Anne-Laure Brochet, Philippe Aubry, Frédéric Thomas, Frédéric Albespy, Matthieu Guillemain, Sylvie van der Werf, Hervé Fritz, Michel Gauthier-Clerc, François Renaud, Camille Lebarbenchon, Andy J. Green, Viviane Grandhomme, Génétique et évolution des maladies infectieuses (GEMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre de recherche de la Tour du Valat, Génétique Moléculaire des Virus Respiratoires, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Office National de la Faune Sauvage (ONCFS), ONCFS, ONCFS - Direction des Etudes et de la Recherche, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie quantitative et évolutive des communautés, Département écologie évolutive [LBBE], Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Department of Wetland Ecology, Estación Biológica de Doñana (EBD), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC)-Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Département de Sciences Biologiques [Montreal], Université de Montréal (UdeM), SSP/8.1 no 044490, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), and Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Since the recent spread of highly pathogenic (HP) H5N1 subtypes, avian influenza virus (AIV) dispersal has become an increasing focus of research. As for any other bird-borne pathogen, dispersal of these viruses is related to local and migratory movements of their hosts. In this study, we investigated potential AIV spread by Common Teal (Anas crecca) from the Camargue area, in the South of France, across Europe. Based on bird-ring recoveries, local duck population sizes and prevalence of infection with these viruses, we built an individual-based spatially explicit model describing bird movements, both locally (between wintering areas) and at the flyway scale. We investigated the effects of viral excretion duration and inactivation rate in water by simulating AIV spread with varying values for these two parameters. The results indicate that an efficient AIV dispersal in space is possible only for excretion durations longer than 7 days. Virus inactivation rate in the environment appears as a key parameter in the model because it allows local persistence of AIV over several months, the interval between two migratory periods. Virus persistence in water thus represents an important component of contamination risk as ducks migrate along their flyway. Based on the present modelling exercise, we also argue that HP H5N1 AIV is unlikely to be efficiently spread by Common Teal dispersal only.