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De tres cepas de Microsporum canis provenientes de pacientes con Tinea capitis se extrajeron macroconidias que fueron expuestas durante 13 días consecutivos a concentraciones crecientes de ajoene, entre 1 y 300 μM, usando el método de microdilución en placa CLSI M38-A2. Las estructuras fueron evaluadas morfométricamente para observar el efecto de este compuesto sobre el hongo. La comparación entre las conidias normales y las expuestas mostraron diferencias morfológicas. Los efectos in vitro de ajoene fueron tiempo dependiente, capaces de provocar en los fragmoconidios cambios morfológicos drásticos e irreversibles, evidenciados en el notable aumento del espesor de la membrana citoplasmática y en la pérdida de la proporción de los espacios interseptales de las conidias. El ajoene, como agente antimicótico, inhibió el crecimiento conidial, reconocido en microscopia por la deformación de la arquitectura normal de las células. La pérdida de la funcionalidad y viabilidad de las conidias, que se tornaron irregularares, probablemente se encuentran asociadas a alteración de la síntesis de la membrana plasmática e interconidial. From three strains of Microsporum canis isolated from patients with Tinea capitis, macroconidia were extracted. These were exposed during 13 cosecutive days to growing concentrations of ajoene, between 1-300μM, using the microdilution method in plate M38-A2. The structures were monitored morphometrically to observe the effect of this compound on the fungus. The comparison between the normal conidia and those exposed to the compound showed morphologic diferences. The in vitro effects were time dependent, able to induce drastic and irreversible morphologic changes in the fragmoconidia, evidenced in the noticeable increase of thickness of cytoplasmic membrane and in the loss of proportion of the interceptal spaces of conidia. Ajoene, as antimicotic agent, inhibited conidial growth, which is evidenced under the microscope by the deformation of the normal architecture of cells. The loss of function and viability of conidia, which became irregular, is probably associated to alteration of the synthesis of plasmic and interconidial membrane.