduos e o maior peso ocorreu em fevereiro de 2002 (8.816 g). A salinidade da água de fundo, ao longo do período de estudo, variou entre 14 e 36 e a temperatura da água variou entre 19 e 30 °C. Na região amostrada foram capturados exemplares jovens e adultos, ocorrendo um predomínio de jovens, o que demonstra que esta área apresenta condições favoráveis para crescimento. The purpose of this study was to analyze the taxocenose of marine catfish in the complex bay-estuary of Sao Vicente, Brazil. The sampling was done monthly from September/2000 to August/2002, in four places of the estuary. Were caught 3.985 individuals belonging for 5 genus and 6 species, totalizing 47.807 g. The specie Cathorops spixii showed the biggest plentiful with 1.569 individuals sampled. In the transect I (close to the coastal region), it was registered the biggest richness (6 species) and in the transect IV (upper estuary) the biggest number of individuals (n = 2.602) e weight of 26.236 g. In March/2002 were registered the biggest occurrence with 687 individuals and biggest weight in February/2002 (8.816 g). The bottom water salinity, in the time of study, changed between 14 and 36, and the water temperature varied between 19 and 30 °C. In the sample place juveniles and adults' individuals were caught, a mostly juvenile which demonstrates that of this place shows favorable conditions for growth. [Schmidt, Thassya Christina dos Santos; Reigada, Alvaro Luis Diogo] Universidade Metropolitana de Santos, Brasil Dias, June Ferraz] Universidade de São Paulo, Brazil Schmidt, Thassya Christina dos Santos; Martins, Itamar Alves] Universidade de Taubaté, Brasil

Mestrado em Biologia Marinha Submitted by Patrícia Correia (patriciacorreia@ua.pt) on 2015-10-23T15:55:24Z No. of bitstreams: 1 Tese de Mestrado Joana Andrade 49815.pdf: 2887855 bytes, checksum: a8e5b8699c2f4f1046c546fc29568c7b (MD5) Made available in DSpace on 2015-10-23T15:55:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese de Mestrado Joana Andrade 49815.pdf: 2887855 bytes, checksum: a8e5b8699c2f4f1046c546fc29568c7b (MD5) Previous issue date: 2015

Between October 2001 and March 2002, 103 specimens of A. tricolor from Angra dos Reis (23°01'S, 44°19'W), in the coastal zone of the State of Rio de Janeiro, Brazil, were analyzed in order to study their metazoan parasite infracommunities. Ten species of metazoan parasites were collected: 4 digeneans, 1 cestode, 1 acantocephalan, 2 nematodes, 1 copepod, and 1 hirudinean; 77.7% of the fishes were parasitized by one or more metazoan, with a mean of 3.5 ± 6.2 parasite/fish. Digenean was the most dominant with 4 species that accounted for 53.2% of the total parasites collected; Ergasilus sp. was the most abundant species. Abundance and prevalence of Parahemiurus merus (Linton, 1910) were positively correlated with the total length of host. Relationships between total body length of fish and both total parasite abundance and mean parasite species richness were observed. Mean parasite diversity of species was correlated to host's total length, with significant differences found between male and female fishes. Two pairs of larval species showed significant positive association and covariation. The metazoan parasite infracommunities of A. tricolor presented dominance of larval endoparasites; correlation of parasite abundance, diversity, and species richness with host total length; and low number of parasite interspecific relationships. The parasite community of A. tricolor showed some similarities with the parasite community of another South American Atlantic engraulid.Entre outubro de 2001 e março de 2002, foram examinados 103 espécimes de A. tricolor provenientes de Angra dos Reis (23°01'S, 44°19'W), litoral do Estado do Rio de Janeiro, Brasil, para o estudo de suas infracomunidades de metazoários parasitos. Foram coletadas 10 espécies de metazoários parasitos: 4 digenéticos, 1 cestóide, 1 acantocéfalo, 2 nematóides, 1 copépode e 1 hirudíneo; e 77% dos peixes estavam parasitados por 1 ou mais metazoários, com média de 3,5 ± 6,2 parasitos/peixe. Os digenéticos foram dominantes, representando 53,2% do total de parasitos coletados, e Ergasilus sp., a espécie mais abundante. A abundância e a prevalência de Parahemiurus merus (Linton, 1910) foram positivamente correlacionadas ao comprimento total dos hospedeiros. Relações entre a abundância parasitária total e a riqueza parasitária média ao comprimento total dos hospedeiros foram observadas. A diversidade parasitária média foi corrrelacionada com o comprimento total dos hospedeiros, apresentando diferenças significativas entre os peixes machos e fêmeas. Dois pares de espécies de larvas apresentaram associação e covariação positiva significativas. As infracomunidades de metazoários parasitos de A. tricolor demonstraram dominância nas larvas de endoparasitos, correlação entre abundância parasitária, diversidade e riqueza de espécies e o comprimento total dos hospedeiros e o baixo número de associações interespecíficas parasitárias. A comunidade parasitária de A. tricolor apresentou algumas semelhanças com a comunidade parasitária de outros engraulídeos do Atlântico Sul-Americano.

Between April and December 2000, seventy-nine specimens of Centropomus undecimalis from Angra dos Reis, coastal zone of the State of Rio de Janeiro (23º01'S, 44º19'W), Brazil, were necropsied to study their infracommunities of metazoan parasites. Nine species of metazoan parasites were collected: 1 digenean, 1 monogenean, 1 acantocephalan, 1 nematode, 4 copepods, and 1 isopod, and 96.2% of the fishes were parasitized by one or more metazoan, with mean of 85.3 ± 122.9 parasite/fish. The digenean Acanthocollaritrema umbilicatum Travassos, Freitas & Bührnheim represented the majority of the parasites specimens collected, totaling, 94.7%. This species was the most abundant, prevalent, and dominant, showing positive correlation with the host's total body length and parasite abundance. The copepod species Acantholochus unisagittatus Tavares & Luque presented differences in abundance in relation to sex of host. The mean diversity in the infracommunities of C. undecimalis was H = 0.095 ± 0.116, with no correlation with the host's total body length but correlated with the host's sex. No pair of parasite species showed positive or negative association or covariation. The dominance of digenean A. umbilicatum in the later juvenile common snook parasite community could be related with the predatory food habits of common snook and an apparent feeding transition period which might occasion great exposure to infective forms. Entre abril e dezembro de 2000, 79 espécimes de C. undecimalis, provenientes de Angra dos Reis, litoral do Estado do Rio de Janeiro (23º01'S, 44º19'W), Brasil, foram necropsiados para o estudo de suas infracomunidades de metazoários parasitos. Foram coletadas nove espécies de metazoários parasitos: 1 digenético, 1 monogenético, 1 acantocéfalo, 1 nematóide, 4 copépodes e 1 isópode; e 96,2% dos peixes estavam parasitados por um ou mais metazoários parasitos, com média de 85,3 ± 122,9 parasitos/peixe. O digenético Acanthocollaritrema umbilicatum Travassos, Freitas & Bührnheim foi o táxon maioritário, representando 94,7% do total de parasitos coletados. Esta espécie foi a mais abundante, prevalente e dominante, apresentando correlação positiva entre o comprimento total dos hospedeiros e a abundância parasitária. O copépode Acantholochus unisagittatus Tavares & Luque apresentou diferenças em sua abundância em relação ao sexo dos hospedeiros. A diversidade média das infracomunidades de C. undecimalis foi de H = 0,095 ± 0,116 sem correlação com o comprimento total dos hospedeiros e com diferenças em relação ao sexo dos hospedeiros. Nenhum par de espécies demonstrou associação e covariação positiva ou negativa. A dominância do digenético A. umbilicatum na comunidade parasitária dos robalos jovens pode estar relacionada ao hábito predador e ao aparente período de transição alimentar, que pode levar a uma grande exposição às formas infectantes.

Foram examinados 93 espécimes de Paralonchurus brasiliensis (Steindachner, 1875), provenientes da Pedra de Guaratiba (23º01’S, 43º38’W) litoral do Estado do Rio de Janeiro, Brasil. No período de setembro de 2001 até março de 2002, sendo necropsiados para estudo da sua comunidade de metazoários parasitos. Quinze espécies de parasitos foram coletadas. Paralonchurus brasiliensis é um novo registro de hospedeiro para 13 espécies de parasitos. Contracaecum sp. foi a espécie dominante, com os maiores índices de prevalência e abundância parasitária. Os componentes da comunidade parasitária de P. brasiliensis apresentaram o típico padrão de distribuição superdispersa. A abundância e a prevalência de Procamallanus (Spirocamallus) pereirai apresentaram correlação positiva com o comprimento total do hospedeiro. A abundância de Contracaecum sp. apresentou correlação positiva com o comprimento total do hospedeiro. Um par de endoparasitos adultos (Aponurus laguncula - Procamallanus (S.) pereirai) apresentou covariação negativa e um par de estágios larvais de endoparasitos apresentou covariação positiva entres as abundâncias. Paralonchurus brasiliensis apresentou uma comunidade de metazoários parasitos composta de espécies generalistas, pouco ordenadas e com poucas evidências de associações interespecíficas. Este padrão está em concordância com os estudos realizados com comunidades parasitárias de siaenídeos da região neotropicalNinety-three specimens of banded croaker, Paralonchurus brasiliensis (Steindachner, 1875), collected from Pedra de Guaratiba (23º01’S, 43º38’W), coastal zone, State of Rio de Janeiro, Brazil, between September 2001 and March 2002, were necropsied to study their infracommunities of metazoan parasites. Fifteen species of metazoan parasites were collected. Paralonchurus brasiliensis is a new host record for 13 parasite species. The majority of fishes were parasitized by one or more metazoan. Larvae of Contracaecum sp. proved to be the dominant species, with highest prevalence and abundance values. The parasite species of P. brasiliensis showed the typical aggregated distribution pattern. Prevalence and abundance of Procamallanus (Spirocamallanus) pereirai was positively correlated with the host total length. Abundance of Contracaecum sp. was positively correlated with the host total length. The abundances of a pair of adult endoparasites (Aponurus laguncula - Procamallanus (S.) pereirai) showed negative covariation and one pair of larvae stages of endoparasites (Nybelinia sp. – Contracaecum sp.) showed positive covariations between their abundances. Paralonchurus brasiliensis showed a metazoan parasite community composed by generalist species, little ordered and with scarce quantitative evidences of interspecific associations. These patterns agree with those detected in preceding studies about the parasite communities of Neotropical sciaenid fishes.

The temporal and spatial variations of feeding habits and trophic groups of demersal fish species of Santos Bay and the adjacent continental shelf were investigated. The samples were taken in September 2005 and March 2006 by bottom otter trawling. The stomach content analysis of 2,328 specimens of 49 species showed most fish fed on a large range of food items but relied heavily on shrimp, crabs/swimming-crabs, amphipods, mysids, polychaetes, ophiuroids, squids, and teleosteans. The species were classified into ten trophic groups. Shrimp were an important food source in the Santos bay and inner shelf, while ophiuroids were important prey for predators of the middle shelf. Many species relied on crabs/swimming-crabs during the summer, especially on the middle shelf. The spatial and temporal variability in food resource utilization by fish were related to the pattern of distribution and abundance of their prey. The predation on shrimp and crabs/swimming-crabs seems to be related to the water mass dynamics of the region. Intraspecific comparisons demonstrated that most of the species display spatial and/or temporal variation in their diet. The demersal ichtyofauna can also be divided into the more general categories of piscivores, nektonic invertebrate feeders, benthic invertebrate feeders and planktonic invertebrate feeders. A variação temporal e espacial dos hábitos alimentares e dos grupos tróficos de peixes demersais abundantes na baía de Santos e plataforma continental adjacente foi investigada. As amostras foram obtidas em setembro de 2005 e março de 2006, utilizando-se rede de arrasto de fundo. A análise dos conteúdos estomacais de 2.328 exemplares de 49 espécies demonstrou que a maioria se alimentou de uma grande variedade de presas, destacando-se os camarões, caranguejos/siris, anfípodes, misidáceos, poliquetas, ofiuróides, lulas e teleósteos. De acordo com as presas principais, os peixes foram agrupados em dez grupos tróficos. Os camarões foram presas importantes na baía e plataforma interna, e os ofiuróides apenas na plataforma média. Caranguejos/siris tiveram grande importância na dieta de várias espécies durante o verão, em especial na plataforma média. A variação espacial e temporal na alimentação dos peixes esteve associada ao padrão de distribuição e abundância de suas presas. A ingestão de camarões e caranguejos/siris está, provavelmente, associada à dinâmica das massas de água na região. Comparações intraespecíficas demonstraram que a maioria das espécies apresenta variação espacial e/ou temporal na dieta. A ictiofauna demersal pode ser categorizada em grupos tróficos mais abrangentes: piscívoros, comedores de invertebrados nectônicos, comedores de invertebrados bentônicos e comedores de invertebrados planctônicos.

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar (Biologia Marinha) As áreas marinhas protegidas (AMPs) desempenham um papel chave na preservação da biodiversidade e dos habitats, e na gestão sustentável dos recursos naturais. Um desenho representativo, conectado, resiliente e adequado das redes de AMPs requere uma boa compreensão da distribuição das espécies e da sua preferência de habitats. No entanto, um conhecimento detalhado está geralmente concentrado em apenas alguns locais de amostragem e espécies. A presente tese está direcionada para os peixes marinhos em habitats costeiros até os 40 m. A abordagem que foi desenvolvida foca-se no desenho de redes de AMPs planeadas para otimizar benefícios ecológicos. Para esta finalidade, previsões preditivas de um conjunto de variáveis dos peixes foram mapeadas para identificar áreas prioritárias para a conservação de múltiplos espécies e objetivos. A dissertação está organizada em sete capítulos. O capítulo 1 dá uma introdução geral ao estado do conhecimento da ciência das AMPs, modelos de distribuição de espécies (MDEs) e ao ecossistema marinho da área de estudo, que integra duas ilhas vizinhas do arquipélago dos Açores (Nordeste Atlântico). Uma visão geral da rede existente de AMPs e das pescas regionais está descrita. O capítulo conclui com a motivação e objetivos desta dissertação. O capítulo 2 apresenta o método de amostragem para aquisição dos dados de ictiofauna, a seleção das espécies-alvos, e os dados ambientais que foram usados na dissertação. Os principais métodos de MDEs utilizados para a produção de mapas preditivos são explicados em detalhe. Este capítulo é a base metodológica para os seguintes três capítulos. Abundância ou presença-ausência de peixes de recife com diferentes ecologias tróficas são modelados e mapeados no capítulo 3. Os resultados mostram que o ambiente determinou o padrão espacial das espécies estudadas. Por exemplo, a abundância foi sempresuperior na interface entre os principais tipos de habitat: rocha e sediment. As áreas com a presença potencial de espécies individuais foram espalhadas na área de estudo mas mais pequenos para múltiplas espécies de um determinado nível trófico. Estes hotspots de multi-espécies são uma potencial contribuição para o 'efeito de reserva' minimizando a área necessária para a conservação. O capítulo 4 apresenta modelos espaciais para a biomassa desovante e a fecundidade potencial (o número de oócitos das fêmeas matures) de peixes de recife selecionados. As duas medidas mostraram uma distribuição espacial heterogénea por espécie e influenciada pela batimetria, forças oceanográficas e distância à fronteira do habitat. Mapas de fecundidade potencial refinaram os padrões espaciais da biomassa desovante para espécies com um sex-ratio altamente enviesado para os machos. Hotspots reprodutivos de várias espécies são potenciais "habitats fonte" aumentando a produção e exportação de larvas para áreas adjacentes. Como tal, vêm potencialmente apoiar o "efeito de recrutamento" das AMPs. Consequentemente, a sua total proteção deve ser promovida. Diferentes índices de biodiversidade e de vulnerabilidade intrínseca para a pesca são analisados no capítulo 5. A proteção de locais de alta biodiversidade é frequentemente exigida em conservação marinha. No entanto, os resultados mostraram que somente os padrões de biodiversidade podem não representar bem as áreas de maior interesse e necessidade para a conservação. A integração da vulnerabilidade intrínseca para a pesca no planeamento espacial resultou numa identificação mais precisa de sítios prioritários. A combinação de ambos os parâmetros é proposta como uma nova abordagem para apoiar o planeamento espacial marítimo que serve a gestão pesqueira e os objetivos de conservação. O capítulo 6 é uma análise abrangente que combina os mapas preditivos que foram produzidos nos três capítulos anteriores com outras características do habitat e sócio-econômicos. Cenários alternativos da rede de reserva foram produzidos com o software 'Marxan', considerando diferentes alvos de conservação e objetivos. Os resultados demonstraram que a estatística da rede (ex. tamanho, 'rácio da-borda-à-área', e percentagem da linha de costa protegida) e o posicionamento da reserva foram influenciados, principalmente, pelos diferentes níveis de proteção. As diferenças foram menos pronunciadas entre soluções que se focaram na pesca ou na conservação da biodiversidade. As soluções criadas pelo Marxan correspondem parcialmente à atual rede de AMPs. Estas mostram alternativas para a localização e tamanho das áreas protegidas, que podem ser usadas em processos de gestão adaptativa. O capítulo 7 combina a discussão geral dos resultados da dissertação, impactos e possíveis trabalhos futuros. Os resultados evidenciam que as AMPs não podem beneficiar igualmente todas as espécies, portanto, é fundamental incluir informação da ecologia espacial de multi-espécies no seu desenho. Análises de representatividade mostraram que todos os hotspots de multi-espécies são quantitativamente bem integrados na rede existente de AMPs. Porém dada a elevada importância biológica/ecológica e a pequena extensão destes hotspots, os futuros processos de gestão devem promover a proteção de toda a área de hotspots para assegurar o seu funcionamento ecológico. Devido à sua clareza a aplicação de mapas preditivos deve ser uma ferramenta prioritária para a gestão do espaço marítimo, especialmente em situações de escassez de dados, desde que rigorosos critérios de validação sejam aplicados. O enquadramento apresentado é simples, direto e eficiente na identificação de habitats com potencialmente alta abundância, fecundidade, diversidade e vulnerabilidade para a pesca. Propõe-se a integração desta abordagem promissora como um primeiro passo de um múltiplo processo para a identificação de sítios prioritários para a conservação que servem vários objetivos. ABSTRACT: Marine protected areas (MPAs) can play a key role in preserving biodiversity and habitats and in managing the sustainable use of natural resources, including fish stocks. Designing representative, connected, resilient, and adequate MPA networks requires a good understanding of the species’ distribution and habitat preferences. Yet, detailed knowledge is often reduced to a few sampled locations and species. This thesis focuses on marine reef fishes in coastal habitats down to the 40 m isobath. A framework is developed to design MPA networks that optimise ecological benefits. For this purpose, predictive distributions of a set of fish variables are spatialised to identify potential sites of priority for conservation that can serve multiple species and objectives. The thesis is organised in seven chapters. Chapter 1 gives an overall introduction to the state of the art on the science of MPAs, species distribution models (SDMs) and the marine ecosystem of the study area, two neighbouring islands of the Azores archipelago (Northeast Atlantic). It includes an overview of the existing MPA network and regional fisheries. The motivation and objectives of the thesis are outlined. Chapter 2 presents the sampling method to acquire fish data, the selection of individual study species, and the environmental data that are used in the thesis. The main methods and background knowledge for the statistical models used to describe the species-environment relationships and to produce predictive maps are explained in detail, setting the basis for the following three chapters. The occurrence and abundance of reef fishes with different trophic ecologies are modelled and spatialised in chapter 3. Results showed that the environment shapes the spatial distribution patterns of the reef fishes. For instance, the abundance was typically highest at the interface between rock and sediment, highlighting the importance of this main ecotone for subtidal fish assemblages. Individual species were predicted to occur in large parts of the study area but these areas were much smaller if multiple species from the same trophic guild were considered. These multi-species abundance hotspots can be a major potential contribution to the 'reserve effect' of MPAs while minimising the area needed for protection. Chapter 4 presents spatially explicit models for the spawning biomass and the potential fecundity (number of oocytes of mature females) of selected reef fishes. The spatial distribution of both measures was heterogeneous, species-specific and influenced by bathymetry, oceanographic forces and the distance to the habitat edge. Maps of the potential fecundity further refined the spatial patterns of the spawning biomass for species with sex-ratios highly skewed towards males. Multi-species reproductive hotspots were identified and are potential 'source habitats' of increased larvae production and export to adjacent areas. As such, they potentially support the 'recruitment effect' of MPAs and their complete protection should be promoted. Chapter 5 evaluates different indices of biodiversity and vulnerability to fishing of fish assemblages. The protection of high-biodiversity sites is often demanded in marine conservation. Yet, results showed that biodiversity patterns alone may not represent well the areas of higher need for conservation. Integrating the intrinsic vulnerability to fishing in spatial planning resulted in a more precise identification of priority sites. The combination of both parameters is proposed as a novel approach to support marine spatial planning that serves fisheries management and conservation objectives. Chapter 6 is one comprehensive analysis that combines the predictive maps produced in the previous three chapters with additional habitat and socio-economic characteristics. Alternative scenarios for a reserve network are produced with the systematic conservation software 'Marxan' considering different conservation targets and objectives. Results demonstrated that the network statistics (e.g. size, edge-to-area ratio, and percentage of protected coastline) and reserve localisation were mainly influenced by the targeted level of protection. In contrast, differences were less pronounced between solutions that focused either on fisheries aspects or the protection of biodiversity within a given conservation target. The solutions provided by Marxan overlapped only partially with the existing MPA network. They provide potential alternatives for the location and size of protected areas that can be used in adaptive management processes. Chapter 7 combines a general discussion of the thesis results, impacts and possible future work. Results highlight that MPAs may not equally benefit all species, thus it is critical to include information of multi-species spatial ecology in their design. Analyses of representativeness showed that all multi-species hotspots are quantitatively well integrated in the existing MPA network. However, given the high biological/ecological significance and the rather small extent of these hotspots, future adaptive management processes should, possibly, promote the protection of the entire area of the hotspots to ensure their ecological functionality. Because of its clarity the application of predictive species distribution maps should be a principle tool for marine spatial management, especially in data scarce situations, provided that rigorous validation criteria are applied. The presented framework is simple, straightforward and efficient in identifying habitats with potentially high fish abundance, fecundity, biodiversity or vulnerability to fishing. It is proposed to integrate this promising approach as a first step of a manifold process for the identification of priority sites for conservation that serve multiple purposes.

Dissertação de Mestrado, Estudos Integrados dos Oceanos, 29 de Julho 2013, Universidade dos Açores. De forma a estudar as possíveis alterações da comunidade de peixes da Baía de Porto Pim (Faial, Açores) em termos de composição e riqueza específicas e abundância, foram analisados dados recolhidos em três períodos de amostragem com rede de arrasto de praia. No primeiro período realizaram-se 11 meses de amostragem entre os meses de Junho de 1989 e Junho de 1990, no segundo, foram realizados 18 meses de amostragem entre Agosto de 1997 e Setembro de 1999, e no terceiro período foram realizados 12 meses de amostragem de Julho de 2011 e Junho de 2012. No terceiro período, foram analisadas as variações diárias e sazonais, tendo sido detectado uma preferência da comunidade por períodos nocturos e de baixa-mar, e fortes variações sazonais com valores elevados de abundância no Verão e mais baixos no Inverno. A análise dos três períodos permitiu determinar a existência de diferenças entre eles e relaciona-las com a variação da composição específica nos diferentes anos. A presença de uma grande densidade de juvenis de várias espécies ao longo de todo o ano, em todos os períodos reforça a ideia de que a Baía de Porto Pim se trata de uma importante zona de maternidade. ABSTRACT: The aim of this work was to study possible changes in the fish community at Porto Pim Bay (Faial, Azores) in terms of compositions and specific richness, and also abundance. Data were collected with seine beach and three sampling periods were analyzed. In the first period, 11 months were sampled between July 1989 and June 1990; in the second period 18 months were sampled between August 1997 and September 1999; and in the third, 12 months were sampled between July 2011 and June 2012. Daily and seasonal changes were analyzed for the third period. The fish community showed preference for low tide periods at night and strong seasonal changes were observed with higher values of abundance in the summer and lower values in the winter. The analysis of the three sampling periods allowed determining the existence of significant differences between all of them. These differences were related to variations in species composition of the Bay in the different periods. The presence of high density juveniles of several species, throughout all year in each sampling period, reinforces the idea that Porto Pim Bay represents an important nursery ground.

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O número de espécies de peixes marinhos listadas para a costa do estado de São Paulo é razoavelmente alto em comparação com outras áreas do Brasil com extensão semelhante, a maior parte representada por espécies demersais que resultaram de coletas realizadas ao longo da plataforma continental. Espécies de fundos rochosos e áreas de recifes e de regiões profundas do oceano são menos abundantes. Como o inventário ainda é incompleto e nenhum projeto foi realizado através do programa BIOTA/FAPESP, espera-se que grupos de pesquisa engajados no estudo de sistemática, biologia e outros aspectos relativos aos peixes marinhos sejam estimulados a contribuir para aumentar o conhecimento atual do grupo. The number of marine fish species listed for the coast of the São Paulo state is reasonably high in comparison with other Brazilian coastal regions of similar extension and mostly represented by demersal species that resulted from collecting efforts along the continental shelf. Species from rocky bottoms and reef areas as well as those from the deep sea are less abundant. Since the inventory is far from complete and no projects related to marine fishes have been carried out through the BIOTA/FAPESP program, it is expected that research groups involved in systematics, biology and other aspects related to the study of marine fishes be stimulated to contribute to increase of the knowledge of the group.

Mercury distribution in the oceans is controlled by complex biogeochemical cycles, resulting in retention of trace amounts of this metal in marine biota. The impact of upwelling processes in this metal behavior has been overlooked. Data from literature are insufficient to evaluate the risks associated with the presence of mercury in the fish collected in upwelling areas and its consumers. Therefore, the aim of the present work was to perform a study of mercury speciation in four fish species belonging to different trophic levels from Cabo Frio-Brazil upwelling region. The total mercury content vary of 53 ng g-1 (Sardinella brasiliensis -sardine) to 1215 ng g-1 (Cynoscion striatus -striped weakfish) and, with exception of the planktivorous fish, methylmercury levels reaches circa 90% of total mercury concentration.A distribuição de Mercúrio nos oceanos é controlada por um complexo ciclo biogeoquímico, resultando na retenção de pequenas quantidades na biota marinha. O impacto dos processos de ressurgência costeira no comportamento desse metal tem sido negligenciado. Dados da literatura são insuficientes para elucidar o risco associado com a presença de mercúrio em peixes capturados em áreas de ressurgência e seus consumidores. Portanto o objetivo do presente trabalho foi realizar um estudo de especiação de mercúrio em quatro espécies de peixes pertencentes a diferentes níveis tróficos da região de ressurgência de Cabo Frio-Brasil. O conteúdo total de mercúrio variou de 53 ng g-1 (Sardinella brasiliensis -sardinha) to 1215 ng g-1 (Cynoscion striatus -pescada) e, com exceção da espécie planctivora, os níveis de metilmercúrio atingem cerca de 90% da concentração total de mercúrio.

Bactérias ácido-láticas (BAL) constituem um grupo diverso, associado à produção de alimentos, incluindo fermentados de peixe. Por meio de processos fermentativos, é possível obter produtos mais saborosos e saudáveis. Estas bactérias também são importantes na medicina por suas atividades probióticas. Neste contexto, nove linhagens de bactérias ácido-láticas foram isoladas de sardinha e guaivira. Destas, duas linhagens foram caracterizadas fisiologicamente, juntamente com Leuconostoc mesenteroides ATCC8293. Lactobacillus homohiochii F3 apresentou ótimo crescimento a 40 ºC, diferente de Lactobacillus intestinalis G1 e Leuconostoc mesenteroides ATCC8293, que tiveram ótimo crescimento a 30 ºC. Em relação à tolerância ao NaCl, L. homohiochii F3 e L. mesenteroides ATCC8293 toleraram uma concentração de 5% de NaCl no meio. A espécie L. intestinalis G1 tolerou uma concentração de 7,5%, podendo ser considerada mais halotolerante que as demais espécies. L. mesenteroides ATCC8293, por causa do aumento da taxa de crescimento, pode ser considerada levemente halofílica. Na presença de concentrações não ótimas de NaCl, a adição de solutos orgânicos foi eficaz na restauração do balanço osmótico das células Lactic acid bacteria constitute a diversified group associated with the production of food, including fermented fishes. Through fermentative processes, it is possible to obtain several healthy and tasty products. Those bacteria are also important in medicine due to their probiotic activities. In this context, nine lactic acid bacteria were isolated from sardine and leatherjacket fish. Among them, two lineages, and the reference strain Leuconostoc mesenteroides ATCC8293 were physiologically characterized. Lactobacillus homohiochii F3 grew optimally at 40 ºC, differently from Lactobacillus intestinalis G1 and Leuconostoc mesenteroides ATCC8293 that grew optimally at 30 ºC. With regard to NaCl tolerance, L. homohiochii F3 and L. mesenteroides ATCC8293 grew in media containing 5% NaCl. Lactobacillus intestinalis G1 grew in media containing 7.5% NaCl and can be considered more halotolerant than the other species. L. mesenteroides ATCC8293 can be considered slightly halophilic. In non-optimal NaCl concentrations, the addition of organic solutes to the culture media was effective in restoring the osmotic balance of the bacteria

Estudamos a dieta dos juvenis de Trachinotus carolinus (Linnaeus, 1766) em praias da Baía de Sepetiba (Rio de Janeiro, Brasil) entre janeiro de 2000 e abril de 2001. Procuramos avaliar a plasticidade trófica de peixes desta espécie ao longo de um gradiente espacial com diferentes níveis de exposição às ondas, sazonalidade, além de avaliar mudanças ontogenéticas na dieta. Os itens alimentares foram analisados através do índice de importância relativa (IIR), determinado pelos valores das frequências de ocorrência, de número e de peso. Os itens de maior importância foram do subfilo Crustacea, ordens Mysidacea, e o representante da ordem Decapoda Emerita brasiliensis (Schmitt, 1935), além de Cefalochordata, representado por Branchiostoma platae (Fitzinger, 1862). Na zona de maior exposição às ondas (praia de Barra de Guaratiba) e com substrato predominantemente arenoso, a dieta foi constituída principalmente por Emerita brasiliensis e Cirripedia, este último presente nos costões rochosos que limitam a praia; na zona de exposição intermediária (praia de Muriqui), houve um predomínio de Mysidacea e Branchiostoma platae; na zona mais protegida (praia de Itacuruçá), os itens de maior abundância foram Polychaeta, Mysidacea e Branchiostoma platae. Sazonalmente não ocorreu variação no uso de Mysidacea, enquanto Branchiostoma platae foi mais consumido durante o inverno, Polychaeta na primavera e Cirripedia e Emerita brasiliensis, no verão. Mysidacea foi o alimento predominante em todas as classes de tamanho, enquanto Polychaeta foi utilizado predominantemente por peixes menores que 20 mm de comprimento padrão e Emerita brasiliensis e Cirripedia foram consumidos principalmente por indivíduos maiores que 40 mm, somente na praia de maior exposição. O sucesso no uso de praias desprotegidas e zonas de arrebentação por esta espécie de peixe pode ser em parte devido à estratégia trófica oportunista, que utiliza uma ampla variedade de recursos disponíveis no ambiente. We studied the diet of juvenile Trachinotus carolinus (Linnaeus, 1766) in sandy beaches of Sepetiba Bay (Rio de Janeiro, Brazil), between January 2000 and April 2001. We tried to evaluate the trophic plasticity of fish this species along a spatial gradient of wave exposure, seasonality, besides to evaluate ontogenetic changes in the diet. The Index of Relative Importance (IRI) was used to measure the food items, determined by their frequency of occurrence, numbers and weights. The subphylum Crustacea, mainly the order Mysidacea, Decapoda Emerita brasiliensis (Schmitt, 1935) and Cephalochordata, represented by Branchiostoma platae (Fitzinger, 1862) were dominant in the diet. In the most exposed zone (Barra de Guaratiba beach) with predominant sandy substrate, the diet was comprised mainly by Emerita brasiliensis and Cirripedia, this later item common in rocky shores at the beach edge; in the intermediate exposed beach (Muriqui beach), Mysidacea and Branchiostoma platae; in the most protected beach (Itacuruçá beach), Polychaeta, Mysidacea and Branchiostoma platae was predominant. No seasonal change was recorded for the use of Mysidacea, while Branchiostoma platae was the more consumed during the winter, Polychaeta in spring, Cirripedia and Emerita brasiliensis, in summer. Mysidacea was the predominate food in all size classes, while Polychaeta was used predominantly by fish smaller than 20 mm standard length (SL) and Emerita brasiliensis and Cirripedia, were consumed mainly by larger individuals than 40 mm in the most exposed beach only. The success in use of surf zones and sand beaches by this fishes species, it can be partly, due the opportunist trophic strategy that uses a wide variety of available resources on environmental.

Dissertação (Mestrado) - Centro de Biociências e Biotecnologia da Universidade Estadual do Norte Fluminense, Campos dos Goytacazes, RJ, 2010. Bibliografia: p. 57-67. Sob condições estáveis ou de inst abilidades períodicas, a organização de comunidades naturais está ajustada às variacões espaço-temporais e suas populações apresentam ótimos limites de tolerância (Odum, 1988). A interação entre as espécies e os fatores do meio podem fa vorecer ou dificultar o desenvolvimento dos indivíduos em suas dist intas fases de vida (Yáñez -Arancibia & Sanchez-Gil, 1988).

A ecologia humana analisa as relações entre populações humanas e os recursos naturais e pode gerar informações úteis para o manejo das atividades de pesca em áreas costeiras. Este estudo foi realizado nos anos de 2007 e 2008 em duas comunidades de pescadores do litoral sul do Brasil, localizadas nas praias da Guarda do Embaú (GE) e Pinheira (PP), no estado de Santa Catarina. Os principais objetivos deste estudo foram: analisar as estratégias de pesca e as interações entre diferentes grupos humanos nas atividades da pesca artesanal de subsistência; identificar as decisões e estratégias utilizadas pelos pescadores na pesca artesanal comercial e registrar o conhecimento ecológico local (CEL) dos pescadores de duas comunidades sobre os peixes, comparando-o com o conhecimento científico e comparando o CEL entre as comunidades. Na praia da GE foi registrado o número de pescadores e obtidas as seguintes variáveis da pesca através de entrevistas realizadas com estes pescadores: procedência, atividade econômica, petrechos e técnicas utilizadas, tempo gasto pescando e pontos de pesca utilizados, além da composição e biomassa de peixes capturados. Na época de migração de tainhas e paratis (Mugil platanus e M. curema), pescadores locais e ocasionais (de outras regiões) intensificaram a atividade da pesca, registrando um maior rendimento pesqueiro. As técnicas de pesca (espía e sarraio utilizadas com tarrafas e a vara de pesca) utilizadas pelos pescadores (n=163), apresentaram diferenças quanto à produtividade e seletividade. A espía foi a técnica mais produtiva. O sarraio e a espía foram técnicas mais seletivas, quando comparadas à vara de pesca. Foi evidenciada a partilha de nicho entre os pescadores locais e ocasionais quanto ao uso do espaço de pesca e das estratégias de captura utilizadas. Foram observados indícios de regras de uso do espaço de pesca: o respeito dos pescadores ocasionais sobre o ponto de pesca utilizado apenas pelos pescadores locais, além de um comportamento territorial dos pescadores locais que defenderam o ponto de pesca através de sanções sociais (intimidação). Foram registrados os fatores sócio-ecológicos que favorecem planos de co-manejo pesqueiro, como a presença da associação de pescadores dentre outros. A pesca na praia da Pinheira foi analisada através do modelo de forrageio ótimo a partir de um “lugar central” (ponto de saída das embarcações de pesca), que prevê que os pescadores procurarão maximizar os ganhos (biomassa de peixe capturada) em pontos de pesca mais distantes intensificando o esforço de captura. Foram registrados os seguintes dados dos desembarques pesqueiros (n=285): técnicas e áreas de pesca, tempo de viagem até as áreas de pesca (custos), tempo de permanência nas áreas de pesca (esforço) e espécies capturadas (benefícios). O comportamento dos pescadores não seguiu as premissas do modelo de forrageio ótimo. Os pescadores das técnicas de pesca caceio e fundeio visitaram as áreas de pesca de maior probabilidade de boas capturas, independente da distância do “lugar central”. Para encontrar esses lugares os pescadores utilizaram técnicas de sondagem que indicaram as áreas de pesca de maior produtividade. Também foram realizadas entrevistas com pescadores das praias da GE (n=28) e PP (n=31), com mais de dez anos de experiência na atividade, com o objetivo de registrar o conhecimento ecológico local (CEL) e compará-lo com a literatura científica e com estudos biológicos. Foi registrado o CEL dos pescadores sobre a abundância, período de reprodução e itens alimentares ingeridos por 7 espécies de peixes na GE e 13 espécies na PP. Foram coletados peixes de cinco espécies junto aos pescadores da PP para análises dos aspectos reprodutivos e alimentares. Os pescadores das duas comunidades possuem um conhecimento detalhado sobre as espécies de peixes, que foi influenciado por fatores como a utilidade e a abundância dos peixes e esteve de acordo com a literatura científica, na maioria das vezes. Algumas informações obtidas pelo CEL não foram encontradas na literatura científica e outras não condizentes com a literatura serviram para formular hipóteses para futuras investigações. Foram registradas diferenças no CEL dos pescadores quanto à biologia das espécies de mugilídeos e da anchova (Pomatomus saltatrix), quando comparadas as duas comunidades de pesca. O reconhecimento das particularidades das diferentes comunidades de pescadores permite conduzir as estratégias de manejo dos recursos de uma forma participativa e mais eficiente, através de práticas de co-manejo pesqueiro. Human ecology examines the relationships between human populations and natural resources and can generate useful information for management of fishing activities in coastal areas. This study was conducted in the years 2007 and 2008 in two fishing communities of southern Brazilian coast, located at Guarda do Embaú (GE) and Pinheira beaches (PP), state of Santa Catarina. The main objectives of this study were: analyze the strategies of fisheries and interactions between different groups in the activities of artisanal fisheries subsistence, identifying the decisions and strategies used by fishermen on the fishing trade and register the local ecological knowledge (LEK) of fishers of two communities over the fish, comparing it with scientific knowledge and comparing the LEK between communities. On the beach GE was the number of registered fishers and the following variables of fishing through interviews with fishers: origin, economic activity, fishing gear and techniques, time spent fishing and fishing spots used in addition to the composition and biomass fishes. At the time of migration of mullets (Mugil platanus and M. curema), local fishers and fishers occasional (other regions) have intensified the activity of fishing, logging a higher yield fishery. The fishing techniques (espia and sarraio used with cast nets and fishing pole) used by fishers (n = 163) differed in yield and selectivity. The espia was the most productive technique. The sarraio and espia techniques were more selective when compared to the fishing pole. There was evidence for niche sharing between local fishers and occasional about the use of the area of fisheries and capture strategies used. Indication, rules of use of space fishing: respect for the occasional fishers on the fishing spot only used by local fishermen, and a territorial behavior of the local fishers who defended the fishing spot through social sanctions (intimidation). Were recorded the socio-ecological factors that promote co-management plans for fisheries, as the presence of the fishermen's association and others. Fishing on the beach Pinheira was analyzed using the model of optimal foraging from a "central place" (point of exit of fishing vessels), which provides that the fishers seek to maximize gains (biomass of fish caught) in points more distant fishing intensifying the fishing effort. Were recorded the following data of fishing landings (n = 285): techniques and fishing areas, travel time to the fishing areas (costs), time in the fishing areas (effort) and species caught (benefits). The behavior of the fishers did not follow the model assumptions of optimal foraging. The fishers of the fishing techniques caceio and fundeio, visited the fishing areas with the highest probability of good catches, regardless of distance from the "central place". To find these places the fishers used probing techniques indicated that the fishing areas of higher productivity. Were also conducted interviews with fishers from the beaches of GE (n = 28) and PP (n = 31), with over ten years experience in the activity, in order to register the local ecological knowledge (LEK) and compare it with the scientific literature and other biological studies. Were registered fishers LEK on the abundance, breeding period and food items eaten by 7 species of fish and 13 species at GE in the PP. Were collected five species of fish of the fishers at PP for analysis of the reproductive aspects and feeding. Fishers from both communities have a detailed knowledge about the species of fish, which was influenced by such factors as the usefulness and abundance of fish and was in accordance with the scientific literature, most of the time. Some information obtained from LEK was not found in the literature and others not consistent with the literature used to formulate hypotheses for future investigations. Differences in the KEL were fishermen on the biology of the species of mullets and bluefish (Pomatomus saltatrix), compared to the two fishing communities. The recognition of the particularities of different fishing communities allows driving the strategies for managing resources in a participatory manner and more efficiently, through practices of comanagement fisheries.

Com o objetivo de detectar grupos tróficos, foram analisadas amostras de conteúdos estomacais de sete espécies de peixes cartilaginosos. Os exemplares foram coletados no período de Outubro/85 a Julho/87 na plataforma interna de Ubatuba, SP, Brasil (da costa, até a isóbata de 50 m). A importância dos itens alimentares foi analisada através da freqüência numérica (FN) e da freqüência de ocorrência (FO). As espécies foram agrupadas em três grupos distintos: Piscívoros: Squalus cubensis; comedores de peixes e crustáceos bentônicos: Raja castelnaui, Raja cyclophora, Raja agassizi; comedores de invertebrados bentônicos: Psammobatis glansdissimilis, Rhinobatos horkelii, Zapteryx brevirostris.Stomach contents of seven cartilaginous fish species were analysed with the aim to detect trophic groups. Sampling was effectuated between October/85 and July/87 off the coast of Ubatuba (São Paulo, Brazil) in waters up 50 m depth. The relative importance of different components of the diet was expressed as a percentage frequency of occurrence and percentage number. The seven species were grouped in: fish feeders - Squalus cubensis; benthonic crustacean and fish feeders - Raja castelnaui, Raja cyclophora, Raja agassizi; benthonic invertebrate feeders - Rhinobatos horkelii, Zapteryx brevirostris, Psammobatis glansdissimilis.

Biomarkers as lipid peroxidation, metallothionein and delta-aminolevulinic acid dehydratase were determined in Cathorops spixii to compare the biological responses of this fish from estuaries with distinct anthropogenic influence. Three areas were selected in two estuaries in accordance with the levels of contamination for the polluted (Santos/São Vicente) and with the hydrodynamic characteristics for the non-polluted (Cananéia) estuary. Water characteristics and mercury levels in C. spixii confirmed a high human influence in the polluted system. In general, the biomarkers showed differences between the estuaries, suggesting disturbances in the specific cell mechanisms due to the presence of multiple xenobiotics in the contaminated system. Therefore, these biomarkers are recommended to promote more accurate information about the exposure to pollutants. Additionally, the study of the effect of the multiple xenobiotics on resident species such as the benthic fish C. spixii can favor a better assessment of the environmental quality of these systems. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Fifty four specimens of marine fish belonging to seven species collected from the coast of the State of Rio de Janeiro, Brazil were examined for helminths, and results relating to Monogenea and Digenea are presented. The monogeneans Metamicrocotyla macracantha, Microcotyle pomatomi and Gotocotyla acanthura are reported in new hosts. The digeneans Parahemiurus merus, Lecithochirium microstomum, Gonocercella pacifica, Aponurus laguncula, Gonocerca trematomi and Lampritrema miescheri are reported in new hosts, and the latter two species are also reported for the first time in Brazil. Cinquenta e quatro espécimens de peixes marinhos pertencentes a sete espécies coletados do litoral do estado do Rio de Janeiro, Brasil foram examinados para helmintos, os resultados referentes a Monogenea e Digenea são apresentados. Os monogenéticos Metamicrocotyla macracantha, Microcotyle pomatomi e Gotocotyla acanthura são apresentados em novos hospedeiros. Os digenéticos Parahemiurus merus, Lecithochirium microstomum, Gonocercella pacifica, Aponurus laguncula, Gonocerca trematomi e Lampritrema miescheri são registrados em novos hospedeiros, as duas últimas espécies são também registradas pela primeira vez no Brasil.