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The inherent value of nature is immeasurable. That being said, through bioprospection – the systematic search for functional products or processes from living organisms –, the oceans and marine life have emerged as a relevant source of biodiscoveries that hold significant economic worth. Particularly considering the pharmaceutical industry, an increasing number of natural molecules of marine origin have been making their way into pipelines and receiving approval for clinical use. Still, in its earliest days, this had become an extractivist practice, putting marine environments at risk and nearly driving species to extinction through over-collecting. While it is now well understood that exploration of the oceans’ living resources must withstand a sustainable agenda, thus, protecting the environment from unnatural genetic losses, it was the developments towards achieving more efficient bioprospective strategies and non-destructive but feasible means to assure product supply that pushed for the greatest advances in this field. Herein, we present our assessment of this story by telling it through the 20-year journey – and few detours – we took in the chemical and pharmacological study of the ascidian Eudistoma vannamei, a species endemic to the northeast coast of Brazil that retains novel natural products with remarkable modes of action. Indeed, ascidians figure among the most pharmacologically talented marine organisms, having yielded the active principles of three new anticancer drugs, one of which is being considered for repositioning towards the treatment of COVID-19. Finally, we argue that emphasizing the unceasing biotechnological potential of marine biological diversity, exemplified herein by Brazilian ascidians, but certainly true worldwide for this and many other groups, would work in favor of raising awareness and supporting strategies to foster conservation of the oceans. O valor intrínseco da natureza é incomensurável. Dito isso, por meio da bioprospecção – a busca sistemática de produtos ou processos funcionais a partir de organismos vivos –, os oceanos e a vida marinha emergiram como uma fonte relevante de biodescobertas com significativo valor econômico. Particularmente considerando a indústria farmacêutica, um número crescente de moléculas naturais de origem marinha tem sido alvo de pesquisa e desenvolvimento e recebido aprovação para uso clínico. Ainda assim, em seus primeiros dias, isso se tornou uma prática extrativista, colocando os ambientes marinhos em risco e quase levando espécies à extinção por meio da coleta excessiva. Embora agora seja bem compreendido que a exploração dos recursos vivos dos oceanos deve suportar uma agenda sustentável, protegendo o meio ambiente de perdas genéticas não naturais, foi o desenvolvimento no sentido de alcançar estratégias bioprospectivas mais eficientes e meios não destrutivos, mas viáveis para garantir o suprimento do produto que impulsionou os maiores avanços nesse campo. Aqui, apresentamos essa história contando-a ao longo de uma jornada de 20 anos – e alguns desvios – que fizemos no estudo químico e farmacológico da ascídia Eudistoma vannamei, uma espécie endêmica do litoral nordeste do Brasil, que possui novos produtos naturais com modos de ação notáveis. De fato, as ascídias figuram entre os organismos marinhos mais talentosos farmacologicamente, tendo produzido os princípios ativos de três novos medicamentos anticâncer, um dos quais está sendo considerado para reposicionamento para o tratamento de COVID-19. Por fim, argumentamos que enfatizar o incessante potencial biotecnológico da diversidade biológica marinha, aqui exemplificado pelas ascídias brasileiras, mas certamente verdadeiro em todo o mundo para este e tantos outros grupos, funcionaria a favor da conscientização e apoio a estratégias de promoção da conservação dos oceanos.

A secção UAciência é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. Em abril deste ano observou-se no litoral da ilha de São Miguel um fenómeno novo: acumulações massivas de uma alga castanha. Estes arrojamentos, que vão provavelmente continuar e estender-se a mais lugares da ilha, são a face visível de um processo de colonização por uma alga invasora, Rugulopteryx okamurae, que começou há pouco mais de dois anos, de acordo com um estudo liderado pelo autor deste texto, do Grupo de Biodiversidade dos Açores (cE3c), e submetido para publicação em revista científica internacional. A espécie foi detetada pela primeira vez no início de 2019 na costa sul da Ilha de São Miguel, tendo a identificação sido confirmada por dados moleculares e morfológicos. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

The order Harpacticoida (Copepoda) is composed of microcrustaceans, generally benthic, with wide distribution, and can be found even in deep-sea regions. In these environments, the presence of undersea canyons that present peculiar characteristics that influence the benthic communities is common. The present work aimed to study the occurrence and spatio-temporal distribution of the harpacticoid community in two submarine canyons on the continental margin of Sergipe, Brazil, relating them to environmental variables. The biotic and abiotic samples came from two oceanographic campaigns carried out in March/April (SED3) and October/November (SED4) 2013, through the project “Environmental Characterization of the Sergipe-Alagoas Basin” (MARSEAL), coordinated by PETROBRAS/ CENPES, on the Sergipe continental slope, in the regions of the São Francisco (C) and Japaratuba (E) canyons, at depths of 400, 700, 1,000, 1,300, 1,900 and 3,000 m. At each station, the sediment samples were collected in triplicate, with the aid of a box corer to carry out the physicochemical and biological analyses. The samples for the study of the fauna were cut into strata of 0-2 and 2-5 cm. In the laboratory, the samples were washed in 300 μm sieves and all retained material was sorted under a stereomicroscope and then identified under an optical microscope. As a result, 40 new occurrences were registered for the continental margin of Sergipe, being 27 of these taxa, new records for the Brazilian coast. The Harpacticoida community was composed of 87 species, 45 genera and 18 families. Argestidae, Pseudotachidiidae, Ameiridae, Aegisthidae and Ectinosomatidae were the most abundant families. Of the 2.968 specimens identified in both canyons, the taxa with the highest total abundance were: Sarsameira sp.1, Pseudotachidius spp., Argestes mollis, Cervinia bradyi, Bradya spp., Anoplosomella sp., Pseudotachidius coronatus, Dactylopusia sp., Keraia longiseta and Bradya scotti. The presence of harpacticoids was significantly more abundant in the 0-2 cm superficial stratum (ANOVA, F=69.40, p=3.44e10), confirming existing records in the literature. Considering the sum of the strata, it was observed that the ecological descriptors of the harpacticoids did not vary significantly between the months sampled. Multivariate permutation analysis detected a significant difference in the composition of the harpacticoid community between the two canyons (PERMANOVA, F=24.31, p=0.001). The São Francisco canyon was represented by 616 adult harpacticoid copepods distributed in 59 taxa, 19 of which were not registered in Japaratuba. In the Japaratuba canyon, 2.352 individuals distributed in 81 taxa were identified, however 41 of these did not occur in the São Francisco canyon region. The abundance, richness and diversity index of harpacticoids were higher at intermediate depths when compared to shallower and deeper regions. Depth, temperature and total carbonate were the environmental variables that most influenced the structuring of the harpacticoid community in both canyons. A ordem Harpacticoida (Copepoda) é composta por microcrustáceos, geralmente bentônicos, de ampla distribuição, podendo ser encontrados inclusive em regiões de mar profundo. Nesses ambientes, é comum a presença de cânions submarinos que apresentam características peculiares que influenciam as comunidades bentônicas. O presente estudo teve como objetivo estudar a ocorrência e a distribuição espaço-temporal da comunidade de harpacticóides em dois cânions submarinos na margem continental de Sergipe, Brasil, relacionando-as com as variáveis ambientais. As amostras bióticas e abióticas foram provenientes de duas campanhas oceanográficas realizadas em março/abril (SED3) e outubro/novembro (SED4) de 2013, através do projeto “Caracterização Ambiental da Bacia de Sergipe-Alagoas”(MARSEAL), coordenado pela PETROBRAS/CENPES, no talude continental de Sergipe, nas regiões dos cânions São Francisco (C) e Japaratuba (E), em profundidades de 400, 700, 1.000, 1.300, 1.900 e 3.000 m. Em cada estação, as amostras de sedimentos foram coletadas em triplicata, com o auxílio de um box corer para a realização das análises físico-químicas e biológicas. As amostras destinadas ao estudo da fauna foram recortadas em estratos de 0-2 e 2-5 cm. No laboratório, as amostras foram lavadas em peneiras de 300 μm e todo o material retido foi triado sob microscópio-estereoscópio e, em seguida, identificado sob microscópio ótico. Como resultados, foram registradas 40 novas ocorrências para margem continental de Sergipe, sendo 27 destes táxons, novos registros para costa brasileira. A comunidade de Harpacticoida foi composta por 87 espécies, 45 gêneros e 18 famílias. Argestidae, Pseudotachidiidae, Ameiridae, Aegisthidae e Ectinosomatidae foram as famílias mais abundantes. Dos 2.968 exemplares identificados em ambos os cânions, os táxons que apresentaram maior abundância total foram: Sarsameira sp.1, Pseudotachidius spp., Argestes mollis, Cervinia bradyi, Bradya spp., Anoplosomella sp., Pseudotachidius coronatus, Dactylopusia sp., Keraia longiseta e Bradya scotti. A presença dos harpacticóides foi significativamente mais abundante no estrato superficial de 0-2 cm (ANOVA, F=69,40, p=3,44e-10), confirmando os registros já existentes na literatura. Considerado a soma dos estratos, observou-se que os descritores ecológicos dos harpacticóides não variaram significativamente entre os meses amostrados. A análise multivariada de permutação detectou diferença significativa na composição da comunidade de harpacticóides entre os dois cânions (PERMANOVA, F=24,31, p=0,001). O cânion São Francisco foi representado por 616 copépodes harpacticóides adultos distribuídos em 59 táxons, sendo que 19 destes, não foram registrados no Japaratuba. No cânion Japaratuba, foram identificados 2.352 indivíduos distribuídos em 81 táxons, contudo 41 destes, não ocorreram na região do cânion São Francisco. A abundância, riqueza e índice de diversidade dos harpacticóides se mostraram mais elevados em profundidades intermediárias quando comparada a regiões mais rasas e profundas. A profundidade, a temperatura e o carbonato total foram as variáveis ambientais que mais influenciaram na estruturação da comunidade de harpacticóide em ambos os cânions. São Cristóvão, SE

Orientadora: Profa. Dra. Maria Angélica Haddad Coorientadora: Dra. Susel Castellanos Iglesias Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa : Curitiba, 31/03/2021 Inclui referências Resumo: Hidroide é o nome comum da fase polipoide das espécies da Classe Hydrozoa, Filo Cnidaria. Hydrozoa e outras classes do Subfilo Medusozoa incluem, no ciclo de vida, uma alternância de gerações entre a fase polipoide, bentônica e assexuada, e a fase medusoide, pelágica e sexuada. Este grupo de cnidários é um dos mais diversos do ambiente bentônico consolidado, com mais de 3.200 espécies já descritas. Os objetivos deste trabalho foram realizar novos levantamentos de hidroides da Subclasse Anthoathecata (atecados), atualizar a lista de espécies desses organismos em Cuba e avaliar sua diversidade e distribuição em dois ecossistemas marinhos da plataforma rasa, recifes de corais e gramas marinhas. A diversidade dos atecados foi ainda relacionada com indicadores de contaminação orgânica nos recifes de coral e com indicadores de qualidade da água em gramas marinas. As coletas foram feitas em Março/2013 e Maio/2011, respectivamente, em recifes de corais de norte Havana e em pradarias de gramas marinhas em Caibarien, Villa Clara. Em mergulho autônomo, as técnicas de coleta foram censos visuais direcionados à raspagem dos hidroides, ao longo de transecções, e censos indiretos de raspagem total dos organismos de substratos delimitados por quadrados, onde toda a fauna e flora foram coletadas para analisar a presença de hidroides epibiontes. As amostras foram anestesiadas com mentol e fixadas em formalina 4%. Os hidroides foram separados dos substratos sob estéreo-microscópio e para a identificação das espécies foram preparadas lâminas e fotografias em microscópios. As identificações foram embasadas principalmente nos estudos taxonômicos de Cuba, Caribe e região tropical do Atlântico Ocidental. Para confirmar as novas ocorrências, ampla literatura foi consultada. Da revisão bibliográfica resultaram 24 espécies de hidroides atecados já registradas, separados em 13 gêneros de 9 famílias. Das coletas do presente estudo foram identificadas 20 espécies de hidroides, agrupadas em 12 gêneros e 7 famílias, das quais11 espécies são novas adições à fauna de hidroides atecados de Cuba. Como resultado deste estudo, a lista dos hidroides atecados de Cuba aumentou para 35 espécies separadas em 9 famílias e 18 gêneros. No recife de coral foram registradas 14 espécies, sendo Eudendrium carneum e Coryne pusilla as mais frequentes, e 7 apareceram nas gramas marinhas. Myrionema amboinense foi a espécie com maior frequência de ocorrência em gramas marinhas. Rhizogetom conicum foi a única espécie comum em ambos os habitats. Para testar se o gradiente de contaminação era um impulsionador de variações na diversidade de hidroides atecados no recife de coral, diferentes contaminantes orgânicos químicos foram avaliados: esteróis (coprostanol, colesterol e estigmasterol), alquilbenzenos lineares (LABs), hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (PAH), PAH de 4 a 6 anéis e hidrocarbonetos alifáticos (HA), que incluem a mistura complexa não resolvida (UCM). Nas gramas marinhas foram coletadas diferentes variáveis ambientais: profundidade, salinidade, turbidez, temperatura, pH, saturação de oxigênio (SO), oxigênio dissolvido (DO), demanda química de oxigênio (COD) e distância da costa (DistCoast) como indicadores de contaminação, baseado na qualidade da água e o impacto da contaminação da costa. No recife de coral de Havana, os melhores preditores para a riqueza de hidroides atecados foram coprostanol combinado com alquilbenzenos Linear Total (cop + LABs totais), e com a mistura complexa não resolvida (cop + UCM), mostrando a sensibilidade dos hidroides atecados a esses contaminantes. Nas gramas marinhas, a temperatura, salinidade, turbidez e a distância da costa marcaram a diferença de variação entre os locais. O oxigênio dissolvido também foi significativo para a variação nas assembleias de hidroides. Esses resultados mostram que a distribuição e diversidade das assembleias de hidroides atecados são variáveis sensíveis que responderam à variação de marcadores moleculares químicos indicadores de contaminação orgânica por esgoto, óleo e detergentes nos recifes de corais. Para a variação dos hidroides das pradarias de gramas, tiveram melhores respostas os fatores físicos das condições de qualidade da água como turbidez, distância da costa e oxigênio dissolvido, reforçando mais uma vez a importância deste grupo como indicadores ambientais. Palavras-chave: Hidrozoários, Leptothecata, Anthoathecata, Gramas marinhas, Recifes de corais, diversidade, organic contamination, water qualitiy Abstract: Hydroids is the common name of the polypoid phase (benthic and asexual) of the hydrozoan life cycle. Class Hydrozoa and other classes of the Subphylum Medusozoa include, in the life cycle, an alternation of generations between the polypoid, benthic and asexual phase, and the medusoid, pelagic and sexual phase. This group of cnidarians is one of the most diverse in the consolidated benthic environment, with more than 3,200 species already described. The objective of this work was to carry out new surveys of the athecate hydroids, update the list of species of these organisms in Cuba, and evaluate their diversity and distribution in two shallow platform marine ecosystems, coral reefs and seagrass, as well as the relationship between the diversity of species and indicators of organic contamination in coral reefs and water quality indicators in seagrass. The collections were made in March/2013 and May/2011, respectively in coral reefs in northern Havana and in seagrass meadows, in Caibarien, Villa Clara. With the use of scuba diving, the collection techniques were visual censuses directed to scraping the hydroids along transections and indirect censuses of total scraping of the substrate organisms delimited by squares, where all the fauna and flora were collected for analyze the presence of epibiontic hydroids. As a result of the literature review, 24 species have already been registered, separated into 13 genera from 9 families. From the collections of the present study, 20 species of hydroids were identified, grouped into 12 genera and 7 families, of which 11 species are new additions to the fauna of athecate hydroids in Cuba. As a result of this study, the list of athecate hydroids in Cuba has been increased to 35 species separated into 9 families and 18 genera. On the coral reef, 14 species were recorded, with Eudendrium carneum and Coryne pusilla being the most frequent, and 7 species appeared on seagrasses. Myrionema amboinense was the species with the highest frequency of occurrence in seagrasses. Rhizogetom conicum was the only species common to both habitats. To test whether the contamination gradient was a driver of variations in the diversity of athecate hydroids in the coral reef, different organic chemical contaminants were used: sterols (coprostanol, cholesterol and stigmasterol), linear alkylbenzenes (LABs), polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH), PAH of 4 to 6 rings and aliphatic hydrocarbons (HA) that include the unresolved complex mixture (UCM). Different environmental variables were collected from seagrasses: depth, salinity, turbidity, temperature, pH, oxygen saturation (SO), dissolved oxygen (DO), chemical oxygen demand (COD) and distance from the shore (DistCoast) as indicators of contamination, based on water quality and the impact of coastal contamination. In the Havana coral reef, the best predictors for the richness of athecate hydroids were coprostanol combined with Total Linear alkylbenzenes (cop + total LABs), and with the unresolved complex mixture (cop + UCM) showing the sensitivity of the hydroids to these contaminants. In seagrass, temperature, salinity, turbidity, and distance from the coast marked the differences in variation between locations. Dissolved oxygen was also significant for the variation in hydroid assemblages. These results show that distribution and diversity of the athecate hydroid assemblages are sensitive variables that responded to the variation of chemical molecular markers that indicate organic contamination by sewage, oil and detergents in the coral reefs. For the variation of hydroids in seagrasses meadows, the physical factors of water quality conditions such as turbidity, distance from the coast and dissolved oxygen had better responses, reinforcing once again the importance of this group as environmental indicators. Keywords: Hydrozoans, Leptothecata, "Anthoathecata", Marine seagrass, Coral reefs, diversity, organic contamination, water qualitiy.

Data on the deep sea fishes found off the northern Brazilian coast are restricted to the results of the surveys of the RV Oregon, a research vessel of the North American National Marine Fisheries Service, and the REVIZEE Program. The REVIZEE Score-Norte Program focused on commercial fish species and natural resources with potential for exploitation on the continental shelf and slope off the northern coast of Brazil. In this sense, the REVIZEE Score-Norte Program generated little information on species of no commercial value, did not catalog its inventory in zoological collections, and did not publish species lists. Given this considerable knowledge gap on the deep-sea fish found off the North coast of Brazil, we compiled all the available data on the deep-sea fish of this region and also retrieved photographic records from the REVIZEE Score-Norte Program, including the PRODEMERSAL and PROTUNA projects. Considering the published records, specimens deposited in zoological collections, and the interpretation of photographic records, we compiled a list of 63 species of deep-sea fish from the North coast of Brazil. An additional 30 species were found in the published records from the PRODEMERSAL and PROTUNA, but were considered to be doubtful or pending confirmation., Os dados sobre peixes de profundidade encontrados na costa Norte do Brasil são restritos aos resultados de coletas realizadas pelo RV Oregon, um navio do Serviço Nacional de Pesca Marítima da América do Norte, e do Programa REVIZEE. O Programa REVIZEE Score-Norte teve como foco as espécies de peixes com valor comercial e recursos naturais com potencial para exploração na plataforma continental da costa Norte do Brasil. Contudo, o REVIZEE Score-Norte gerou pouca informação sobre as espécies sem valor comercial, não catalogou o material da biodiversidade inventariada, assim como não gerou listas de espécies. Dada a lacuna no conhecimento sobre os peixes de profundidade da costa norte do Brasil, nós compilamos todos os dados disponíveis e recuperamos registros fotográficos do Programa REVIZEE Score-Norte, incluindo os projetos PRODEMERSAL e PROTUNA. Considerando os registros publicados, espécimes depositados em coleções zoológicas e os registros fotográficos, apresentamos uma lista de 63 espécies de peixes de profundidade na costa Norte do Brasil. Outras 30 espécies encontradas nos registros publicados do PRODEMERSAL e PROTUNA, foram consideradas duvidosas, carecendo de confirmação

A secção UAciência é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. Os Açores são conhecidos por possuírem condições ideais para observação de espécies marinhas junto à costa. A sua localização no Atlântico Norte, entre as correntes ricas em nutrientes vindas do Norte e as águas quentes da corrente do Golfo, reflecte-se num autêntico santuário para muitas espécies, reflectindo uma riqueza e biodiversidade marinhas únicas. Porém, algumas dessas espécies são também alvo da pesca comercial e/ou recreativa, uma potencial ameaça, particularmente, para espécies com elevado estatuto de conservação como o peixe-cão, badejo, mero, cavaco e lagosta. Essas cinco espécies vulneráveis apresentam desafios diferentes de sustentabilidade, considerando as suas características biológicas, valor socioeconómico e acesso. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

The world’s seas, its resources and the services they provide have been of great value to society as a whole, however, over the centuries the rapid loss of species and their habitats has been cause for concern, leading to the introduction of mechanisms to save marine biodiversity. There has been in recent years an increase in the number of marine protected areas implemented worldwide and Angola has as part of its political agenda, the creation of marine protected areas as a mean to stop the loss of its marine biodiversity. This dissertation will serve as contribution for the work carried out by the Angolan authorities on the creation and management of marine protected areas. Os mares, os seus recursos e os serviços prestados pelos ecossistemas marinhos são de grande valia para a sociedade e para o bem comum. A preocupação com as espécies e habitats que os integram tem vindo a crescer ao longo dos séculos e a introdução de mecanismos destinados a travar a perda acelerada da biodiversidade é indicativo do reconhecimento da sua importância para as sociedades humanas e para a preservação do ambiente. Tem-se vindo a verificar uma dinâmica crescente a nível global com a criação de novas áreas marinhas protegidas e Angola tem uma agenda política de proteção ambiental que deve incluir a criação de áreas marinhas protegidas. O presente trabalho de dissertação pretende ser um contributo para a criação de áreas marinhas protegidas em Angola e apresenta caminhos para sua concretização.

Os oceanos existem a milhões de anos e abrigam a maior diversidade do planeta. Grande parte dos seres vivos marinhos guardam muitas substâncias desconhecidas que podem ser utilizados em diversas áreas. A biotecnologia exerce uma importante função na descoberta e utilização sustentável dessas substâncias presentes nos organismos marinhos com grande impacto na economia dos países. No Brasil, a biotecnologia marinha é um campo emergente e com realizações promissoras nas áreas de bioquímica, genética, genômica, aquicultura, bioenergia e em outros campos relacionados. No presente estudo foi realizada uma avaliação do potencial biotecnológico da biodiversidade marinha dos costões rochosos de Arraial do Cabo, utilizando a metodologia desenvolvida por Menezes (2019) para buscar, com base na literatura, espécies relevantes em áreas de aplicação da Biotecnologia Marinha a partir das listas de espécies geradas no catálogo “Biodiversidade Marinha dos Costões Rochosos de Arraial do Cabo” publicado em 2020 por Batista e colaboradores. Os resultados mostraram que a metodologia utilizada reduziu o tempo da busca bibliográficas ligada a biotecnologia de cada espécie listada no catálogo, mostrando ser possível a utilização da metodologia em dados oriundos de locais de grande biodiversidade e pouco conhecimento sobre as espécies. No caso específico da região de Arraial do Cabo, este estudo indicou que espécies marinhas bentônicas que ocorrem nessa região possuem um grande potencial biotecnológico. Dentre elas, Rachycentron canadum, Ulva fasciata, Asparagopsis taxiformis, Bugula neritina e Palythoa caribaeorum foram as que mais se destacaram, de acordo com o algoritmo. migrarnovodspace Oceans have existed for millions of years and have the greatest diversity on the planet. Most of the marine organims contain many unknown substances that can be used in different areas. Biotechnology plays an important role in the discovery and in the sustainability of these substances present in marine organisms with great impact on the countries' economies. In Brazil, marine biotechnology is an emerging field with promising achievements in the areas of biochemistry, genetics, genomics, aquaculture, bioenergy and other related fields. In the present study, an evaluation of the biotechnological potential of the marine biodiversity of the rocky coasts of Arraial do Cabo was carried out. We use the methodology developed by Menezes (2019) to screen, based on the literature, relevant species in areas of application of Marine Biotechnology using the species checklists from the catalogue “ Biodiversity of the Rocky Coasts of Arraial do Cabo” publised by Batista and collaborators in 2020. The results showed that the methodology reduced the time for bibliographic search, linked to biotechnology, for each species listed in the catalogue, indicating that it is possible to use data from locations with great biodiversity and little knowledge about the species. In the specific case of the Arraial do Cabo region, this study showed that several marine benthic species that occur in this region have a high biotechnological potential. Among them, Rachycentron canadum, Ulva fasciata, Asparagopsis taxiformis, Bugula neritina and Palythoa caribaeorum were the most relevant to the algoritm.

DOI: https://doi.org/10.18623/rvd.v17i39.1968 Submitted by Maria Fernanda Leite (leitem@stj.jus.br) on 2021-02-17T16:11:41Z No. of bitstreams: 2 acordo_sobre_biodiversidade_toledo.pdf: 558716 bytes, checksum: 7cb812b595b1b5e8698dd0c534f7c095 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by Stephanie Moira (rsmoira@stj.jus.br) on 2021-02-19T17:35:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 acordo_sobre_biodiversidade_toledo.pdf: 558716 bytes, checksum: 7cb812b595b1b5e8698dd0c534f7c095 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Made available in DSpace on 2021-02-19T17:35:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 acordo_sobre_biodiversidade_toledo.pdf: 558716 bytes, checksum: 7cb812b595b1b5e8698dd0c534f7c095 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Previous issue date: 2020

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2020. Os ambientes recifais abrigam a maior biodiversidade do ambiente marinho. Os organismos bentônicos que compõem esses ecossistemas são responsáveis por muitas funções ecossistêmicas, como ciclagem de nutrientes, produção primária, acreção de carbonato de cálcio. Ainda, organismos bentônicos conferem complexidade estrutural nos recifes. A complexidade é responsável por fornecer habitat para outros organismos marinhos, influenciando como eles interagem entre si e com o ambiente. Como resposta aos mais intensos e frequentes distúrbios climáticos nos últimos anos, recifes ao redor do mundo estão perdendo muitas dessas importantes funções, inclusive em ilhas oceânicas protegidas e remotas, como o Atol das Rocas. Como alternativa às abordagens taxonômicas, a utilização de uma abordagem funcional, a qual busca entender como as funções conduzem a dinâmica do ecossistema utilizando os atributos funcionais dos organismos, pode revelar dinâmicas temporais no funcionamento do ecossistema. O objetivo desse trabalho foi avaliar a dinâmica anual da diversidade funcional na comunidade bentônica recifal do Atol das Rocas entre 2013 e 2018. A comunidade bentônica foi amostrada anualmente por fotoquadrados em quatro áreas recifais fixas. Usando o software CPCe, os organismos foram quantificados e classificados de acordo com cinco atributos biológicos (tamanho máximo, tipo de crescimento, categoria trófica, modularidade e acreção de carbonato de cálcio) e um de história de vida (tipo de reprodução). Calculamos quatro índices de diversidade funcional (Riqueza Funcional - FRic, Entropia Funcional - FEnt, Redundância Funcional - FRed e Vulnerabilidade Funcional - FVul) para cada ano. Ao longo dos seis anos de monitoramento, foram identificadas 48 morfoespécies, distribuídas em 17 entidades funcionais (i.e. aquelas que compartilham os mesmos atributos). A FRic é baixa e similar ao longo dos anos, indicando pequenas mudanças nas funções ecossistêmicas. Porém, a FEnt oscilou temporalmente, indicando variações na porcentagem de cobertura de entidades funcionais com atributos funcionais mais dissimilares na comunidade. A FRed tende a decrescer e FVul a aumentar temporalmente, revelando menor riqueza de morfoespécies compondo determinadas entidades e realizando funções similares no ecossistema. Comunidades em ilhas oceânicas geralmente possuem baixa riqueza e redundância e, consequentemente, alta vulnerabilidade. No Atol das Rocas, onde a redundância já é baixa e mostra tendência decrescente, o movimento ou armazenamento de energia ou matéria por entidades funcionais chaves (como as compostas por organismos calcificadores) pode ser afetado. Uma possível consequência será a redução de taxas de acreção e produção de carbonato de cálcio e, portanto, redução da complexidade estrutural devido à diminuição de calcificadores, como corais e algas calcárias crostosas. Mesmo em uma ilha remota com pouco impacto antrópico como o Atol das Rocas, o sistema recifal pode estar se tornando ainda mais vulnerável não por conta da perda de entidades funcionais, mas pela redução da redundância e de suas abundâncias. Abstract: Reef ecosystems have the highest biodiversity in marine environments. Important components of reefs, the benthic community associated to ecosystem functions as nutrient cycling, primary production, carbonate accretion and structural complexity. Reef complexity provides shelter for other marine organisms, dictating how they interact with each other and with the environment. As a response to more intense and frequent climate disturbances in the last years, reefs around the world are losing many ecosystem functions, even in protected and remote oceanic islands like Rocas Atoll. Functional diversity - measured through traits - offers a complementary approach to temporal dynamics and ecosystem functioning. The aim of this work was to evaluate temporal functional diversity patterns of the reef benthic community in Rocas Atoll, from 2013 to 2018. Reef benthic communities were annually sampled at four fixed areas. Using CPCe software, organisms were quantified and classified according to five biological traits (maximum size, growth form, trophic type, modularity, carbonate accretion) and one life history trait (reproduction type). We calculated four functional diversity indices (Functional Richness - FRic, Functional Entropy - FEnt, Functional Redundancy - FRed, Functional Vulnerability - FVul) for each year. During six years of monitoring, we identified 48 morphospecies distributed in 17 functional entities (i.e. those who share traits). FRic was low and similar across years, indicating small changes in ecosystem functions. However, FEnt varied temporally, indicating changes in percent covers of functional entities with unique trait combination. These entities were mostly macroalgae, responsible for primary production and reef tridimensional complexity. FRed declined while FVul increased temporally, thus less morphospecies are associated to functional entities across time. Communities in oceanic islands usually have low functional redundancy and, therefore, high vulnerability. At Rocas Atoll, the low functional redundancy and its decreasing trend over the years may compromise carbonate accretion rates and structural complexity due to the reduction of calcifiers, as corals and crustose coralline algae. Even in a remote island with reduced anthropic impacts like Rocas Atoll, the reef is possibly becoming more vulnerable by changes in functional redundancy and abundances.

DOI: https://doi.org/10.18623/rvd.v17i39.1803 Submitted by Maria Fernanda Leite (leitem@stj.jus.br) on 2021-02-17T16:32:25Z No. of bitstreams: 2 environmental_impacts_maritime_zanella.pdf: 540435 bytes, checksum: af2f2ae690966aa30d96057c845d93ce (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by Stephanie Moira (rsmoira@stj.jus.br) on 2021-02-19T17:40:29Z (GMT) No. of bitstreams: 2 environmental_impacts_maritime_zanella.pdf: 540435 bytes, checksum: af2f2ae690966aa30d96057c845d93ce (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Made available in DSpace on 2021-02-19T17:40:29Z (GMT). No. of bitstreams: 2 environmental_impacts_maritime_zanella.pdf: 540435 bytes, checksum: af2f2ae690966aa30d96057c845d93ce (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Previous issue date: 2020 Aborda os impactos ambientais dos “Maritime Autonomous Surface Ships” (MASS) e quais os novos desafios que a humanidade terá que enfrentar com o eminente advento destes navios. Mostra as vantagens e desvantagens destas embarcações para o meio ambiente e, em especial, quais os cuidados o conjunto da sociedade internacional precisa ter para proteger e preservar o meio marinho com estas novas tecnologias.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Direito, Programa de Pós-Graduação em Direito, 2019. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). As normas materiais aplicáveis à mineração dos fundos marinhos são limitadas para conectar esta atividade à conservação da biodiversidade contida no leito marinho. O princípio da prevenção e o princípio da precaução, da forma como regulados nas normas materiais, apresentam limitações para direcionar e orientar o direito positivo para a construção de um framework jurídico pautado na conservação da biodiversidade no âmbito das atividades de prospecção e exploração dos fundos marinhos. Portanto, o arcabouço jurídico vigente para a Área não se direciona para a conservação da biodiversidade marinha. Da mesma forma, a regulação material das obrigações de conservar, bem como obrigações relacionadas à abordagem ecossistêmica e ao instrumento de estudos de impacto ambiental também apresentam limitações no que tange à instituição de regras mais específicas para a adequada gestão e conservação da biodiversidade marinha. Apesar dessas limitações, foi possível verificar importantes pontos de conexão entre a mineração nos fundos marinhos e a conservação da biodiversidade tanto em relação aos princípios quanto em relação às obrigações analisadas, sobretudo nos regulamentos adotados pela Autoridade Internacional dos Fundos Marinhos (AIFM). O arcabouço normativo existente é limitado, mas capaz de instituir uma base normativa para o desenvolvimento e aperfeiçoamento dos pontos de conexão já estabelecidos por parte da AIFM. A superação desses limites é necessária caso se queira desenvolver as atividades de mineração que levem em consideração a adequada gestão e conservação da ainda desconhecida biodiversidade contida nos fundos marinhos. The substantive law applicable to seabed mining is limited to connect this activity to the conservation of the biodiversity contained in the seabed. The principle of prevention and the precautionary principle, as regulated in substantive law, have limitations to guide the positive law for the construction of a legal framework based on the conservation of biodiversity in deep seabed mining. Therefore, the current legal framework for the Area is not directed towards the conservation of marine biodiversity. Likewise, the regulation of the obligations to conserve, as well as the obligations related to the ecosystem approach and the instrument of environmental impact assessment, also presented limitations on the establishment of more specific rules for the proper management and conservation of marine biodiversity. In spite of these limitations, it was possible to verify important points of connection between deep seabed mining and the conservation of biodiversity, both in relation to the principles and in relation to the obligations analyzed, especially in the regulations adopted by the International Seabed Authority (ISBA). The existing normative framework is limited but capable of establishing a normative basis for the development and improvement of already established connection points by the ISBA. Exceeding these limits is necessary if mining activities are to be developed considering the proper management and conservation of the still unknown biodiversity contained in the seabed.

A macroecologia, assim como outros campos da ecologia, tem sido historicamente uma disciplina terrestre. No entanto, a biodiversidade marinha pode conter características fundamentais para a nossa compreensão dos padrões globais de diversidade. Aqui, eu explorei essa possibilidade integrando conhecimento sobre o ambiente marinho com hipóteses e modelos verbais utlilizados para explicar variações geográficas na diversidade de espécies. Inicialmente, eu utilizei dados de produtividade marinha para avaliar o efeito de subsídios espaciais na diversidade de plantas insulares (capítulo 1). Esse estudo mostrou que, ao contrário da hipótese proposta, não existem evidências de que recursos alóctones influenciam a diversidade de ilhas pequenas. Posteriormente, eu realizei uma revisão conceitual dos principais mecanismos propostos para explicar o gradiente latitudinal de especiação sob uma perspectiva marinha (capítulo 2). Nessa revisão eu mostro que, ao contrário do sistema terrestre, cada mecanismo gera uma predição totalmente diferente para os oceanos. No entanto, é preciso também reconhecer e destacar as limitações que são inerentes aos dados de biodiversidade marinha, principalmente o viés amostral. Por isso, eu avaliei aqui nosso grau de conhecimento sobre a distribuição latitudinal de diferentes grupos taxonômicos (capítulo 3). Nesse estudo eu revelo a existência de um gradiente de ausência de espécies que é fortemente associado com baixo esforço amostral nos trópicos. Por fim, eu testei através de um modelo de simulação a eficiêcia do esforço amostral empírico em detectar acuradamente padrões de diversidade gerados em um oceano virtual (capítulo 4). O resultado mostrou que o gradiente de diversidade atualmente observado nos oceanos não difere do que é registrado ao aplicar a mesma amostragem em um simples modelo nulo. Com isso, eu concluo que a biodiversidade marinha apresenta, de fato, um potencial enorme para a compreensão de fenômenos macroecológicos. No entanto, existem ainda algumas lacunas geográficas e taxonômicas que precisam ser preenchidas para que esse conhecimento possa ser explorado em todo seu potencial. Macroecology, like other fields of ecology, has been historically a terrestrial discipline. However, marine biodiversity may contain key features for our understanding of global diversity patterns. Here, I explored this possibility by integrating knowledge about the marine environment with hypotheses and verbal models used to explain geographic variations in species diversity. Initially, I used marine productivity data to evaluate the effect of spatial subsidies on island plant diversity (Chapter 1). This study showed that, contrary to the proposed hypothesis, there is no evidence that allochthonous resources influence the diversity of small islands. Subsequently, I realized a conceptual review of the main mechanisms proposed to explain the latitudinal gradient of speciation under a marine perspective (chapter 2). In this review I show that, unlike the terrestrial system, each mechanism generates predictions totally different in the oceans. Nevertheless, it is also necessary to recognize and highlight the limitations that are inherent to marine biodiversity data, especially sample bias. Therefore, I evaluated here the state of our knowledge about the latitudinal distribution of different taxonomic groups (Chapter 3). In this study I reveal the existence of a species absence gradient that is strongly associated with low sampling effort in the tropics. Finally, I tested through a simulation model the efficiency of the empirical sample effort to accurately detect diversity patterns generated in a virtual ocean (Chapter 4). The result showed that the diversity gradient currently observed in the oceans does not differ from what is recorded after applying the same sampling effort in a simple null model. Therefore, I conclude that marine biodiversity may, indeed, be of great importance to understand macroecological patterns. However, there are still some geographic and taxonomic gaps that need to be addressed in order to explore this knowledge to its full potential.

Submitted by Veronica Gresilene Pereira Bernardes (vebernardes@gmail.com) on 2019-04-22T20:41:04Z No. of bitstreams: 1 bernardes_vp_me_bot.pdf: 1467693 bytes, checksum: 89c664bbfce03ccaa4c0d2a0d7482ad4 (MD5) Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2019-04-24T13:43:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bernardes_vgp_me_bot.pdf: 1467693 bytes, checksum: 89c664bbfce03ccaa4c0d2a0d7482ad4 (MD5) Made available in DSpace on 2019-04-24T13:43:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bernardes_vgp_me_bot.pdf: 1467693 bytes, checksum: 89c664bbfce03ccaa4c0d2a0d7482ad4 (MD5) Previous issue date: 2019-02-25 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) A abundância dos camarões R. constrictus e X. kroyeri, assim como, as variáveis ambientais, mostraram relevantes alterações ao longo de um intervalo de 20 anos na Enseada de Ubatuba. Como observado, ocorreu uma deposição de sedimentos finos, a qual resultou em um aumento expressivo na fração da classe C na enseada. Essa sedimentação, provavelmente foi causada pela interação de fenômenos naturais e atividades humanas. Com relação a distribuição espacial e abundância de R. constrictus e X. kroyeri, ficou claro que as características do substrato foi um fator importante. R. constrictus manteve o mesmo padrão de distribuição em ambos os períodos, com preferência por locais com areia fina e muito fina e heterogêneo. Por outro lado, para X. kroyeri foi mais abundante em sedimento mais fino. Tal sedimentação que ocorreu na enseada pode ter contribuído de modo positivo para esta espécie, reforçando a importância do sedimento e suas características na explicação nos padrões de sua distribuição. Temporalmente, R. constrictus pode ser mais tolerante em relação a temperatura de fundo, o qual não apresentou um padrão de distribuição, sendo no primeiro período teve maior abundancia na primavera e no segundo período no outono, diferente de X. kroyeri apresentou o mesmo padrão de distribuição em temperaturas entre 21ºC e 26ºC. Além da deposição de sedimentos finos na Enseada de Ubatuba, demais fatores como áreas de exclusão natural de pesca, as medidas de gestão e manejo criadas, com o limite do esforço da pesca, foram essenciais para o estabelecimento e ocorrência de R. constrictus e X. kroyeri na Enseada de Ubatuba, representando importantes ferramentas para preservação e conservação. Sendo assim, nossos resultados podemos reforçar a importância desses planos de manejo e dessas áreas de exclusão natural de pesca, a qual foi possível obter uma recuperação e estabelecimento dessas duas espécies bentônicas por ser locais com menos impacto dessa atividade, para que as futuras gerações continuem se beneficiando desses recursos naturais de forma sustentável, garantindo proteção e / ou a restauração da biodiversidade marinha The abundance of the R. constrictus and X. kroyeri shrimps, as well as the environmental variables, showed relevant changes over a 20-year interval in the Ubatuba Bay. As observed, a deposition of fine sediments occurred, which resulted in an expressive increase in the fraction of class C in the cove. This sedimentation was probably caused by the interaction of natural phenomena and human activities. Regarding the spatial distribution and abundance of R. constrictus and X. kroyeri, it was clear that the substrate characteristics were an important factor. R. constrictus maintained the same pattern of distribution in both periods, with preference for sites with fine and very fine and heterogeneous sand. On the other hand, for X. kroyeri it was more abundant in thinner sediment. Such sedimentation that occurred in the cove may have contributed positively to this species, reinforcing the importance of the sediment and its characteristics in the explanation in the patterns of its distribution. Temporally, R. constrictus may be more tolerant to background temperature, which did not present a distribution pattern, being in the first period had greater abundance in the spring and in the second period in autumn, different from X. kroyeri presented the same pattern temperatures between 21ºC and 26ºC. In addition to the deposition of fine sediments in the Ubatuba Cove, other factors such as areas of natural fishing exclusion, the management and management measures created, with the limit of the fishing effort, were essential for the establishment and occurrence of R. constrictus and X kroyeri in the Ubatuba Cove, representing important tools for preservation and conservation. Thus, our results can reinforce the importance of these management plans and these areas of natural exclusion of fishing, which was possible to obtain a recovery and establishment of these two benthic species because they are places with less impact of this activity, so that future generations continue benefiting from these natural resources in a sustainable manner, ensuring protection and / or restoration of marine biodiversity CNPQ: 131966-0

Submitted by Iury Batista (iurys@stj.jus.br) on 2019-07-15T19:04:16Z No. of bitstreams: 2 reenvios_normativos_limites_guerra.pdf: 469338 bytes, checksum: 3918c91e6e45ce2624b13cc1d31893b2 (MD5) license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) Approved for entry into archive by Roberta Marins (rmarins@stj.jus.br) on 2019-07-22T21:10:25Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) reenvios_normativos_limites_guerra.pdf: 469338 bytes, checksum: 3918c91e6e45ce2624b13cc1d31893b2 (MD5) Made available in DSpace on 2019-07-22T21:10:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1239 bytes, checksum: c9b4c351324448672315a00808efb725 (MD5) reenvios_normativos_limites_guerra.pdf: 469338 bytes, checksum: 3918c91e6e45ce2624b13cc1d31893b2 (MD5) Previous issue date: 2019 Aborda as mudanças no princípio da jurisdição universal na Espanha e suas implicações no julgamento de crimes de tráfico de drogas em alto mar. Demonstra que a legislação espanhola interpreta erroneamente as obrigações relativas à jurisdição e cooperação presentes na Convenção das Nações Unidas contra o Tráfico Ilícito de Entorpecentes e Substâncias Psicotrópicas de 1988.

A secção UAciência é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. MACBIOBLUE e o acrónimo de um projeto no qual participam Canárias, Açores, Madeira, Cabo Verde, Mauritânia e Senegal. Este projeto pretende contribuir para o desenvolvimento de novos produtos e processos de origem marinha, em especial derivados de algas. A ideia surgiu, entre outras razões, pelo facto de periodicamente haver os chamados arrojamentos de algas nas costas de algumas ilhas. Este fenómeno é mais significativo nas Canárias: numa só praia da Gran Canaria chegam-se a acumular 1.500 toneladas de algas por ano, arrancadas dos fundos marinhos quando o mar está mais revolto. Estas deposições massivas de algas entram em conflito com o uso balnear das praias, e surgiu a ideia de se procurar uma utilidade biotecnológica que permitisse rentabilizar a sua recolha, transformando um problema numa solução. Nos Açores o fenómeno tem menos expressão, mas pode ocorrer por exemplo na costa norte de Santa Maria e na costa oeste do Pico. Independentemente de ocorrências periódicas como os arrojamentos, a rica biodiversidade marinha dos Açores permite perspetivar o uso das nossas algas de modo a desenvolver processos que originem produtos de valor acrescentado, podendo a Região ir muito além da mera recolha e envio deste recurso para transformação noutras partes do mundo. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas, Programa de Pós-Graduação Interdisciplinar em Ciências Humanas, Florianópolis, 2018. Esta tese investiga as origens, motivações e desdobramentos da controvérsia sociotécnica sobre a relação entre uso sustentável e conservação marinha no Brasil. Em 2014, o Ministério do Meio Ambiente emitiu uma portaria que proíbe a captura e comercialização de uma lista de 475 espécies de peixes e invertebrados aquáticos ameaçados de extinção, que gerou uma crise institucional nacional entrelaçada com controvérsias tecnocientíficas internacionais. Partimos do pressuposto de que o caso dessa portaria pode ser investigado como uma síntese do conjunto de alianças e confrontos entre atores implicados nas diferentes redes sociotécnicas que influenciam a administração pública do uso dos recursos pesqueiros no país. Argumentamos que essa portaria inscreve a agenda ecológica da biologia da conservação na gestão pública pesqueira brasileira sem, contudo, promover nem o uso sustentável nem a sustentabilidade das pescarias extrativas. A análise está situada no campo dos estudos sociais da ciência, tecnologia e sociedade e se apoia, principalmente, em matrizes teóricas da ontologia orientada aos objetos, a exemplo da teoria ator-rede (TAR), pós-TAR, e nos trabalhos sobre a ciência regulatória. A pesquisa empírica foi realizada no Brasil e complementada na Espanha e França. O trabalho permitiu a comparação de particularidades técnicas, socioeconômicas, ecológicas e institucionais que diferenciam esses cenários e podem influenciar o resultado da ação política orientada para gestão do uso sustentável dos recursos pesqueiros. O estudo demonstra que, ao contrário do praticado pela maior parte das nações pesqueiras do Atlântico e Pacífico Norte, bem como pelas principais agências transnacionais de governança marinha ? que adotam indicadores das ciências pesqueiras como referência de gestão ?, no Brasil são os indicadores da biologia da conservação que orientam práticas institucionais de gestão pública das pescas. A pesquisa histórica demonstra que tentativas de transposição de modelagens de administração pesqueira sustentável do Atlântico Norte para os cenários nacionais têm interagido de forma impremeditada com redes de atores e práticas políticas localizadas e produzido resultados contrários aos que os cientistas pesqueiros esperavam. Se naqueles cenários o Rendimento Máximo Sustentável (RMS) e as ciências pesqueiras têm se ressignificado e fortalecido como referência central de gestão das pescas, no Brasil indicadores e modelagens da biologia da conservação têm prevalecido. Isso decorre de um processo histórico conflituoso e contestado de disputas sociopolíticas entre atores que se agrupam de maneira não ortodoxa em quatro redes heterogêneas com diferentes posicionamentos sobre a relação conservação marinha e uso sustentável: preservacionistas, desenvolvimentistas, conservacionistas e situacionistas-oportunistas. Outra constatação é que, no país, tensões entre esses diferentes posicionamentos são institucionalizadas em dois aparatos jurídicos-normativos antinômicos ? a Lei de Crimes Ambientais e o Sistema de Gestão Compartilhada do Uso dos Recursos Pesqueiros. Estes dois instrumentos divergem sobre como o uso sustentável deve ser politicamente operacionalizado. Tal particularidade normativa estimula a judicialização de tensões institucionais impossibilitando a ação política para promoção da conservação dos recursos pesqueiros e das pescarias extrativas sustentáveis. Por fim, constatamos que ferramentas políticas convencionais de administração pesqueira sustentável fundamentadas no RMS, a exemplo dos modelos de gestão por distribuição de cotas de captura empregados em nações altamente industrializadas, são contraditórias com os valores da sustentabilidade. Esses modelos, além de não garantirem a conservação marinha, aprofundam as desigualdades socioeconômicas e excluem da atividade pescadores e empresários da pesca menos capitalizados Abstract : This thesis investigates the origins, motivations and consequences of the controversy between different positions about the relation between sustainable use and marine conservation in Brazil. In 2014, the Ministry of the Environment issued an edict that prohibited the capture and sale of a list of 475 species of fish and aquatic invertebrates threated with extinction, which generated a national institutional crisis, associated to international techno-scientific controversies. We begin with the presumption that the case of this edict can be investigated as a synthesis of the set of alliances and confrontations among actors involved in the different socio-technical networks that influence the public administration of the use of fisheries resources in the country. We argue that this edict inscribes the ecological agenda of conservation biology on the public administration of Brazilian fisheries without, however, promoting either the sustainable use or sustainability of extractive fishing. The analysis is situated in the field of social studies of science, technology and society and is mainly supported by theoretical matrices of ontology oriented to objects, such as the Actor-Network Theory (ANT), Post-ANT and on works about regulatory science. The empiric study was conducted in Brazil and complemented in Spain and France. The study allowed a comparison of technical, socio-economic, ecological and institutional particularities that differentiate these situations and can influence the results of political actions aimed at management of the sustainable use of fisheries resources. The study demonstrates that, contrary to that practice by most fishing nations of the North Atlantic and Pacific, as well as the main transnational agencies of marine governance ? which adopt indicators of fisheries sciences as management references ? in Brazil it is the indicators of conservation biology that guide institutional practices of public administration of fishing. The historic research demonstrates that attempts at transposition of modelings of sustainable fishing administration from the North Atlantic to Brazilian situations has interacted in a unpremeditated form with networks of localized political practices and actors and produced results contrary to those that the fishery scientists expected. If in those scenarios, the Maximum Sustainable Yield and the fishery sciences have been resignified and strengthened as a central reference of fishery management, in Brazil, indicators and modeling of conservation biology have prevailed. This is due to a conflictive and contested historic process of socio-political disputes among actors grouped in a non-orthodox manner in four heterogeneous networks with different positionings about the relationship between marine conservation and sustainable use: preservationists, developmentalists, conservationists, and situationists-opportunists. Another finding is that, in Brazil, tensions between these different positions are institutionalized in two antinomic legal-normative apparatuses ? the Law of Environmental Crimes and the System of Shared Management of Use of Fishery Resources. These two instruments diverge on how the sustainable use should be politically operationalized. This normative particularity stimulates attempts to resolve institutional tensions in the courts, impeding political action for the promotion of conservation of fishery resources and of sustainable extractive fishing. Finally, we find that conventional political tools for sustainable fishery management based on Maximum Sustainable Yield, such as the administrative models for distribution of fishing quotas used in highly industrialized nations, are contradictory with the values of sustainability. These models, in addition to not guaranteeing marine conservation, deepen socio-economic inequalities and exclude from the activity less capitalized fishermen and fishing business.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2018. O entendimento de como a distribuição dos seres vivos varia no espaço e no tempo é a base para estudos de macroecologia, biogeografia e ecologia. Dentre os padrões de larga escala, o gradiente latitudinal de diversidade é um dos padrões mais conhecidos, tanto em ambiente terrestre como marinho, onde a maior riqueza de espécies ocorre na região próximo ao Equador e declina em direção aos polos. Além da descrição de padrões, os estudos de ecologia moderna têm focado em entender os processos e mecanismos envolvidos na organização das comunidades e no funcionamento ecossistêmico. Os atributos das espécies são considerados respostas aos diferentes fatores bióticos e abióticos, e a abordagem funcional da diversidade tem sido cada vez mais utilizada para entender como as comunidades são organizadas, podendo inclusive, inferir sobre o funcionamento ecossistêmico. Os ambientes marinhos estão sofrendo globalmente com impactos antrópicos (e.g. sobrepesca, mudanças climáticas), o que tem levado a uma grande perda de diversidade marinha. Assim, estudos que avaliem os padrões de diversidade marinha e suas variações frente a fatores ambientais são essenciais para o entendimento da biodiversidade e seu funcionamento e, posteriormente, prever possíveis mudanças. A Província Brasileira possui uma grande extensão, cerca de 8 mil quilômetros da costa brasileira mais quatro ilhas oceânicas, e apresenta ambientes heterogêneos, o que a torna um bom modelo para estudos de larga escala. Esta tese aborda as duas bases da macroecologia, a descrição de padrões e a investigação dos processos que levam aos padrões observados, e se encontra dividida em dois artigos: (1) Large-scale patterns of benthic marine communities in the Brazilian Province , que descreve a estrutura das comunidades e os padrões de diversidade taxonômica dos organismos bentônicos marinhos ao longo do gradiente latitudinal da Província Brasileira (2) Functional richness far from the classic diversity center: the case of reef benthic communities along the Brazilian Province", que avalia a influência de filtros abióticos (e.g. salinidade, temperatura, ondas e nutrientes) na diversidade funcional nas comunidades bentônicas ao longo da Província Brasileira. Para isso, nós amostramos a comunidade bentônica durante o período de verão de 2011 a 2014 em dois estratos de profundidades (1 a 7 metros e 8 a 15 metros) em 40 sítios ao longo da Província Brasileira (entre as latitudes 0° a 27°S), agrupados dentro de 15 localidades, através de metodologia de fotoquadrados. Ao total foram analisados 3.855 fotoquadrados e os organismos foram identificados ao menor nível taxonômico possível, posteriormente agrupados pelos seus atributos funcionais. Foi observado que: (I) as comunidades bentônicas marinhas são dominadas por turf e macroalgas e apresentam baixa cobertura de corais; (II) não existe diferença na estrutura da comunidade entre os estratos de profundidade amostrados; (III) como padrão geral, a diversidade bentônica é menor em baixas latitudes e apresenta o pico de diversidade em latitudes intermediárias (entre 20°S-23°S); (IV) comunidades em latitudes maiores que 20°S apresentam um aumento da cobertura de outros grupos bentônicos, como octocorais, organismos supensívoros e filtradores e outros invertebrados; (V) a riqueza funcional também foi baixa próximo da região do equador e maior entre as latitudes 20°S-23°S; (VI) a divergência funcional foi menor próxima aos limites sul e norte da Província Brasileira e maior na latitude 12°S (Baia de Todos os Santos, BA); (VII) a equitabilidade funcional não variou ao longo do gradiente estudado; (VIII) salinidade, temperatura, ondas e nutrientes explicam 48,9% da riqueza funcional, 44,2% da divergência funcional e 5,46% da equitabilidade funcional. As condições ambientais, como a salinidade baixa proveniente do desague do rio Amazonas, baixas temperaturas e salinidade no limite sul da Província Brasileira e a influencia de ondas maiores principalmente nas ilhas oceânicas, atuam como filtros que limitam a chegada e/ou o estabelecimento dos organismos, gerando assim, baixa diversidade próximo aos limites norte e sul da Província Brasileira e nas ilhas oceânicas. As comunidades bentônicas da Baia de Todos os Santos (12°S) apresentaram valores mais altos de divergência funcional, indicando que filtros bióticos atuam ali mais fortemente. A região entre a latitude 20°S-23°S corresponde à zona de transição entre águas frias, trazendo organismos subtropicais da região sul, e as águas quentes, provenientes do norte e que transportam organismos com afinidades tropicais, favorecendo assim a alta diversidade na região. Além disso, a quantidade de nutrientes - maior na região entre 20°S-27°S - está ligada à disponibilidade de energia e recursos alimentares, o que também influencia na diversidade e abundância dos organismos bentônicos marinhos estudados. Assim, o padrão de diversidade taxonômica e funcional atípico dos organismos de recifes rasos do Atlântico Sul Ocidental, com maiores riquezas em latitudes intermediárias (20°S-23°S), é resultante da influência dos fatores abióticos acima descritos. Os resultados desse estudo proporcionam o primeiro baseline quantitativo das comunidades bentônicas marinhas brasileiras, podendo inclusive ter implicações para conservação dos recifes rasos do Brasil. Abstract : The understanding of how the distribution of living things varies spatially is the basis for the studies of macroecology, biogeography and ecology. Within these large-scale patterns, latitudinal gradients of diversity are one of the most well-known general patterns for both terrestrial and marine environments, where highest species richness occurs near the equator and declines towards the poles. Beyond just describing such patterns, modern ecology attempts to understand how ecosystem processes and mechanisms influence community assembly and ecosystem functioning. Species traits are a response to different biotic and abiotic factors, and functional diversity has been used to understand how communities are structured, and may provide information about ecosystem functioning. Marine environments are suffering globally from human impacts (e.g., overfishing, climate change), which is causing a large decline in marine diversity. Thus, studies that assess marine diversity patterns and its changes due to environmental factors are essential to understanding biodiversity and its functioning, and help to quantify possible changes. The Brazilian Province covers a large area, with nearly 8,000 km of coastline as well as the oceanic islands, and is characterized by heterogeneous environments, being a good model for large-scale studies. This thesis investigates the two main bases of macroecology, the description of patterns and the investigation of the processes that lead to the observed pattern, divided into two articles: (1) "Large-scale patterns of benthic marine communities in the Brazilian Province", which describes the structure of communities and the pattern of taxonomic diversity of marine benthic organisms along the latitudinal gradient of the Brazilian Province (2) Functional richness far from the classic diversity center: the case of reef benthic communities along the Brazilian Province , which evaluates the influence of abiotic filters (e.g., salinity, temperature, wave action and nutrients) on functional diversity in benthic communities throughout the Brazilian Province. To accomplish this, we sampled during austral summer of 2011 to 2014 benthic communities in two depth strata (1-7 meters and 8-15 meters) in 40 sites along the Brazilian Province (between latitudes 0º to 27ºS), grouped into 15 localities through photoquadrats. In total, 3,855 photoquadrats were analyzed, and the benthic organisms were identified to the lowest possible taxonomic level and later grouped based on their functional traits. We observed that: (I) marine benthic communities are dominated by turf and macroalgae and are characterized by low coral cover; (II) no difference in community structure was observed between sampled depth strata; (III) as a general pattern, benthic diversity is lower in lower latitudes and peaks in mid-latitudes (between 20ºS-23ºS); (IV) benthic communities at latitudes higher than 20ºS showed an increase of other benthic groups, such as octocorals, suspension/filter-feeders organisms, and other invertebrates; (V) functional richness was also low near the equator and higher between latitudes 20ºS-23ºS; (VI) functional divergence was low near the southern and northern limits of the Brazilian Province and higher at the latitude 12ºS (Baia de Todos os Santos, BA); (VII) functional evenness did not vary along the studied gradient; (VIII) salinity, temperature, wave action and nutrients explained 48.9% of functional richness, 44.2% of functional divergence, and 5.46% of functional evenness. Environmental conditions, such as low salinity from the drainage of the Amazon River, low temperatures and salinity at the southern limit of the Brazilian Province and in the influence of higher waves in oceanic communities, act as filters that limit the arrival and/or establishment of organisms, generating low diversity near the northern and southern limits and in oceanic islands. Benthic communities in the Baia de Todos os Santos (12°S) had higher values of functional divergence, indicating that biotic filters acted more strongly at this locality. The region between latitudes 20°S-23°S corresponds to a transition zone between cold waters, which bring subtropical organisms from the south region, and warm waters, which come from the north and carry organisms with tropical affinities, favoring the high diversity in the region. Moreover, the amount of nutrients - greater in the region between 20°S-27°S - is linked to the availability of energy and food resources, which also influence in the diversity and abundance of the marine benthic organisms studied. Thus, the taxonomic and functional diversity patterns for shallow reef organisms of the Southwestern Atlantic, with higher richness at mid-latitudes (20°S-23°S), is a result of the influence of the abiotic factors. The results of this study provide the first quantitative baseline of Brazilian marine benthic communities, and may even have implications for shallow reef conservation in Brazil.

A secção UAciência é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. […]. Desde novembro de 2016, o Subgrupo de Investigação em Ecologia Aquática Insular do Grupo de Biodiversidade dos Açores - Centro de Ecologia, Evolução e Alterações Ambientais (GBA/cE3c), com base na Universidade dos Açores, esta a desenvolver o projeto intitulado “Impacte ecossistemático e benefícios socioeconómicos de Asparagopsis armata nos Açores” (ASPAZOR, AÇORES-01-0145-FEDER-00060), financiado em 85% pelo FEDER e 15% pela ORAA, e aprovado pela Autoridade de Gestão do Programa Operacional AZORES 2020. A alga exótica A. armata e considerada como uma das espécies com maior potencial invasor nas aguas europeias, onde foi observada pela primeira vez em 1925, encontrando-se agora bem estabelecida na RAA. Aqui proliferam as duas fases do seu ciclo de vida, a fase produtora de gametas conhecida por A. armata e a fase produtora de esporos, anteriormente considerada como uma espécie distinta, Falkenbergia rufolanosa. Uma particularidade importante dos espécimes do género Asparagopsis e a produção de uma variedade de metabolitos com reconhecidas atividades antibacteriana, antimicrobiana, citotóxica e antioxidante, com aplicação em piscicultura, cosmética, e mesmo em medicina como alternativa a antibióticos convencionais. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Doutoramento em Biologia Submitted by Carla Jesus (cjesus@ua.pt) on 2018-02-01T13:52:52Z No. of bitstreams: 1 PhD thesis Pedro Vieira.pdf: 13651731 bytes, checksum: 4bc7fcba5f649513d45b5381331fee50 (MD5) Made available in DSpace on 2018-02-01T13:52:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PhD thesis Pedro Vieira.pdf: 13651731 bytes, checksum: 4bc7fcba5f649513d45b5381331fee50 (MD5) Previous issue date: 2017-11-10

Doutoramento em Biologia In the complex and rich Northeast (NE) Atlantic and Macaronesia coasts, the superoder Peracarida (Crustacea) is one of the most abundant and commom marine invertebrate taxa with an important role in benthic communities. The study of this group is often limited to inventory lists or benthic community studies and the genetic knowledge of the group in this region is poor. The main goal of this thesis was to improve knowledge on Peracarida diversity and evolution in the NE Atlantic and Macaronesia, with particular emphasis on shallow water and rocky shore members of the orders Amphipoda, Isopoda and Tanaidacea. The thesis comprises five chapters with original research, entailing a DNA barcodebased screening of the species diversity in this group through the comparison of morphology and molecular-derived data (chapter 2), a set of two studies of the isopod genus Dynamene (chapters 3 and 4), one chapter about the amphipod family Hyalidae (chapter 5), and a multi-species analyses of the diversity and broad phylogeographic patterns of Macaronesian peracarideans (chapter 6). In the first chapter, we reported a DNA barcode reference library for the superorder Peracarida, comprising specimens from marine Atlantic coasts, mainly from Iberian Peninsula, together with additional members of the same or sister taxa from other locations. A higher number of Barcode Index Numbers (BINs) compared with the number of morphospecies was found, with some of them displaying up to six BINs. The presence of deeply divergent intraspecific lineages suggests the existence of considerable overlooked taxonomic diversity, even in one of the most well-known peracaridean faunas in the world. These findings indicate the need for a broad, comprehensive and integrated revision of the peracaridean fauna from the Southern European Atlantic coasts. In the second chapter, the commom but species-poor and controversial isopod Dynamene genus was investigated in detail by examining thousands of specimens records sampled during more than fifty years. The distribution and taxonomy of the six Dynamene species along the Northeast Atlantic-Black Sea axis was revised and updated. New distribution maps and illustrated keys to the adult males and females of the northern hemisphere species are provided. In the last three chapters, molecular delineation tools revealed extensive cryptic diversity in the genus Dynamene (3 morphospecies vs 12 molecular operational taxonomic units - MOTUs), in the amphipod family Hyalidae (7 morphospecies vs 32 MOTUs) and in twenty-five peracaridean species (25 morphospecies vs 90 MOTUs). A split between Macaronesian and continental populations was patent, and in most cases the Macaronesian populations displayed high levels of diversity. These findings suggest a much larger role of oceanic islands in the diversification of these marine invertebrates than would have been anticipated, and contributes to expose weakly explored events in the phylogeography and evolution of Macaronesia’s marine fauna. This thesis showed that marine biodiversity, as seen in peracarideans from the NE Atlantic and Macaronesia, has been considerably underestimated. The level of diversity will likely increase with the addition of different taxa, different types of habitat and distinct marine regions. It also suggests that these oceanic islands may act as drivers of evolution, diversification and endemism, just as well for marine organisms as they do for terrestrial ones. Nas costas complexas e ricas do Nordeste (NE) Atlântico e da Macaronésia, a superordem Peracarida (Crustacea) é um dos taxa de invertebrados marinhos mais abundante e comum, com um papel importante nas comunidades bentónicas. O estudo deste grupo é muitas vezes limitado a listas de inventários ou estudos de comunidade bentónicas e o seu conhecimento genético nesta região é deficiente. O objetivo principal desta tese foi o de melhorar o conhecimento sobre a diversidade e a evolução dos peracarídeos no Atlântico Nordeste e na Macaronésia, com ênfase nos membros presentes nas zonas pouco profundas e nas zonas costeiras rochosas das ordens Amphipoda, Isopoda e Tanaidacea. Esta tese compreende cinco capítulos com pesquisa original, incluindo uma biblioteca de referência de DNA barcodes neste grupo, através da comparação de dados morfológicos e moleculares (capítulo 2), um conjunto de dois estudos dedicados ao género isopode Dynamene (capítulos 3 e 4), um capítulo dedicado à família de anfípodes Hyalidae (capítulo 5), e uma abordagem multi-espécies da diversidade e dos padrões filogeográficos dos peracarídios presentes na Macaronésia (capítulo 6). No primeiro capítulo, relatamos uma biblioteca de referência de DNA barcodes para a superordem Peracarida, que inclui espécimes de costas do Atlântico, principalmente da Península Ibérica, juntamente com membros adicionais do mesmo ou semalhantes taxa de outros locais. Um maior número de Barcode Index Numbers (BINs) em comparação com o número de morfo-espécies foi encontrado, com algumas morfo-espécies exibindo até seis BINs. A presença de linhagens profundamente divergentes sugere a existência de uma considerável diversidade taxonómica anteriormente negligenciada, mesmo numa das mais conhecidas faunas de peracarídeos do mundo. Estas descobertas indicam a necessidade de uma revisão ampla, abrangente e integrada da fauna de peracarídeos das costas do Atlântico do Sul da Europa. No segundo capítulo, o abundante mas controverso género Dynamene foi investigado em detalhe, ao examinar vários milhares de individuos amostrados durante mais de cinquenta anos. A distribuição e a taxonomia das seis espécies de Dynamene ao longo do eixo Nordeste Atlântico-Mar Negro foram revistas e actualizadas. Novos mapas de distribuição e chaves ilustradas para os machos adultos e fêmeas das espécies deste género, presentes no hemisfério norte, são fornecidas. Nos três últimos capítulos, as ferramentas de delineamento molecular revelaram uma extensa diversidade críptica no género Dynamene (3 morfoespécies vs 12 unidades taxonómicas operacionais moleculares - MOTUs), na família de anfípipodes Hyalidae (7 morfoespécies vs 32 MOTUs) e em vinte e cinco espécies de peracarídeos (25 morfoespécies vs 90 MOTUs). Uma separação entre as populações presentes na Macaronésia e as presentes no continente foi visivel e, na maioria dos casos, as populações presentes na Macaronésia apresentavam maiores níveis de diversidade. Estas descobertas sugerem um papel maior das ilhas oceânicas na diversificação destes invertebrados marinhos do que se anteciparia e contribuiram para expor eventos pouco explorados na filogeografia e evolução da fauna marinha na Macaronésia. Esta tese mostrou que a biodiversidade marinha, como se observa em peracarídeos presentes no NE Atlântico e na Macaronésia, foi consideravelmente subestimada. O nível de diversidade provavelmente aumentará com a adição de diferentes taxa, diferentes tipos de habitat e de regiões marinhas distintas. Esta tese também sugere que estas ilhas oceânicas podem atuar como impulsionadoras da evolução, da diversificação e do endemismo em organismos marinhos, como acontece nos organismos terrestres.

The study was conducted in the Estuarine Complex of Vaza-Barris River, an area near to city of Aracaju, Sergipe State, Brazil. The aim of this study is to analyze the pattern of occurrence, population structure and ecological aspects of H. reidi in order to find out ways for the conservation of these animals. In total 21 monthly samplings from September 2013 to May 2015 were carried out. 473 observations of seahorses were done in three sampling points: Riacho da Baleia point (total of 279 observations), Viral point (total of 105 observations) and Caruara point (total of 89 observations). The length of the seahorses observed ranged from 2.1 cm to 19.2 cm, and the overall length mean was 14.4 cm. All over the sample period more male individuals than female individuals were found likewise more adult individuals than juveniles. The population density showed significant differences according to the collection point, but this has not varied significantly over time. Individuals have been found in stage of the reproductive cycle in almost every month of sampling, and the reproductive peaks occurred in February 2014, July 2014 and October 2014. Starting January 2014, the markings were initiated for the observed organisms using elastomers and 232 individuals were marked. Through the mark-recapture, population density was estimated at 294 fish in Riacho da Baleia point, 69 fish in Viral point and 65 fish in Caruara point. The growth of the tracked organisms showed an average of 0.8 cm per month, and male and female individuals showed quite similar pattern of growth. The variations related to the growth pattern according to size classes was obtained and it showed the highest average growth rates in April, May and June. In total 26 couples, 11 pairs of males, 3 pairs of females, two pairs of males with juveniles and nine groups with three or more seahorses were observed. Throughout time, five couples, two pairs of male with juvenile, in the same way that a pair of males, remained together. The data about the clustering of seahorses indicate that there is fidelity to the partner, and demonstrate the highly structured social behavior of seahorses. The spatial fish distribution in the environment was monitored and the results corroborate the literature as it relates to loyalty to the habitat. No fish recaptured moved to another point monitored within the estuary. It was concluded that there is a population in the estuary of the Vaza-Barris River of seahorses H. reidi which is found throughout the year distributed in patches of low mobility, moving according to the tide and changing location, but always remaining within the same areas. The study area gets the impact of various anthropogenic sources, such as professional and recreational fishing, floating bars, boats navigation and jet-skis, construction of houses and condominiums, requiring actions and policies that limit the multiple uses of the region in order to conserve the biota in general and specifically the species H. reidi, which appears today as vulnerable to extinction. The areas used as home for the populations of seahorses must be delineated and human activities with the greatest impact should be avoided in those locations. Also the removal of mangrove vegetation should be avoided since this substrate is essential for the Seahorses continue surviving on such sites. Through the implementation of community management projects of fishery resources, the H. reidi can become a flagship species for the estuary of the Vaza-Barris River, allowing the implementation of conservation projects and ecotourism in the region. O trabalho foi realizado no Complexo Estuarino do Rio Vaza-Barris, área próxima à cidade de Aracaju. O objetivo geral deste estudo é analisar o padrão de ocorrência, estrutura populacional e aspectos ecológicos do Hippocampus reidi (GINSBURG, 1933), de modo a buscar a conservação desses peixes. Foram realizadas 21 coletas mensais, de setembro de 2013 até maio de 2015. Foram feitas 473 observações de cavalos-marinhos, em três pontos de amostragem: Riacho da Baleia, com 279 observações, Viral, com 105 observações e Caruara, com 89 observações. O comprimento dos cavalos-marinhos observados variou de 2,1 cm até 19,2 cm, e a média geral foi de 14,4 cm. Em todo o período amostral, foram encontrados mais indivíduos machos que fêmeas, e muito mais indivíduos adultos que juvenis. A densidade populacional variou significativamente de acordo com o ponto de coleta, porém esta não variou significativamente ao longo do tempo. Foram encontrados indivíduos em estágio do ciclo reprodutivo em quase todos os meses de amostragem, sendo que os picos de reprodução ocorreram em fevereiro de 2014, julho de 2014 e outubro de 2014. A partir de janeiro de 2014, foram iniciadas as marcações com elastômeros nos peixes observados, sendo marcados 232 indivíduos. Através da marcação e recaptura, a densidade populacional foi estimada em 294 peixes no Riacho da Baleia, 69 no Viral e 65 no Caruara. Em média, o crescimento dos peixes monitorados foi de 0,8 cm por mês, sendo que fêmeas e machos tiveram o padrão de crescimento bem próximos. Já o padrão de crescimento de acordo com as classes de tamanho obteve variação. As maiores médias nas taxas de crescimento ocorreram em abril, maio e junho. Foram observados 26 casais, 11 duplas de machos, 3 duplas de fêmeas, duas duplas de machos com indivíduos juvenis e nove grupos com três ou mais cavalos-marinhos. Ao longo do tempo, cinco casais se mantiveram juntos, duas duplas de machos com juvenis, e uma dupla de machos. Os dados relacionados ao agrupamento dos cavalos-marinhos indicam que existe fidelidade ao parceiro, e demonstram o comportamento social altamente estruturado dos cavalos-marinhos. A distribuição dos peixes no ambiente foi monitorada, e os dados corroboram a literatura na questão relacionada à fidelidade ao hábitat. Nenhum peixe recapturado se locomoveu para outro ponto monitorado do estuário. Conclui-se que existe uma população de cavalos-marinhos da espécie H. reidi distribuída em manchas no estuário do rio Vaza-Barris, que é encontrada ao longo de todo ano, e que possui baixa mobilidade, e se movimenta de acordo com a maré, mudando de localização, mas permanecendo sempre nas mesmas regiões. A área estudada possui diversas fontes de impacto antrópico, tais como pesca profissional e recreativa, bares flutuantes, navegação de lanchas e jet-skis, construção de casas e condomínios, e necessita de ações e políticas que limitem os diferentes usos desses locais, com o objetivo de conservar a biota em geral, e especificamente, a espécie H. reidi, que figura atualmente como vulnerável à extinção. As áreas de residência dessas populações de cavalos-marinhos devem ser delimitadas e atividades antrópicas de maior impacto devem ser evitadas. Além disso, deve-se evitar a supressão da vegetação de manguezal, já que esse substrato é fundamental para que os cavalosmarinhos continuem nestes locais. Através da implantação de projetos de gestão comunitária de recursos pesqueiros, o H. reidi pode se tornar uma espécie bandeira para o estuário do Rio Vaza-Barris, possibilitando a execução de projetos de conservação e ecoturismo na região.

Mestrado em Biologia Marinha A pesca é parte integrante e indispensável da cultura portuguesa. Evidência disso mesmo é o consumo per capita de peixe em Portugal, que é um dos maiores do mundo (61,77% em 2007) mas que pode eventualmente levar à exploração excessiva dos recursos pesqueiros. Sabe-se que atualmente muitas das espécies comercialmente relevantes estão sobre-exploradas. E um dos grandes contribuidores para a preocupação insuficiente com a sustentabilidade dos recursos explorados é o pouco ou nenhum conhecimento do que é efetivamente capturado. O pescado não contabilizado e não reportado pelos dados oficiais das capturas inclui pesca ilegal, pesca recreativa, pesca de subsistência e frequentemente as rejeições efectuadas antes do desembarque em lota. Este trabalho tem como objectivo principal contribuir para o conhecimento da dinâmica da arte xávega e da biodiversidade e biomassa envolvidas nas rejeições de modo a obter evidência científica para apoiar decisões socioeconómicas e de gestão para uma maior sustentabilidade desta arte tradicional. Foi feita a caracterização dos desembarques em lota e a análise das rejeições de duas embarcações de arte-xávega a operar na praia de Mira-Coimbra. Estimou-se, entre Junho e Setembro de 2015, um total de desembarques de ca. 57 toneladas para uma embarcação e de ca. 40 toneladas para a outra. Do conjunto das 39 espécies capturadas, foram desembarcados em lota espécimes de 20 espécies e rejeitados espécimes de 31 espécies. As principais espécies alvo foram o carapau (Trachurus trachurus), o biqueirão (Engraulis encrasicolus) e a lula-vulgar (Loligo vulgaris) que representaram respectivamente 58-73%, 13-24% e 6-9% do pescado desembarcado. No conjunto das espécies rejeitadas encontram-se espécies-alvo como o biqueirão, o carapau e a sardinha (Sardine pilchardus), espécies de baixo valor comercial e raramente desembarcadas como o ruivo (Chelidonichthys lucernus), e a faneca (Trisopterus luscus) e outras espécies acessórias como o caranguejo-pilado (Polybius henslowii). A biomassa rejeitada de espécies acessórias e de espécies-alvo variou entre, respectivamente, um e 44% e cinco e 75% da captura total por lance. Tipicamente a percentagem de rejeição mantevese entre os 20 e os 40%, excepto num dia em que não houve quaisquer rejeições e em dois dias em que chegou a representar 70-80% da captura total. A composição específica do pescado rejeitado variou ao longo do período de estudo em relação com a variabilidade da comunidade biológica capturada mas também de acordo com variações nas causas das rejeições. São brevemente abordadas as causas e as consequências das rejeições. O facto de que muitas das espécies rejeitadas poderiam encontrar outros destinos alternativos, levanta ainda a necessidade de obter mais informação sobre a quantidade de pescado que é efectivamente retirado dos oceanos, incluindo rejeições, para melhor perceber quais os efeitos da pesca na sustentabilidade dos recursos. Fishing is a structuring and essential part of Portuguese culture. Proof of this is that fish consumption per capita in Portugal is the highest in the world (61.77%, in 2007). However, the increasing demand for fish and fish products may lead to the unsustainability of the fishery resources exploited. It is widely consensual that today, many commercial species are overexploited but there is little or no knowledge on what is truly captured. Consequently, this raises increased concerns on the sustainability of fisheries’ resources. IUU catches (illegal, unregulated and unreported) include not only illegal, recreational and subsistence fishing but frequently also discards, namely the ones that are performed prior to landings. Therefore, this work aims to contribute to the knowledge on beach seine fisheries (“Arte xávega”), namely on the discards’ biodiversity and biomass and, in this way, provide scientific evidence to support socio-economic and management decisionmaking towards a higher sustainability of this Portuguese traditional activity Beach seine landings and discards of two fishing boats operating at Mira beach, (Coimbra, Portugal) were characterised. The total landings between June and September 2015 were estimated as approximately 57 and 40 tonnes for each of the fishing boats analysed. From a total of 39 captured species, specimens of 20 species were landed and specimens of 31 species were discarded. The main target species were the horse mackerel (Trachurus trachurus), the European anchovy (Engraulis encrasicolus) and the squid (Loligo vulgaris) representing, respectively, 58-73%, 13-24% and 6-9% of the landings. The discards include target species such as the European anchovy, the horse mackerel and the sardine (Sardine pilchardus), low commercial value species that are rarely landed, such as the tub gurnard (Chelidonichthys lucernus), and the pout whiting (Trisopterus luscus) and other bycatch such as the henslow's swimming crab (Polybius henslowii). The discarded biomass of bycatch and target species varied from one and 44% and from five and 75% of the total catch per haul. Typically the percentage of the total catch that was discarded varied between 20 and 40%, except for one day when there were no discards (the total catch was landed) and two days when the discard reached 70- 80% of the total catch. The species composition of the discards fluctuated along the studied period in relation to the variations in the fished assemblage but also according to the variation in the causes leading to the discard. Both the causes and consequences of discards are briefly discussed. The fact that the discards could be significantly decreased by other options for use and/or valorisation, supports the need for more research on unreported discards and a more accurate estimate on the real amount of the fish taken from our oceans, to better understand the impacts of fisheries on the sustainability of marine resources.

Imprescindível ao desenvolvimento nacional é a regulação, compreendida como o controle de atividades econômicas, políticas e sociais por meio da elaboração, edição, monitoramento e aplicação de regras de conduta. Nos Estudos Marítimos, por conseguinte, avulta a importância da regulação do uso do mar, máxime o debate quanto à biodiversidade marinha, em especial, o acesso ao seu material genético por bioprospecção e respectivo aproveitamento econômico. A biotecnologia azul é um dos novos usos do mar, não antevisto quando da Convenção das Nações Unidas do Direito do Mar de 1982, importando assim estudar sua relação com outros tratados internacionais. A partir da Hermenêutica filosófica, o presente estudo defende que a bioprospecção é distinta da investigação científica marinha, bem assim que o Estados Costeiros terão direitos soberanos sobre o material genético encontrável no mar territorial, na zona econômica exclusiva e no leito do mar da plataforma continental, podendo regular a respectiva bioprospecção, atividade essa que versa outra utilização legítima do mar. Fundamental to the national development is regulat ion, defined as the organization and control of economic, political, and social activities by means of making, implementing, monitoring, and enforcing of rules. In Maritimes Studies, the regulation of the uses of the sea is paramount, notably the debate ov er marine biodiversity, the access to genetic material through bioprospection and blue biotechnology. Blue biotechnology is one of the new uses of the sea, not foreseen in the treaty - making of the 1982 U nited Nations Convention on the Law of the Sea - UNCL OS , in a manner that the study of the interplay of UNCLOS and other international treaties is relevant . From the perspective of the philosophical hermeneutics, this dissertation holds that bioprospection is dissimilar to marine scientific research and that Costal States enjoy sovereign rights over genetic material found in their territorial sea , their economic exclusive zone and on their cont inental shelf seabed , so they can regulate bioprospection, which is another legitimate use of the sea.

As changes in coastal and marine environments are expected to negatively affect Brazilian ecosystems, the importance of Marine Environmental Education (MEE) comes to the fore. However, so far only 32 contributions related to this issue have been published in Brazil. The MEE workgroup of ReBentos aims at promoting EE and the communication of marine ecological research to the scholastic public as a whole, as well as to groups which exert an influence on general perception, such as the media, politicians, and scientists. This paper presents an overview of the initiatives of MEE in Brazil, with emphasis on the ReBentos projects and guidelines. The conceptual background of action is based on the Rio'92 Treaty on Environmental Education, thereby implying an MEE with Transdisciplinar, emancipatory and reflexive characteristics, directed to changes in values, principles and attitudes. During the period 2011 to 2015, 10 projects were developed from Alagoas to Santa Catarina States, involving the development, implementation and testing through scientific research of 16 MEE activity-models. The didactic material subsequently produced comprised three books and 21 book-chapters. A public of around 6,500 Conservation Unit visitors, 250 public school teachers and 800 high school students have been impacted to date. To act as monitors and multipliers, 250 undergraduate students and professionals were trained. Research project evaluation generated the publication of nine papers. As a further step, the need for protocol elaboration for each model is placed in evidence, in order to direct and facilitate future initiatives. Resumo A importância da educação ambiental marinha (EAM) vem tomando relevância à medida que aumenta a expectativa de impactos nos ecossistemas brasileiros ocasionados por mudanças nos ambientes costeiros. Entretanto, apenas 32 contribuições sobre esse assunto foram publicadas no Brasil. O grupo de trabalho em EAM da ReBentos objetiva promover a comunicação da pesquisa ecológica marinha para o público escolar como um todo, bem como a grupos com influência na percepção comum, como a mídia, políticos e cientistas. Este trabalho apresenta uma visão das iniciativas em EAM no Brasil, com ênfase nos projetos e diretrizes da ReBentos. A base conceitual de ação é o Tratado de Educação Ambiental da Rio 92, implicando em um ensino com características transdisciplinares, reflexivas e emancipatórias, dirigidas a mudanças em valores, princípios e atitudes. Durante o período de 2011 a 2015, 10 modelos de atividade foram desenvolvidos, de Alagoas a Santa Catarina, envolvendo sua concepção, implementação e teste por meio de pesquisa científica. O material didático produzido compreendeu três livros e 21 capítulos de livros. Um público total ao redor de 5500 visitantes de UCs, 250 professores de escolas públicas e 800 estudantes foi impactado. Como monitores e multiplicadores, foram treinados 250 estudantes de graduação e profissionais. Projetos de avaliação de pesquisa geraram nove trabalhos científicos. Como uma próxima iniciativa, é salientada a necessidade de elaboração de protocolos para cada modelo, a fim de direcionar e facilitar futuras iniciativas.

Sendo os Açores a região mais isolada do Atlântico Norte, a sua biodiversidade marinha reflecte não apenas essa característica bem como influências de vários locais que o tornam único. O Arquipélago localiza-se perto da crista meso-atlântica estando as ilhas dos grupos central e oriental localizadas na microplaca dos Açores e as do grupo ocidental na placa americana. A latitude média do Arquipélago ronda os 39ºN, ou seja, quase a mesma de Lisboa ou de Nova Iorque embora sem os Invernos e Verões rigorosos daquelas cidades e caracterizando- se por uma baixa amplitude térmica com temperaturas entre valores de conforto térmico ao longo de todo o ano. A temperatura das águas superficiais raramente desce abaixo dos 17ºC no Inverno e atinge médias de 23-24ºC no Verão. É precisamente esta característica climatérica que permite que a diversidade marinha dos Açores apresente aspectos únicos transformando-a, simultaneamente, num conjunto faunístico de características marcadamente subtropicais. A orla costeira das Sete Cidades, até cotas próximas dos 20m de profundidade, constitui uma “janela” para observação e estudo de algumas das espécies marinhas mais emblemáticas e representativas de todo o Arquipélago. […]. ABSTRACT: The Azores Islands, the most isolated area within the north Atlantic, are located near the mid-Atlantic ridge with the eastern and central group in the Azores micro-plate and the western group in the American plate. The Azores average latitude of 39ºN – being practically the same as that of Lisbon or New York – present a low thermic amplitude with mild weather all year long in opposition to the continental climates of the above mentioned cities. Surface seawater is rarely below 17ºC while reaching more than 23 - 24ºC in summer. It is precisely this characteristic almost sub-tropical environment that allows for the Azorean marine Biodiversity to present unique aspects in this specific corner of the NE Atlantic. The coastal shores of Sete Cidades, down to depths close to 20m, is considered as an open "window" to study and observe some of the most emblematic and representative species of the whole Archipelago. [...]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Orientador: Prof. Dr. Paulo da Cunha Lana Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências da Terra, Centro de Estudos do Mar, Programa de Pós-Graduação em Sistemas Costeiros e Oceânicos. Defesa : Pontal do Paraná, 20/12/2016 Inclui referências: p.98-101 Resumo: O objetivo principal dessa tese foi integrar os conceitos básicos de "modelagem de nicho" e "beta diversidade" para entender o impacto das mudanças climáticas na distribuição da ictiofauna brasileira e propor medidas eficazes de gestão e conservação da biodiversidade marinha. Para isso, foram estruturados três capítulos. No primeiro, modelos de nicho ecológico foram desenvolvidos para prever as distribuições potenciais dos principais recursos pesqueiros do Atlântico sul-ocidental frente às mudanças climáticas. No segundo capítulo, os conceitos teóricos dos modelos de nicho foram aplicados em uma análise de comunidades e de beta diversidade, através da aplicação da análise de dissimilaridade generalizada (GDM). No terceiro capítulo, o GDM foi aplicado em uma escala mais detalhada para o estado do Paraná. No primeiro capítulo foi possível observar que, no cenário mais pessimista (IPCC - A2), as amplitudes de distribuição dos peixes sofreram drásticas reduções e houve um deslocamento para o norte, próximo ao Equador. No. Além disso, houve um aumento nas distribuições de algumas espécies principalmente nas latitudes mais altas ou mais baixas. A salinidade, seguida da máxima temperatura do ar, foram as variáveis que mais contribuíram para explicar os padrões de distribuição das espécies. No segundo capítulo, a profundidade e a temperatura máxima da superfície do mar foram os fatores primariamente estruturadores da ictiofauna marinha, sendo que o modelo de dissimilaridade generalizado (GDM) explicou 58,4 % da variação na composição das espécies e previu mudanças drásticas na beta diversidade dos peixes, principalmente nas regiões sul e sudeste do Brasil, assim como em regiões próximas ao Equador. Hipóteses para explicar a origem da beta diversidade também foram testadas e observou-se que os fatores determinísticos explicam grande parte da variação na distribuição dos peixes, mas que fatores neutros relacionados à autocorrelação e à dependência espacial também contribuem para os padrões observados, ainda que secundariamente. No terceiro capítulo, o objetivo de preencher uma lacuna no conhecimento sobre os peixes marinhos da região sul e sudeste do Brasil foi alcançado através de amostragens intensivas durante cinco anos (2012 a 2016). As amostragens foram concentradas em seis ilhas costeiras, mas a beta diversidade da ictiofauna recifai foi extrapolada para toda a região através do GDM. Paralelamente foi realizada uma partição da beta diversidade em componentes de substituição e aninhamento. Observou-se que a estrutura da comunidade dos peixes recifais responde principalmente à salinidade e à distância da costa e a substituição é mais intensa nas ilhas próximas à costa. Fatores relacionados com a batimetria, como a profundidade e a inclinação são estruturadores da beta diversidade na região. O trabalho contribuiu para a gestão dos sistemas marinhos por explicitar de maneira espacial as classes de paisagem marinha, fornecendo informações concretas sobre quais áreas merecem a atenção especial dos gestores. Os mapas gerados evidenciaram que áreas com maior amplitude de variação de fatores abióticos, independente da escala, devem ser priorizados, corroborando a terceira hipótese sobre a origem da beta diversidade, em que os fatores ambientais regulam a distribuição das espécies. Isso implica que todas as partes do ecossistema não são equivalentes e, portanto, as AMPs deveriam representar os diferentes tipos de habitat, levando em consideração as componentes "nestedness" e "turnover" da beta diversidade e preservando especialmente as rotas de dispersão favoráveis as espécies. Abstract: The main objective o f this thesis was to integrate the basic concepts o f "niche modeling" and "beta diversity" to understand the impact of climate change on the distribution o f Brazilian ichthyofauna and propose effective measures for the management and conservation o f marine biodiversity. For that, three chapters were structured. In the first, ecological niche models were developed to predict the potential distributions o f the South Atlantic's main fisheries resources in the face o f climate change. In the second chapter, the theoretical concepts o f the niche models were applied in a community analysis, through the application o f generalized dissimilarity analysis (GDM). In the third chapter, the GDM was applied in a more detailed scale for the state o f Paraná. In the first chapter it was possible to observe that, in the most pessimistic scenario (IPCC - A2), the fish distribution amplitudes suffered drastic reductions and there was a displacement towards the north, near the Equator. In the most optimistic scenario (IPCC - A1B), the reductions were less pronounced and occurred in the places closest to the coast. In addition, there was an increase in the distributions o f some species mainly in the higher or lower latitudes. The salinity, followed by the maximum air temperature, were the variables that contributed the most to explain the distribution patterns o f the species. In the second chapter, the depth and maximum temperature of the sea surface were the primary factors o f the marine ichthyofauna, and the generalized dissimilarity model (GDM) explained 58.4% o f the variation in the species composition and predicted drastic changes in the beta diversity in the southern and southeastern regions of Brazil, as well as in regions close to Ecuador. Assumptions to explain the origin o f beta diversity were also tested and it was observed that deterministic factors explain much o f the variation in fish distribution, but that neutral factors related to autocorrelation and spatial dependence also contribute to the observed patterns, although secondarily. In the third chapter, the objective o f filling a gap in knowledge about the subtropical reef fishes o f southern and southeastern Brazil was achieved through intensive sampling for five years (2012 to 2016). Samplings were concentrated on six coastal islands, but the beta diversity o f the ichthyofauna was extrapolated to the entire region through the GDM. In parallel, a beta partition was performed on turnover and nesting components. It was observed that the structure of the fish community responds mainly to the salinity and distance of the coast and the replacement is more intense in the islands near the coast. Factors related to bathymetry, such as depth and slope, are structurers o f beta diversity in the region. The work has contributed to the management o f marine systems by explicitly spelling out the marine landscape classes, providing concrete information on which areas deserve the special attention of managers. The generated maps showed that areas with a greater amplitude of variation of abiotic factors, regardless o f the scale, should be prioritized, corroborating the third hypothesis on the origin o f beta diversity, in which environmental factors regulate the distribution o f species. This implies that all parts of the ecosystem are not equivalent, and therefore MPAs should represent different habitat types, taking into account the nestedness and turnover components of beta diversity and preserving especially species's dispersion routes.

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar, especialidade de Recursos Marinhos, 27 de Novembro de 2015, Universidade dos Açores. A região dos Açores apresenta uma grande diversidade de comunidades faunísticas em ecossistemas marinhos de profundidade, com numa grande variedade de "hotspots" no fundo do mar, tais como montes submarinos, encostas das ilhas e fontes hidrotermais. No entanto, apesar desta enorme biodiversidade, os seus invertebrados marinhos de profundidade nunca foram bio prospectados enquanto produtos naturais marinhos funcionais. Esta tese teve como objectivo fazê-lo. Foram extraídos lípidos de dezanove espécies animais, num total de trinta e seis extractos brutos, subsequentemente testados in vitro como antibacterianos, antimaláricos e anticancerígenos. Da diversidade de animais de profundidade que incluiu corais, esponjas, ouriços e invertebrados das fontes hidrotermais, os resultados revelaram que os extractos apresentam actividade para todos os ensaios biológicos testados, com as esponjas a apresentarem-se como os animais mais úteis como fonte de compostos naturais marinhos anticancerígenos e os corais de água fria, como antimaláricos. Foi usada uma estratégia de fracionamento guiado pela bioactividade, nos extractos dos animais mais activos: as mega-esponjas Petrosia sp. E Leiodermatium sp.. Os esteróis (Petrosterol, Sitosterol e 23, 24-Dihydrocalysterol) foram identificados nas fracções de Petrosia sp. Mais anticancerígenas mas devido a perca de actividade durante a separação dos compostos, não foi possível confirmá-los como principais anticancerígenos presentes. O estudo com a esponja Leiodermatium sp. resultou no isolamento de uma mistura complexa de compostos, demonstrando um potente efeito anticancerígeno (IC75=0,08 μg/ml). Os compostos foram identificados como pertencentes a uma mesma família de macrólidos e foram denominados "azorelides". Foi possível isolar os compostos azorelide A e azorelide B mas a esteroquímica absoluta de ambas as moléculas não foi determinada devido às suas escassas quantidades (1,1 mg de azorelide A/kg e 0,47 mg de azorelide B/kg de esponja Leiodermatium seca). ABSTRACT: Azores region presents a great diversity of deep-sea ecosystems with faunal communities in a variety of benthic hotspots, as seamounts, islands slopes and hydrothermal vents. Despite its high biodiversity, these deep-sea invertebrates were never bio prospected in regard to their natural products. This thesis aims to do so. Lipids were extracted from nineteen animal species and a total of thirty-six crude extracts were tested in vitro as potential antibacterial, antimalarial and anticancer activities. From a deep-sea diversity of corals, sponges, seaurchins and hydrothermal vents invertebrates, results showed that extracts were active for all tested bioassays, with sponges presenting the best outcomes as anticancer and corals as antimalarial natural product sources. A bioactivity-guided fractionation strategy was used in the most active animal extracts: the mega sponges Petrosia sp. and Leiodermatium. Sterols (Petrosterol, Sitosterol and 23, 24- Dihydrocalysterol) were identified in the most active anticancer fraction from Petrosia sp. but, due to activity lost during compounds isolation, it was not possible to confirm these as the main anticancer compounds present. Study with Leiodermatium sponge extracts lead to isolation of a complex mixture of compounds, showing potent anticancer activities (IC75=0.08 μg/ml). Compounds were identified as belonging to the same macrolide family and were named "azorelides". It was possible to isolate azorelide A and azorelide B, but their absolute stereochemistry was not achieved due to amount scarcity (1.1 mg of azorelide A/kg and 0.47 mg of azorelide B/kg of dry Leiodermatium sponge). Several projects financed part of laboratory consumables and chemicals products used during this research, namely PTDC/QUI-QUI/119116/2010-"Ocean Treasures", PTDC/MAR/111749/2009-DeepFun; PEst-C/EQB/LA0006/2013, Pest-OE/BIA/UI0457/2011-CREM, FP7/2007-2013 n° PCOFUND-GA-2009-246542 and LA 9-2013-2014-PEST OE/EEI/LA0009/2013, financed by FCT, Ministério da Educação e Ciência, Portugal and FEDER.

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar (especialidade em Ecologia Marinha), 11 de Setembro de 2015, Universidade dos Açores. Os corais de águas frias constituem importantes e abundantes componentes estruturais dos habitats bentónicos do mar profundo, criando condições favoráveis para uma maior abundancia e variedade de invertebrados e peixes, muitos deles de elevado valor comercial. Contudo, o conhecimento acerca da diversidade taxonómica e dos padrões de distribuição desses organismos frágeis e de crescimento lento e escasso e fragmentado, o que dificulta a implementação de medidas de conservação e gestão espacial eficazes na região dos Açores (capítulo 1). Neste estudo foi feita uma compilação exaustiva de todos os registos disponíveis referentes aos principais grupos de corais de águas frias construtores de habitat – Alcyonacea, Antipatharia, Scleractinia e Stylasteridae – de modo a determinar a diversidade, distribuição e estrutura espacial das suas comunidades na Zona Económica Exclusiva (ZEE) dos Açores (capítulo 2). [...]. Esta tese afigura-se como uma valiosa contribuição para dar continuidade ao desenvolvimento de estratégias eficazes de conservação dos ecossistemas marinhos vulneráveis dos Açores. Os novos dados taxonómicos e ecológicos aqui apresentados em montes submarinos e encostas de ilhas oceânicas do nordeste Atlântico. Procurou-se assim reforçar a sua importância para a manutenção da biodiversidade marinha e vulnerabilidade face as ameaças antropogénicas atuais, como por exemplo a pesca de fundo, e em crescente expansão, a exploração de recursos minerais no leito marinho (capitulo 5). ABSTRACT: Cold-water corals (CWCs) are widely considered as important, and abundant, structural components of deep-sea benthic habitats, enhancing local abundance of variety of fish and invertebrate species, many of which are commercially valuable. Yet, current knowledge of the taxonomic diversity and distribution patterns of these vulnerable, slow-growing organisms is scarce and fragmented, limiting the effectiveness of spatial management and conservation measures in the Azores region (chapter 1). An exhaustive compilation of records for the most representative groups of habitat building corals – Alcyonacea, Antipatharia, Scleractinia and Stylasteridae – available until the present day was conducted to assess the diversity, distribution, and spatial structure of coral assemblages in the Azores Exclusive Economic Zone, EEZ (chapter 2). [...]. This thesis constitutes a valuable contribution to the ongoing development of efficient conservation policies for coral-associated vulnerable marine ecosystems of the Azores (chapter 5). The results presented herein expand our understanding on coldwater coral communities over vast insular slope habitats and seamounts of the northeast Atlantic, reinforcing their ecological importance for the sustainability of marine biodiversity as well as vulnerability to current (e.g. bottom fishing) and emergent (e.g. seabed mining) anthropogenic threats. FCT/PTDC/MAR/72169/2006; PEst-OE/EEI/LA0009/2011

Submitted by Boris Flegr (boris@uerj.br) on 2020-11-08T19:05:32Z No. of bitstreams: 1 Humberto_PPGEE.pdf: 7730901 bytes, checksum: 72b54b59b8700bcdf96a89e05c6f9471 (MD5) Made available in DSpace on 2020-11-08T19:05:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Humberto_PPGEE.pdf: 7730901 bytes, checksum: 72b54b59b8700bcdf96a89e05c6f9471 (MD5) Previous issue date: 2015-02-25 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Marine sponge community studies are scarce in Brazil and this is a pioneering study in this approach on Ilha Grande RJ, a high diversity region. The structure of marine sponges assemblages and sessile marine benthic organisms was evaluated from diversity descriptors index in six sites of Ilha Grande and nearby islands, three in continental side and three on oceanic side. Assemblages were compared between sides and depths counting number of individuals and its coverage area by photo-quadrats method. At the same time, the sponges were collected, fixed and, in lab, identified through specialized methodology and literature. There was a total of 5.457, representing Class Demospongiae and Calcarea, distributed in 41 species and nine morphotypes (50 possible species) with greater diversity to Lagoa Azul on the inside and lower for Parnaióca, outside, while Ilha do Abraão had the greatest richness. Among the identified species, four dominated more than 50% of the total and 26 did not reach even 5% of total abundance. General linear model (GLM) on ANOVA highlighted significant difference only between depths with different substrates (F=2.79; p0.16) and the interaction between factors did not have differences (F=117; p>0.38). Ordination multivariate analyses, Cluster and MDS, distinguished four sponge assemblages: 1) four sites with unconsolidated substrate; 2) Lagoa Azul with unconsolidated substrate; 3) oceanic sites with hard substratum; 4) continental sites with hard substrate. For the community, 49 species were found and Phylum Porifera was the highest specific representation, despite macroalgae have formed the most abundant group. Encrusting calcareous algae, turf algae, sponge Iotrochotaarenosa, exclusive of the continental side and zoanthid Palythoacaribaeorum added approximately 50% of the benthic cover in all sites. The sides were significantly different with highest richness, diversity and evenness for oceanic side while continental had more abundance of species, most probably due to fewer dominant species. Moreover, greater heterogeneity of habitats may promote increased diversity. The 15 new species now recorded which three are new for science and 12 represent new species or genus records for Ilha Grande Bay revealing this area as one of the highest diverse area in marine sponges from Brazil, despite the low knowlegment. Furthermore, this result implies the need to increase the preservation of the rocky shores of the region and shows that a quick survey of the number of species and their abundance is sufficient to manage a conservation area Estudos de comunidades de esponjas marinhas são escassos no Brasil, sendo este trabalho pioneiro nessa abordagem para a Ilha Grande - RJ, um local de alta diversidade biológica. A estrutura das assembleias de esponjas marinhas e da comunidade bentônica marinha séssil foi avaliada, a partir de índices descritores de diversidade, em seis pontos da Ilha Grande e ilhas próximas, sendo três do lado continental e três do lado oceânico. As assembleias foram comparadas entre os diferentes lado e profundidade, através da contagem do número de indivíduos e área de cobertura por foto-quadrados. Paralelamente, as esponjas foram coletadas, fixadas e posteriormente identificadas através de metodologia e literatura especializada. Foi encontrado um total de 5.457 indivíduos, representando as Classes Demospongiae e Calcarea, distribuídos em 41 espécies e nove morfotipos, indicando maior diversidade para Lagoa Azul e menor para Parnaióca, sendo o local com maior riqueza a Ilha do Abraão. Dentre as espécies identificadas, quatro dominaram mais de 50% do total e 26 não alcançaram nem 5% da abundância absoluta. Análises de variância por GLM só evidenciaram diferença significativa para profundidade com substratos diferentes (F= 2,79; p0,16) e a interação entre os fatores (F= 1,17; p>0,38) não tiveram diferença estatística. As análises multivariadas de ordenação Cluster e MDS indicaram a formação de quatro assembleias de esponjas: 1) quatro locais com substrato não consolidado; 2) Lagoa Azul com substrato não consolidado; 3) locais oceânicos de substrato rochoso; e 4) locais continentais de substrato consolidado. Já para a comunidade geral, 49 espécies foram encontradas, sendo o Filo Porifera o de maior representatividade específica, apesar das macroalgas terem formado o grupo mais abundante. A comunidade bentônica foi dominada por quatro espécies, que juntas alcançaram média de 50% da cobertura bentônica: alga calcária incrustante, algas formadoras de tapete de turf, a esponja Iotrochota arenosa e o zoantídeo Palythoacaribaeorum. Estatisticamente, o lado continental se mostrou diferente do oceânico, o qual possui maior riqueza, diversidade e uniformidade de espécies, muito provavelmente pelo menor número de espécies dominantes e aliado a isso maior heterogeneidade de habitats, o que promove o aumento da diversidade. Quinze novas espécies estão sendo registradas para a Baía da Ilha Grande, sendo três novas espécies, as quais estão sendo descritas por especialistas, e 12 são novos registros de espécies ou gêneros para a região, evidenciando que a diversidade de esponjas marinhas na BIG é alta e ainda pouco conhecida e que a formação de assembleias pode ser devida a singularidade de cada local, implicando na necessidade de conservação dos costões rochosos da Ilha Grande e cercanias, a qual pode ser manejada através da realização de rápidos levantamentos sobre a riqueza e o número de indivíduos da espécie na região

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-01-26. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:29:00Z : No. of bitstreams: 1 000848956.pdf: 856337 bytes, checksum: 8efe53c3db57337bc1de30519d4d7cb1 (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) O aumento da frota de pesca no sul do Brasil tem contribuído para a redução dos desembarques de camarões rentáveis e das espécies que compõe a fauna acompanhante. O objetivo deste estudo foi investigar a biodiversidade e distribuição espaço-temporal de crustáceos Anomura, capturados como fauna acompanhante na pesca não seletiva de camarão no litoral norte do estado de Santa Catarina, Brasil. Além disso, analisou-se a influência de fatores ambientais sobre os padrões de abundância das espécies estudadas. Arrastos mensais foram realizadas na área adjacente à Baía da Babitonga de julho de 2010 até junho de 2011, utilizando um barco de camarão equipado com redes double-rig, em profundidades de 5 a 17 m. Índices ecológicos (riqueza de espécies, diversidade, dominância e equitabilidade) e a análise de redundância foram usados para analisar a comunidade de ermitões e sua relação com os fatores ambientais. Um total de 647 indivíduos foi coletado, representado por três famílias, seis gêneros e sete espécies. Isocheles sawayai apresentou a maior abundância, seguido por Loxopagurus loxocheles. Ambas as espécies tiveram uma correlação positiva com a temperatura e Phi (granulometria fina). A maior riqueza e os mais altos valores de equitabilidade foram encontrados na profundidade de 17 m. Por outro lado, a profundidade de cinco metros teve o menor valor de equitabilidade, devido à alta dominância de I. sawayai, ocasionando uma baixa diversidade local. No período de menor temperatura e maior salinidade (julho) foram registrados os mais altos índices de diversidade, influenciados pela baixa dominância de espécies tropicais (I. sawayai) e pela presença de espécies que vivem mais afastadas da costa (Petrochirus diogenes, Dardanus insignis, Pagurus exilis). Portanto, o esforço de captura direcionada à pesca camaroneira extraí no litoral sul do Brasil uma diversidade considerável... The increase in the fishing fleet in southern Brazil has contributed to decrease in landings of profitable shrimps and bycatch species. The aim of this study is to investigate the biodiversity and spatial-temporal distribution of anomuran crustaceans captured as bycatch in the non-selective fishery of shrimps on the northern coast of Santa Catarina state, Brazil. In addition, we analyzed the influence of environmental factors on the abundance patterns of studied species. Monthly trawls were conducted in Babitonga Bay from July 2010 through June 2011, using a shrimp boat outfitted with double-rig nets, at depths from 5 to 17 m. Ecological indices (species richness, diversity, dominance and evenness) and redundancy analysis were assessed to analyze the hermit community and their relation with environmental factors. A total of 647 individuals were collected, represented by three families, six genera and seven species. Isocheles sawayai showed the highest abundance, flowed by Loxopagurus loxocheles. Both species demonstrated a positive correlation with temperature and phi (smaller sediment grain size). The highest richness and the evenness value were estimated at the depth 17 m. Otherwise, the five meters deep has the lowest evenness because the high dominance of I. sawayai, resulting in a lower estimated diversity. In a period with lower temperature and higher salinity as July were registered higher levels of diversity, probably because the lower dominance of tropical species (I. sawayai) and the occupation of species distributed in offshore regions (Petrochirus diogenes, Dardanus insignis, Pagurus exilis). Thus, the capture effort designated in the shrimp fishery carried an important diversity of anomuran crustaceans and others animal species, showing a danger to the marine trophic web

Submitted by Pós Imunologia (ppgimicsufba@gmail.com) on 2017-02-21T17:31:50Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_hugo-26-02_FINAL.pdf: 1752640 bytes, checksum: 8850bc45f8f7842518b7edcf23ab3e82 (MD5) Approved for entry into archive by Delba Rosa (delba@ufba.br) on 2017-06-28T13:16:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_hugo-26-02_FINAL.pdf: 1752640 bytes, checksum: 8850bc45f8f7842518b7edcf23ab3e82 (MD5) Made available in DSpace on 2017-06-28T13:16:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_hugo-26-02_FINAL.pdf: 1752640 bytes, checksum: 8850bc45f8f7842518b7edcf23ab3e82 (MD5) CAPES A primeira linha de defesa do organismo a um dano tissular é orquestrado por uma resposta inflamatória. De modo geral, a inflamação compreende uma resposta fisiológica, no entanto, complexa que envolve a interação entre fatores solúveis e celulares, surgindo em qualquer tecido em resposta á uma lesão traumática, infecciosa, pós-isquêmica, tóxica ou autoimune. A terapêutica utilizada para tratar os distúrbios inflamatórios, envolve o uso de antiinflamatórios não esteroidais (AINES) e corticoides. No entanto, o uso constante e prolongado desses medicamentos apresentam diversos efeitos colaterais afetando diversos sistemas do organismo. Neste sentido, estudos de bioprospecção tornam-se necessários para compor o arsenal terapêutico contra as desordens inflamatórias. A biodiversidade marinha é uma importante fonte de produtos naturais. Neste estudo destacamos a espécie marinha denominada Hippocampus reidi (H. reidi) sendo um dos produtos naturais mais utilizados para o tratamento de asma e outras desordens inflamatórias em inquérito etnofarmacológico realizado pelo nosso grupo de pesquisa. Mediante o uso popular dessa espécie e que a literatura ainda carece de informações sobre sua propriedade imunofarmacólogica, o objetivo deste estudo foi descrever o perfil químico, citotóxico e o potencial efeito imunofarmacológico do extrato hidroalcoólico do H. reidi. O extrato hidroalcoólico de H. reidi foi padronizado, utilizando um cromatografo líquido de alta eficiência (CLAE). Em modelo experimental in vitro avaliamos atividade citotóxica em células esplênicas, bem como, o efeito do extrato do H. reidi na produção de citocinas IL-4, IL-5, IL-10 e INF-y, produção de óxido nítrico em cultura de macrófagos peritoneiais, sobre a capacidade de relaxamento do músculo liso da traqueia isolada independente de epitélio de ratos, capacidade em estabilizar a membrana de eritrócitos e avaliação da expressão gênica do fator transcrição NFk-B. Os resultados obtidos demonstram que o extrato do H. reidi não apresentou toxicidade em células esplênicas nas concentrações utilizadas neste estudo avaliando o potencial anti-inflamatório. Foi possível também a identificação de compostos fenólicos no extrato bruto. H. reidi foi capaz de atenuar a produção de citocinas Th2, IL-4 e IL-5 e Th1, INF-y e modular a produção de citocina imunorregulatória IL-10. Reduziu também a produção de óxido nítrico, induziu estabilização da membrana de eritrócitos e inibiu o fator transcripcional NFk-B. Contudo, não apresentou efeito broncodilatador considerável nas concentrações testadas. Dessa forma, nosso estudo revela que extrato hidroalcoólico do H. reidi exibe ação anti-inflamatória em modelos experimentais in vitro, podendo ser um futuro candidato ao isolamento de moléculas a serem mais profundamente estudadas e, no futuro, compor o arsenal terapêutico de desordens inflamatórias. The body’s first line of defense is orchestrated by an inflammatory response which involves complex interactions between soluble factors and cells, arising in any tissue in response to a traumatic, infectious, post-ischemic injury, toxic or by autoimune mechanisms. The treatment used for inflammatory disorders involves the use of non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDS) and esteroids. However, the constant and prolonged use of these drugs have many side effects which may affect many organs. For this reason, looking for new drugs whithin natural products may be a strategy in order to amplify the therapeutical arsenal against inflammatory disorders in general. Marine biodiversity is an important source of natural products. In this study, we have used the marine specie called Hippocampus reidi (H. reidi) which was one of the most cited natural products used for the treatment of asthma and other inflammatory conditions in an ethnobotanic survey conducted by our group. Considering the popular use of this species and the lack of information in literature about its immunopharmacological property, the aim of this study was to describe the chemical profile and the cytotoxic as well as immunophamacologic potential of the H. reidi hydroalcoholic extract. Hydroalcoholic extract of H. reidi was standardized using a High Performance Liquid Chromatograph (HPLC). In vitro, we evaluated its cytotoxic activity on spleen cells, as well as the effect of H. reidi on the production of IL-4, IL-5, IL- 10 and IFN-y, nitric oxide production in macrophage culture, the capacity of the relaxation of smooth muscle on isolated rat trachea, the stabilizing capacity of H. reidi on membranes of red blood cells and, finally, we evaluated NFk-B gene expression. Our results shown that the H. reidi extract had no toxicity in spleen cells at the concentrations used in this study evaluating the anti-inflammatory potential. It was also possible to identify phenolic compounds in the crude extract. H. reidi was able to attenuate the production of Th2 cytokines, IL-4 and IL-5 and Th1, IFN-y production and modulate the immunoregulatory cytokine, IL-10. Also we observed a reduction on nitric oxide production by the extract as well as a stabilization of erythrocyte membrane in addition to the inhibition of the transcriptional fator, NFk-B. However, no significant bronchodilator effect at the concentrations tested was observed. Thus, our study reveals that hydroalcoholic extract of H. reidi exhibits anti-inflammatory action in vitro and may be a candidate for molecules isolation to be further studied and, in a perspective of being in a near future, part of the therapeutical arsenal of inflammatory disorders.

O objetivo deste artigo é analisar a sustentabilidade econômico-ambiental da comunidade pesqueira da Praia da Armação – Florianópolis/SC/Brasil, através de levantamento de dados sobre a quantidade de pescadores envolvidos, número e tipo de embarcações, e se o modelo de pesca utilizado na Praia da Armação consegue aliar sustentabilidade econômica e ecologica à localidade. A pesquisa se deu em duas frentes, uma bibliográfica e outra de levantamento de dados primários. A parte bibliográfica contemplará a discussão sobre peixes, tipos de pesca, produtos da pesca, valor do pescado, sustentabilidade econômica e ambiental. A coleta de dados primários foi organizada e realizada em torno de três sujeitos principais: a colônia de pescadores artesanais da praia da Armação em Florianópolis, a comunidade local e os restaurantes que ali se encontram. A maior constatação do trabalho é que esta atividade naquela região não se enquadra no conceito exposto de sustentabilidade econômico-ambiental, merecendo atenção de políticas públicas para que se reverta um quadro que pode resultar em degradação socioambiental no local. Ao final sugere-se ações de políticas publicas e de governança pública para a reversão ou minimização deste quadro.

O ambiente marinho constitui uma extraordinária reserva de compostos com características estruturais únicas, diferentes das encontradas nos Produtos Naturais de origem terrestre. Os compostos de origem marinha assumem assim um papel cada vez mais significativo na descoberta de novos medicamentos, de novas aplicações em cosmética, na produção de enzimas com características específicas ou como biomateriais para engenharia de tecidos. A investigação nesta área, no âmbito do Crescimento Azul, ganhou novo impulso com a Estratégia Nacional para o Mar e as diretivas do Horizonte 2020. A elevada biodiversidade do mar dos Açores e os ambientes e ecossistemas que o distinguem de outras regiões, nomeadamente a influência do vulcanismo ativo e residual, estão na base da investigação que tem vindo a ser feita na Universidade dos Açores, pelo Grupo de Biotecnologia do Centro de Investigação em Recursos Naturais (CIRN), em colaboração com o DCTD, DB e CIBIO-Açores.

Tese de Doutoramento, Ciências do Mar (Biologia Marinha) As áreas marinhas protegidas (AMPs) desempenham um papel chave na preservação da biodiversidade e dos habitats, e na gestão sustentável dos recursos naturais. Um desenho representativo, conectado, resiliente e adequado das redes de AMPs requere uma boa compreensão da distribuição das espécies e da sua preferência de habitats. No entanto, um conhecimento detalhado está geralmente concentrado em apenas alguns locais de amostragem e espécies. A presente tese está direcionada para os peixes marinhos em habitats costeiros até os 40 m. A abordagem que foi desenvolvida foca-se no desenho de redes de AMPs planeadas para otimizar benefícios ecológicos. Para esta finalidade, previsões preditivas de um conjunto de variáveis dos peixes foram mapeadas para identificar áreas prioritárias para a conservação de múltiplos espécies e objetivos. A dissertação está organizada em sete capítulos. O capítulo 1 dá uma introdução geral ao estado do conhecimento da ciência das AMPs, modelos de distribuição de espécies (MDEs) e ao ecossistema marinho da área de estudo, que integra duas ilhas vizinhas do arquipélago dos Açores (Nordeste Atlântico). Uma visão geral da rede existente de AMPs e das pescas regionais está descrita. O capítulo conclui com a motivação e objetivos desta dissertação. O capítulo 2 apresenta o método de amostragem para aquisição dos dados de ictiofauna, a seleção das espécies-alvos, e os dados ambientais que foram usados na dissertação. Os principais métodos de MDEs utilizados para a produção de mapas preditivos são explicados em detalhe. Este capítulo é a base metodológica para os seguintes três capítulos. Abundância ou presença-ausência de peixes de recife com diferentes ecologias tróficas são modelados e mapeados no capítulo 3. Os resultados mostram que o ambiente determinou o padrão espacial das espécies estudadas. Por exemplo, a abundância foi sempresuperior na interface entre os principais tipos de habitat: rocha e sediment. As áreas com a presença potencial de espécies individuais foram espalhadas na área de estudo mas mais pequenos para múltiplas espécies de um determinado nível trófico. Estes hotspots de multi-espécies são uma potencial contribuição para o 'efeito de reserva' minimizando a área necessária para a conservação. O capítulo 4 apresenta modelos espaciais para a biomassa desovante e a fecundidade potencial (o número de oócitos das fêmeas matures) de peixes de recife selecionados. As duas medidas mostraram uma distribuição espacial heterogénea por espécie e influenciada pela batimetria, forças oceanográficas e distância à fronteira do habitat. Mapas de fecundidade potencial refinaram os padrões espaciais da biomassa desovante para espécies com um sex-ratio altamente enviesado para os machos. Hotspots reprodutivos de várias espécies são potenciais "habitats fonte" aumentando a produção e exportação de larvas para áreas adjacentes. Como tal, vêm potencialmente apoiar o "efeito de recrutamento" das AMPs. Consequentemente, a sua total proteção deve ser promovida. Diferentes índices de biodiversidade e de vulnerabilidade intrínseca para a pesca são analisados no capítulo 5. A proteção de locais de alta biodiversidade é frequentemente exigida em conservação marinha. No entanto, os resultados mostraram que somente os padrões de biodiversidade podem não representar bem as áreas de maior interesse e necessidade para a conservação. A integração da vulnerabilidade intrínseca para a pesca no planeamento espacial resultou numa identificação mais precisa de sítios prioritários. A combinação de ambos os parâmetros é proposta como uma nova abordagem para apoiar o planeamento espacial marítimo que serve a gestão pesqueira e os objetivos de conservação. O capítulo 6 é uma análise abrangente que combina os mapas preditivos que foram produzidos nos três capítulos anteriores com outras características do habitat e sócio-econômicos. Cenários alternativos da rede de reserva foram produzidos com o software 'Marxan', considerando diferentes alvos de conservação e objetivos. Os resultados demonstraram que a estatística da rede (ex. tamanho, 'rácio da-borda-à-área', e percentagem da linha de costa protegida) e o posicionamento da reserva foram influenciados, principalmente, pelos diferentes níveis de proteção. As diferenças foram menos pronunciadas entre soluções que se focaram na pesca ou na conservação da biodiversidade. As soluções criadas pelo Marxan correspondem parcialmente à atual rede de AMPs. Estas mostram alternativas para a localização e tamanho das áreas protegidas, que podem ser usadas em processos de gestão adaptativa. O capítulo 7 combina a discussão geral dos resultados da dissertação, impactos e possíveis trabalhos futuros. Os resultados evidenciam que as AMPs não podem beneficiar igualmente todas as espécies, portanto, é fundamental incluir informação da ecologia espacial de multi-espécies no seu desenho. Análises de representatividade mostraram que todos os hotspots de multi-espécies são quantitativamente bem integrados na rede existente de AMPs. Porém dada a elevada importância biológica/ecológica e a pequena extensão destes hotspots, os futuros processos de gestão devem promover a proteção de toda a área de hotspots para assegurar o seu funcionamento ecológico. Devido à sua clareza a aplicação de mapas preditivos deve ser uma ferramenta prioritária para a gestão do espaço marítimo, especialmente em situações de escassez de dados, desde que rigorosos critérios de validação sejam aplicados. O enquadramento apresentado é simples, direto e eficiente na identificação de habitats com potencialmente alta abundância, fecundidade, diversidade e vulnerabilidade para a pesca. Propõe-se a integração desta abordagem promissora como um primeiro passo de um múltiplo processo para a identificação de sítios prioritários para a conservação que servem vários objetivos. ABSTRACT: Marine protected areas (MPAs) can play a key role in preserving biodiversity and habitats and in managing the sustainable use of natural resources, including fish stocks. Designing representative, connected, resilient, and adequate MPA networks requires a good understanding of the species’ distribution and habitat preferences. Yet, detailed knowledge is often reduced to a few sampled locations and species. This thesis focuses on marine reef fishes in coastal habitats down to the 40 m isobath. A framework is developed to design MPA networks that optimise ecological benefits. For this purpose, predictive distributions of a set of fish variables are spatialised to identify potential sites of priority for conservation that can serve multiple species and objectives. The thesis is organised in seven chapters. Chapter 1 gives an overall introduction to the state of the art on the science of MPAs, species distribution models (SDMs) and the marine ecosystem of the study area, two neighbouring islands of the Azores archipelago (Northeast Atlantic). It includes an overview of the existing MPA network and regional fisheries. The motivation and objectives of the thesis are outlined. Chapter 2 presents the sampling method to acquire fish data, the selection of individual study species, and the environmental data that are used in the thesis. The main methods and background knowledge for the statistical models used to describe the species-environment relationships and to produce predictive maps are explained in detail, setting the basis for the following three chapters. The occurrence and abundance of reef fishes with different trophic ecologies are modelled and spatialised in chapter 3. Results showed that the environment shapes the spatial distribution patterns of the reef fishes. For instance, the abundance was typically highest at the interface between rock and sediment, highlighting the importance of this main ecotone for subtidal fish assemblages. Individual species were predicted to occur in large parts of the study area but these areas were much smaller if multiple species from the same trophic guild were considered. These multi-species abundance hotspots can be a major potential contribution to the 'reserve effect' of MPAs while minimising the area needed for protection. Chapter 4 presents spatially explicit models for the spawning biomass and the potential fecundity (number of oocytes of mature females) of selected reef fishes. The spatial distribution of both measures was heterogeneous, species-specific and influenced by bathymetry, oceanographic forces and the distance to the habitat edge. Maps of the potential fecundity further refined the spatial patterns of the spawning biomass for species with sex-ratios highly skewed towards males. Multi-species reproductive hotspots were identified and are potential 'source habitats' of increased larvae production and export to adjacent areas. As such, they potentially support the 'recruitment effect' of MPAs and their complete protection should be promoted. Chapter 5 evaluates different indices of biodiversity and vulnerability to fishing of fish assemblages. The protection of high-biodiversity sites is often demanded in marine conservation. Yet, results showed that biodiversity patterns alone may not represent well the areas of higher need for conservation. Integrating the intrinsic vulnerability to fishing in spatial planning resulted in a more precise identification of priority sites. The combination of both parameters is proposed as a novel approach to support marine spatial planning that serves fisheries management and conservation objectives. Chapter 6 is one comprehensive analysis that combines the predictive maps produced in the previous three chapters with additional habitat and socio-economic characteristics. Alternative scenarios for a reserve network are produced with the systematic conservation software 'Marxan' considering different conservation targets and objectives. Results demonstrated that the network statistics (e.g. size, edge-to-area ratio, and percentage of protected coastline) and reserve localisation were mainly influenced by the targeted level of protection. In contrast, differences were less pronounced between solutions that focused either on fisheries aspects or the protection of biodiversity within a given conservation target. The solutions provided by Marxan overlapped only partially with the existing MPA network. They provide potential alternatives for the location and size of protected areas that can be used in adaptive management processes. Chapter 7 combines a general discussion of the thesis results, impacts and possible future work. Results highlight that MPAs may not equally benefit all species, thus it is critical to include information of multi-species spatial ecology in their design. Analyses of representativeness showed that all multi-species hotspots are quantitatively well integrated in the existing MPA network. However, given the high biological/ecological significance and the rather small extent of these hotspots, future adaptive management processes should, possibly, promote the protection of the entire area of the hotspots to ensure their ecological functionality. Because of its clarity the application of predictive species distribution maps should be a principle tool for marine spatial management, especially in data scarce situations, provided that rigorous validation criteria are applied. The presented framework is simple, straightforward and efficient in identifying habitats with potentially high fish abundance, fecundity, biodiversity or vulnerability to fishing. It is proposed to integrate this promising approach as a first step of a manifold process for the identification of priority sites for conservation that serve multiple purposes.

Dissertação de Mestrado, Biodiversidade e Biotecnologia Vegetal, 10 de Fevereiro de 2014, Universidade dos Açores. Hoje em dia a degradação da zona litoral em todo o mundo é cada vez mais visível. As zonas costeiras naturais estão a ser progressivamente substituídas por estruturas artificiais construídas pelo homem para diversos fins, e.g abrandamento da erosão marinha, protecção de estruturas ligadas a actividades marítimas, etc.. Nos países mais desenvolvidos a costa natural está visivelmente a desaparecer e cada vez mais se observam estruturas artificiais que, por sua vez, podem causar distúrbios na biodiversidade costeira de cada zona. Na Ilha de São Miguel, a mais desenvolvida do arquipélago, existe já um número considerável de estruturas artificiais. De alguns anos a esta parte, a investigação sobre o efeito do urbanismo costeiro no sistema natural tem aumentado. Apesar desta tendência, poucos estudos têm‐se centrado nas mudanças na distribuição e abundância de organismos, causadas pela introdução de estruturas feitas pelo homem. Nos Açores só se conhece um estudo realizado na ilha do Pico e que teve por objectivo avaliar o efeito de uma estrutura artificial, construída para diminuir a exposição da costa à acção das ondas, sobre a organização e o funcionamento das comunidades adjacentes. O presente estudo teve como objectivo geral avaliar o efeito da natureza do substrato na composição e estrutura de comunidades do intertidal rochoso da ilha de São Miguel. Contemplou um desenho experimental que envolveu investigar molhes de basalto e molhes de cimento em diferentes locais do litoral da ilha, comparando as comunidades maduras de ambos e investigando a colonização de placas de substrato natural e artificial colocadas em ambos. Os resultados obtidos para a caracterização das comunidades maduras revelaram que não existem diferenças significativas ao nível das associações epibióticas que habitam nos diferentes substratos (basalto/cimento) para nenhum dos níveis de costa estudados (infra e mediolitoral). Por outro lado, encontraram‐se diferenças significativas ao nível da colonização das placas colocadas nos dois tipos de molhes. Os resultados sugerem que, embora a natureza do substrato não pareça ser factor condicionante das comunidades maduras, tem influência ao nível do recrutamento das placas, de acordo com o tipo placa, altura de costa e natureza dos molhes. ABSTRACT: Degradation of the littoral ecosystems is increasing worldwide. The natural coastline is being replaced by artificial structures built either for land protection, or for protection of activities related to the sea. In most developed countries the natural shore is visibly disappearing and progressively being replaced by artificial structures that can impair coastal biodiversity. On the island of São Miguel, the most developed of the archipelago, there is already a considerable number of artificial structures on the coast. Research on the effect of urbanization on coastal natural systems has increased recently. Despite this trend, few studies have focused on changes in the distribution and abundance of organisms, caused by the introduction of man‐made structures. In the Azores only one study developed on the island of Pico is known. It was aimed to evaluate the effect of an artificial structure, built to minimize the influence of wave‐action of the coast, on the organization and functioning of adjacent communities. The present study aimed to evaluate the effect of the nature of the substrate on the composition and structure of rocky intertidal communities of the island of São Miguel. The experimental design adopted involved the characterization of established mature communities on seawalls made of basalt and cement, and to experimentally examine the effects of substrate nature on the colonization of assemblages on seawalls. The structure of established mature communities was similar on seawalls made of the different substrates (basalt / cement) for any level of the coastline studied (infra/eulittoral). However, significant differences were found in the structure of early successional assemblages colonizing experimental plates of different substrate types (basalt vs cement), and which was also influenced by the nature of the surrounding habitat. The results suggest that the nature of the substrate does not seem to influence the mature communities but it influences the recruitment, depending on the type of plate, the level of the coast and the nature of the seawalls.

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas A exploração dos organismos marinhos começou em meados do século XX pela Industria Farmacêutica e as Universidades, mas é no século XXI que atinge o seu expoente máximo na pesquisa de novos organismos como fonte de compostos bioativos, onde as Empresas de Biotecnologias dão um importante contributo. Se essas pesquisas inicialmente se basearam em organismos marinhos como fonte de compostos bioativos com potencial farmacológico, com o evoluir das pesquisas foi possível perceber que estes organismos possuíam também um potencial cosmético, cosmecêutico e nutracêutico. Neste trabalho, através da revisão bibliográfica, pode constatar-se que as algas marinhas, os moluscos, as esponjas e as ascídias apresentam o maior potencial de novas moléculas e metabolitos secundários, muito importantes no tratamento de várias patologias como o cancro, o herpes, a SIDA e no tratamento da dor. Os produtos cosmecêuticos e de cosmética têm como objetivo, a prevenção e o tratamento dermatológico através de compostos antioxidantes, hidratantes e anti idade. Já os produtos nutracêuticos e suplementos alimentares são importantes na dieta alimentar quotidiana dos seres humanos, na prevenção de doenças cardiovasculares através da ingestão de alimentos funcionais que não só previnem doenças como são uma fonte de saúde e bem-estar. The harvesting of marine organisms begains in mid-twentieth century with the Pharmaceutical Industry and Universities to lead, but it is in the twenty-first century that reaches its peak in search of new organisms as a source of bioactive compounds, where Biotechnology Companies make an important contribute. If these surveys are based initially on the research of marine organisms as a source of bioactive compounds with pharmacological potential for the evolution of the research it was revealed that these organisms also have cosmetic, cosmoceutical and nutraceutical potential. In this paper, through literature review, it can be seen that the seaweeds, clams, sponges and sea squirts have the greatest potential for new molecules and secondary metabolites, important in treating various diseases such, herpes and AIDS, and for the treatment of pain. Cosmeceuticals and cosmetic products aim, the prevention and dermatological treatment by antioxidants, moisturizers and anti-aging. Already nutraceuticals and dietary supplements are important in the daily diet of humans, in the prevention of cardiovascular disease through ingestion of functional foods that not only prevent disease as they are a source of health and well-being.

Coral Bleaching is an environmental phenomena that has been used worldwide to demonstrate environmental changes in tropical marine ecosystems. This study reports the first occurrence of coral bleaching for the Ceará coast (NE Brazil). Although the monitoring covers the period from 2005 to 2010 taken on an artificial reef within a port area, and a sandstone intertidal reef, the bleaching event in corals (Siderastrea stellata and Favia gravida) and zoanthid (Zoanthus sociatus) just occurred during the summer of 2010 (February and March). The event is related to changes in temperature anomaly of sea surface (1 – 2 ºC), 4 – 7 weeks of heat above average, high temperatures on the sea surface (30 to 32 ºC) and positive hot-spots values (the oceanographic and climatic data were obtained from the NOAA’s Coral Reef Watch Program). It’s assumed that there is the relationship between the anthozoan bleaching, levels of irradiation and the events of the anomaly of sea surface temperature (SST) in the studied reefs. High temperatures, the turbidity of the waters and the periodic stresses of intertidal reefs may have a synergistic effect during the reported bleaching episode; which creates a different situation compared to other stretches of the coast of Southwest Tropical Atlantic O branqueamento de corais é um dos fenômenos ambientais que têm sido usado mundialmente para demonstrar alterações ambientais em ecossistemas marinhos tropicais. Este estudo relata a primeira ocorrência de branqueamento de corais no litoral do Ceará (NE, Brasil). Embora o monitoramento abranja o período de 2005 a 2010 em um recife artificial, dentro de uma área portuária, e em um recife de arenito entremarés, o episódio de branqueamento intenso de corais (Siderastrea stellata e Favia gravida) e zoantídeos (Zoanthus sociatus) somente ocorreu no verão de 2010 (fevereiro e março). O evento está provavelmente relacionado a anomalias da temperatura da superfície do mar (1 a 2 ºC acima da média), 4 a 7 semanas de calor acima da média, altas temperaturas na superfície marinha (30 a 32 ºC) e valores positivos de hot-spots (os dados oceanográficos e climáticos foram obtidos do Programa Coral Reef Watch, da NOAA). Admite-se uma relação entre o branqueamento dos antozoários e os eventos de anomalia da temperatura da superfície do mar (TSM) na área estudada. As altas temperaturas, a turbidez e os estresses periódicos de recifes entre marés (dessecação, insolação e temperaturas elevadas em poças de maré) tiveram um efeito sinergético durante o episódio de branqueamento aqui relatado; o que gera uma situação diferenciada em relação a outros trechos do litoral do Atlântico Sudoeste Tropical.

Orientador : Prof. Dr. Henry Louis Spach Orientador : Prof. Dr. Jean-Christophe Joyeux Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia e Conservação. Defesa: Curitiba, 17/03/2014 Inclui referências Resumo: Nesse estudo, foram investigadas as mudanças na estrutura da ictiofauna estuarina em diferentes escalas geográficas, os processos ecológicos subjacentes a essas mudanças, bem como a localização de áreas prioritárias para a conservação na zona marinha brasileira. No Capítulo 1, um desenho de amostragem hierárquico foi usado para comparar a variação na estrutura das assembleias de peixes entre duas escalas espaciais e para estimar os efeitos individuais e sinergéticos de alguns parâmetros ambientais e da distância geográfica na estruturação da fauna. Para isso, foram amostradas oito áreas separadas por 0,7-25 km (escala local) dentro de cada um dos cinco estuários separados por 970-600 km (escala regional). As análises revelaram diferenças significativas na estrutura das assembleias (em termos de biomassa relativa e presença/ausência das espécies) para ambas as escalas e que a variação regional foi comparativamente maior do que a variação local. Porém, os cinco estuários amostrados segregaram-se em dois grupos amplamente congruentes com as províncias biogeográficas Brasileira e Argentina. Três variáveis ambientais (temperatura média da água no mês mais frio, área de manguezal e precipitação média anual) e a distância entre os estuários explicaram, respectivamente, 44,8 e 16,3% da variabilidade regional na biomassa relativa das espécies. Em escala local, os resultados sugerem que as assembleias de diferentes estuários são estruturadas por fatores distintos. No Capítulo 2, os padrões geográficos de riqueza de espécies e raridade da ictiofauna estuarina foram mapeados e integrados para identificar regiões importantes para a conservação na costa brasileira. Além disso, também foi analisada a efetividade do sistema nacional de áreas protegidas para representar essas regiões. Quarenta e oito bandas, com 0,25° de latitude cada, foram consideradas prioritárias para a conservação, por possuírem simultaneamente uma alta riqueza de espécies e assembleias relativamente raras. Também foi verificado que o sistema atual de áreas protegidas é ineficiente para proteger essas bandas. Por fim, no Capítulo 3, foram elaboradas alternativas para a expansão das áreas marinhas protegidas (AMPs) em águas brasileiras, que maximizam a representação das espécies e evitam conflitos com atividades econômicas relevantes. Para isso, foram utilizados dados de distribuição de 750 espécies de vertebrados marinhos (incluindo mamíferos, aves, tartarugas e peixes), das AMPs existentes e das concessões para exploração/produção de petróleo e gás natural na Zona Econômica Exclusiva do País. As soluções elaboradas mostraram que uma rede de AMPs, abrangendo 10% da área de estudo com alta prioridade para a conservação, poderia proteger, em média, entre 85,8 e 86,5% da distribuição das espécies. Foi constatado que a inclusão das AMPs existentes e das concessões para exploração de petróleo e gás no processo de priorização causou somente uma pequena perda na representação de espécies em perigo e ameaçadas de extinção. Os resultados sugerem, no entanto, que é possível compatibilizar a produção atual de petróleo e gás com a expansão da rede nacional de AMPs. As informações apresentadas nesse estudo podem contribuir para a tomada de decisões vinculadas ao objetivo do Brasil, de proteger 10% da sua zona marinha e costeira até 2020. Palavras-chave: comunidade de peixes, biodiversidade, estuários, planejamento para conservação, áreas marinhas protegidas, raridade. Abstract: The present study aims to investigate changes in estuarine ichthyofauna across different spatial scales, the ecological process underlining these changes, as well as the localization of priority areas for conservation at Brazilian marine zone. In Chapter 1, a hierarchical sampling design was used to quantify variations in assemblage structures of Brazilian estuarine fish across two spatial scales and to estimate the individual and synergetic effects of selected environmental variables and of geographical distance on the ichthyofauna structure. For this analysis, eight areas separated by 0.7 to 25 km (local scale) were sampled in five estuaries separated by 970 to 6000 km (regional scale). Multivariate analysis revealed that assemblage structure varied significantly in terms of relative biomass and presence/absence of species on both scales, and that the regional variation was greater than the local variation for either dataset. However, the five estuaries sampled segregated into two major groups largely congruent with the Brazilian and Argentinian biogeographic provinces. Three environmental variables (mean temperature of the coldest month, mangrove area and mean annual precipitation) and distance between estuaries explained 44.8 and 16.3%, respectively, of the regional-scale variability in the species relative biomass. At the local scale, the importance of environmental predictors for the spatial structure of the assemblages differed between estuarine systems. In Chapter 2, geographic patterns of species richness and rarity of the estuarine ichthyofauna were mapped and integrated to identify important regions for biodiversity conservation across the Brazilian coast. Furthermore, also was analyzed the effectiveness of the national system of protected areas to represent these regions. Forty-eight bands of 0.25° latitude each were recognized as conservation priorities by harbor simultaneously high species richness and assemblages that are relatively rare. Also was found that the existing system of protected areas is inefficient to represent priority bands identified in this study. Lastly, in Chapter 3 were developed alternatives for the expansion of current marine protected areas (MPAs) in Brazilian waters that maximize species representation and reduce potential conflicts with relevant economic activities. For this were utilized distribution data of 750 marine vertebrate species (including mammals, birds, turtles and fishes), of established MPAs and of the areas concessioned for oil and gas exploitation. The results showed that a MPA network encompassing 10% of the study area with high conservation priority would protect, on average, between 85.8 and 86.5% of species distribution. It was found that incorporating existing MPAs and areas concessioned for oil and gas exploitation in the prioritization process caused only a small loss in representation of near-threatened and threatened species. The results highlight, therefore, that it is possible to reconcile current offshore oil and gas production with the expansion of the national MPA network, without significant losses in species' representation. The solutions presented here may be useful as scientific support in political negotiations about Brazil's commitment to protect 10% of its coastal and marine areas by 2020. Key-words: fish communities, biodiversity, estuaries, conservation planning, marine protected areas, rarity.

A secção UAciência é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. […]. Os Açores são uma região privilegiada para a descoberta de medicamentos de origem marinha. Para alem da extensão da costa e da sua proximidade, o oceano que nos rodeia encontra-se ainda pouco afectado pela poluição, com uma rica biodiversidade que se reflecte em comunidades de algas bem desenvolvidas e saudáveis. A Universidade dos Açores estuda estas comunidades desde há mais de 20 anos, e mais recentemente tem-se vindo a estudar o seu potencial farmacológico. Algumas das algas estudadas revelaram ser de grande interesse. Por exemplo, descobrimos que duas delas, Cystoseira abies-marina e Fucus spiralis, eram extremamente activas contra células de cancro em ensaios de laboratório. Se acrescentarmos que matavam as células de cancro por um mecanismo chamada apoptose, com menos efeitos negativos para as células normais, facilmente se conclui que estas algas poderão ser uma boa fonte de agentes anticancerígenos. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

A secção Biologia é coordenada pelo Professor Universitário Armindo Rodrigues. […]. Na última década a Universidade dos Açores tem contribuído para o desenvolvimento de metodologias não destrutivas em ecologia, aproveitando o desenvolvimento de novas tecnologias como telemetria, o uso de filme e da imagem digital. Em 2008 publicou-se um artigo na revista «Hidrobiologia» que propunha a utilização de imagem digital para a identificação de comunidades algais na zona entre mares bem como na zona submersa das costas açorianas. […]. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Doutoramento em Biologia Submitted by Nuno Cruz (nuno@ua.pt) on 2012-05-11T10:48:08Z No. of bitstreams: 1 tese final.pdf: 18959185 bytes, checksum: c1aa0ace9c1726df9b7733798e98ce30 (MD5) Made available in DSpace on 2012-05-11T10:48:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese final.pdf: 18959185 bytes, checksum: c1aa0ace9c1726df9b7733798e98ce30 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29

Doutoramento em Biologia No actual cenário de perda acelerada de biodiversidade, o nosso conhecimento dos ecossistemas marinhos, apesar da sua extensão e complexidade, continua muito inferior ao dos ecossistemas terrestres. A classe Malacostraca (Arthropoda, Crustacea), um grupo dos mais representativos nos ecossistemas marinhos, apresenta um elevado nível de diversidade morfológica e ecológica, mas difícil sua identificação ao nível de espécie requer frequentemente a ajuda de especialistas em taxonomia. A utilização recente do “barcoding” (código de barras do ADN), revelou ser um método rápido e eficaz para a identificação de espécies em diversos grupos de metazoários, incluindo os Malacostraca. No âmbito desta tese foi construída uma base de dados de código de barras de ADN envolvendo 132 espécies de Malacostraca vários locais de amostragem no Atlântico Nordeste e Mediterrâneo. As sequências de ADN mitocondrial provenientes de 601 espécimes formaram, em 95% dos casos, grupos congruentes com as identificações baseadas em características morfológicas. No entanto, foi detectado polimorfismo em seis casos e a divergência intra-específica foi elevada em exemplares pertencentes a duas espécies morfológicas, sugerindo, neste caso, a ocorrência de especiação críptica. Este estudo confirma a utilidade do código de barras de ADN para a identificação de Malacostraca marinhos. Apesar do sucesso obtido, este método apresenta alguns problemas, como por exemplo a possível amplificação de pseudogenes. A ocorrência de pseudogenes e as possíveisabordagens para a detecção e resolução deste tipo de problemas são discutidas com base em casos de estudo: análises dos códigos de barras ADN na espécie Goneplax rhomboides (Crustacea, Decapoda). A análise dos códigos de barras ADN revelou ainda grupos prioritários de decápodes para estudos taxonómicos e sistemáticos, nomeadamente os decápodes dos géneros Plesionika e Pagurus. Neste âmbito são discutidas as relações filogenéticas entre espécies seleccionadas dos géneros Plesionika e Pagurus. Este trabalho aponta para várias questões no âmbito da biodiversidade e evolução molecular da classe Malacostraca que carecem de um maior esclarecimento, podendo ser considerado como a base para estudo futuros. Análises filogenéticas adicionais integrando dados morfológicos e moleculares de um maior número de espécies e de famílias deverão certamente conduzir a uma melhor avaliação da biodiversidade e da evolução dentro da classe. The biodiversity of many habitats is under threat and although seas cover the majority of our planet’s surface, far less is known about the biodiversity of marine environments than that of terrestrial systems. The complexity of its species and ecosystems is immense. Marine malacostraca are known as a group with a high level of morphological and ecological diversity but are difficult to identify by traditional approaches and usually require the help of highly trained taxonomists. A faster identification method, DNA barcoding, was found to be an effective tool for species identification in many metazoan groups including some malacostraca. Moreover, the generation of a larger comparative database allows additional insights into the tempo and mode of molecular evolution. Indeed, examination of diversity at the COI region yields an informative framework to identify and explore priority issues, demanding in turn a fully integrative approach utilising additional molecular, distributional and ecological information. Here we expand the DNA barcode database with a case study involving more than 132 malacostracan species from the Northeast Atlantic Ocean and Mediterranean Sea. DNA sequences from around 601 specimens grouped into clusters corresponding to known morphological species in 95% of cases. However shared polymorphism between sister-species was detected in six species. Intraspecific divergence was high in specimens belonging to two morphological species, suggesting the occurrence of cryptic speciation, allowing a rapid assessment of taxon diversity in groups that have until now received limited morphological and systematic examination. We highlight taxonomic groups or species with unusual nucleotide composition or evolutionary rates. Such data are relevant to strategies for conservation of existing decapod biodiversity, as well as elucidating the mechanisms and constraints shaping the patterns observed.This study reconfirms the usefulness of DNA barcoding for the identification of marine malacostraca, despite complexities that sometimes arise due to pseudogenes (numts). Here, we study the effect of numts on DNA barcoding based on barcoding analyses in decapoda species: Goneplax rhomboides. DNA barcodes reveal priority groups for taxonomic and systematic focus of decapods. Here we discussed two cases of phylogenetic relationships among selected species of Plesionika and Pagurus, respectively. Issues relating to the molecular biodiversity and evolution of the Malacostraca arising from this study allow identification of future priorities. Further phylogenetic analyses including morphological and molecular data of selected families is required, especially encompassing broad geographic and ecological coverage, will lead to an improved evaluation of the biodiversity and evolution among selected Malacostraca species

Tese de doutoramento, Biologia (Biodiversidade), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2011 Submitted by amelia Janeiro (ajaneiro@reitoria.ul.pt) on 2011-12-02T11:24:25Z No. of bitstreams: 4 ulsd061459_td_metadados.pdf: 1325689 bytes, checksum: 69a4a68d236636f5e045fcdcb7de8a2e (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_1.pdf: 19101622 bytes, checksum: e3802eb220826da98c71e8db04f33d8c (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_2.pdf: 14561992 bytes, checksum: e99c172d2970493c4d6caaa1afc30d58 (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_3.pdf: 4043427 bytes, checksum: fc8ef2b8651c71d5b384acb58bdf20cd (MD5) Made available in DSpace on 2011-12-02T11:30:43Z (GMT). No. of bitstreams: 4 ulsd061459_td_metadados.pdf: 1325689 bytes, checksum: 69a4a68d236636f5e045fcdcb7de8a2e (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_1.pdf: 19101622 bytes, checksum: e3802eb220826da98c71e8db04f33d8c (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_2.pdf: 14561992 bytes, checksum: e99c172d2970493c4d6caaa1afc30d58 (MD5) ulsd061459_td_João_Gil_vol_3.pdf: 4043427 bytes, checksum: fc8ef2b8651c71d5b384acb58bdf20cd (MD5) Previous issue date: 2011 Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT - Programa PRAXIS XXIPRAXIS XXI/ BD/ 4036/ 94)

XIV Expedição Científica do Departamento de Biologia - Santa Maria 2009. Na XIV Expedição Cientifica à ilha de Santa Maria 2009, organizada pelo Departamento de Biologia da Universidade dos Açores, foram realizados vários trabalhos em diversos locais do litoral da ilha, tendo como objectivo o registo, recolha e identificação de espécies marinhas, tendo sido feita amostragem de fauna e flora intertidal e subtidal (em mergulho com escafandro autónomo). Em cada um dos locais de amostragem procedeu-se a identificação dos exemplares in loco e quando esta não era possível, os indivíduos foram colectados para posterior identificação em laboratório. Em paralelo, colectaram-se algas e crustáceos decápodes para análise genética (sequenciação de DNA; COI). Foram ainda efectuados dois arrastos para recolha de plâncton. Toda a informação obtida irá ser incluída na base de dados Atlantis. Os trabalhos efectuados inserem-se no âmbito de vários projectos em curso no Departamento de Biologia da UAç (e.g. LusoMarBol, Inspect). A inventariação de espécies resultou no acréscimo de 18 registos à lista de espécies costeiras e marinhas anteriormente referenciadas para Santa Maria, contribuindo deste modo para um melhor conhecimento da biodiversidade costeira e marinha da ilha de Santa Maria.

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico A taxonomia e a ecologia dos Copepoda Harpacticoida dos sedimentos do talude da Bacia de Campos são aqui apresentadas (capitulo 1), assim como a descrição de três espécies novas de Echinopsyllus (capitulo 2) e uma discussão acerca da distribuição geográfica e batimétrica da família Ancorabolidae (capitulo 3). Um total de 44 estações foi amostrado ao longo de nove transectos, considerando-se cinco profundidades (750 m, 1050 m, 1350 m, 1650 m e 1950 m) nas áreas Norte e Sul da Bacia de Campos e em dois estratos sedimentares (0-2 e 2-5cm). Para analisar a composição taxonômica e os aspectos ecológicos dos dados, foram construídos gráficos e organizadas tabelas. O índice de diversidade utilizado foi o de Shannon-Wiener e a equitabilidade calculada pelo índice de Pielou (J ). A análise de variância, por postos, de Kruskal-Wallis, foi aplicada aos valores do número total de indivíduos de Copepoda Harpacticoida, por amostra, a fim de testar diferenças entre os estratos trabalhados. Para a determinação de padrões ecológicos da comunidade, aplicou-se o índice de similaridade de Bray-Curtis e foi realizada uma análise de ordenação não-métrica multidimensional, considerando diferentes fatores: campanhas, áreas, profundidades e estratos. A significância da formação dos grupos de amostras foi testada pela análise ANOSIM. Para uma avaliação das relações entre a estrutura da comunidade de Harpacticoida e as variáveis ambientais, foi realizada a análise BIOENV. Foram identificados 1449 exemplares de Copepoda Harpacticoida. A composição desta fauna, na Bacia de Campos, mostrou-se semelhante à de outras áreas, especialmente, a da Bacia de Angola; porém, um alto valor percentual de táxons novos foi encontrado na Bacia de Campos (10 gêneros e 78 espécies novas). Os valores de densidade foram inferiores, de um modo geral, aos de outros estudos de mar profundo. A diversidade apresentou, em geral, valores altos ao longo das diferentes estações e áreas estudadas, além de uma tendência à redução com o aumento da profundidade. O estrato mais superficial apresentou, significativamente, os maiores valores de densidade e diversidade, o que confirma os relatos já existentes na literatura, Utilizando diferentes níveis de resolução taxonômica, os padrões observados para a comunidade mostraram uma resposta semelhante, no entanto, o uso de categorias taxonômicas mais elevadas leva a uma grande perda do conhecimento da biodiversidade marinha. A descoberta de novas espécies de Echinopsyllus estendeu o limite de distribuição desse gênero para o hemisfério sul e é uma evidência adicional de uma ampla distribuição dos gêneros de Ancorabolidae, anteriormente não esperada, nos oceanos mundiais. A posição filogené tica de Echinopsyllus dentro de Ancorabolinae é discutida. As observações dos registros de latitudes, profundidades e faixas de temperatura dos ancorabolídeos evidenc iaram uma clara tendência de distribuição: das altas latitudes existem registros em profundidades baixas e altas, enquanto nas baixas latitudes, os registros provém, unicamente, de altas profundidades. Esse padrão nos leva a hipotetizar que os limites de distribuição latitudinal e batimétrica das espécies de Ancorabolidae podem ser controlados/restritos pela temperatura. A posição filogené tica basal da subfamilia Laophontodinae sugere que Ancorabolidae foi, originalmente, uma família de áreas rasas e plataformas continentais frias de águas subantarticas que irradiaram para o mar profundo

The sea anemones Telmatactis cricoides (Duchassaign, 1850) and Actinia n. sp., the molluscs Tonna galea Linnaeus, 1758, Vitreolina philippi (de Rayneval & Ponzi, 1854), Melanella n. sp., Phidiana lynceus (de Rayneval & Ponzi, 1854) and Anomia patelliformis (Linnaeus, 1761), the nemertine Baseodiscus delineatus (DelleChiaje, 1825) and the echinoderms Leptosynapta inhaerens (O. F. Müller, 1776) and Stichopus regalis (Cuvier, 1817), are here recorded from the Azores for the first time. The presence of the two starfish species Chaetaster longipes (Retzius, 1805) and Luidia ciliaris (Philippi, 1837) in the Azores is confirmed and the spawning behaviour of the sea urchin Echinocyamus pusillus (O. F. Müller, 1776) is described. Praxis XXI/BCC/16435/98 info:eu-repo/semantics/publishedVersion

The sea anemones Actinoporus elegans Duchassaing, 1850 and Anthothoe affinis (Johnson, 1861) are new records from Cape Verde Islands. Also new to the marine fauna of Cape Verde are an undescribed mysid species of the genus Heteromysis that lives in association with the polychaete Branchiomma nigromaculata, the shrimp Tulearicoaris neglecta Chace, 1969 that lives in association with the sea urchin Diadema antillarum, an undescribed nudibranch of the genus Hypselodoris, and two undescribed species of the parasitic gastropod genus Melanella and Melanella cf. eburnea. An undescribed plathelmint of the genus Pseudobiceros, the nudibranch Phyllidia flava (Aradas, 1847) and the parasitic gastropod Echineulima leucophaes (Tomlin & Shackleford, 1913) are recorded, based on colour photos taken in the field. The crab Nepinnotheres viridis Manning, 1993 was encountered in the bivalve Pseudochama radians, which represents the first host record for this pinnotherid species. The nudibranch Tambja anayana, previously only known from a single animal, was reencountered and photographed alive. The sea anemone Actinoporus elegans, previously only known from the western Atlantic, is also reported here from São Tomé Island. In addition, the bythiid fish Grammonus longhursti and an undescribed species of the genus Apletodon are recorded from the Cape Verde Islands for the first time. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

XIII Expedição Científica do Departamento de Biologia - Flores e Corvo 2007. Submitted by Duarte Furtado (dfurtado@uac.pt) on 2010-11-18T12:59:12Z No. of bitstreams: 1 Contributo para o conhecimento da biodiversidade marinha da ilha das Flores.pdf: 2290534 bytes, checksum: 365504c452274769a15e23e2a66beed7 (MD5) Made available in DSpace on 2010-11-24T16:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Contributo para o conhecimento da biodiversidade marinha da ilha das Flores.pdf: 2290534 bytes, checksum: 365504c452274769a15e23e2a66beed7 (MD5) Previous issue date: 2008-06