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Introduction: The 2019 coronavirus pandemic (COVID-19) has caused around 25 million cases worldwide. Asymptomatic patients have been described as potential sources of transmission. However, there are difficulties to detect them and to establish their role in the dynamics of virus transmission, which hinders the implementation of prevention strategies. Objective: To describe the behavior of asymptomatic SARS-CoV-2 virus infection in a cohort of workers at the El Dorado “Luis Carlos Galán Sarmiento” International Airport in Bogotá, Colombia. Materials and methods: A prospective cohort of 212 workers from the El Dorado airport was designed. The follow-up began in June, 2020. A survey was used to characterize health and work conditions. Every 21 day, a nasopharyngeal swab was taken to identify the presence of SARS-CoV-2 using RT-PCR. We analyzed the behavior of the cycle threshold (ORF1ab and N genes) according to the day of follow-up. Results: In the first three follow-ups of the cohort, we found an incidence of SARS-CoV-2 infection of 16.51%. The proportion of positive contacts was 14.08%. The median threshold for cycle threshold was 33.53. Conclusion: We characterized the asymptomatic SARS-CoV-2 infection in a cohort of workers. The identification of asymptomatic infected persons continues to be a challenge for epidemiological surveillance systems. Introducción. La pandemia de COVID-19 ha ocasionado cerca de 25 millones de casos en el mundo. Se ha descrito que los pacientes asintomáticos pueden ser fuentes de transmisión. Sin embargo, es difícil detectarlos y no es claro su papel en la dinámica de transmisión del virus, lo que obstaculiza la implementación de estrategias para la prevención. Objetivo. Describir el comportamiento de la infección asintomática por SARS-CoV-2 en una cohorte de trabajadores del Aeropuerto Internacional El Dorado "Luis Carlos Galán Sarmiento" de Bogotá, Colombia. Materiales y métodos. Se diseñó una cohorte prospectiva de trabajadores del Aeropuerto El Dorado. El seguimiento se inició en junio de 2020 con una encuesta a cada trabajador para caracterizar sus condiciones de salud y trabajo. Cada 21 días se tomó una muestra de hisopado nasofaríngeo para detectar la presencia del SARS-CoV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR). Se analizó el comportamiento del umbral del ciclo (cycle threshold) de los genes ORF1ab y N según el día de seguimiento. Resultados. En los primeros tres seguimientos de la cohorte se encontró una incidencia de la infección por SARS-CoV-2 del 16,51 %. La proporción de contactos positivos fue del 14,08 %. La mediana del umbral del ciclo fue de 33,53. Conclusión. Se determinaron las características de la infección asintomática por el SARSCoV-2 en una cohorte de trabajadores. La detección de infectados asintomáticos sigue siendo un reto para los sistemas de vigilancia epidemiológica.

IntroductionSARS-CoV-2 is a new member of the genusBetacoronavirus, responsible for the COVID-19 pandemics. The virus crossed the species barrier and established in the human population due to its ability to exploit the ACE receptor for virus entry, which is present and abundant in several tissues, including the lung and respiratory tract, gastrointestinal tract and hearth. Virus interaction with the cellular receptor is mediated by the surface protein, known as Spike. Another structural protein of major importance in the Nucleocapsid, directly interacting with the viral RNA to form the ribonucleocapsid, considered a multifunctional protein, and being the target of the most molecular diagnostics assays.ObjectiveTo describe the frequency of substitutions in spike and nucleocapsid proteins of SARS-CoV-2 circulating in Colombia and evaluate the frequency of these substitutions in SARS-CoV-2 sequences from other countries of South America.Materials and methodsSamples of 43 patients were included for viral RNA detection by real-time RT-PCR using the Charité-Berlin protocol for the amplification of the SARS-CoV-2 E and RdRp genes. Genome sequences were obtained through the Oxford Nanopore and Illumina MiSeq technologies, following the artic.network “nCoV-2019 sequencing protocol”. Available genomes were consulted from GISAID, GenBank, and Genome sequence archive (GSA) and a total of 371 genomes sequences from South America were included. The genome sequences were aligned with the Muscle tool using the MEGA X software. Substitution matrices of the Colombian sequences respect to the reference genome (NC_045512) at the nucleotide and amino acid levels were generated for the spike and nucleocapsid gene.Resultssubstitution D614G in the amino acid sequence of spike protein was found in 86.7% of the Colombian sequences; substitutions G181V and D936Y in 2.3%, respectively. Five substitutions were found in the nucleocapsid protein, with substitution R203K and G204R being the most frequent (13.95 %) in Colombia. The substitutions D614G in Spike and R203K-G204R in nucleocapsid have a frequency of 83% and 28% respectively in sequences from South America.ConclusionNon-synonymous substitutions were found in the spike and nucleocapsid proteins in Colombian genomes, the most frequent being D614G in Spike and R203K-G204R in nucleocapsid. These substitutions are frequent in the genomes reported for other South American countries. It is necessary to continue with genomic surveillance of the changes in Spike and Nucleocapsid proteins during the SARS-CoV-2 pandemic in Colombia and South America, even more considering that these proteins are the most commonly used antigen in serological tests.HighlightsThe spike and nucleocapsid proteins of SARS-CoV-2 circulating in Colombia and South-American countries have similar patterns of non-synonymous substitutionsSubstitutions D614G in Spike and R203K-G204R in Nucleocapsid are the most frequent in Colombia and South-American countries

El desarrollo de mecanismos de prevención y control de las leishmaniasis se ha dificultado en parte por las pocas opciones terapéuticas y por los vacíos en el conocimiento de la interacción entre el parásito y el hospedero. El parásito posee varios mecanismos para modular la respuesta del macrófago, entre estos, la alteración de la expresión genética del macrófago durante la infección. En un trabajo previo del grupo de investigación, por análisis de microarreglos se reportaron los cambios en la expresión de genes de macrófagos derivados de células U937 infectados durante 72 horas con Leishmania Viannia braziliensis. A partir de estos resultados se seleccionó un grupo de genes para ser validados funcionalmente durante la infección in vitro. El gen RhoB que codifica para una pequeña GTPasa hace parte de un grupo de genes expresados diferencialmente entre macrófagos infectados y no infectados. El control de la expresión de esté gen está relacionado con la síntesis del colesterol, proceso que se ha reportado como alterado durante la infección. El objetivo de este trabajo fue validar de manera cuantitativa los niveles de expresión del gen RhoB en los macrófagos infectados y determinar el efecto del silenciamiento genético de RhoB sobre el fenotipo de infección, medido éste como carga parasitaria y porcentaje de infección en los macrófagos infectados con L. (V.) braziliensis. Los niveles de expresión del gen RhoB fueron medidos por PCR en tiempo real en macrófagos entre las 0 y las 120 horas después de la infección in vitro, con el fin de describir la cinética de expresión del gen durante la infección. Posteriormente, se utilizó transducción lentiviral para generar líneas celulares derivadas de U937 con expresión constitutiva de shRNAs dirigidos contra RhoB. El silenciamiento de RhoB y la cantidad de RhoB-activa en las líneas celulares fue determinado por western blot y ensayo de pull-down. Las líneas celulares con mayor nivel de silenciamiento fueron infectadas in vitro para determinar mediante tinción fluorescente y análisis de imágenes el efecto del silenciamiento sobre el porcentaje de infección y la carga parasitaria. Los resultados evidenciaron que el gen RhoB no presenta cambio en su expresión en los macrófagos entre las 0 y las 24 horas después de la infección, pero si se sobre-expresa entre las 48 y las 96 horas, resultados concordantes con los obtenidos previamente con microarreglos. Mediante la evaluación funcional usando shRNAs se encontró que el silenciamiento de RhoB se asocia con reducción en la carga parasitaria y en el porcentaje de infección in vitro. Estos resultados permiten preguntarse si la expresión del gen RhoB podría relacionarse con el establecimiento de la infección, teniendo cuenta que el intervalo de tiempo en que se sobre-expresa el gen coincide con el intervalo reportado en el que los amastigotes se multiplican activamente en el macrófago. Abstract: The development of mechanisms for prevention and control of leishmaniasis has been hampered in part by the few therapeutic options and gaps in the knowledge of the interaction between the parasite and the host. The parasite has several mechanisms to modulate macrophage response, among these, altered macrophage gene expression during infection. In a previous work of the research group, were reported the changes in the expression of genes derived macrophages infected U937 cells for 72 hours with Leishmania Viannia braziliensis by microarray analysis. From these results, a group of genes to be functionally validated for in vitro infection was selected. The RhoB gene encodes a small GTPase is part of a group of genes differentially expressed between infected and uninfected macrophages. The expression controlling of this gene it is associated with cholesterol synthesis, a process that has been reported as altered during infection. The aim of this study was to quantitatively validate the levels of RhoB gene expression in infected macrophages and determine the effect of RhoB gene silencing on the phenotype of infection, measured as parasite load and percentage of infection in L. (V.) braziliensis infected macrophages. The expression levels of the RhoB gene were measured by real-time PCR in macrophages between 0 and 120 hours after in vitro infection, in order to describe the kinetics of gene expression during infection. Subsequently, lentiviral transductions were used to generate cell lines derived from U937 with constitutive expression of shRNAs directed against RhoB. RhoB silencing and the amount of RhoB-active in the cell lines was determined by western blot and pull-down assay. Cell lines with higher silencing was infected in vitro to determine the effect on the rate of infection and parasite load by fluorescent staining and image analysis silencing. The results showed that RhoB was not change in gene expression in macrophages between 0 and 24 hours after infection, but is over-expressed between 48 and 96 hours, consistent with the results previously obtained by microarrays. The RhoB gene silencing was associated with reduction in parasite load and percentage of in vitro infection. These results raise the question whether RhoB gene expression could be related to the establishment of infection, taking account that the time interval in which over-expresses the gene matches the reported range in which they thrive amastigotes in macrophage. Maestría