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Las VI Jornadas Científicas del Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC) fueron celebradas el 17 y 18 de abril de 2023 en Madrid. En ellas tuvieron lugar 3 sesiones plenarias de 45 minutos, 21 charlas de 15 minutos y 31 charlas de 5 minutos. Finalizaron con mesa redonda sobre "El futuro de la carrera investigadora en el Museo".

Microbial ecology is responsible for the study of the interactions of microorganisms among themselves and with their environment, whose knowledge allows understanding the structure and composition of microbial communities in a given habitat, such as little explored extreme ecosystems or environments of the human domain. Moreover, it allows the association of the metabolic processes of some microorganisms with biotechnological applications in industries such as food, pharmaceuticals or agriculture. These technological applications are only possible when the identity and function of the microbial communities that carry out these processes, the field of study of microbial ecology, are known in detail., La ecología microbiana se encarga del estudio de las interacciones de los microorganismos entre ellos y con su ambiente, cuyo conocimiento permite comprender la estructura y composición de las comunidades microbianas en un hábitat determinado, como ecosistemas extremos poco explorados o ambientes del entorno humano. Más aún: permite asociar los procesos metabólicos de algunos microorganismos con aplicaciones biotecnológicas en industrias como la alimenticia, la farmacéutica o la agricultura. Estas aplicaciones tecnológicas sólo son posibles cuando se conoce a detalle la identidad y función de las munidades microbianas que realizan estos procesos, ámbito de estudio de la ecología microbiana.

A global assessment of the structure and function of the crop microbiome is urgently needed for the development of effective and rationally designed microbiome technologies for sustainable agriculture. Such an effort will provide new knowledge on the key ecological and evolutionary interactions between plant species and their microbiomes that can be harnessed for increasing agriculture productivity.

A global assessment of the structure and function of the crop microbiome is urgently needed for the development of effective and rationally designed microbiome technologies for sustainable agriculture. Such an effort will provide new knowledge on the key ecological and evolutionary interactions between plant species and their microbiomes that can be harnessed for increasing agriculture productivity.

[ES] Las herramientas de monitorización para el control de los sistemas biológicos en las estaciones depuradoras de aguas residuales (EDAR) deben estar basadas en metodologías precisas, que permitan apuntar hacia la correcta gestión del proceso. En este estudio se han utilizado técnicas de secuenciación dirigida de segunda (Illumina) y tercera generación (PacBio) para caracterizar las comunidades microbianas del fango activo durante un episodio de descenso en los rendimientos de eliminación del amonio. Además, para detectar posibles sesgos en la secuenciación y caracterizar las bacterias involucradas en el proceso de nitrificación, se ha utilizado la técnica de hibridación in situ (FISH). Para valorar la actividad de la biomasa se han aplicado técnicas de cuantificación del ATP de última generación. Los análisis realizados aportan información sobre qué tipo de resultados esperar según la tecnología de secuenciación utilizada. Los resultados de la ATPmetría sugieren que la medida de los sólidos suspendidos volátiles activos puede mejorar el cálculo de las variables de diseño y control más habituales de las EDAR., [EN] Monitoring tools for biological process control in wastewater treatment plants (WWTP) need to be based on accurate methodologies that aim at adequate process management. In this work, second (Illumina) and third (PacBio) amplicon sequencing techniques were used to monitoring microbial communities during nitrification break performance in an activate sludge system. Nitrifying bacterial communities were monitored by fluorescence in situ hybridization (FISH). To assess bacterial activity second-generation ATP determination technique was used. The comparison between techniques provides information about the biases of each sequencing technology. ATP determination techniques suggest that the measurement of active volatile suspended solids can improve the calculation of most common design and control parameters of WWTP.

[ES] Las herramientas de monitorización para el control de los sistemas biológicos en las estaciones depuradoras de aguas residuales (EDAR) deben estar basadas en metodologías precisas, que permitan apuntar hacia la correcta gestión del proceso. En este estudio se han utilizado técnicas de secuenciación dirigida de segunda (Illumina) y tercera generación (PacBio) para caracterizar las comunidades microbianas del fango activo durante un episodio de descenso en los rendimientos de eliminación del amonio. Además, para detectar posibles sesgos en la secuenciación y caracterizar las bacterias involucradas en el proceso de nitrificación, se ha utilizado la técnica de hibridación in situ (FISH). Para valorar la actividad de la biomasa se han aplicado técnicas de cuantificación del ATP de última generación. Los análisis realizados aportan información sobre qué tipo de resultados esperar según la tecnología de secuenciación utilizada. Los resultados de la ATPmetría sugieren que la medida de los sólidos suspendidos volátiles activos puede mejorar el cálculo de las variables de diseño y control más habituales de las EDAR., [EN] Monitoring tools for biological process control in wastewater treatment plants (WWTP) need to be based on accurate methodologies that aim at adequate process management. In this work, second (Illumina) and third (PacBio) amplicon sequencing techniques were used to monitoring microbial communities during nitrification break performance in an activate sludge system. Nitrifying bacterial communities were monitored by fluorescence in situ hybridization (FISH). To assess bacterial activity second-generation ATP determination technique was used. The comparison between techniques provides information about the biases of each sequencing technology. ATP determination techniques suggest that the measurement of active volatile suspended solids can improve the calculation of most common design and control parameters of WWTP.

Introduction. Moniliophthora spp. species are endemic from South America and infect America’s cocoa crops. Objetive. The objective of the study was to analyze the potential distribution and the fundamental niche of Moniliophthora roreri (Mr) and M. perniciosa (Mp) in America and Africa. Materials and methods. The occurrence records were obtained from a bibliographic review. Bioclimatic variables were used as predictors in the maximum entropy niche model (MaxEnt) and for its visualization in Niche Analyst 3.0. Results. The areas where Mr was most likely to occur were Esmeraldas and Los Ríos, Ecuador, coastal zones of Costa Rica, Santander and Antioquia of Colombia, and for Mp the States of Bahia and Acré of Brazil. The variables that most influenced the distribution of Mr are those associated with precipitation. Temperature-related conditions were more important in the Mp model. The risk of Mr invasion was identified in the Acre and Pará regions, Brazil. The transfer of the models evidenced the potential of Mr and Mp invasion in cocoa crops in Africa. The fundamental niche of pathogens and cocoa showed average similarity values, while the niche of fungal species showed a low similarity. Low pathogen niche similarity and differences in bioclimatic variables affecting pathogens distribution were related to a process of niche partitioning. Conclusion. Geographical regions with a greater potential distribution of pathogens and bioclimatic characteristics that would favor their probability of presence in America’s cocoa crops were identified. It is necessary to regulate the transport of contaminated plant material and equipment between regions to avoid the introduction of pathogens in healthy cocoa crops., Introducción. Las especies de Moniliophthora spp. son endémicas de Sudamérica e infectan los cultivos de cacao de América. Objetivo. El objetivo del estudio fue analizar la distribución potencial y el nicho fundamental de Moniliophthora roreri (Mr) y M. perniciosa (Mp) en América y África. Materiales y métodos. Los registros de ocurrencia fueron obtenidos de una revisión bibliográfica. Se utilizaron variables bioclimáticas como predictores en el modelo de nicho de máxima entropía (MaxEnt) y para su visualización en Niche Analyst 3.0. Resultados. Las zonas donde se registró mayor probabilidad de ocurrencia de Mr fueron Esmeraldas y Los Ríos, Ecuador, zonas costeras de Costa Rica, Santander y Antioquia de Colombia, y para Mp los Estados de Bahía y Acré de Brasil. Las variables que más influyeron en la distribución de Mr están asociadas a las precipitaciones. Las condiciones relacionadas con la temperatura fueron más importantes en el modelo de Mp. Se identificó el riesgo de invasión de Mr en las regiones de Acré y Pará, Brasil. La transferencia de los modelos evidenció el potencial de invasión de Mr y Mp en los cultivos de cacao en África. El nicho fundamental de los patógenos y el cacao presentó valores de similitud medios, mientras que, el nicho de las especies de hongos mostró una baja similitud. La baja similitud de los nichos de los patógenos y las diferencias en las variables bioclimáticas que afectan su distribución se podrían relacionar a un proceso de partición del nicho. Conclusión. Se identificaron las regiones geográficas con una mayor distribución potencial de los patógenos y las características bioclimáticas que favorecerían su probabilidad de presencia en los cultivos de cacao de América. Es necesario regular el transporte de material vegetal y equipo contaminado entre regiones para evitar la introducción de los patógenos en cultivos de cacao sanos.

The dark ocean contains about 70% of the ocean’s microbial cells and 60% of its heterotrophic activity, which is mainly fueled by the flux of organic particles produced in the surface ocean and exported to the bathypelagic ocean (1,000 – 4,000 m depth). The bathypelagic ocean represents a nonhomogeneous environment and contains a variety of particles that are considered as the main supply of organic carbon to this environment. The microorganisms inhabiting this realm play a pivotal regulatory role in the biogeochemical cycles at a planetary scale. Accordingly, the study of these microorganisms is an essential step to decipher the ecological functioning of the deep ocean. Chapters 1 to 3 in this Thesis are dedicated to the description of the prokaryotic community composition in the bathypelagic ocean at a global scale through the sequencing of ribosomal DNA and RNA fragments using data collected during the Malaspina 2010 expedition. Chapter 1 identifies the dominant prokaryotes in the deep ocean and reveals a high proportion (~50%) of previously undescribed prokaryotes. The water masses and the structure of the deep ocean’s floor, organized into basins, are identified as the main drivers of their biogeography. Chapter 2 addresses the differences between free-living and particle-attached bathypelagic prokaryotic communities. This is shown to be a phylogenetically conserved trait, indicating that the bathypelagic particles and the water surrounding them constitute two distinct niches and that transitions from one to the other have been rare at an evolutionary timescale. Finally, in Chapter 3 we identify a linear relationship between the 16S RNA/DNA ratio and particle attachment preference, suggesting a global relationship between the prokaryote’s preference for a particle-attached lifestyle and their growth rate. While the deep ocean is a highly unexplored environment, a more complete knowledge exists for the epipelagic ocean (0 – 200 m depth). Steep gradients of light, El océano profundo contiene el 70% de las células microbianas del océano las cuales suponen el 60% de la actividad heterotrófica. Dicha actividad biológica está mantenida por un flujo de partículas orgánicas producidas en el océano superficial y exportadas al océano batipelágico (1,000 - 4,000 m de profundidad). Éste no es, por tanto, un ambiente homogéneo, sino que contiene una variedad de partículas consideradas el aporte dominante de carbono orgánico. Los microorganismos de este ambiente tienen, por tanto, un papel regulatorio central en los ciclos biogeoquímicos planetarios. Consecuentemente, el estudio de estos microorganismos supone un paso esencial para descifrar el funcionamiento ecológico del océano profundo. Los Capítulos 1 a 3 de esta Tesis están dedicados a la descripción a nivel global de la composición de las comunidades de procariotas en el océano batipelágico mediante la secuenciación de fragmentos del ADN y ARN ribosomal. En el Capítulo 1 se identifican los procariotas dominantes en el océano profundo y se revela la existencia de una alta proporción (~50%) de procariotas previamente no descritos. Se reconocen además las masas de agua y la orografía del fondo oceánico, organizado en cuencas, como factores claves en su biogeografía. En el Capítulo 2 se estudian las diferencias entre las comunidades de procariotas de vida libre y aquellos adheridos a partículas. Este rasgo se demuestra estar conservado filogenéticamente, indicando que las partículas del batipelágico y el agua que las rodea constituyen dos nichos claramente diferenciados y que las transiciones entre uno y otro por parte de los procariotas han sido eventos poco frecuentes a escalas evolutivas. Finalmente se identifica en el Capítulo 3 una relación lineal entre el cociente de 16S ARN/ADN ribosomal y la preferencia a un modo de vida adherido a partículas, lo que sugiere una relación a nivel global entre la adherencia a partículas y su tasa de crecimiento. Mientras el océano profundo es un, Postprint (published version)

Introduction. Moniliophthora spp. species are endemic from South America and infect America’s cocoa crops. Objetive. The objective of the study was to analyze the potential distribution and the fundamental niche of Moniliophthora roreri (Mr) and M. perniciosa (Mp) in America and Africa. Materials and methods. The occurrence records were obtained from a bibliographic review. Bioclimatic variables were used as predictors in the maximum entropy niche model (MaxEnt) and for its visualization in Niche Analyst 3.0. Results. The areas where Mr was most likely to occur were Esmeraldas and Los Ríos, Ecuador, coastal zones of Costa Rica, Santander and Antioquia of Colombia, and for Mp the States of Bahia and Acré of Brazil. The variables that most influenced the distribution of Mr are those associated with precipitation. Temperature-related conditions were more important in the Mp model. The risk of Mr invasion was identified in the Acre and Pará regions, Brazil. The transfer of the models evidenced the potential of Mr and Mp invasion in cocoa crops in Africa. The fundamental niche of pathogens and cocoa showed average similarity values, while the niche of fungal species showed a low similarity. Low pathogen niche similarity and differences in bioclimatic variables affecting pathogens distribution were related to a process of niche partitioning. Conclusion. Geographical regions with a greater potential distribution of pathogens and bioclimatic characteristics that would favor their probability of presence in America’s cocoa crops were identified. It is necessary to regulate the transport of contaminated plant material and equipment between regions to avoid the introduction of pathogens in healthy cocoa crops., Introducción. Las especies de Moniliophthora spp. son endémicas de Sudamérica e infectan los cultivos de cacao de América. Objetivo. El objetivo del estudio fue analizar la distribución potencial y el nicho fundamental de Moniliophthora roreri (Mr) y M. perniciosa (Mp) en América y África. Materiales y métodos. Los registros de ocurrencia fueron obtenidos de una revisión bibliográfica. Se utilizaron variables bioclimáticas como predictores en el modelo de nicho de máxima entropía (MaxEnt) y para su visualización en Niche Analyst 3.0. Resultados. Las zonas donde se registró mayor probabilidad de ocurrencia de Mr fueron Esmeraldas y Los Ríos, Ecuador, zonas costeras de Costa Rica, Santander y Antioquia de Colombia, y para Mp los Estados de Bahía y Acré de Brasil. Las variables que más influyeron en la distribución de Mr están asociadas a las precipitaciones. Las condiciones relacionadas con la temperatura fueron más importantes en el modelo de Mp. Se identificó el riesgo de invasión de Mr en las regiones de Acré y Pará, Brasil. La transferencia de los modelos evidenció el potencial de invasión de Mr y Mp en los cultivos de cacao en África. El nicho fundamental de los patógenos y el cacao presentó valores de similitud medios, mientras que, el nicho de las especies de hongos mostró una baja similitud. La baja similitud de los nichos de los patógenos y las diferencias en las variables bioclimáticas que afectan su distribución se podrían relacionar a un proceso de partición del nicho. Conclusión. Se identificaron las regiones geográficas con una mayor distribución potencial de los patógenos y las características bioclimáticas que favorecerían su probabilidad de presencia en los cultivos de cacao de América. Es necesario regular el transporte de material vegetal y equipo contaminado entre regiones para evitar la introducción de los patógenos en cultivos de cacao sanos.

[ES] Durante los últimos años, los avances en las técnicas metagenómicas y bioinformáticas han permitido explorar la biodiversidad microbiana presente en distintos tipos de ambientes. Entre todos ellos, los ambientes extremos y artificiales han despertado un especial interés en la comunidad científica debido a su alto valor ecológico y su enorme potencial como fuente de microorganismos con aplicaciones industriales. Las placas solares son una de las estructuras hechas por el hombre más extendidas y se caracterizan por combinar estas dos propiedades: son ambientes artificiales sometidos a condiciones fisicoquímicas extremas. En un trabajo anterior, nuestro grupo caracterizó este ecosistema utilizando una aproximación metagenómica en placas solares de la ciudad de Valencia, y determinó que la comunidad microbiana presente tenía más relación con ambientes naturales extremos, como desiertos, que con otro tipo de ambientes relacionados con los humanos o las áreas urbanas. El objetivo de este trabajo es discernir el origen de esta comunidad microbiana. Para ello, se partió de la hipótesis de que el microbioma de placas solares dependía en gran medida de las migraciones microbianas desde los desiertos a través de las tormentas de polvo. Se analizaron diferentes perfiles taxonómicos extraídos de la bibliografía y correspondientes a ecosistemas susceptibles de ser el germen de la biocenosis presente en los paneles fotovoltaicos (aire sin polvo, aire con polvo desértico y suelo desértico), y se compararon con muestras de placas solares de Valencia y Berkeley secuenciadas por nuestro grupo. Los resultados demostraron que la comunidad microbiana presente en los paneles solares no es fruto de una simple deposición de microorganismos aéreos, sino que se trata de una comunidad compleja en la que se seleccionan aquellos organismos mejor adaptados. Se encontró que tanto el aire como los desiertos ejercían una importante influencia en la formación del microbioma de placas solares. Ad, [EN] During the last years, new advances in metagenomic and bioinformatic techniques have allowed the exploration of the biodiversity present in different types of environments. Among them, extreme and artificial environments have been found of special interest by the scientific community due to their high ecological value and their potential as a source of microorganisms with industrial applications. Solar panels are one of most widespread man-made structures that combine these two characteristics: they are artificial environments that are subjected to extreme physicochemical conditions. In a previous work, our group characterized this ecosystem by means of a metagenomic approach performed on solar panels in the city of Valencia. The microbial community present in the surface of these structures proved more similar to that associated to other extreme environments, such as deserts, than to other human-associated or urban-associated areas. The objective of this work is to explore the origin of this microbial community, under the hypothesis that the microbiome present on solar panels is largely dependent on microbial migrations coming from deserts through dust storms. Different taxonomic profiles that corresponded to the ecosystems susceptible to be the germ of the solar panels biocenosis (air without dust, air with dust, and desert soil) were retrieved from the literature and compared with those of solar panels sampled in Valencia and Berkeley that had been previously sequenced by our group. Our results showed that the microbial community present in the surface of solar panels was not a simple deposition of air microorganisms, but a complex community in which resistant microorganisms are selected. Air and deserts proved to have an important influence on the formation of the solar panels microbiome. Furthermore, the microbial communities inhabiting solar panels were found to be strikingly similar in the two locations analyzed, and a reduced core of those communities w

[ES] Durante los últimos años, los avances en las técnicas metagenómicas y bioinformáticas han permitido explorar la biodiversidad microbiana presente en distintos tipos de ambientes. Entre todos ellos, los ambientes extremos y artificiales han despertado un especial interés en la comunidad científica debido a su alto valor ecológico y su enorme potencial como fuente de microorganismos con aplicaciones industriales. Las placas solares son una de las estructuras hechas por el hombre más extendidas y se caracterizan por combinar estas dos propiedades: son ambientes artificiales sometidos a condiciones fisicoquímicas extremas. En un trabajo anterior, nuestro grupo caracterizó este ecosistema utilizando una aproximación metagenómica en placas solares de la ciudad de Valencia, y determinó que la comunidad microbiana presente tenía más relación con ambientes naturales extremos, como desiertos, que con otro tipo de ambientes relacionados con los humanos o las áreas urbanas. El objetivo de este trabajo es discernir el origen de esta comunidad microbiana. Para ello, se partió de la hipótesis de que el microbioma de placas solares dependía en gran medida de las migraciones microbianas desde los desiertos a través de las tormentas de polvo. Se analizaron diferentes perfiles taxonómicos extraídos de la bibliografía y correspondientes a ecosistemas susceptibles de ser el germen de la biocenosis presente en los paneles fotovoltaicos (aire sin polvo, aire con polvo desértico y suelo desértico), y se compararon con muestras de placas solares de Valencia y Berkeley secuenciadas por nuestro grupo. Los resultados demostraron que la comunidad microbiana presente en los paneles solares no es fruto de una simple deposición de microorganismos aéreos, sino que se trata de una comunidad compleja en la que se seleccionan aquellos organismos mejor adaptados. Se encontró que tanto el aire como los desiertos ejercían una importante influencia en la formación del microbioma de placas solares. Ad, [EN] During the last years, new advances in metagenomic and bioinformatic techniques have allowed the exploration of the biodiversity present in different types of environments. Among them, extreme and artificial environments have been found of special interest by the scientific community due to their high ecological value and their potential as a source of microorganisms with industrial applications. Solar panels are one of most widespread man-made structures that combine these two characteristics: they are artificial environments that are subjected to extreme physicochemical conditions. In a previous work, our group characterized this ecosystem by means of a metagenomic approach performed on solar panels in the city of Valencia. The microbial community present in the surface of these structures proved more similar to that associated to other extreme environments, such as deserts, than to other human-associated or urban-associated areas. The objective of this work is to explore the origin of this microbial community, under the hypothesis that the microbiome present on solar panels is largely dependent on microbial migrations coming from deserts through dust storms. Different taxonomic profiles that corresponded to the ecosystems susceptible to be the germ of the solar panels biocenosis (air without dust, air with dust, and desert soil) were retrieved from the literature and compared with those of solar panels sampled in Valencia and Berkeley that had been previously sequenced by our group. Our results showed that the microbial community present in the surface of solar panels was not a simple deposition of air microorganisms, but a complex community in which resistant microorganisms are selected. Air and deserts proved to have an important influence on the formation of the solar panels microbiome. Furthermore, the microbial communities inhabiting solar panels were found to be strikingly similar in the two locations analyzed, and a reduced core of those communities w

[ES] Durante los últimos años, los avances en las técnicas metagenómicas y bioinformáticas han permitido explorar la biodiversidad microbiana presente en distintos tipos de ambientes. Entre todos ellos, los ambientes extremos y artificiales han despertado un especial interés en la comunidad científica debido a su alto valor ecológico y su enorme potencial como fuente de microorganismos con aplicaciones industriales. Las placas solares son una de las estructuras hechas por el hombre más extendidas y se caracterizan por combinar estas dos propiedades: son ambientes artificiales sometidos a condiciones fisicoquímicas extremas. En un trabajo anterior, nuestro grupo caracterizó este ecosistema utilizando una aproximación metagenómica en placas solares de la ciudad de Valencia, y determinó que la comunidad microbiana presente tenía más relación con ambientes naturales extremos, como desiertos, que con otro tipo de ambientes relacionados con los humanos o las áreas urbanas. El objetivo de este trabajo es discernir el origen de esta comunidad microbiana. Para ello, se partió de la hipótesis de que el microbioma de placas solares dependía en gran medida de las migraciones microbianas desde los desiertos a través de las tormentas de polvo. Se analizaron diferentes perfiles taxonómicos extraídos de la bibliografía y correspondientes a ecosistemas susceptibles de ser el germen de la biocenosis presente en los paneles fotovoltaicos (aire sin polvo, aire con polvo desértico y suelo desértico), y se compararon con muestras de placas solares de Valencia y Berkeley secuenciadas por nuestro grupo. Los resultados demostraron que la comunidad microbiana presente en los paneles solares no es fruto de una simple deposición de microorganismos aéreos, sino que se trata de una comunidad compleja en la que se seleccionan aquellos organismos mejor adaptados. Se encontró que tanto el aire como los desiertos ejercían una importante influencia en la formación del microbioma de placas solares. Ad, [EN] During the last years, new advances in metagenomic and bioinformatic techniques have allowed the exploration of the biodiversity present in different types of environments. Among them, extreme and artificial environments have been found of special interest by the scientific community due to their high ecological value and their potential as a source of microorganisms with industrial applications. Solar panels are one of most widespread man-made structures that combine these two characteristics: they are artificial environments that are subjected to extreme physicochemical conditions. In a previous work, our group characterized this ecosystem by means of a metagenomic approach performed on solar panels in the city of Valencia. The microbial community present in the surface of these structures proved more similar to that associated to other extreme environments, such as deserts, than to other human-associated or urban-associated areas. The objective of this work is to explore the origin of this microbial community, under the hypothesis that the microbiome present on solar panels is largely dependent on microbial migrations coming from deserts through dust storms. Different taxonomic profiles that corresponded to the ecosystems susceptible to be the germ of the solar panels biocenosis (air without dust, air with dust, and desert soil) were retrieved from the literature and compared with those of solar panels sampled in Valencia and Berkeley that had been previously sequenced by our group. Our results showed that the microbial community present in the surface of solar panels was not a simple deposition of air microorganisms, but a complex community in which resistant microorganisms are selected. Air and deserts proved to have an important influence on the formation of the solar panels microbiome. Furthermore, the microbial communities inhabiting solar panels were found to be strikingly similar in the two locations analyzed, and a reduced core of those communities w

[ES] Durante los últimos años, los avances en las técnicas metagenómicas y bioinformáticas han permitido explorar la biodiversidad microbiana presente en distintos tipos de ambientes. Entre todos ellos, los ambientes extremos y artificiales han despertado un especial interés en la comunidad científica debido a su alto valor ecológico y su enorme potencial como fuente de microorganismos con aplicaciones industriales. Las placas solares son una de las estructuras hechas por el hombre más extendidas y se caracterizan por combinar estas dos propiedades: son ambientes artificiales sometidos a condiciones fisicoquímicas extremas. En un trabajo anterior, nuestro grupo caracterizó este ecosistema utilizando una aproximación metagenómica en placas solares de la ciudad de Valencia, y determinó que la comunidad microbiana presente tenía más relación con ambientes naturales extremos, como desiertos, que con otro tipo de ambientes relacionados con los humanos o las áreas urbanas. El objetivo de este trabajo es discernir el origen de esta comunidad microbiana. Para ello, se partió de la hipótesis de que el microbioma de placas solares dependía en gran medida de las migraciones microbianas desde los desiertos a través de las tormentas de polvo. Se analizaron diferentes perfiles taxonómicos extraídos de la bibliografía y correspondientes a ecosistemas susceptibles de ser el germen de la biocenosis presente en los paneles fotovoltaicos (aire sin polvo, aire con polvo desértico y suelo desértico), y se compararon con muestras de placas solares de Valencia y Berkeley secuenciadas por nuestro grupo. Los resultados demostraron que la comunidad microbiana presente en los paneles solares no es fruto de una simple deposición de microorganismos aéreos, sino que se trata de una comunidad compleja en la que se seleccionan aquellos organismos mejor adaptados. Se encontró que tanto el aire como los desiertos ejercían una importante influencia en la formación del microbioma de placas solares. Ad, [EN] During the last years, new advances in metagenomic and bioinformatic techniques have allowed the exploration of the biodiversity present in different types of environments. Among them, extreme and artificial environments have been found of special interest by the scientific community due to their high ecological value and their potential as a source of microorganisms with industrial applications. Solar panels are one of most widespread man-made structures that combine these two characteristics: they are artificial environments that are subjected to extreme physicochemical conditions. In a previous work, our group characterized this ecosystem by means of a metagenomic approach performed on solar panels in the city of Valencia. The microbial community present in the surface of these structures proved more similar to that associated to other extreme environments, such as deserts, than to other human-associated or urban-associated areas. The objective of this work is to explore the origin of this microbial community, under the hypothesis that the microbiome present on solar panels is largely dependent on microbial migrations coming from deserts through dust storms. Different taxonomic profiles that corresponded to the ecosystems susceptible to be the germ of the solar panels biocenosis (air without dust, air with dust, and desert soil) were retrieved from the literature and compared with those of solar panels sampled in Valencia and Berkeley that had been previously sequenced by our group. Our results showed that the microbial community present in the surface of solar panels was not a simple deposition of air microorganisms, but a complex community in which resistant microorganisms are selected. Air and deserts proved to have an important influence on the formation of the solar panels microbiome. Furthermore, the microbial communities inhabiting solar panels were found to be strikingly similar in the two locations analyzed, and a reduced core of those communities w

Se determinó la sistemática paleontológica de 39 especies de foraminíferos bentónicos y 12 especies de foraminíferos planctónicos, encontrados en las Formaciones Jimol y Castilletes (Mioceno Temprano-Medio) de la Cuenca de Cocinetas en la Alta Guajira colombiana -- A partir de estas se identificaron, por medio de un análisis de agrupamiento, 14 asociaciones de foraminíferos a través de las unidades geológicas estudiadas. La microfauna planctónica encontrada se usó para datar las unidades en el Burdigaliano y en el Langhiano -- Para interpretar paleoambientalmente los datos: primero se compararon las asociaciones fósiles halladas con comunidades de foraminíferos de ambientes actuales del sur del Mar Caribe (Isla de Barú, Colombia) con el fin de encontrar análogos modernos -- Posteriormente, la morfología del genero bentónico Ammonia fue usada como paleoindicador de condiciones de paleosalinidad, mostrando que esta metodología es promisoria como herramienta para inferir ambientes salobres y distancia con respecto a la costa -- Por último, para cada asociación descubierta fue definido el número de géneros y especies, el índice de diversidad Alpha, la dominancia, el FoRAM Index, el Foraminiferal number, la proporción entre fauna infaunal/epifaunal, planctónica/bentónica y el género planctónico dominante en las muestras con recobro de fauna de este tipo -- Por medio de una síntesis de los resultados obtenidos a partir de las metodologías usadas se reconstruyeron, para la Formación Jimol, condiciones marinas marginales en su sección media que pasan a ambientes de plataforma, para luego volver a entornos proximales -- En la parte superior solo fueron encontradas muestras estériles -- Para la parte baja de la Formación Castilletes fueron sugeridas condiciones marinas marginales que pasan a ambientes de plataforma interna profunda, que luego en la sección media pasan nuevamente a condiciones marinas marginales -- En la parte superior no se encontraron muestras con recobro de

[ES] Introducción. El desierto de Atacama está considerado como el desierto más seco (P <2mm año-1) y más antiguo (90-150 Ma) de la Tierra. Su núcleo hiperárido constituye uno de los ambientes más extremos y ha sido considerado como carente de vida. En esta zona, las precipitaciones atmosféricas son tremendamente escasas e irregulares que junto con las elevadas tasas de evaporación (1300-1600 mm año-1) genera prolongados periodos de desecación. Aparte de la hiperaridez, el desierto de Atacama presenta también otros factores ambientales que imponen severos límites para la vida, tales como una intensa radiación solar que conlleva una elevada dosis de radiación UV, una amplia oscilación diaria de la temperatura y la humedad relativa, condiciones oligotróficas extremas, y con frecuencia elevadas concentraciones de oxidantes inorgánicos y sales en los suelos. En este escenario, como en otros desiertos, los ecosistemas líticos se convierten en los componentes biológicos dominantes. De entre todos los hábitats litobionticos descubiertos formando “islas” u “oasis” a lo largo del desierto de Atacama, cobra especial relevancia la colonización endolítica de los nódulos superficiales de halita que se encuentran presentes en diferentes salares fósiles repartidos por el núcleo hiperárido. Estos nódulos constituyen formaciones exclusivas del desierto de Atacama que permiten el establecimiento de comunidades microbianas basadas en fotosíntesis en áreas previamente descritas como el “limite seco para la vida fotosintética en la Tierra”., [ES] Objetivos y metodologías. La presente tesis doctoral tiene como objetivo principal realizar una detallada caracterización de las comunidades endolíticas microbianas presentes en los nódulos superficiales de halita ofreciendo una descripción de su ecología bajo tres aproximaciones metodológicas diferentes pero complementarias que definen los objetivos parciales: 1) Caracterizar los elementos abióticos que influyen en la colonización microbiana de los nódulos de halita a través de un análisis comparado de: las condiciones microclimáticas en el entorno y en el interior de nódulos de halita presentes en distintas localizaciones del núcleo hipérarido del desierto de Atacama, de su composición químico-mineralógica y de su estructura porosa 2) Caracterizar el microhábitat y analizar la organización de las comunidades microbianas presentes en el interior de los nódulos, su diversidad morfológica así como las relaciones que mantienen los microrganismos entre sí, a través de distintas técnicas de microscopía. 3) Caracterizar la diversidad microbiana en los nódulos de halita mediante un análisis comparado de la estructura de comunidad en distintas localizaciones del desierto de Atacama por DGGE y una estimación de su biomasa a través de técnicas indirectas (ATP)., [ES] Resultados. La microclimatología de las áreas de muestreo parece estar sujeta al balance radiativo del suelo, la ausencia de nubes y precipitaciones que explican su regularidad diaria a lo largo del año. Las diferencias registradas a nivel microclimático en el entorno de las halitas permiten agrupar las localizaciones en tres grupos: Yungay la localidad más seca y extrema, que no recibe influencia de masas de aire húmedas oceánicas; Salar Grande Sur, la más húmeda y moderada, que posiblemente se sitúe en un área de transición entre el desierto absoluto y el desierto costero; y las localidades de Llamará y Salar Grande Norte que manifiestan condiciones intermedias. Los datos registrados en el interior de los nódulos de halita muestran la presencia de agua líquida durante un 66% del tiempo medido (6 meses) en Yungay y un 100% en Salar Grande Sur. Esta presencia de agua líquida en el interior de los nódulos coincide con niveles adecuados de intensidad lumínica para realizar la fotosíntesis. En este sentido, los nódulos exhiben capacidad para filtrar la radiación UV en los primeros milímetros de la roca permitiendo la transmisión de un 11-12% de radiación fotosintéticamente activa a 6-9 mm de profundidad cuando se presenta agua líquida. La colonización microbiana en el interior de los nódulos de halita se presenta en forma de agregados celulares dispuestos entre los espacios entre los cristales de sal, o adheridos a ellos, embebidos en una salmuera de NaCl y frecuentemente asociados a espacios con aire. Los agregados celulares se componen de células de un posible nuevo género de cianobacteria, como productor primario, y agrupaciones de bacterias no fotosintéticas y arqueas relacionadas filogenéticamente con organismos de otros ambientes hipersalinos. A esta organización básica se suma la presencia de otro productor primario (alga) en las dos localidades de Salar Grande. Los microorganismos que forman parte de los agregados están estrechamente asociados y embebidos, [ES] Discusión y Conclusiones. Aunque en un principio las cuatro áreas estudiadas se encuentran dentro del núcleo hiperárido del desierto de Atacama, que se caracteriza por su estabilidad climática, ha sido posible detectar diferencias a nivel microclimático en el entorno de los nódulos entre localidades. Estas diferencias han podido ser vinculadas a las variaciones en el comportamiento microclimatico en el interior de los nódulos, a las diferencias en la estructura porosa, y a las variaciones en la estructura de comunidad microbiana detectadas en el desarrollo de esta tesis. Los factores observados que presentan mayor influencia son el valor de la humedad relativa media, la probabilidad de aparición de eventos en los que los nódulos se secan totalmente, el valor máximo de la temperatura diaria y el valor de la oscilación térmica. Las propiedades fisicoquímicas y estructurales de los nódulos de halita: delicuescencia, microporosidad, morfología y capacidad para filtrar la radiación UV permitiendo el paso de radiación fotosintéticamente activa, desempeñan un papel esencial y activo en la dinámica de este sistema que facilita la colonización del interior de los nódulos por comunidades de microorganismos basadas en la fotosíntesis. Estas propiedades configuran a los nódulos superficiales de halita como un hábitat potencial para la búsqueda de indicios de vida en Marte. El reducido número de filotipos obtenidos en los perfiles de DGGE y la falta de similitudes con organismos de los suelos circundantes u otros ecosistemas microbianos presentes en el desierto de Atacama parece indicar que las características hipersalinas del interior de los nódulos, imponen condicionantes limitantes añadidos a la colonización microbiana endolítica, incrementando la presión selectiva del hábitat y haciendo de los nódulos de halita un microecosistema excepcional y altamente especializado compuesto posiblemente por nuevas especies de microorganismos., [EN] Introduction. The Atacama Desert is considered the driest (<2mm year-1 rainfall) and the oldest (90-150 My) desert on Earth. Its hyperarid core is one of the most extreme environments and has been considered lifeless. In this area atmospheric precipitations are extremely scarce and irregular which together with high rates of evaporation (1300-1600 mm year-1) generates long periods of desiccation. Aside from the hyperaridity, Atacama Desert also has other environmental factors that impose severe limits to life, such as elevated UV-radiation levels and intense solar radiation, large daily fluctuations of temperature and relative humidity, extreme oligotrophic conditions, and often elevated concentrations of inorganic oxidants and salts in soils. In this scenario, as in others deserts, lithic ecosystems become the dominant biological components. Among all the lithobiontic habitats discovered forming “islands” or “oasis” across the Atacama Desert, the endolithic colonization of superficial halite nodules that are present in different fossil salt flats scattered in the hyperarid core is particularly relevant. These nodules are unique formations of the Atacama Desert which allow the establishment of microbial communities based on photosynthesis in areas previously described as "dry limit for photosynthetic life on Earth"., [EN] Objectives. The main objective of this PhD thesis is to carry out a detailed characterization of endolithic microbial communities in superficial halite nodules providing a description of their ecology under three different but complementary methodological approaches which define the partial objectives: 1) Characterization of abiotic elements that influence microbial colonization of halite nodules through a comparative analysis of: microclimatic conditions in the environment and inside halite nodules which are present in different locations in the hyperarid core of the Atacama Desert, its chemical and mineralogical composition and their porous structure. 2) Microhabitat characterization and analysis of microbial community organization inside nodules, morphological diversity and relations between microorganisms, using different microscopy techniques. 3) Microbial diversity characterization inside halite nodules using a comparative analysis of community structure in different locations of Atacama Desert by DGGE and an estimation of its biomass analysing the amount of ATP., [EN] Results. The microclimatologic behaviour in sampling areas seems to be subject to the radiation balance of bare soil, the absence of clouds and rainfall, which explain their daily regularity throughout the year. The recorded differences at the microclimate level in the vicinity of the halite can cluster locations into three groups: Yungay the driest and most extreme area, which receives no influence from humid ocean air masses; Salar Grande South, the most humid and moderate area, which may be located in a transition area between absolute desert and coastal desert; and the locations of Llamará and Salar Grande North which exhibit intermediate conditions. The recorded data inside halite nodules show the presence of liquid water during 66% of the measured time in Yungay and 100% in Salar Grande South. The presence of liquid water inside the nodules coincides with adequate levels of light intensity for photosynthesis. The nodules exhibit ability to filter UV radiation in the first milllimeters of the rock allowing transmission of 11-12% of photosynthetically active radiation to 6-9 mm deep when liquid water is present. Microbial colonization inside halite nodules is disposed as cell aggregates in the spaces between salt crystals, or attached to them, embedded in a concentrated brine and frequently associated to air spaces. The cell aggregates are composed of cells of a possible new genus of cyanobacteria, as a primary producer, and groups of non-photosynthetic bacteria and archaea phylogenetically related to other organisms of hypersaline environments. To this basic organization is added the presence of another primary producer (algae) in the two locations of Salar Grande. The microorganisms that are part of the aggregates are close associated and embedded in a matrix of extracellular polymeric substances (EPS) where various biotic and abiotic interactions occur. The microbial community structure comparison between nodules exhibits differences in the representativ, [EN] Discussion and Conclusions. Although at first the four studied areas are within the hyperarid Atacama Desert core, which is characterized by its climate stability, it has been possible to detect environmental differences at microclimate level of nodules between locations. These differences have been connected to the microclimatic behaviour variations inside nodules, to differences in the porous structure, and changes in microbial community structure detected in the development of this thesis. The observed factors that have higher influence are: the average of relative humidity value, the probability of appearance of events in which the nodules are completely dry, the maximum value of daily temperature and the value of the thermal oscillation. The physicochemical and structural properties of superficial halite nodules: deliquescence, microporosity, morphology and capacity to filter UV radiation allowing transmission of photosynthetically active radiation, plays a crucial and active role in the dynamics of this system that facilitates colonization inside the nodules by microbial communities based on photosynthesis. These properties set the superficial halite nodules as a potential habitat for the search for evidence of life on Mars. The low number of phylotypes obtained in DGGE profiles and the lack of similarities with organisms of the surrounding soils or other microbial ecosystems in the Atacama Desert, suggests that hypersaline features inside nodules, impose added limiting conditions to the endolithic microbial colonization, increasing habitat selective pressure and making halite nodules as an exceptional and highly specialized microecosystem possibly composed of new species of microorganisms.

El grupo ECOGEO que pertenece en la actualidad a El Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC), comenzó sus trabajos de investigación en las interfases talo liquénico-sustrato lítico, hace casi cuatro décadas.

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Population growth is accompanied by an alarming increase of solid and liquid waste production worldwide. The maintenance of soil and water reservoirs as well as their protection against pollution effects are of extreme importance for human civilization. Microorganisms are directly involved in biogeochemical cycles, being key drivers of the degradation of many carbon sources, as pollutants, which when properly known and managed provide a wide range of applications, including in wastewater, landfills and leachate treatment. Recent advancements in molecular tools to study the diversity and function of microbial communities are driving and contributing to a better understanding of microbial ecology, and researchers apply this knowledge to manage and understand biotechnological processes. In wastewater and leachate treatment, as well in landfills, microbial ecology techniques have been applied to study the behavior of microbial community during the process. This article will briefly outline the most widely used and the newest tools presenting their potential and limitations., O crescimento cada vez maior da população mundial é acompanhado pelo aumento alarmante da produção e deposição de resíduos sólidos e líquidos no mundo inteiro. A manutenção de reservatórios de água e de solos, assim como a proteção desse ambientes contra os efeitos da poluição, são essenciais para a manutenção da civilização humana. Os microrganismos estão diretamente envolvidos nos ciclos biogeoquímicos sendo os responsáveis pela degradação de inúmeras fontes de carbono, como muitos poluentes e, quando devidamente conhecidos e manejados, podem ser utilizados em uma vasta gama de aplicações biotecnológicas, incluindo tratamento de esgotos, aterros sanitários e lixiviados. Avanços recentes no desenvolvimento de técnicas moleculares utilizadas no estudo da diversidade e função de comunidades microbianas vêm possibilitando e/ou contribuindo de forma expressiva para um melhor conhecimento da ecologia microbiana, e os pesquisadores aplicam esse maior conhecimento para entender, desenvolver e aperfeiçoar processos biotecnológicos. Em sistemas de tratamento de esgoto e lixiviados, assim como em solos de cobertura de aterros sanitários, essas técnicas vêm sendo aplicadas no estudo da estrutura e do perfil das comunidades microbianas durante o processo de tratamento desses resíduos. O presente trabalho irá apresentar resumidamente as técnicas mais utilizadas atualmente no estudo de comunidades microbianas nesses ambientes, e relatará algumas novas e promissoras técnicas, com suas potenciais aplicações e limitações., El crecimiento de la población viene acompañado por el aumento alarmante de la producción de residuos sólidos y líquidos en todo el mundo. La manutención del suelo y de los cuerpos de agua y su protección contra los efectos de la contaminación son esenciales para la civilización humana. Los microorganismos están directamente relacionados con los ciclos biogeoquímicos, como agentes responsables de la degradación de varias fuentes de carbono, como numerosas sustancias contaminantes y, cuando son conocidos y manejados adecuadamente, proveen un amplio rango de aplicaciones biotecnológicas, incluyendo el tratamiento de aguas residuales, rellenos sanitarios y lixiviados. Avances recientes en el desarrollo de técnicas moleculares para el estudio de la diversidad y función de las comunidades microbianas están contribuyendo a un mejor entendimiento de la ecología microbiana y los investigadores aplican este conocimiento para entender, desarrollar y perfeccionar procesos biotecnológicos. Estas técnicas de ecología microbiana son aplicadas para estudiar la estructura y el perfil de las comunidades microbianas durante el proceso de tratamiento de aguas residuales y lixiviados, así como en rellenos sanitarios. El presente trabajo documenta brevemente las herramientas más utilizadas actualmente para el estudio de comunidades microbianas en estos ambientes, y presenta algunas nuevas y prometedoras técnicas, con sus aplicaciones potenciales y limitaciones.

O crescimento cada vez maior da população mundial é acompanhado pelo aumento alarmante da produção e deposição de resíduos sólidos e líquidos no mundo inteiro. A manutenção de reservatórios de água e de solos, assim como a proteção desse ambientes contra os efeitos da poluição, são essenciais para a manutenção da civilização humana. Os microrganismos estão diretamente envolvidos nos ciclos biogeoquímicos sendo os responsáveis pela degradação de inúmeras fontes de carbono, como muitos poluentes e, quando devidamente conhecidos e manejados, podem ser utilizados em uma vasta gama de aplicações biotecnológicas, incluindo tratamento de esgotos, aterros sanitários e lixiviados. Avanços recentes no desenvolvimento de técnicas moleculares utilizadas no estudo da diversidade e função de comunidades microbianas vêm possibilitando e/ou contribuindo de forma expressiva para um melhor conhecimento da ecologia microbiana, e os pesquisadores aplicam esse maior conhecimento para entender, desenvolver e aperfeiçoar processos biotecnológicos. Em sistemas de tratamento de esgoto e lixiviados, assim como em solos de cobertura de aterros sanitários, essas técnicas vêm sendo aplicadas no estudo da estrutura e do perfil das comunidades microbianas durante o processo de tratamento desses resíduos. O presente trabalho irá apresentar resumidamente as técnicas mais utilizadas atualmente no estudo de comunidades microbianas nesses ambientes, e relatará algumas novas e promissoras técnicas, com suas potenciais aplicações e limitações., El crecimiento de la población viene acompañado por el aumento alarmante de la producción de residuos sólidos y líquidos en todo el mundo. La manutención del suelo y de los cuerpos de agua y su protección contra los efectos de la contaminación son esenciales para la civilización humana. Los microorganismos están directamente relacionados con los ciclos biogeoquímicos, como agentes responsables de la degradación de varias fuentes de carbono, como numerosas sustancias contaminantes y, cuando son conocidos y manejados adecuadamente, proveen un amplio rango de aplicaciones biotecnológicas, incluyendo el tratamiento de aguas residuales, rellenos sanitarios y lixiviados. Avances recientes en el desarrollo de técnicas moleculares para el estudio de la diversidad y función de las comunidades microbianas están contribuyendo a un mejor entendimiento de la ecología microbiana y los investigadores aplican este conocimiento para entender, desarrollar y perfeccionar procesos biotecnológicos. Estas técnicas de ecología microbiana son aplicadas para estudiar la estructura y el perfil de las comunidades microbianas durante el proceso de tratamiento de aguas residuales y lixiviados, así como en rellenos sanitarios. El presente trabajo documenta brevemente las herramientas más utilizadas actualmente para el estudio de comunidades microbianas en estos ambientes, y presenta algunas nuevas y prometedoras técnicas, con sus aplicaciones potenciales y limitaciones., Population growth is accompanied by an alarming increase of solid and liquid waste production worldwide. The maintenance of soil and water reservoirs as well as their protection against pollution effects are of extreme importance for human civilization. Microorganisms are directly involved in biogeochemical cycles, being key drivers of the degradation of many carbon sources, as pollutants, which when properly known and managed provide a wide range of applications, including in wastewater, landfills and leachate treatment. Recent advancements in molecular tools to study the diversity and function of microbial communities are driving and contributing to a better understanding of microbial ecology, and researchers apply this knowledge to manage and understand biotechnological processes. In wastewater and leachate treatment, as well in landfills, microbial ecology techniques have been applied to study the behavior of microbial community during the process. This article will briefly outline the most widely used and the newest tools presenting their potential and limitations.

Consultable des del TDX, Títol obtingut de la portada digitalitzada, La ecología de Bacillus thuringiensis, un bioinsecticida muy común, es poco conocida. Nuestro principal objetivo era investigar acerca de la ecología de esta bacteria en la filosfera. En un primer estudio se recogieron 35 muestras de hojas del género Piper de bosques andinos colombianos. Se obtuvieron 256 aislamientos de B. thuringiensis del 74% de las muestras estudiadas. Los aislamientos fueron caracterizados según la morfología del cristal, la presencia de genes cry por PCR y la toxicidad contra insectos. Además, se estimaron las poblaciones de células vegetativas viables y endosporas por unidad de área obteniéndose 2-5x103 cfu/cm2 de hoja. En general, no se encontraron diferencias estadísticamente significativas en el número de aislamientos de B. thuringiensis por cm2 de hoja ni en las características de los aislamientos de B. thuringiensis entre las diferentes especies de Piper. Después de comprobar que B. thuringiensis estaba presente en el filoplano, se quiso comparar las poblaciones de esta bacteria en el suelo y en las hojas. Se aisló B. thuringiensis del filoplano y del suelo de cultivos de maíz y fríjol. Se recuperaron 214 aislamientos de 96 muestras de filoplano (0-34 cfu/cm2) y 59 aislamientos de 24 muestras de suelo. Todos los aislamientos fueron caracterizados como se ha explicado anteriormente. Las poblaciones predominantes de B. thuringiensis en el filoplano contenían genes cry1 y eran activas contra Spodoptera frugiperda, mientras que los aislamientos del suelo tenían genes cry11 y eran activos contra Culex quinquefasciatus. El hecho de que predominaran poblaciones específicas de B. thuringiensis en las hojas diferentes a las del suelo sugiere que existe una selección diferencial en las poblaciones de B. thuringiensis en el filoplano y en el suelo. Entonces, se investigó la capacidad de migración de B. thuringiensis desde el suelo a las hojas. Se inocularon dos cepas diferentes de B. thuringiensis en suelos, semillas y hojas jóvenes de plantas de f, The ecology of Bacillus thuringiensis, a common biopesticide, is poorly understood. Our main objective was to investigate the ecology of this bacteria on the phylloplane. In a first study 35 leaf samples of the genus Piper were collected from the Colombian Andean forest. Two hundred and fifty-six isolates of B. thuringiensis were obtained from 74% of the samples studied. The isolates were characterized by crystal morphology, the presence of cry genes by PCR and toxicity against insects. The populations of viable vegetative cells and spores per unit area were estimated (2-5x103 cfu/cm2 of leaf). Overall, no significant differences in the number of B. thuringiensis isolates per cm2 of leaf nor in the B. thuringiensis characteristics were found among the different Piper species evaluated. After observing B. thuringiensis on the phylloplane, a comparison was performed between soil and leaf populations. B. thuringiensis was isolated from the phylloplane and soil in plantings of maize and bean from Colombia; and 214 isolates were recovered from 96 phylloplane samples (0-34 cfu/cm2) while 59 isolates from 24 soil samples. All the isolates were characterized as above-mentioned. The predominant population of B. thuringiensis on the phylloplane harbored cry1 gene and was active against Spodoptera frugiperda, whereas in soil the isolates harboring cry11 gene and active against Culex quinquefasciatus predominated. The predominance of specific B. thuringiensis populations both on the leaves and in the soil, suggests the presence of differential selection in B. thuringiensis populations on the phylloplane and in soil. Then, we addressed the process of immigration of B. thuringiensis from soil to leaves. Two different B. thuringiensis strains were inoculated into soils, onto seeds or onto lower leaves of bean plants to determine if they were able to disperse to upper leaves under controlled conditions. While B. thuringiensis isolates were commonly recovered from leaves exposed to

La Antártida es el continente con las condiciones climáticas más severas de nuestro planeta. Esa dureza ambiental limita notablemente la diversidad de seres vivos que encontramos en los ecosistemas antárticos en comparación con los de latitudes más bajas. Sin embargo, los ecosistemas acuáticos antárticos, y más concretamente los continentales, en la medida en que presentan agua libre, suponen una oportunidad para la vida que encuentra en ellos unos oasis en un desierto helado. A pesar de que generalmente los lagos antárticos presentan una densa cubierta de hielo, la primavera y el verano austral permiten reducir la dureza de las restricciones abióticas, y facilitan el desarrollo de comunidades planctónicas y bentónicas microbianas, que incluyen bacterias autótrofas y heterótrofas, protistas (fotosintéticos, mixótrofos o heterótrofos), y, en los lagos de condiciones climáticas menos restrictivas, metazooplancton, generalmente copépodos, que en algunos casos pueden ejercer un importante papel en el control de las redes tróficas planctónicas. Por otro lado, los tapetes microbianos, principalmente formados por cianobacterias, constituyen la comunidad béntica más característica en los lagos y zonas encharcables de la Antártida., Antarctic climate is the hardest in the Earth. Climatic conditions limit biological diversity in Antarctic ecosystems compared to those from lower latitudes. However, Antarctic aquatic ecosystems, and especially those non-marine, which present free liquid water, represent a chance for life, which there can find oases in a frozen desert. Despite Antarctic lakes often present a dense ice cover, abiotic life restrictions are less extreme during Antarctic spring and summer, thus favouring the establishment of planktonic and benthic microbial communities, which include photoautotrophic and heterotrophic bacteria, protists (either photosynthetic, heterotrophic or mixotrophic) and, in those lakes from zones with less restrictive climate, metazooplankton, often copepods, that sometimes can exert an important role in controlling pelagic food webs. Microbial mats, which are mainly formed by cyanobacteria, are, on the other hand, the most characteristic benthic community within Antarctic lakes and wetlands.

El río Tinto es un ambiente extremo caracterizado por un pH muy bajo y altas concentraciones de metales en disolución. Las extremas condiciones del río son en gran medida producidas y mantenidas por el componente biológico del ecosistema, principalmente por organismos procarióticos quimiolitótrofos. Las algas eucarióticas son los otros productores primarios del sistema mientras que hongos y bacterias heterotróficas juegan el papel de consumidores y descomponedores. Otros consumidores son protistas heterotróficos y, en ocasiones, rotíferos. El río en sí tiene una amplia variedad de ambientes en donde se desarrollan distintas comunidades (bentónicas en zonas aerobias, neustónicas en la superficie de aguas semiquietas, planctónicas en la columna de agua óxica y anóxica), además, las zonas adyacentes al río como los montones de mineral, las galerías mineras o el acuífero son ambientes distintos y aún inexplorados. A pesar de las condiciones extremas de este ecosistema, el río Tinto posee una gran diversidad de comunidades microbianas, cuyas interacciones son de gran interés para la ecología microbiana., The Tinto River is an extreme environment characterized by a very low pH and high concentration of heavy metals in solution. The extreme features of the river are produced and sustained by the biological components of the ecosystem, mainly by chemolithoautotrophic prokaryotic organisms. Eukaryotic algae are another primary producers in the system, while fungi and heterotrophic bacteria play the role of consumers and decomposers. Other consumers are heterotrophic protists and sometime rotifers. The river has a wide variety of environments where different communities develop (benthonic in aerobic zones and neustonic in the surface of calm waters, planktonic in the anoxic and oxic water column). In addition, adjacent zones of the river, like the piles of mineral, the mining galleries or the aquifer, are interesting and unexplored. In spite of the extreme conditions of this ecosystem, the Tinto River has a great diversity of microbial communities, whose interaction are of great interest for microbial ecology.

La Antártida es el continente con las condiciones climáticas más severas de nuestro planeta. Esa dureza ambiental limita notablemente la diversidad de seres vivos que encontramos en los ecosistemas antárticos en comparación con los de latitudes más bajas. Sin embargo, los ecosistemas acuáticos antárticos, y más concretamente los continentales, en la medida en que presentan agua libre, suponen una oportunidad para la vida que encuentra en ellos unos oasis en un desierto helado. A pesar de que generalmente los lagos antárticos presentan una densa cubierta de hielo, la primavera y el verano austral permiten reducir la dureza de las restricciones abióticas, y facilitan el desarrollo de comunidades planctónicas y bentónicas microbianas, que incluyen bacterias autótrofas y heterótrofas, protistas (fotosintéticos, mixótrofos o heterótrofos), y, en los lagos de condiciones climáticas menos restrictivas, metazooplancton, generalmente copépodos, que en algunos casos pueden ejercer un importante papel en el control de las redes tróficas planctónicas. Por otro lado, los tapetes microbianos, principalmente formados por cianobacterias, constituyen la comunidad béntica más característica en los lagos y zonas encharcables de la Antártida., Antarctic climate is the hardest in the Earth. Climatic conditions limit biological diversity in Antarctic ecosystems compared to those from lower latitudes. However, Antarctic aquatic ecosystems, and especially those non-marine, which present free liquid water, represent a chance for life, which there can find oases in a frozen desert. Despite Antarctic lakes often present a dense ice cover, abiotic life restrictions are less extreme during Antarctic spring and summer, thus favouring the establishment of planktonic and benthic microbial communities, which include photoautotrophic and heterotrophic bacteria, protists (either photosynthetic, heterotrophic or mixotrophic) and, in those lakes from zones with less restrictive climate, metazooplankton, often copepods, that sometimes can exert an important role in controlling pelagic food webs. Microbial mats, which are mainly formed by cyanobacteria, are, on the other hand, the most characteristic benthic community within Antarctic lakes and wetlands.

El río Tinto es un ambiente extremo caracterizado por un pH muy bajo y altas concentraciones de metales en disolución. Las extremas condiciones del río son en gran medida producidas y mantenidas por el componente biológico del ecosistema, principalmente por organismos procarióticos quimiolitótrofos. Las algas eucarióticas son los otros productores primarios del sistema mientras que hongos y bacterias heterotróficas juegan el papel de consumidores y descomponedores. Otros consumidores son protistas heterotróficos y, en ocasiones, rotíferos. El río en sí tiene una amplia variedad de ambientes en donde se desarrollan distintas comunidades (bentónicas en zonas aerobias, neustónicas en la superficie de aguas semiquietas, planctónicas en la columna de agua óxica y anóxica), además, las zonas adyacentes al río como los montones de mineral, las galerías mineras o el acuífero son ambientes distintos y aún inexplorados. A pesar de las condiciones extremas de este ecosistema, el río Tinto posee una gran diversidad de comunidades microbianas, cuyas interacciones son de gran interés para la ecología microbiana., The Tinto River is an extreme environment characterized by a very low pH and high concentration of heavy metals in solution. The extreme features of the river are produced and sustained by the biological components of the ecosystem, mainly by chemolithoautotrophic prokaryotic organisms. Eukaryotic algae are another primary producers in the system, while fungi and heterotrophic bacteria play the role of consumers and decomposers. Other consumers are heterotrophic protists and sometime rotifers. The river has a wide variety of environments where different communities develop (benthonic in aerobic zones and neustonic in the surface of calm waters, planktonic in the anoxic and oxic water column). In addition, adjacent zones of the river, like the piles of mineral, the mining galleries or the aquifer, are interesting and unexplored. In spite of the extreme conditions of this ecosystem, the Tinto River has a great diversity of microbial communities, whose interaction are of great interest for microbial ecology.

Fluorescent Pseudomonas are one of the most important benefic bacteria of the rizhosphere. It is because they can control some soil borne phytopatogen agents as a result of their antagonistic capacity. There are few works about the composition and diversity of fluorescent Pseudomonas in tropical countries. In this work we studied the composition of fluorescent Pseudomonas form different potato crops located at the Cundiboyacense región between 2100 and 3200 mosl, which is the most important area of potato production in Colombia. This study also assesses the effect of some crop practices variables on rizosphere bacteria richness and diversity. Finally, it was determined the antagonistic capacity of some Pseudomonas fluorescens isolates against Rhizoctonia solani. A total of 45 rhizosphere samples were taken from 15 potato fields. To isolate the Pseudomonas it was used king B medium modified by us. Our results showed that this modified medium consistently allowed a more efficient recovery of the fluorescent Pseudomonas than the media reported in the literature. 80.7% and 82.7% of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere and rizoplane respectively were Pseudomonas fluorescens. It suggest a low fluorescent pseudomonas diversity. Our work also denotes an effect of the maize-potato crop rotation strategy on the amount of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere. These results may have importance in designing appropriate strategies for bio-controlling soil borne phytopathogens. In tropical countries like Colombia, this knowledge might help to improve crop yields. Finally it was found native isolates with antagonistic activity against Rhizoctonia solani in the bioassays in vitro, such results if not assure an efficient control of the pathogen in field conditions, may give an idea of the potentiality of P.fluorescens to be applied as bacterial community, strains or derived products of them., Las pseudomonas fluorescentes son unas de las bacterias benéficas más importantes a nivel de la rizosfera gracias a que pueden controlar algunos fitopatógenos habituales del suelo como resultado de su capacidad antagonista. Hay muy pocos trabajos realizados para conocer la composición y diversidad de pseudomonas fluorescentes en países tropicales. En este trabajo se determinó la composición de pseudomonas fluorescentes provenientes de dife-rentes cultivos de papa ubicados en la región Cundiboyacense, entre 2.100 y 3.200 msnm, la cual es considerada la zona de mayor producción de papa de Colombia. Así mismo se evaluó el efecto de algunas prácticas de cultivo sobre dicha composición. Finalmente se determinó la capacidad de antagonismo de algunos aislamientos de pseudomonas fluorescentes contra Rhizoctonia solani. Fueron evaluadas 45 muestras de rizosfera y rizoplano de cultivos de papa provenientes de 15 campos de papa diferentes. Las muestras se procesaron usando una modificación del medio King B, la cual resultó ser más eficiente para aislar pseudomonas fluorescentes, que otras reportadas en la literatura. El 80,7% y 82,7% de las pseudomonas fluorescentes aisladas en rizosfera y rizoplano, respectivamente, fueron Pseudomonas fluorescens, mostrando poca diversidad en las muestras evaluadas. Por otra parte se observó un efecto de la estrategia de rotación de cultivo maíz-papa, sobre el número de pseudomonas fluorescentes aisladas de la rizosfera. Estos resultados tienen implicaciones para el diseño de estrategias de manejo integrado de plagas en los cultivos de los países tropicales. Finalmente se encontraron aisla-mientos nativos con actividad antagonista sobre anteriores, si bien no aseguran un control eficaz del pató-geno en condiciones de campo, sí dan una idea del poten-cial biocontrolador de la especie aplicados como comuni-dades bacterianas, cepas o subproductos de éstas.

Fluorescent Pseudomonas are one of the most important benefic bacteria of the rizhosphere. It is because they can control some soil borne phytopatogen agents as a result of their antagonistic capacity. There are few works about the composition and diversity of fluorescent Pseudomonas in tropical countries. In this work we studied the composition of fluorescent Pseudomonas form different potato crops located at the Cundiboyacense región between 2100 and 3200 mosl, which is the most important area of potato production in Colombia. This study also assesses the effect of some crop practices variables on rizosphere bacteria richness and diversity. Finally, it was determined the antagonistic capacity of some Pseudomonas fluorescens isolates against Rhizoctonia solani. A total of 45 rhizosphere samples were taken from 15 potato fields. To isolate the Pseudomonas it was used king B medium modified by us. Our results showed that this modified medium consistently allowed a more efficient recovery of the fluorescent Pseudomonas than the media reported in the literature. 80.7% and 82.7% of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere and rizoplane respectively were Pseudomonas fluorescens. It suggest a low fluorescent pseudomonas diversity. Our work also denotes an effect of the maize-potato crop rotation strategy on the amount of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere. These results may have importance in designing appropriate strategies for bio-controlling soil borne phytopathogens. In tropical countries like Colombia, this knowledge might help to improve crop yields. Finally it was found native isolates with antagonistic activity against Rhizoctonia solani in the bioassays in vitro, such results if not assure an efficient control of the pathogen in field conditions, may give an idea of the potentiality of P.fluorescens to be applied as bacterial community, strains or derived products of them., Las pseudomonas fluorescentes son unas de las bacterias benéficas más importantes a nivel de la rizosfera gracias a que pueden controlar algunos fitopatógenos habituales del suelo como resultado de su capacidad antagonista. Hay muy pocos trabajos realizados para conocer la composición y diversidad de pseudomonas fluorescentes en países tropicales. En este trabajo se determinó la composición de pseudomonas fluorescentes provenientes de dife-rentes cultivos de papa ubicados en la región Cundiboyacense, entre 2.100 y 3.200 msnm, la cual es considerada la zona de mayor producción de papa de Colombia. Así mismo se evaluó el efecto de algunas prácticas de cultivo sobre dicha composición. Finalmente se determinó la capacidad de antagonismo de algunos aislamientos de pseudomonas fluorescentes contra Rhizoctonia solani. Fueron evaluadas 45 muestras de rizosfera y rizoplano de cultivos de papa provenientes de 15 campos de papa diferentes. Las muestras se procesaron usando una modificación del medio King B, la cual resultó ser más eficiente para aislar pseudomonas fluorescentes, que otras reportadas en la literatura. El 80,7% y 82,7% de las pseudomonas fluorescentes aisladas en rizosfera y rizoplano, respectivamente, fueron Pseudomonas fluorescens, mostrando poca diversidad en las muestras evaluadas. Por otra parte se observó un efecto de la estrategia de rotación de cultivo maíz-papa, sobre el número de pseudomonas fluorescentes aisladas de la rizosfera. Estos resultados tienen implicaciones para el diseño de estrategias de manejo integrado de plagas en los cultivos de los países tropicales. Finalmente se encontraron aisla-mientos nativos con actividad antagonista sobre anteriores, si bien no aseguran un control eficaz del pató-geno en condiciones de campo, sí dan una idea del poten-cial biocontrolador de la especie aplicados como comuni-dades bacterianas, cepas o subproductos de éstas.

Fluorescent Pseudomonas are one of the most important benefic bacteria of the rizhosphere. It is because they can control some soil borne phytopatogen agents as a result of their antagonistic capacity. There are few works about the composition and diversity of fluorescent Pseudomonas in tropical countries. In this work we studied the composition of fluorescent Pseudomonas form different potato crops located at the Cundiboyacense región between 2100 and 3200 mosl, which is the most important area of potato production in Colombia. This study also assesses the effect of some crop practices variables on rizosphere bacteria richness and diversity. Finally, it was determined the antagonistic capacity of some Pseudomonas fluorescens isolates against Rhizoctonia solani. A total of 45 rhizosphere samples were taken from 15 potato fields. To isolate the Pseudomonas it was used king B medium modified by us. Our results showed that this modified medium consistently allowed a more efficient recovery of the fluorescent Pseudomonas than the media reported in the literature. 80.7% and 82.7% of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere and rizoplane respectively were Pseudomonas fluorescens. It suggest a low fluorescent pseudomonas diversity. Our work also denotes an effect of the maize-potato crop rotation strategy on the amount of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere. These results may have importance in designing appropriate strategies for bio-controlling soil borne phytopathogens. In tropical countries like Colombia, this knowledge might help to improve crop yields. Finally it was found native isolates with antagonistic activity against Rhizoctonia solani in the bioassays in vitro, such results if not assure an efficient control of the pathogen in field conditions, may give an idea of the potentiality of P.fluorescens to be applied as bacterial community, strains or derived products of them., Las pseudomonas fluorescentes son unas de las bacterias benéficas más importantes a nivel de la rizosfera gracias a que pueden controlar algunos fitopatógenos habituales del suelo como resultado de su capacidad antagonista. Hay muy pocos trabajos realizados para conocer la composición y diversidad de pseudomonas fluorescentes en países tropicales. En este trabajo se determinó la composición de pseudomonas fluorescentes provenientes de dife-rentes cultivos de papa ubicados en la región Cundiboyacense, entre 2.100 y 3.200 msnm, la cual es considerada la zona de mayor producción de papa de Colombia. Así mismo se evaluó el efecto de algunas prácticas de cultivo sobre dicha composición. Finalmente se determinó la capacidad de antagonismo de algunos aislamientos de pseudomonas fluorescentes contra Rhizoctonia solani. Fueron evaluadas 45 muestras de rizosfera y rizoplano de cultivos de papa provenientes de 15 campos de papa diferentes. Las muestras se procesaron usando una modificación del medio King B, la cual resultó ser más eficiente para aislar pseudomonas fluorescentes, que otras reportadas en la literatura. El 80,7% y 82,7% de las pseudomonas fluorescentes aisladas en rizosfera y rizoplano, respectivamente, fueron Pseudomonas fluorescens, mostrando poca diversidad en las muestras evaluadas. Por otra parte se observó un efecto de la estrategia de rotación de cultivo maíz-papa, sobre el número de pseudomonas fluorescentes aisladas de la rizosfera. Estos resultados tienen implicaciones para el diseño de estrategias de manejo integrado de plagas en los cultivos de los países tropicales. Finalmente se encontraron aisla-mientos nativos con actividad antagonista sobre anteriores, si bien no aseguran un control eficaz del pató-geno en condiciones de campo, sí dan una idea del poten-cial biocontrolador de la especie aplicados como comuni-dades bacterianas, cepas o subproductos de éstas.

Fluorescent Pseudomonas are one of the most important benefic bacteria of the rizhosphere. It is because they can control some soil borne phytopatogen agents as a result of their antagonistic capacity. There are few works about the composition and diversity of fluorescent Pseudomonas in tropical countries. In this work we studied the composition of fluorescent Pseudomonas form different potato crops located at the Cundiboyacense región between 2100 and 3200 mosl, which is the most important area of potato production in Colombia. This study also assesses the effect of some crop practices variables on rizosphere bacteria richness and diversity. Finally, it was determined the antagonistic capacity of some Pseudomonas fluorescens isolates against Rhizoctonia solani. A total of 45 rhizosphere samples were taken from 15 potato fields. To isolate the Pseudomonas it was used king B medium modified by us. Our results showed that this modified medium consistently allowed a more efficient recovery of the fluorescent Pseudomonas than the media reported in the literature. 80.7% and 82.7% of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere and rizoplane respectively were Pseudomonas fluorescens. It suggest a low fluorescent pseudomonas diversity. Our work also denotes an effect of the maize-potato crop rotation strategy on the amount of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere. These results may have importance in designing appropriate strategies for bio-controlling soil borne phytopathogens. In tropical countries like Colombia, this knowledge might help to improve crop yields. Finally it was found native isolates with antagonistic activity against Rhizoctonia solani in the bioassays in vitro, such results if not assure an efficient control of the pathogen in field conditions, may give an idea of the potentiality of P.fluorescens to be applied as bacterial community, strains or derived products of them., Las pseudomonas fluorescentes son unas de las bacterias benéficas más importantes a nivel de la rizosfera gracias a que pueden controlar algunos fitopatógenos habituales del suelo como resultado de su capacidad antagonista. Hay muy pocos trabajos realizados para conocer la composición y diversidad de pseudomonas fluorescentes en países tropicales. En este trabajo se determinó la composición de pseudomonas fluorescentes provenientes de dife-rentes cultivos de papa ubicados en la región Cundiboyacense, entre 2.100 y 3.200 msnm, la cual es considerada la zona de mayor producción de papa de Colombia. Así mismo se evaluó el efecto de algunas prácticas de cultivo sobre dicha composición. Finalmente se determinó la capacidad de antagonismo de algunos aislamientos de pseudomonas fluorescentes contra Rhizoctonia solani. Fueron evaluadas 45 muestras de rizosfera y rizoplano de cultivos de papa provenientes de 15 campos de papa diferentes. Las muestras se procesaron usando una modificación del medio King B, la cual resultó ser más eficiente para aislar pseudomonas fluorescentes, que otras reportadas en la literatura. El 80,7% y 82,7% de las pseudomonas fluorescentes aisladas en rizosfera y rizoplano, respectivamente, fueron Pseudomonas fluorescens, mostrando poca diversidad en las muestras evaluadas. Por otra parte se observó un efecto de la estrategia de rotación de cultivo maíz-papa, sobre el número de pseudomonas fluorescentes aisladas de la rizosfera. Estos resultados tienen implicaciones para el diseño de estrategias de manejo integrado de plagas en los cultivos de los países tropicales. Finalmente se encontraron aisla-mientos nativos con actividad antagonista sobre anteriores, si bien no aseguran un control eficaz del pató-geno en condiciones de campo, sí dan una idea del poten-cial biocontrolador de la especie aplicados como comuni-dades bacterianas, cepas o subproductos de éstas.

Fluorescent Pseudomonas are one of the most important benefic bacteria of the rizhosphere. It is because they can control some soil borne phytopatogen agents as a result of their antagonistic capacity. There are few works about the composition and diversity of fluorescent Pseudomonas in tropical countries. In this work we studied the composition of fluorescent Pseudomonas form different potato crops located at the Cundiboyacense región between 2100 and 3200 mosl, which is the most important area of potato production in Colombia. This study also assesses the effect of some crop practices variables on rizosphere bacteria richness and diversity. Finally, it was determined the antagonistic capacity of some Pseudomonas fluorescens isolates against Rhizoctonia solani. A total of 45 rhizosphere samples were taken from 15 potato fields. To isolate the Pseudomonas it was used king B medium modified by us. Our results showed that this modified medium consistently allowed a more efficient recovery of the fluorescent Pseudomonas than the media reported in the literature. 80.7% and 82.7% of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere and rizoplane respectively were Pseudomonas fluorescens. It suggest a low fluorescent pseudomonas diversity. Our work also denotes an effect of the maize-potato crop rotation strategy on the amount of the fluorescent Pseudomonas isolated from the rizosphere. These results may have importance in designing appropriate strategies for bio-controlling soil borne phytopathogens. In tropical countries like Colombia, this knowledge might help to improve crop yields. Finally it was found native isolates with antagonistic activity against Rhizoctonia solani in the bioassays in vitro, such results if not assure an efficient control of the pathogen in field conditions, may give an idea of the potentiality of P.fluorescens to be applied as bacterial community, strains or derived products of them., Las pseudomonas fluorescentes son unas de las bacterias benéficas más importantes a nivel de la rizosfera gracias a que pueden controlar algunos fitopatógenos habituales del suelo como resultado de su capacidad antagonista. Hay muy pocos trabajos realizados para conocer la composición y diversidad de pseudomonas fluorescentes en países tropicales. En este trabajo se determinó la composición de pseudomonas fluorescentes provenientes de dife-rentes cultivos de papa ubicados en la región Cundiboyacense, entre 2.100 y 3.200 msnm, la cual es considerada la zona de mayor producción de papa de Colombia. Así mismo se evaluó el efecto de algunas prácticas de cultivo sobre dicha composición. Finalmente se determinó la capacidad de antagonismo de algunos aislamientos de pseudomonas fluorescentes contra Rhizoctonia solani. Fueron evaluadas 45 muestras de rizosfera y rizoplano de cultivos de papa provenientes de 15 campos de papa diferentes. Las muestras se procesaron usando una modificación del medio King B, la cual resultó ser más eficiente para aislar pseudomonas fluorescentes, que otras reportadas en la literatura. El 80,7% y 82,7% de las pseudomonas fluorescentes aisladas en rizosfera y rizoplano, respectivamente, fueron Pseudomonas fluorescens, mostrando poca diversidad en las muestras evaluadas. Por otra parte se observó un efecto de la estrategia de rotación de cultivo maíz-papa, sobre el número de pseudomonas fluorescentes aisladas de la rizosfera. Estos resultados tienen implicaciones para el diseño de estrategias de manejo integrado de plagas en los cultivos de los países tropicales. Finalmente se encontraron aisla-mientos nativos con actividad antagonista sobre anteriores, si bien no aseguran un control eficaz del pató-geno en condiciones de campo, sí dan una idea del poten-cial biocontrolador de la especie aplicados como comuni-dades bacterianas, cepas o subproductos de éstas.