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8 results on '"Pontlevoy, Charline"'

1. Additional file 1 of Predicting male fertility from the sperm methylome: application to 120 bulls with hundreds of artificial insemination records

Author

Costes, Valentin, Chaulot-Talmon, Aurélie, Sellem, Eli, Perrier, Jean-Philippe, Aubert-Frambourg, Anne, Jouneau, Luc, Pontlevoy, Charline, Hozé, Chris, Fritz, Sébastien, Boussaha, Mekki, Le Danvic, Chrystelle, Sanchez, Marie-Pierre, Boichard, Didier, Schibler, Laurent, Jammes, Hélène, Jaffrézic, Florence, and Kiefer, Hélène

Abstract

Additional file 1: Fig. S1.. correlation clustering run on the methylation percentages at CpGs10 covered in at least 22 samples per group. Fig. S2: heatmap run on CpGs discriminant between sperm and somatic cells. Fig. S3: annotation of fertility-related DMRs relative to different genome features. Fig. S4: average DNA methylation at individual LINE and LTR repeats after alignment of the RRBS sequences on a Repbase artificial genome. Fig. S5: pyrosequencing validation of the upstream region of LBX1 gene. Fig. S6: fertility, semen functional parameters and semen sample characteristics in correctly classified and misclassified bulls. Fig. S7: PCA run on the methylation percentages at DMCs, with or without the imputation of missing values. Fig. S8: semen functional parameters before and after correction for the batch effect.

Published
2022
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2. Prediction of bull fertility based on the sperm methylome

Author

Costes, valentin, Chaulot-Talmon, Aurélie, Sellem, Eli, Perrier, Jean-Philippe, Aubert-Frambourg, Anne, Jouneau, Luc, Pontlevoy, Charline, Hozé, Chris, Fritz, Sebastien, Boussaha, Mekki, Le Danvic, Chrystelle, Sanchez, Marie-Pierre, Boichard, Didier, Schibler, Laurent, Jaffrezic, Florence, Kiefer, Hélène, Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement (BREED), Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, BREED, 94700, Maisons-Alfort, France

Subjects
[STAT.ML]Statistics [stat]/Machine Learning [stat.ML], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BDLR.RS]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology/Sexual reproduction
Abstract

International audience

Published
2021

3. APPRENTISSAGE AUTOMATIQUE ET EPIGENETIQUE : PREDICTION DE LA FERTILITE DES TAUREAUX A PARTIR DU METHYLOME SPERMATIQUE

Author

Costes, valentin, Chaulot-Talmon, Aurélie, Sellem, Eli, Perrier, Jean-Philippe, Aubert, Anne, Jouneau, Luc, Pontlevoy, Charline, Hozé, Chris, Fritz, Sebastien, Boussaha, Mekki, Le Danvic, Chrystelle, Sanchez, Marie-Pierre, Boichard, Didier, Schibler, Laurent, Jammes, Hélène, Jaffrezic, Florence, Kiefer, Hélène, Perrier, J-P, Sanchez, M-P, Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement (BREED), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Ecole Nationale Vétérinaire d’Alfort, BREED, 94700, Maisons-Alfort, France

Subjects
[MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BDLR.RS]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology/Sexual reproduction
Abstract

International audience

Published
2021

4. Effects of aging on epigenetics of immune cells in dairy cattle

Author

Jammes, Hélène, Chaulot-Talmon, Aurélie, Pontlevoy, Charline, Jouneau, Luc, Richard, Christophe, Foucras, Gilles, Kiefer, Hélène, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Saclay (COmUE), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM (UR 0892)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, European Federation of Animal Science (EAAP). INT., and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2019

5. Effet du vieillissement chez le bovin sur le méthylome des monocytes à génome constant

Author

Jammes, Hélène, Chaulot-Talmon, Aurélie, Pontlevoy, Charline, Jouneau, Luc, Gelin, Valerie, Richard, Christophe, Ledoux, Dorothee, de Boyer des Roches, Alice, Kiefer, Hélène, Foucras, Gilles, ProdInra, Migration, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Saclay (COmUE), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Lyon (COMUE), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
[SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2019

6. Complémentarité des observations comportementales en direct et via des capteurs pour détecter précocement l’inflammation et la douleur chez la vache

Author

Ledoux, Dorothee, Meunier, Bruno, Jammes, Hélène, Gelin, Valerie, Richard, Christophe, Pontlevoy, Charline, Robcis, Rodolphe, Devriendt, Noémie, Andanson, Stéphane, Delval, Eric, Chandeze, Herve, Ravel, Christine, Foucras, Gilles, de Boyer des Roches, Alice, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Saclay (COmUE), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

National audience

Published
2018

7. Eplmmun: Effets du vieillissement sur la réponse inflammatoire chez la vache laitière

Author

Jammes, Hélène, Foucras, Gilles, de Boyer des Roches, Alice, Ledoux, Dorothee, Gelin, Valerie, Richard, Christophe, Robcis, Rodolphe, Pontlevoy, Charline, Prézelin, Audrey, Chaulot-Talmon, Aurélie, Sellem, Eli, Delval, Eric, Chandeze, Herve, Ravel, Christine, Biologie du Développement et Reproduction (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Paris Saclay (COmUE), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UE 1298 Unité Commune d'Expérimentation Animale, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)

Subjects
processus épigénétiques, [SDV]Life Sciences [q-bio], réponse immunitaire, efficience, [INFO]Computer Science [cs], vieillissement, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract

National audience

Published
2018

8. Eplmmun: Effets du vieillissement sur la réponse inflammatoire chez la vache laitière

Author

Foucras, Gilles, De Boyer Des Roches, Alice, Ledoux, Dorothee, Gelin, Valerie, Richard, Christophe, Robcis, Rodolphe, Pontlevoy, Charline, Prezelin, Audrey, Chaulot Talmon, Aurélie, Sellem, Eli, Delval, Eric, Chandeze, Herve, Ravel, Christine, and Jammes, Helene

Subjects
réponse immunitaire, efficience, vieillissement, processus épigénétiques, vache laitière, bien-être animal, réponse inflammatoire
Published
2018

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